MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanocella arvoryzae MRE50 chromosome

Total Repeats: 63788

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_009464	ATGT	2	8	515367	515374	25 %	50 %	25 %	0 %	147919168
10002	NC_009464	CTGC	2	8	515426	515433	0 %	25 %	25 %	50 %	147919168
10003	NC_009464	GGC	2	6	515495	515500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147919168
10004	NC_009464	ATG	2	6	515529	515534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147919168
10005	NC_009464	GAC	2	6	515618	515623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147919168
10006	NC_009464	CCA	2	6	515632	515637	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147919168
10007	NC_009464	TCT	2	6	515688	515693	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10008	NC_009464	CGC	2	6	515694	515699	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10009	NC_009464	TAA	2	6	515710	515715	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10010	NC_009464	TAA	2	6	515726	515731	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10011	NC_009464	GGC	2	6	515746	515751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10012	NC_009464	GAT	2	6	515802	515807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147919169
10013	NC_009464	CGA	2	6	515817	515822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147919169
10014	NC_009464	A	6	6	515824	515829	100 %	0 %	0 %	0 %	147919169
10015	NC_009464	AAG	2	6	515899	515904	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147919169
10016	NC_009464	ACG	2	6	515999	516004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147919169
10017	NC_009464	GCT	2	6	516157	516162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147919169
10018	NC_009464	TGC	2	6	516176	516181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147919169
10019	NC_009464	GTC	3	9	516238	516246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147919169
10020	NC_009464	CGGA	2	8	516263	516270	25 %	0 %	50 %	25 %	147919169
10021	NC_009464	GCTT	2	8	516321	516328	0 %	50 %	25 %	25 %	147919169
10022	NC_009464	GCC	2	6	516340	516345	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147919169
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10034	NC_009464	CTG	3	9	517072	517080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147919169
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10038	NC_009464	GGC	2	6	517379	517384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10039	NC_009464	AAG	2	6	517387	517392	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147919170
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10041	NC_009464	TGAGT	2	10	517529	517538	20 %	40 %	40 %	0 %	147919170
10042	NC_009464	T	7	7	517659	517665	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10045	NC_009464	CGC	2	6	517739	517744	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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10052	NC_009464	CGTCGG	2	12	518268	518279	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	147919171
10053	NC_009464	CCG	2	6	518291	518296	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147919171
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10055	NC_009464	TAG	2	6	518339	518344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147919171
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10057	NC_009464	CCAG	2	8	518460	518467	25 %	0 %	25 %	50 %	147919171
10058	NC_009464	ATC	2	6	518539	518544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147919171
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10061	NC_009464	CTG	2	6	518652	518657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10062	NC_009464	TA	3	6	518728	518733	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10063	NC_009464	CTGT	2	8	518737	518744	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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10093	NC_009464	CCA	2	6	520299	520304	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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10112	NC_009464	TG	3	6	521408	521413	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10113	NC_009464	TTA	2	6	521462	521467	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	147919174
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10121	NC_009464	ATCT	2	8	521807	521814	25 %	50 %	0 %	25 %	147919174
10122	NC_009464	CGGC	2	8	521824	521831	0 %	0 %	50 %	50 %	147919174
10123	NC_009464	TCA	2	6	521832	521837	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147919174
10124	NC_009464	CCCG	2	8	521851	521858	0 %	0 %	25 %	75 %	147919174
10125	NC_009464	CTG	2	6	521933	521938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147919174
10126	NC_009464	GCC	2	6	522004	522009	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147919174
10127	NC_009464	CCGC	2	8	522010	522017	0 %	0 %	25 %	75 %	147919174
10128	NC_009464	AT	3	6	522048	522053	50 %	50 %	0 %	0 %	147919174
10129	NC_009464	GAT	2	6	522118	522123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147919174
10130	NC_009464	CGCC	2	8	522166	522173	0 %	0 %	25 %	75 %	147919174
10131	NC_009464	ATA	2	6	522197	522202	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	147919174
10132	NC_009464	TCCC	2	8	522267	522274	0 %	25 %	0 %	75 %	147919174
10133	NC_009464	GGC	2	6	522326	522331	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147919174
10134	NC_009464	AGC	2	6	522410	522415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147919174
10135	NC_009464	TAC	3	9	522419	522427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147919174
10136	NC_009464	CGG	2	6	522481	522486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147919174
10137	NC_009464	GCAG	2	8	522500	522507	25 %	0 %	50 %	25 %	147919174
10138	NC_009464	AAC	2	6	522620	522625	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	147919174
10139	NC_009464	GCTC	2	8	522660	522667	0 %	25 %	25 %	50 %	147919174
10140	NC_009464	A	6	6	522687	522692	100 %	0 %	0 %	0 %	147919174
10141	NC_009464	TCTAC	2	10	522693	522702	20 %	40 %	0 %	40 %	147919174
10142	NC_009464	AC	3	6	522851	522856	50 %	0 %	0 %	50 %	147919174
10143	NC_009464	ATC	2	6	522857	522862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147919174
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10145	NC_009464	GACC	2	8	523036	523043	25 %	0 %	25 %	50 %	147919174
10146	NC_009464	CTG	2	6	523076	523081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147919174
10147	NC_009464	TGC	2	6	523083	523088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147919174
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10149	NC_009464	CTT	2	6	523386	523391	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10150	NC_009464	T	6	6	523397	523402	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10151	NC_009464	AT	3	6	523409	523414	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10152	NC_009464	CGC	3	9	523451	523459	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147919175
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10164	NC_009464	ACT	2	6	523975	523980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147919175
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10186	NC_009464	CAC	2	6	524960	524965	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10187	NC_009464	TATC	2	8	525046	525053	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10188	NC_009464	TGAT	2	8	525057	525064	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
10189	NC_009464	A	6	6	525164	525169	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10227	NC_009464	ACG	2	6	526561	526566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147919179
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10230	NC_009464	GCCC	2	8	526706	526713	0 %	0 %	25 %	75 %	147919179
10231	NC_009464	AGA	2	6	526753	526758	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10232	NC_009464	TTA	2	6	526785	526790	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10233	NC_009464	CA	3	6	526794	526799	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10234	NC_009464	CGCTG	2	10	526885	526894	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
10235	NC_009464	CGCTG	2	10	526960	526969	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
10236	NC_009464	CGCTG	2	10	527035	527044	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
10237	NC_009464	CGCTG	2	10	527110	527119	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
10238	NC_009464	CGCTG	2	10	527185	527194	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
10239	NC_009464	CGCTG	2	10	527260	527269	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
10240	NC_009464	CA	3	6	527278	527283	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10241	NC_009464	CTG	2	6	527319	527324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10242	NC_009464	TAC	2	6	527336	527341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10243	NC_009464	ATT	2	6	527418	527423	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10244	NC_009464	T	6	6	527422	527427	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10245	NC_009464	ATCG	2	8	527460	527467	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10246	NC_009464	CAGCG	2	10	527516	527525	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
10247	NC_009464	GA	3	6	527542	527547	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10248	NC_009464	ACA	2	6	527554	527559	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10249	NC_009464	CAT	2	6	527658	527663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147919180
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10272	NC_009464	CTA	2	6	529011	529016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10274	NC_009464	ATCC	2	8	529040	529047	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
10275	NC_009464	ATCC	2	8	529159	529166	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
10276	NC_009464	TACC	3	12	529192	529203	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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10281	NC_009464	TTATT	2	10	529309	529318	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
10282	NC_009464	GT	3	6	529559	529564	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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10481	NC_009464	CGAC	2	8	539339	539346	25 %	0 %	25 %	50 %	147919193
10482	NC_009464	ATACG	2	10	539598	539607	40 %	20 %	20 %	20 %	147919194
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