MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanocella arvoryzae MRE50 chromosome

Total Repeats: 63788

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_009464	TGG	2	6	155212	155217	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147918827
3002	NC_009464	CTG	2	6	155316	155321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147918827
3003	NC_009464	CCG	2	6	155396	155401	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3004	NC_009464	TCG	2	6	155422	155427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3005	NC_009464	TCA	2	6	155482	155487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3006	NC_009464	TCA	2	6	155534	155539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147918828
3007	NC_009464	GGC	2	6	155635	155640	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147918828
3008	NC_009464	GCA	2	6	155889	155894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147918828
3009	NC_009464	GTG	2	6	155956	155961	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147918828
3010	NC_009464	TG	3	6	155987	155992	0 %	50 %	50 %	0 %	147918828
3011	NC_009464	GCCT	2	8	156055	156062	0 %	25 %	25 %	50 %	147918828
3012	NC_009464	CAGC	2	8	156102	156109	25 %	0 %	25 %	50 %	147918828
3013	NC_009464	TCCGC	2	10	156158	156167	0 %	20 %	20 %	60 %	147918828
3014	NC_009464	CAT	2	6	156272	156277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147918829
3015	NC_009464	CAC	2	6	156311	156316	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147918829
3016	NC_009464	CGT	2	6	156404	156409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147918829
3017	NC_009464	ACG	2	6	156436	156441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147918829
3018	NC_009464	GAC	2	6	156462	156467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147918829
3019	NC_009464	TAA	2	6	156695	156700	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	147918829
3020	NC_009464	TCG	2	6	156737	156742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3021	NC_009464	GCC	2	6	156750	156755	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3022	NC_009464	TTG	2	6	156831	156836	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3023	NC_009464	TTA	2	6	156873	156878	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3024	NC_009464	T	6	6	156885	156890	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3025	NC_009464	GGA	2	6	156944	156949	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3026	NC_009464	AG	3	6	156977	156982	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3027	NC_009464	GAG	2	6	156989	156994	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3028	NC_009464	TACG	2	8	157026	157033	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3029	NC_009464	TC	3	6	157039	157044	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3030	NC_009464	CCT	2	6	157067	157072	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3031	NC_009464	ATT	2	6	157174	157179	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3032	NC_009464	A	6	6	157194	157199	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3033	NC_009464	CTT	2	6	157247	157252	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3034	NC_009464	TCA	2	6	157400	157405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3035	NC_009464	T	6	6	157422	157427	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3036	NC_009464	AGT	2	6	157518	157523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3037	NC_009464	GAG	2	6	157559	157564	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3038	NC_009464	ACCA	2	8	157619	157626	50 %	0 %	0 %	50 %	147918830
3039	NC_009464	GAT	2	6	157642	157647	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147918830
3040	NC_009464	CGA	2	6	157702	157707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147918830
3041	NC_009464	CGT	2	6	157822	157827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147918830
3042	NC_009464	GTC	2	6	157868	157873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147918830
3043	NC_009464	GTG	2	6	158000	158005	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147918830
3044	NC_009464	ACA	2	6	158013	158018	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	147918830
3045	NC_009464	AT	3	6	158044	158049	50 %	50 %	0 %	0 %	147918830
3046	NC_009464	GCA	2	6	158114	158119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147918830
3047	NC_009464	GAT	2	6	158146	158151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147918830
3048	NC_009464	AGC	2	6	158184	158189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147918830
3049	NC_009464	ATA	2	6	158269	158274	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3050	NC_009464	AGC	2	6	158313	158318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3051	NC_009464	GCA	2	6	158399	158404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147918831
3052	NC_009464	GAA	2	6	158474	158479	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147918831
3053	NC_009464	TA	3	6	158587	158592	50 %	50 %	0 %	0 %	147918831
3054	NC_009464	AGA	2	6	158731	158736	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147918831
3055	NC_009464	GCC	2	6	158815	158820	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147918831
3056	NC_009464	GTTCA	2	10	158900	158909	20 %	40 %	20 %	20 %	147918831
3057	NC_009464	TTA	2	6	159042	159047	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	147918831
3058	NC_009464	GCA	2	6	159056	159061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147918831
3059	NC_009464	A	6	6	159074	159079	100 %	0 %	0 %	0 %	147918831
3060	NC_009464	TAC	2	6	159137	159142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147918832
3061	NC_009464	AAG	2	6	159206	159211	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147918832
3062	NC_009464	AAT	2	6	159235	159240	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	147918832
3063	NC_009464	CT	3	6	159281	159286	0 %	50 %	0 %	50 %	147918832
3064	NC_009464	GCAG	2	8	159332	159339	25 %	0 %	50 %	25 %	147918832
3065	NC_009464	ATCCT	2	10	159441	159450	20 %	40 %	0 %	40 %	147918832
3066	NC_009464	TA	3	6	159560	159565	50 %	50 %	0 %	0 %	147918832
3067	NC_009464	GAT	2	6	159583	159588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147918832
3068	NC_009464	AAT	2	6	159625	159630	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	147918832
3069	NC_009464	TG	3	6	159657	159662	0 %	50 %	50 %	0 %	147918832
3070	NC_009464	GTC	2	6	159789	159794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147918833
3071	NC_009464	TCA	2	6	159910	159915	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147918833
3072	NC_009464	CT	3	6	159976	159981	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3073	NC_009464	ATG	2	6	159990	159995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147918834
3074	NC_009464	CCA	2	6	160204	160209	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147918834
3075	NC_009464	GCCAGC	2	12	160287	160298	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	147918834
3076	NC_009464	TTG	2	6	160314	160319	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	147918834
3077	NC_009464	ACG	2	6	160359	160364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147918834
3078	NC_009464	T	6	6	160373	160378	0 %	100 %	0 %	0 %	147918834
3079	NC_009464	CAG	2	6	160393	160398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147918834
3080	NC_009464	TTC	2	6	160503	160508	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147918834
3081	NC_009464	GAT	2	6	160526	160531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147918834
3082	NC_009464	ACA	2	6	160756	160761	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	147918834
3083	NC_009464	GCC	2	6	160770	160775	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147918834
3084	NC_009464	CAAGG	2	10	160835	160844	40 %	0 %	40 %	20 %	147918834
3085	NC_009464	TCCT	2	8	160861	160868	0 %	50 %	0 %	50 %	147918834
3086	NC_009464	TCT	2	6	160894	160899	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147918834
3087	NC_009464	GTA	2	6	160912	160917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147918834
3088	NC_009464	ATT	2	6	160965	160970	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3089	NC_009464	ATGGAT	2	12	160971	160982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3090	NC_009464	TCA	2	6	161012	161017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3091	NC_009464	GATT	2	8	161062	161069	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3092	NC_009464	ATTG	2	8	161082	161089	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3093	NC_009464	GGC	2	6	161313	161318	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147918835
3094	NC_009464	TAC	2	6	161379	161384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147918835
3095	NC_009464	CGA	2	6	161436	161441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147918835
3096	NC_009464	CAC	2	6	161454	161459	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147918835
3097	NC_009464	ACC	2	6	161527	161532	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147918835
3098	NC_009464	GTC	2	6	161554	161559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147918835
3099	NC_009464	CCT	2	6	161574	161579	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	147918835
3100	NC_009464	CTGG	2	8	161615	161622	0 %	25 %	50 %	25 %	147918835
3101	NC_009464	CAG	3	9	161624	161632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147918835
3102	NC_009464	AG	3	6	161689	161694	50 %	0 %	50 %	0 %	147918835
3103	NC_009464	GAT	2	6	161751	161756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147918835
3104	NC_009464	GGA	2	6	161768	161773	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	147918835
3105	NC_009464	GTA	2	6	161842	161847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147918835
3106	NC_009464	ACTGGG	2	12	161948	161959	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	147918835
3107	NC_009464	CT	3	6	161983	161988	0 %	50 %	0 %	50 %	147918835
3108	NC_009464	TTTGA	2	10	162040	162049	20 %	60 %	20 %	0 %	147918835
3109	NC_009464	GAT	2	6	162057	162062	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147918835
3110	NC_009464	A	6	6	162092	162097	100 %	0 %	0 %	0 %	147918835
3111	NC_009464	CCA	2	6	162109	162114	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147918835
3112	NC_009464	TCA	2	6	162194	162199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147918835
3113	NC_009464	GTG	2	6	162209	162214	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147918835
3114	NC_009464	TTG	2	6	162263	162268	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	147918835
3115	NC_009464	CTT	2	6	162428	162433	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147918835
3116	NC_009464	ATT	2	6	162445	162450	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	147918835
3117	NC_009464	TTA	2	6	162485	162490	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	147918835
3118	NC_009464	TCA	2	6	162572	162577	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147918835
3119	NC_009464	CTG	2	6	162598	162603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147918835
3120	NC_009464	AG	3	6	162615	162620	50 %	0 %	50 %	0 %	147918835
3121	NC_009464	ATTA	2	8	162638	162645	50 %	50 %	0 %	0 %	147918835
3122	NC_009464	T	7	7	162731	162737	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3123	NC_009464	GGCA	2	8	162826	162833	25 %	0 %	50 %	25 %	147918836
3124	NC_009464	CGG	2	6	162838	162843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147918836
3125	NC_009464	G	6	6	162886	162891	0 %	0 %	100 %	0 %	147918836
3126	NC_009464	TGC	2	6	162904	162909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147918836
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3129	NC_009464	GCAG	2	8	163122	163129	25 %	0 %	50 %	25 %	147918836
3130	NC_009464	TAGGCG	2	12	163146	163157	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	147918836
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3132	NC_009464	CGA	2	6	163255	163260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147918836
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3245	NC_009464	CGA	2	6	168514	168519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147918841
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3369	NC_009464	GCT	2	6	175658	175663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147918850
3370	NC_009464	CTG	2	6	175683	175688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147918850
3371	NC_009464	CTG	2	6	175692	175697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147918850
3372	NC_009464	TCG	2	6	175711	175716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147918850
3373	NC_009464	GCA	2	6	175728	175733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147918850
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3375	NC_009464	CCGG	2	8	175931	175938	0 %	0 %	50 %	50 %	147918850
3376	NC_009464	GAT	2	6	175985	175990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147918850
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3378	NC_009464	GCCA	2	8	176210	176217	25 %	0 %	25 %	50 %	147918850
3379	NC_009464	GCT	2	6	176273	176278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147918850
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3382	NC_009464	GTC	2	6	176400	176405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147918850
3383	NC_009464	TGT	2	6	176407	176412	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	147918850
3384	NC_009464	ATC	2	6	176450	176455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147918851
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3386	NC_009464	GCT	2	6	176520	176525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147918851
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3392	NC_009464	GTC	2	6	176818	176823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147918851
3393	NC_009464	TTG	2	6	176879	176884	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	147918851
3394	NC_009464	GGT	2	6	176892	176897	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147918851
3395	NC_009464	ATA	2	6	177004	177009	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	147918851
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3397	NC_009464	CCTC	2	8	177134	177141	0 %	25 %	0 %	75 %	147918851
3398	NC_009464	ATG	2	6	177167	177172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147918851
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3400	NC_009464	GTT	2	6	177232	177237	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	147918851
3401	NC_009464	ATT	2	6	177242	177247	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	147918851
3402	NC_009464	TA	3	6	177336	177341	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3403	NC_009464	GGCT	2	8	177357	177364	0 %	25 %	50 %	25 %	147918852
3404	NC_009464	GAC	2	6	177423	177428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147918852
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3406	NC_009464	AG	3	6	177651	177656	50 %	0 %	50 %	0 %	147918852
3407	NC_009464	CAT	2	6	177713	177718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147918852
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3412	NC_009464	ATC	2	6	177984	177989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147918852
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3422	NC_009464	CAG	2	6	178361	178366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147918852
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3434	NC_009464	CAGA	2	8	178859	178866	50 %	0 %	25 %	25 %	147918852
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3443	NC_009464	ATC	2	6	179289	179294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147918852
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3449	NC_009464	GCA	2	6	179863	179868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3450	NC_009464	GTT	2	6	180109	180114	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	147918853
3451	NC_009464	GGGCT	2	10	180161	180170	0 %	20 %	60 %	20 %	147918853
3452	NC_009464	GCAT	2	8	180183	180190	25 %	25 %	25 %	25 %	147918853
3453	NC_009464	GGCA	2	8	180382	180389	25 %	0 %	50 %	25 %	147918854
3454	NC_009464	TAC	2	6	180412	180417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147918854
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3471	NC_009464	GA	3	6	181099	181104	50 %	0 %	50 %	0 %	147918854
3472	NC_009464	TGA	2	6	181131	181136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147918854
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3477	NC_009464	ATC	2	6	181447	181452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147918854
3478	NC_009464	GGC	2	6	181485	181490	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147918855
3479	NC_009464	ATC	2	6	181582	181587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147918855
3480	NC_009464	TCAAGC	2	12	181628	181639	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	147918855
3481	NC_009464	GCCA	2	8	181673	181680	25 %	0 %	25 %	50 %	147918855
3482	NC_009464	TAT	2	6	181759	181764	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	147918855
3483	NC_009464	GAA	2	6	181806	181811	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147918855
3484	NC_009464	GC	3	6	181857	181862	0 %	0 %	50 %	50 %	147918855
3485	NC_009464	CCCGGC	2	12	181868	181879	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147918855
3486	NC_009464	GATC	2	8	181926	181933	25 %	25 %	25 %	25 %	147918855
3487	NC_009464	AGT	2	6	181977	181982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147918855
3488	NC_009464	ACT	2	6	181997	182002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147918855
3489	NC_009464	ACG	2	6	182030	182035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147918855
3490	NC_009464	GGA	2	6	182058	182063	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	147918855
3491	NC_009464	AG	3	6	182139	182144	50 %	0 %	50 %	0 %	147918855
3492	NC_009464	GA	3	6	182218	182223	50 %	0 %	50 %	0 %	147918855
3493	NC_009464	AAG	2	6	182224	182229	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147918855
3494	NC_009464	GAC	2	6	182260	182265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147918855
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3497	NC_009464	GTCT	2	8	182360	182367	0 %	50 %	25 %	25 %	147918856
3498	NC_009464	GTC	2	6	182399	182404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147918856
3499	NC_009464	GAT	2	6	182426	182431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147918856
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