MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanocella arvoryzae MRE50 chromosome

Total Repeats: 63788

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_009464	TCT	2	6	564447	564452	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147919217
11002	NC_009464	CTGC	2	8	564468	564475	0 %	25 %	25 %	50 %	147919217
11003	NC_009464	GGC	2	6	564491	564496	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147919217
11004	NC_009464	GGA	2	6	564605	564610	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	147919218
11005	NC_009464	CGG	2	6	564641	564646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147919218
11006	NC_009464	CT	3	6	564662	564667	0 %	50 %	0 %	50 %	147919218
11007	NC_009464	GAT	2	6	564672	564677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147919218
11008	NC_009464	CGT	2	6	564767	564772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147919218
11009	NC_009464	GCA	2	6	564782	564787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147919218
11010	NC_009464	GAC	2	6	564825	564830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147919218
11011	NC_009464	GCAG	2	8	564840	564847	25 %	0 %	50 %	25 %	147919218
11012	NC_009464	CCG	2	6	564916	564921	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147919218
11013	NC_009464	CGC	2	6	564927	564932	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147919218
11014	NC_009464	CAG	2	6	564990	564995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147919218
11015	NC_009464	TCTTGT	2	12	565145	565156	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	147919218
11016	NC_009464	GCC	2	6	565173	565178	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147919218
11017	NC_009464	GCA	2	6	565241	565246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147919218
11018	NC_009464	GCC	2	6	565260	565265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147919218
11019	NC_009464	CCA	2	6	565298	565303	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147919218
11020	NC_009464	CCAT	2	8	565396	565403	25 %	25 %	0 %	50 %	147919218
11021	NC_009464	CAGC	2	8	565483	565490	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
11022	NC_009464	CAGAAG	2	12	565506	565517	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
11023	NC_009464	AAAGCT	2	12	565520	565531	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
11024	NC_009464	GTT	2	6	565550	565555	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11025	NC_009464	CAT	3	9	565577	565585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11026	NC_009464	AT	3	6	565607	565612	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11027	NC_009464	TC	3	6	565695	565700	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11028	NC_009464	CGCTG	2	10	565728	565737	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
11029	NC_009464	TAC	2	6	565764	565769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11030	NC_009464	AGAT	2	8	565779	565786	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11031	NC_009464	CAGCG	2	10	565918	565927	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
11032	NC_009464	TCT	2	6	565989	565994	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147919219
11033	NC_009464	GCC	2	6	566012	566017	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147919219
11034	NC_009464	GAA	2	6	566035	566040	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147919219
11035	NC_009464	CGC	2	6	566073	566078	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147919219
11036	NC_009464	GAT	2	6	566092	566097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147919219
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11038	NC_009464	TCT	2	6	566121	566126	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147919219
11039	NC_009464	AAG	2	6	566163	566168	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147919219
11040	NC_009464	TC	3	6	566297	566302	0 %	50 %	0 %	50 %	147919220
11041	NC_009464	ATC	2	6	566303	566308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147919220
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11044	NC_009464	TCT	2	6	566397	566402	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147919220
11045	NC_009464	TGG	2	6	566489	566494	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147919220
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11049	NC_009464	CT	3	6	566715	566720	0 %	50 %	0 %	50 %	147919220
11050	NC_009464	TGA	2	6	566751	566756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147919220
11051	NC_009464	TCG	2	6	566777	566782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147919220
11052	NC_009464	GCTT	2	8	566793	566800	0 %	50 %	25 %	25 %	147919220
11053	NC_009464	CGA	2	6	566856	566861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147919220
11054	NC_009464	GCC	2	6	567195	567200	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11055	NC_009464	CTT	3	9	567217	567225	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11056	NC_009464	GAA	2	6	567299	567304	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147919221
11057	NC_009464	ACA	2	6	567412	567417	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	147919221
11058	NC_009464	T	6	6	567575	567580	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11059	NC_009464	CTC	2	6	567636	567641	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11060	NC_009464	TAC	2	6	567646	567651	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11061	NC_009464	CT	3	6	567668	567673	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11062	NC_009464	TC	3	6	567676	567681	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11063	NC_009464	TC	3	6	567693	567698	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11064	NC_009464	CA	3	6	567740	567745	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11065	NC_009464	A	6	6	567756	567761	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11066	NC_009464	AG	3	6	567813	567818	50 %	0 %	50 %	0 %	147919222
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11069	NC_009464	GGA	2	6	567853	567858	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	147919222
11070	NC_009464	ATC	2	6	567872	567877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147919222
11071	NC_009464	AG	4	8	568183	568190	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11072	NC_009464	TGA	2	6	568192	568197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11073	NC_009464	TGA	2	6	568220	568225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11074	NC_009464	GCC	2	6	568259	568264	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11075	NC_009464	AAT	2	6	568295	568300	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11076	NC_009464	CGA	2	6	568362	568367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11077	NC_009464	CAGCG	2	10	568412	568421	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
11078	NC_009464	GGCG	2	8	568470	568477	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
11079	NC_009464	TAA	2	6	568507	568512	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11080	NC_009464	ATT	2	6	568526	568531	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11081	NC_009464	GGC	2	6	568589	568594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11082	NC_009464	CGA	2	6	568599	568604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11084	NC_009464	GCCGTC	2	12	568659	568670	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	147919223
11085	NC_009464	GGCA	2	8	568684	568691	25 %	0 %	50 %	25 %	147919223
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11088	NC_009464	TCT	2	6	568972	568977	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147919223
11089	NC_009464	CGAT	2	8	569050	569057	25 %	25 %	25 %	25 %	147919223
11090	NC_009464	GCG	2	6	569084	569089	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147919223
11091	NC_009464	CGGGT	2	10	569295	569304	0 %	20 %	60 %	20 %	147919224
11092	NC_009464	CCG	2	6	569322	569327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147919224
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11094	NC_009464	CGCCGG	2	12	569422	569433	0 %	0 %	50 %	50 %	147919224
11095	NC_009464	ACG	2	6	569458	569463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147919224
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11098	NC_009464	CAG	2	6	569774	569779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147919224
11099	NC_009464	ACGA	2	8	569871	569878	50 %	0 %	25 %	25 %	147919224
11100	NC_009464	TTC	2	6	569940	569945	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147919224
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11102	NC_009464	CGT	2	6	569995	570000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147919224
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11104	NC_009464	CCG	2	6	570075	570080	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147919224
11105	NC_009464	TGA	2	6	570100	570105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147919224
11106	NC_009464	AT	4	8	570203	570210	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11107	NC_009464	CCG	2	6	570230	570235	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11108	NC_009464	TCT	2	6	570341	570346	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11109	NC_009464	ATG	2	6	570380	570385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11110	NC_009464	TGA	2	6	570451	570456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147919225
11111	NC_009464	TGTA	2	8	570525	570532	25 %	50 %	25 %	0 %	147919225
11112	NC_009464	CTA	2	6	570539	570544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147919225
11113	NC_009464	CGG	2	6	570554	570559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147919225
11114	NC_009464	TATC	2	8	570560	570567	25 %	50 %	0 %	25 %	147919225
11115	NC_009464	CGAGGT	2	12	570575	570586	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	147919225
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11118	NC_009464	CTT	2	6	570674	570679	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147919225
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11123	NC_009464	A	6	6	570903	570908	100 %	0 %	0 %	0 %	147919225
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11240	NC_009464	CTG	2	6	577340	577345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11243	NC_009464	CAGA	2	8	577470	577477	50 %	0 %	25 %	25 %	147919231
11244	NC_009464	GTG	2	6	577481	577486	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147919231
11245	NC_009464	CGC	2	6	577498	577503	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147919231
11246	NC_009464	AAG	2	6	577562	577567	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147919231
11247	NC_009464	CAGC	2	8	577801	577808	25 %	0 %	25 %	50 %	147919231
11248	NC_009464	TCG	2	6	577830	577835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147919231
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11261	NC_009464	ACCA	2	8	578333	578340	50 %	0 %	0 %	50 %	147919231
11262	NC_009464	GAGAG	2	10	578377	578386	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
11263	NC_009464	CAAA	2	8	578404	578411	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
11264	NC_009464	ATGG	2	8	578439	578446	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
11265	NC_009464	TCT	2	6	578459	578464	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11266	NC_009464	CTT	2	6	578496	578501	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11267	NC_009464	AGT	2	6	578522	578527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11270	NC_009464	TGG	2	6	578672	578677	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147919232
11271	NC_009464	CATG	2	8	578730	578737	25 %	25 %	25 %	25 %	147919232
11272	NC_009464	CGG	2	6	578738	578743	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147919232
11273	NC_009464	TCG	2	6	578825	578830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147919232
11274	NC_009464	CTG	2	6	578854	578859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147919232
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11280	NC_009464	CGT	2	6	579144	579149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147919232
11281	NC_009464	CAGG	2	8	579166	579173	25 %	0 %	50 %	25 %	147919232
11282	NC_009464	AAC	2	6	579199	579204	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	147919232
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11289	NC_009464	GGC	2	6	579547	579552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147919232
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11325	NC_009464	GTAAAA	2	12	581456	581467	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11326	NC_009464	A	6	6	581498	581503	100 %	0 %	0 %	0 %	147919235
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11330	NC_009464	GGA	2	6	581681	581686	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	147919235
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11334	NC_009464	CGT	2	6	581834	581839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147919235
11335	NC_009464	GAGCA	2	10	581903	581912	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
11336	NC_009464	TAG	2	6	581993	581998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147919236
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11338	NC_009464	GA	4	8	582094	582101	50 %	0 %	50 %	0 %	147919236
11339	NC_009464	CTGC	2	8	582187	582194	0 %	25 %	25 %	50 %	147919236
11340	NC_009464	CAG	2	6	582217	582222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11341	NC_009464	CAA	2	6	582237	582242	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	147919237
11342	NC_009464	GA	4	8	582304	582311	50 %	0 %	50 %	0 %	147919237
11343	NC_009464	CTGC	2	8	582397	582404	0 %	25 %	25 %	50 %	147919237
11344	NC_009464	AAT	2	6	582439	582444	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	147919237
11345	NC_009464	GA	4	8	582496	582503	50 %	0 %	50 %	0 %	147919237
11346	NC_009464	CTGC	2	8	582589	582596	0 %	25 %	25 %	50 %	147919237
11347	NC_009464	TTCTTT	2	12	582663	582674	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	147919237
11348	NC_009464	ATT	2	6	582696	582701	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	147919237
11349	NC_009464	TGC	2	6	582705	582710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147919237
11350	NC_009464	TAA	2	6	582728	582733	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11351	NC_009464	ATC	2	6	583052	583057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147919238
11352	NC_009464	CAT	2	6	583093	583098	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147919238
11353	NC_009464	AGC	2	6	583131	583136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147919238
11354	NC_009464	CA	3	6	583155	583160	50 %	0 %	0 %	50 %	147919238
11355	NC_009464	CAA	2	6	583243	583248	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	147919238
11356	NC_009464	ACT	2	6	583296	583301	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147919238
11357	NC_009464	CGA	2	6	583330	583335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147919238
11358	NC_009464	CTG	2	6	583400	583405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147919238
11359	NC_009464	GGC	2	6	583528	583533	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147919238
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11361	NC_009464	GCG	2	6	583597	583602	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147919238
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11479	NC_009464	AGC	2	6	589412	589417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147919244
11480	NC_009464	GTGAG	2	10	589430	589439	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
11481	NC_009464	CGCTG	2	10	589453	589462	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
11482	NC_009464	GA	3	6	589487	589492	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11483	NC_009464	CGCTG	2	10	589505	589514	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
11484	NC_009464	GAT	2	6	589577	589582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11485	NC_009464	GATTC	2	10	589587	589596	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
11486	NC_009464	A	7	7	589608	589614	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11487	NC_009464	AAT	3	9	589650	589658	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11488	NC_009464	AGT	2	6	589681	589686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11489	NC_009464	AATC	2	8	589717	589724	50 %	25 %	0 %	25 %	147919245
11490	NC_009464	GAG	2	6	589743	589748	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	147919245
11491	NC_009464	CAGCG	2	10	589754	589763	20 %	0 %	40 %	40 %	147919245
11492	NC_009464	CA	3	6	589780	589785	50 %	0 %	0 %	50 %	147919245
11493	NC_009464	AG	3	6	589798	589803	50 %	0 %	50 %	0 %	147919245
11494	NC_009464	CAGCG	2	10	589830	589839	20 %	0 %	40 %	40 %	147919245
11495	NC_009464	GCC	2	6	589880	589885	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147919245
11496	NC_009464	CCCG	2	8	589910	589917	0 %	0 %	25 %	75 %	147919245
11497	NC_009464	CTG	2	6	590058	590063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11498	NC_009464	CAT	2	6	590066	590071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11499	NC_009464	TTC	2	6	590103	590108	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147919246
11500	NC_009464	TGCCGC	2	12	590158	590169	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	147919246

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