MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanocella arvoryzae MRE50 chromosome

Total Repeats: 63788

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
45001	NC_009464	T	6	6	2228674	2228679	0 %	100 %	0 %	0 %	147920883
45002	NC_009464	TGG	2	6	2228890	2228895	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147920883
45003	NC_009464	CAT	2	6	2228920	2228925	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147920883
45004	NC_009464	TCAC	2	8	2228927	2228934	25 %	25 %	0 %	50 %	147920883
45005	NC_009464	TTC	2	6	2228989	2228994	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45006	NC_009464	CCA	2	6	2228999	2229004	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
45007	NC_009464	CCA	2	6	2229006	2229011	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
45008	NC_009464	TGAG	2	8	2229075	2229082	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
45009	NC_009464	CAT	2	6	2229098	2229103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45010	NC_009464	CCA	2	6	2229114	2229119	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
45011	NC_009464	TAAGC	2	10	2229192	2229201	40 %	20 %	20 %	20 %	147920884
45012	NC_009464	TCA	2	6	2229251	2229256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147920884
45013	NC_009464	CAT	2	6	2229330	2229335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147920884
45014	NC_009464	ACC	2	6	2229353	2229358	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147920884
45015	NC_009464	GCT	2	6	2229390	2229395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147920884
45016	NC_009464	ATCT	2	8	2229400	2229407	25 %	50 %	0 %	25 %	147920884
45017	NC_009464	GGCT	2	8	2229409	2229416	0 %	25 %	50 %	25 %	147920884
45018	NC_009464	ACA	2	6	2229422	2229427	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	147920884
45019	NC_009464	TCA	2	6	2229446	2229451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147920884
45020	NC_009464	ATC	2	6	2229607	2229612	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147920884
45021	NC_009464	ACA	2	6	2229614	2229619	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	147920884
45022	NC_009464	CTG	2	6	2229742	2229747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147920884
45023	NC_009464	GAC	2	6	2229769	2229774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147920884
45024	NC_009464	CGT	2	6	2229801	2229806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147920884
45025	NC_009464	CCG	2	6	2229830	2229835	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147920884
45026	NC_009464	TCC	2	6	2229863	2229868	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	147920884
45027	NC_009464	ACG	2	6	2229890	2229895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147920884
45028	NC_009464	ATCC	2	8	2229924	2229931	25 %	25 %	0 %	50 %	147920884
45029	NC_009464	GCA	3	9	2229969	2229977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147920884
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45031	NC_009464	CTG	2	6	2230069	2230074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147920884
45032	NC_009464	CGAC	2	8	2230133	2230140	25 %	0 %	25 %	50 %	147920884
45033	NC_009464	GCACCT	2	12	2230148	2230159	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	147920884
45034	NC_009464	CGA	2	6	2230200	2230205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147920884
45035	NC_009464	TAA	2	6	2230224	2230229	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	147920884
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45037	NC_009464	A	7	7	2230333	2230339	100 %	0 %	0 %	0 %	147920884
45038	NC_009464	CAT	2	6	2230362	2230367	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147920884
45039	NC_009464	CGC	2	6	2230374	2230379	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147920884
45040	NC_009464	TCG	2	6	2230397	2230402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147920884
45041	NC_009464	GAA	2	6	2230438	2230443	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147920884
45042	NC_009464	TCA	3	9	2230490	2230498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147920884
45043	NC_009464	CGC	2	6	2230599	2230604	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147920884
45044	NC_009464	ACT	2	6	2230658	2230663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147920884
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45046	NC_009464	ATC	2	6	2230753	2230758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147920884
45047	NC_009464	ACGTAG	2	12	2230763	2230774	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	147920884
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45049	NC_009464	TGG	2	6	2230799	2230804	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147920884
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45052	NC_009464	GTC	2	6	2230948	2230953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147920884
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45054	NC_009464	TGC	2	6	2231081	2231086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147920884
45055	NC_009464	GCA	2	6	2231118	2231123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147920884
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45058	NC_009464	GCA	2	6	2231171	2231176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147920884
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45103	NC_009464	GCAG	2	8	2233330	2233337	25 %	0 %	50 %	25 %	147920885
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45115	NC_009464	CGA	2	6	2233851	2233856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147920885
45116	NC_009464	CGA	2	6	2233899	2233904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147920885
45117	NC_009464	CCG	2	6	2233940	2233945	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147920885
45118	NC_009464	CAC	2	6	2233989	2233994	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147920885
45119	NC_009464	CTT	2	6	2233995	2234000	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147920885
45120	NC_009464	GCCA	2	8	2234091	2234098	25 %	0 %	25 %	50 %	147920885
45121	NC_009464	ACG	2	6	2234207	2234212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147920885
45122	NC_009464	CAG	2	6	2234223	2234228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147920885
45123	NC_009464	CAT	2	6	2234301	2234306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147920885
45124	NC_009464	C	7	7	2234336	2234342	0 %	0 %	0 %	100 %	147920885
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45127	NC_009464	TGGC	2	8	2234431	2234438	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
45128	NC_009464	CCG	2	6	2234508	2234513	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
45129	NC_009464	CTC	2	6	2234589	2234594	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
45130	NC_009464	TCA	3	9	2234646	2234654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147920886
45131	NC_009464	CGG	2	6	2234656	2234661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147920886
45132	NC_009464	GCAG	2	8	2234762	2234769	25 %	0 %	50 %	25 %	147920886
45133	NC_009464	A	6	6	2234791	2234796	100 %	0 %	0 %	0 %	147920886
45134	NC_009464	GCAG	2	8	2234874	2234881	25 %	0 %	50 %	25 %	147920886
45135	NC_009464	ACA	2	6	2234919	2234924	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	147920886
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45141	NC_009464	CGG	2	6	2235066	2235071	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147920886
45142	NC_009464	AGATCG	2	12	2235072	2235083	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	147920886
45143	NC_009464	ATA	2	6	2235145	2235150	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	147920886
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45145	NC_009464	TTA	2	6	2235176	2235181	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45146	NC_009464	CAG	2	6	2235185	2235190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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45151	NC_009464	GGA	2	6	2235512	2235517	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	147920887
45152	NC_009464	CAG	2	6	2235531	2235536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147920887
45153	NC_009464	ACG	3	9	2235610	2235618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147920887
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45159	NC_009464	TG	3	6	2235829	2235834	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
45160	NC_009464	CGCTG	2	10	2235853	2235862	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
45161	NC_009464	GAT	2	6	2235925	2235930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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45163	NC_009464	TAA	2	6	2235968	2235973	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45164	NC_009464	TGAT	2	8	2235979	2235986	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
45165	NC_009464	ATT	2	6	2236013	2236018	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45166	NC_009464	GTA	2	6	2236045	2236050	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45167	NC_009464	CAG	2	6	2236062	2236067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45168	NC_009464	AATC	2	8	2236080	2236087	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
45169	NC_009464	TG	3	6	2236103	2236108	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
45170	NC_009464	CAGCG	2	10	2236117	2236126	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
45171	NC_009464	AAT	2	6	2236161	2236166	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	147920888
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45178	NC_009464	GCCG	2	8	2236418	2236425	0 %	0 %	50 %	50 %	147920888
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45210	NC_009464	AAG	2	6	2238448	2238453	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45211	NC_009464	CGCC	2	8	2238570	2238577	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
45212	NC_009464	CGCTG	2	10	2238626	2238635	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
45213	NC_009464	GAT	2	6	2238676	2238681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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45215	NC_009464	AGGC	2	8	2238873	2238880	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
45216	NC_009464	GGC	2	6	2239017	2239022	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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45224	NC_009464	TCCT	2	8	2239564	2239571	0 %	50 %	0 %	50 %	147920891
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45233	NC_009464	TCT	2	6	2240045	2240050	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147920891
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45287	NC_009464	CTGA	2	8	2242512	2242519	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
45288	NC_009464	CTG	2	6	2242534	2242539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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45291	NC_009464	T	6	6	2242628	2242633	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45292	NC_009464	CAT	2	6	2242653	2242658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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45294	NC_009464	CAGCG	2	10	2242775	2242784	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
45295	NC_009464	CA	3	6	2242802	2242807	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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45324	NC_009464	A	6	6	2244557	2244562	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45325	NC_009464	GA	3	6	2244563	2244568	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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45346	NC_009464	CCG	2	6	2245670	2245675	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
45347	NC_009464	TAG	2	6	2245741	2245746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147920896
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45351	NC_009464	TCG	2	6	2246002	2246007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147920896
45352	NC_009464	GAC	2	6	2246061	2246066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147920896
45353	NC_009464	CT	4	8	2246175	2246182	0 %	50 %	0 %	50 %	147920896
45354	NC_009464	CGTC	2	8	2246186	2246193	0 %	25 %	25 %	50 %	147920896
45355	NC_009464	CAG	2	6	2246281	2246286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147920896
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45413	NC_009464	GT	3	6	2249732	2249737	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
45414	NC_009464	ACT	2	6	2249794	2249799	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45415	NC_009464	ATA	2	6	2249843	2249848	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45416	NC_009464	CCTG	2	8	2249920	2249927	0 %	25 %	25 %	50 %	147920898
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45440	NC_009464	TCCG	2	8	2251016	2251023	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
45441	NC_009464	GGT	2	6	2251050	2251055	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
45442	NC_009464	ATT	2	6	2251123	2251128	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45443	NC_009464	ACGGTG	2	12	2251285	2251296	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	147920899
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45451	NC_009464	ATC	2	6	2251722	2251727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147920899
45452	NC_009464	ACA	2	6	2251765	2251770	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	147920899
45453	NC_009464	TCA	2	6	2251777	2251782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147920899
45454	NC_009464	CAG	2	6	2251812	2251817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147920899
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45457	NC_009464	CAGC	2	8	2252120	2252127	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
45458	NC_009464	AT	3	6	2252224	2252229	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45459	NC_009464	CAC	2	6	2252257	2252262	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
45460	NC_009464	CTG	2	6	2252266	2252271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45461	NC_009464	CCTGCT	2	12	2252434	2252445	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	147920900
45462	NC_009464	CGT	2	6	2252515	2252520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147920900
45463	NC_009464	GCC	2	6	2252597	2252602	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147920900
45464	NC_009464	TGA	3	9	2252607	2252615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147920900
45465	NC_009464	TCA	2	6	2252688	2252693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147920900
45466	NC_009464	GCC	2	6	2252738	2252743	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147920900
45467	NC_009464	GCT	2	6	2252881	2252886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147920900
45468	NC_009464	GTTCGG	2	12	2252893	2252904	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	147920900
45469	NC_009464	AGGC	2	8	2252910	2252917	25 %	0 %	50 %	25 %	147920900
45470	NC_009464	CTG	2	6	2252918	2252923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147920900
45471	NC_009464	CCG	2	6	2252969	2252974	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147920900
45472	NC_009464	CCA	2	6	2252982	2252987	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147920900
45473	NC_009464	TCA	2	6	2253000	2253005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147920900
45474	NC_009464	TCC	2	6	2253053	2253058	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	147920900
45475	NC_009464	GTG	2	6	2253083	2253088	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147920900
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45482	NC_009464	TGG	2	6	2253476	2253481	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147920900
45483	NC_009464	GCA	2	6	2253516	2253521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147920900
45484	NC_009464	TCC	2	6	2253596	2253601	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	147920900
45485	NC_009464	CTC	2	6	2253620	2253625	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	147920900
45486	NC_009464	TGG	2	6	2253639	2253644	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147920900
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45489	NC_009464	AGA	2	6	2253739	2253744	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147920901
45490	NC_009464	CGA	2	6	2253829	2253834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147920901
45491	NC_009464	CGC	2	6	2253835	2253840	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147920901
45492	NC_009464	CTG	2	6	2253860	2253865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147920901
45493	NC_009464	GCAG	2	8	2253893	2253900	25 %	0 %	50 %	25 %	147920901
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45495	NC_009464	TCA	2	6	2253954	2253959	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147920901
45496	NC_009464	CGCCC	2	10	2253982	2253991	0 %	0 %	20 %	80 %	147920901
45497	NC_009464	AG	3	6	2254029	2254034	50 %	0 %	50 %	0 %	147920901
45498	NC_009464	CT	4	8	2254276	2254283	0 %	50 %	0 %	50 %	147920902
45499	NC_009464	CAG	2	6	2254343	2254348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147920902
45500	NC_009464	TCG	2	6	2254365	2254370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147920902

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