MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanocella arvoryzae MRE50 chromosome

Total Repeats: 63788

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_009464	ACT	2	6	340036	340041	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147919002
6502	NC_009464	CTC	2	6	340101	340106	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	147919002
6503	NC_009464	GAA	2	6	340109	340114	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147919002
6504	NC_009464	GCCG	2	8	340127	340134	0 %	0 %	50 %	50 %	147919002
6505	NC_009464	AAC	3	9	340188	340196	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	147919002
6506	NC_009464	CGCCGA	2	12	340267	340278	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	147919002
6507	NC_009464	TACCCG	2	12	340431	340442	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	147919002
6508	NC_009464	AACCCG	2	12	340446	340457	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	147919002
6509	NC_009464	TACCCG	2	12	340503	340514	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	147919002
6510	NC_009464	AGT	2	6	340634	340639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6511	NC_009464	ATT	2	6	340712	340717	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6512	NC_009464	AGAT	2	8	340762	340769	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6513	NC_009464	ATG	2	6	340771	340776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147919003
6514	NC_009464	GAA	2	6	340780	340785	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147919003
6515	NC_009464	CAT	2	6	340803	340808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147919003
6516	NC_009464	TAC	2	6	340861	340866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147919003
6517	NC_009464	CGA	2	6	340902	340907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147919003
6518	NC_009464	CCA	2	6	340929	340934	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147919003
6519	NC_009464	AG	4	8	340982	340989	50 %	0 %	50 %	0 %	147919003
6520	NC_009464	TCGA	2	8	341026	341033	25 %	25 %	25 %	25 %	147919003
6521	NC_009464	ATG	2	6	341165	341170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147919003
6522	NC_009464	GA	3	6	341269	341274	50 %	0 %	50 %	0 %	147919003
6523	NC_009464	CGC	2	6	341285	341290	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147919003
6524	NC_009464	CGC	2	6	341408	341413	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6525	NC_009464	CGT	2	6	341488	341493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147919004
6526	NC_009464	ATG	2	6	341550	341555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147919004
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6528	NC_009464	TGA	2	6	341722	341727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147919004
6529	NC_009464	TAG	2	6	341760	341765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147919004
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6532	NC_009464	GCG	2	6	341817	341822	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147919004
6533	NC_009464	ACCTT	2	10	341835	341844	20 %	40 %	0 %	40 %	147919004
6534	NC_009464	TCGCC	2	10	341860	341869	0 %	20 %	20 %	60 %	147919004
6535	NC_009464	GTT	2	6	341894	341899	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	147919004
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6537	NC_009464	AGT	2	6	341971	341976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147919004
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6539	NC_009464	GC	3	6	342139	342144	0 %	0 %	50 %	50 %	147919004
6540	NC_009464	ATC	2	6	342162	342167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147919004
6541	NC_009464	GAA	2	6	342192	342197	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147919004
6542	NC_009464	CGT	2	6	342235	342240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147919004
6543	NC_009464	CTGGC	2	10	342257	342266	0 %	20 %	40 %	40 %	147919004
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6546	NC_009464	GCTC	2	8	342374	342381	0 %	25 %	25 %	50 %	147919004
6547	NC_009464	GTAGGC	3	18	342468	342485	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	147919004
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6549	NC_009464	AATG	2	8	342598	342605	50 %	25 %	25 %	0 %	147919004
6550	NC_009464	AGG	2	6	342667	342672	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	147919004
6551	NC_009464	GAG	2	6	342800	342805	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	147919004
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6553	NC_009464	ATA	2	6	342874	342879	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6554	NC_009464	TTG	2	6	342881	342886	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6555	NC_009464	AT	3	6	342888	342893	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6556	NC_009464	TA	3	6	343015	343020	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6557	NC_009464	ATA	2	6	343025	343030	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6558	NC_009464	TAA	2	6	343033	343038	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6559	NC_009464	TAAT	2	8	343044	343051	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6560	NC_009464	GTA	2	6	343062	343067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147919005
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6562	NC_009464	GAA	2	6	343109	343114	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147919005
6563	NC_009464	GAG	2	6	343158	343163	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	147919005
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6606	NC_009464	AT	3	6	345799	345804	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6607	NC_009464	ATAA	2	8	345813	345820	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6608	NC_009464	AAAT	2	8	345853	345860	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6609	NC_009464	GCCA	2	8	345920	345927	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6610	NC_009464	A	6	6	345930	345935	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6611	NC_009464	TATG	2	8	345987	345994	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6612	NC_009464	ATAA	2	8	346010	346017	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6613	NC_009464	AT	3	6	346025	346030	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6615	NC_009464	CGT	2	6	346063	346068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147919007
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6622	NC_009464	AT	3	6	346673	346678	50 %	50 %	0 %	0 %	147919007
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6998	NC_009464	TCCG	2	8	366964	366971	0 %	25 %	25 %	50 %	147919024
6999	NC_009464	GC	3	6	366987	366992	0 %	0 %	50 %	50 %	147919024
7000	NC_009464	TTC	2	6	366993	366998	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147919024

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