MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanocella arvoryzae MRE50 chromosome

Total Repeats: 63788

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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43002	NC_009464	TCG	2	6	2130828	2130833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147920790
43003	NC_009464	TCTCT	2	10	2130858	2130867	0 %	60 %	0 %	40 %	147920790
43004	NC_009464	TC	3	6	2130878	2130883	0 %	50 %	0 %	50 %	147920790
43005	NC_009464	CCT	2	6	2130899	2130904	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43006	NC_009464	CCG	2	6	2130925	2130930	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147920791
43007	NC_009464	T	7	7	2130933	2130939	0 %	100 %	0 %	0 %	147920791
43008	NC_009464	CTTT	2	8	2130943	2130950	0 %	75 %	0 %	25 %	147920791
43009	NC_009464	CTT	2	6	2130953	2130958	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147920791
43010	NC_009464	CCTG	2	8	2130985	2130992	0 %	25 %	25 %	50 %	147920791
43011	NC_009464	ATCTTG	2	12	2131083	2131094	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	147920791
43012	NC_009464	TCT	2	6	2131228	2131233	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147920791
43013	NC_009464	CTC	2	6	2131298	2131303	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	147920791
43014	NC_009464	AGC	2	6	2131323	2131328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147920791
43015	NC_009464	GCA	2	6	2131348	2131353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147920791
43016	NC_009464	CCGG	2	8	2131372	2131379	0 %	0 %	50 %	50 %	147920791
43017	NC_009464	TGG	2	6	2131381	2131386	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147920791
43018	NC_009464	TAC	3	9	2131394	2131402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147920791
43019	NC_009464	CTC	2	6	2131412	2131417	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	147920791
43020	NC_009464	CT	3	6	2131453	2131458	0 %	50 %	0 %	50 %	147920791
43021	NC_009464	TCG	2	6	2131512	2131517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147920791
43022	NC_009464	AAG	2	6	2131518	2131523	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147920791
43023	NC_009464	TCG	2	6	2131528	2131533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147920791
43024	NC_009464	TTG	2	6	2131596	2131601	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	147920791
43025	NC_009464	TGA	2	6	2131624	2131629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147920791
43026	NC_009464	CGG	2	6	2131685	2131690	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147920791
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43033	NC_009464	CCTC	2	8	2131846	2131853	0 %	25 %	0 %	75 %	147920791
43034	NC_009464	TTC	2	6	2131872	2131877	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147920791
43035	NC_009464	GTC	2	6	2131892	2131897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147920791
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43037	NC_009464	TCGATG	2	12	2131944	2131955	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	147920791
43038	NC_009464	ATC	2	6	2131965	2131970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147920791
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43042	NC_009464	TTC	2	6	2132076	2132081	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147920791
43043	NC_009464	TGA	2	6	2132197	2132202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147920791
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43053	NC_009464	CTG	2	6	2132519	2132524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147920791
43054	NC_009464	GAG	2	6	2132531	2132536	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	147920791
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43058	NC_009464	CGATCT	2	12	2132692	2132703	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	147920791
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43087	NC_009464	GCTAT	2	10	2133798	2133807	20 %	40 %	20 %	20 %	147920792
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43102	NC_009464	CGG	2	6	2134414	2134419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147920792
43103	NC_009464	TA	4	8	2134492	2134499	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43104	NC_009464	CCGG	2	8	2134514	2134521	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
43105	NC_009464	ATA	2	6	2134554	2134559	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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43107	NC_009464	A	6	6	2134625	2134630	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43108	NC_009464	GTC	2	6	2134667	2134672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147920793
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43111	NC_009464	TC	5	10	2134911	2134920	0 %	50 %	0 %	50 %	147920793
43112	NC_009464	GCCA	2	8	2134951	2134958	25 %	0 %	25 %	50 %	147920793
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43114	NC_009464	CGC	2	6	2135118	2135123	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147920793
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43116	NC_009464	GTG	2	6	2135219	2135224	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147920793
43117	NC_009464	AGAT	2	8	2135226	2135233	50 %	25 %	25 %	0 %	147920793
43118	NC_009464	AGC	2	6	2135284	2135289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147920793
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43123	NC_009464	GCA	2	6	2135462	2135467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147920793
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43125	NC_009464	TCG	2	6	2135564	2135569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147920793
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43128	NC_009464	TCT	2	6	2135676	2135681	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147920793
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43143	NC_009464	ATT	2	6	2136161	2136166	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43144	NC_009464	AT	3	6	2136175	2136180	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43145	NC_009464	GCTG	2	8	2136252	2136259	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
43146	NC_009464	CGC	3	9	2136341	2136349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147920794
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43201	NC_009464	TGCGT	2	10	2138896	2138905	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
43202	NC_009464	ATGTA	2	10	2138920	2138929	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
43203	NC_009464	CAG	2	6	2138995	2139000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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43218	NC_009464	TCCTCT	2	12	2139768	2139779	0 %	50 %	0 %	50 %	147920798
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43221	NC_009464	A	6	6	2139932	2139937	100 %	0 %	0 %	0 %	147920798
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43225	NC_009464	CGCAT	2	10	2140067	2140076	20 %	20 %	20 %	40 %	147920798
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43227	NC_009464	CGG	2	6	2140237	2140242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147920798
43228	NC_009464	TCG	3	9	2140359	2140367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147920798
43229	NC_009464	CCTC	2	8	2140404	2140411	0 %	25 %	0 %	75 %	147920798
43230	NC_009464	AGG	2	6	2140452	2140457	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	147920798
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43232	NC_009464	GACCTC	2	12	2140496	2140507	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	147920798
43233	NC_009464	CTC	2	6	2140514	2140519	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	147920798
43234	NC_009464	CGG	2	6	2140540	2140545	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147920798
43235	NC_009464	GGC	3	9	2140550	2140558	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147920798
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43237	NC_009464	CGT	3	9	2140576	2140584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147920798
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43243	NC_009464	GGCTC	2	10	2140899	2140908	0 %	20 %	40 %	40 %	147920799
43244	NC_009464	CGATGG	2	12	2140981	2140992	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	147920799
43245	NC_009464	TACGTC	2	12	2141042	2141053	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	147920799
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43279	NC_009464	AT	3	6	2143297	2143302	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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43282	NC_009464	TA	4	8	2143366	2143373	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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43285	NC_009464	C	7	7	2143438	2143444	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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43289	NC_009464	CCTCG	2	10	2143548	2143557	0 %	20 %	20 %	60 %	147920801
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43297	NC_009464	TTTA	2	8	2143894	2143901	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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43316	NC_009464	TA	3	6	2144604	2144609	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43317	NC_009464	CAA	2	6	2144634	2144639	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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43332	NC_009464	CTG	2	6	2145364	2145369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147920803
43333	NC_009464	GCC	2	6	2145406	2145411	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147920803
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43342	NC_009464	AAG	2	6	2145950	2145955	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147920804
43343	NC_009464	TGA	2	6	2145988	2145993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147920804
43344	NC_009464	AGC	2	6	2145999	2146004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147920804
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43346	NC_009464	CTGA	2	8	2146116	2146123	25 %	25 %	25 %	25 %	147920804
43347	NC_009464	CAG	2	6	2146189	2146194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147920805
43348	NC_009464	GCA	2	6	2146242	2146247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147920805
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43466	NC_009464	GTA	2	6	2152197	2152202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147920809
43467	NC_009464	CTA	2	6	2152208	2152213	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147920809
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43469	NC_009464	AAAGTA	2	12	2152232	2152243	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	147920809
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43471	NC_009464	T	6	6	2152277	2152282	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43472	NC_009464	T	6	6	2152325	2152330	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43473	NC_009464	GAG	2	6	2152359	2152364	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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43480	NC_009464	G	6	6	2152803	2152808	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
43481	NC_009464	TGGT	2	8	2152831	2152838	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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