MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanocella arvoryzae MRE50 chromosome

Total Repeats: 63788

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
21001	NC_009464	ATGG	2	8	1063443	1063450	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
21002	NC_009464	CAT	2	6	1063486	1063491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147919758
21003	NC_009464	GAA	2	6	1063514	1063519	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147919758
21004	NC_009464	GATC	2	8	1063587	1063594	25 %	25 %	25 %	25 %	147919758
21005	NC_009464	CGT	2	6	1063609	1063614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147919758
21006	NC_009464	CTA	2	6	1063657	1063662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147919758
21007	NC_009464	CAG	2	6	1063700	1063705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147919758
21008	NC_009464	ATC	2	6	1063709	1063714	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147919758
21009	NC_009464	CGA	2	6	1063801	1063806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147919758
21010	NC_009464	ACG	2	6	1063818	1063823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147919758
21011	NC_009464	AGA	2	6	1063824	1063829	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147919758
21012	NC_009464	CGCC	2	8	1063831	1063838	0 %	0 %	25 %	75 %	147919758
21013	NC_009464	CAG	2	6	1063843	1063848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147919758
21014	NC_009464	CAGC	2	8	1063958	1063965	25 %	0 %	25 %	50 %	147919758
21015	NC_009464	GAA	2	6	1063988	1063993	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147919758
21016	NC_009464	GAA	3	9	1063999	1064007	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147919758
21017	NC_009464	GGC	2	6	1064009	1064014	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147919758
21018	NC_009464	CAG	2	6	1064083	1064088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21019	NC_009464	CAG	2	6	1064149	1064154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147919759
21020	NC_009464	GAT	2	6	1064180	1064185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147919759
21021	NC_009464	CTG	2	6	1064204	1064209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147919759
21022	NC_009464	AGA	2	6	1064213	1064218	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147919759
21023	NC_009464	GGCT	2	8	1064360	1064367	0 %	25 %	50 %	25 %	147919759
21024	NC_009464	CGA	2	6	1064368	1064373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147919759
21025	NC_009464	CAGC	2	8	1064377	1064384	25 %	0 %	25 %	50 %	147919759
21026	NC_009464	TATC	2	8	1064409	1064416	25 %	50 %	0 %	25 %	147919759
21027	NC_009464	ACC	2	6	1064421	1064426	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147919759
21028	NC_009464	GAG	2	6	1064567	1064572	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	147919759
21029	NC_009464	TAC	2	6	1064621	1064626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147919759
21030	NC_009464	TGA	2	6	1064714	1064719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21031	NC_009464	TGA	2	6	1064743	1064748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21032	NC_009464	GCC	2	6	1064783	1064788	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
21033	NC_009464	AG	3	6	1064911	1064916	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
21034	NC_009464	T	6	6	1064966	1064971	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21035	NC_009464	TC	3	6	1064980	1064985	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
21036	NC_009464	CCT	2	6	1065008	1065013	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21037	NC_009464	CT	3	6	1065012	1065017	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
21038	NC_009464	TC	3	6	1065055	1065060	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
21039	NC_009464	CCTCC	2	10	1065083	1065092	0 %	20 %	0 %	80 %	147919760
21040	NC_009464	AAT	2	6	1065140	1065145	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	147919760
21041	NC_009464	AT	3	6	1065245	1065250	50 %	50 %	0 %	0 %	147919760
21042	NC_009464	AGTG	2	8	1065307	1065314	25 %	25 %	50 %	0 %	147919760
21043	NC_009464	CTG	2	6	1065359	1065364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21044	NC_009464	GTCT	2	8	1065489	1065496	0 %	50 %	25 %	25 %	147919761
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21047	NC_009464	CGG	2	6	1065679	1065684	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147919761
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21050	NC_009464	CTG	2	6	1065755	1065760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147919761
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21053	NC_009464	GAA	2	6	1065890	1065895	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147919761
21054	NC_009464	TAT	2	6	1065921	1065926	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	147919761
21055	NC_009464	ATC	2	6	1065963	1065968	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147919761
21056	NC_009464	CTG	2	6	1066008	1066013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147919761
21057	NC_009464	AGAGA	2	10	1066098	1066107	60 %	0 %	40 %	0 %	147919761
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21061	NC_009464	CGGTC	2	10	1066192	1066201	0 %	20 %	40 %	40 %	147919761
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21064	NC_009464	GCAG	2	8	1066327	1066334	25 %	0 %	50 %	25 %	147919762
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21068	NC_009464	TCA	2	6	1066555	1066560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147919762
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21072	NC_009464	GGT	2	6	1066781	1066786	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147919762
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21087	NC_009464	ATA	2	6	1067655	1067660	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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21101	NC_009464	GTC	2	6	1068358	1068363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147919763
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21113	NC_009464	CA	3	6	1068959	1068964	50 %	0 %	0 %	50 %	147919764
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21451	NC_009464	CGCTG	2	10	1085325	1085334	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
21452	NC_009464	CAGATT	2	12	1085356	1085367	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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21456	NC_009464	CAGCG	2	10	1085553	1085562	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
21457	NC_009464	ACA	2	6	1085590	1085595	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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21459	NC_009464	TGA	2	6	1085742	1085747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147919778
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21464	NC_009464	GTC	2	6	1085884	1085889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147919778
21465	NC_009464	ACA	3	9	1085971	1085979	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	147919778
21466	NC_009464	GT	3	6	1086005	1086010	0 %	50 %	50 %	0 %	147919778
21467	NC_009464	GGC	2	6	1086028	1086033	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147919778
21468	NC_009464	GCCT	2	8	1086070	1086077	0 %	25 %	25 %	50 %	147919778
21469	NC_009464	CG	3	6	1086078	1086083	0 %	0 %	50 %	50 %	147919778
21470	NC_009464	CTT	2	6	1086105	1086110	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147919778
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21477	NC_009464	CAGC	2	8	1086414	1086421	25 %	0 %	25 %	50 %	147919778
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21488	NC_009464	TA	3	6	1086812	1086817	50 %	50 %	0 %	0 %	147919779
21489	NC_009464	TC	3	6	1086883	1086888	0 %	50 %	0 %	50 %	147919779
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21499	NC_009464	A	7	7	1087304	1087310	100 %	0 %	0 %	0 %	147919780
21500	NC_009464	GGA	2	6	1087359	1087364	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	147919780

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