MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanocella arvoryzae MRE50 chromosome

Total Repeats: 63788

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
61001	NC_009464	AAGA	2	8	3034388	3034395	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
61002	NC_009464	CGT	2	6	3034503	3034508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147921634
61003	NC_009464	AGA	2	6	3034529	3034534	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147921634
61004	NC_009464	CCG	2	6	3034544	3034549	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147921634
61005	NC_009464	CTA	2	6	3034560	3034565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147921634
61006	NC_009464	GCA	2	6	3034581	3034586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147921634
61007	NC_009464	CGA	2	6	3034733	3034738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147921634
61008	NC_009464	AAGA	2	8	3034843	3034850	75 %	0 %	25 %	0 %	147921634
61009	NC_009464	TC	3	6	3034987	3034992	0 %	50 %	0 %	50 %	147921634
61010	NC_009464	CAT	2	6	3035079	3035084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147921634
61011	NC_009464	GCC	2	6	3035098	3035103	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147921634
61012	NC_009464	GCG	2	6	3035117	3035122	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147921634
61013	NC_009464	GCT	2	6	3035124	3035129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147921634
61014	NC_009464	GTC	2	6	3035155	3035160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147921634
61015	NC_009464	ATC	2	6	3035254	3035259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147921634
61016	NC_009464	GTA	2	6	3035335	3035340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147921634
61017	NC_009464	TCA	2	6	3035447	3035452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147921634
61018	NC_009464	CGA	2	6	3035541	3035546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147921634
61019	NC_009464	CAC	2	6	3035562	3035567	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147921634
61020	NC_009464	CGG	2	6	3035572	3035577	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147921634
61021	NC_009464	ATC	2	6	3035578	3035583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147921634
61022	NC_009464	TCA	2	6	3035588	3035593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147921634
61023	NC_009464	ATC	2	6	3035641	3035646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147921634
61024	NC_009464	CGC	2	6	3035694	3035699	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147921634
61025	NC_009464	CTA	2	6	3035748	3035753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147921634
61026	NC_009464	CTT	2	6	3035918	3035923	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61027	NC_009464	GAA	2	6	3036054	3036059	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147921635
61028	NC_009464	AGC	2	6	3036070	3036075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147921635
61029	NC_009464	GCT	2	6	3036173	3036178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147921635
61030	NC_009464	TGA	2	6	3036211	3036216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147921635
61031	NC_009464	AGC	2	6	3036259	3036264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147921635
61032	NC_009464	AAG	3	9	3036273	3036281	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147921635
61033	NC_009464	CGG	2	6	3036284	3036289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147921635
61034	NC_009464	A	6	6	3036302	3036307	100 %	0 %	0 %	0 %	147921635
61035	NC_009464	CGA	2	6	3036323	3036328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147921635
61036	NC_009464	TTC	2	6	3036354	3036359	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147921635
61037	NC_009464	AGA	2	6	3036368	3036373	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147921635
61038	NC_009464	TCA	2	6	3036394	3036399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147921635
61039	NC_009464	AGC	2	6	3036534	3036539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147921635
61040	NC_009464	GA	3	6	3036588	3036593	50 %	0 %	50 %	0 %	147921635
61041	NC_009464	CTT	2	6	3036623	3036628	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147921635
61042	NC_009464	T	6	6	3036627	3036632	0 %	100 %	0 %	0 %	147921635
61043	NC_009464	GCC	2	6	3036688	3036693	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147921635
61044	NC_009464	GGC	2	6	3036698	3036703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
61045	NC_009464	TGCCT	2	10	3036748	3036757	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
61046	NC_009464	TTA	2	6	3036852	3036857	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61047	NC_009464	GTG	2	6	3037028	3037033	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
61048	NC_009464	A	6	6	3037178	3037183	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
61049	NC_009464	CTCAT	2	10	3037238	3037247	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
61050	NC_009464	ACGCTG	2	12	3037328	3037339	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61051	NC_009464	T	6	6	3037416	3037421	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
61052	NC_009464	TAAT	2	8	3037494	3037501	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61053	NC_009464	TATT	2	8	3037511	3037518	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
61054	NC_009464	ACAT	2	8	3037570	3037577	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
61055	NC_009464	CTGT	2	8	3037624	3037631	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
61056	NC_009464	GTC	2	6	3037645	3037650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61057	NC_009464	GCC	2	6	3037661	3037666	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
61058	NC_009464	GCCAAG	2	12	3037684	3037695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147921636
61059	NC_009464	TA	3	6	3037717	3037722	50 %	50 %	0 %	0 %	147921636
61060	NC_009464	GTG	2	6	3037777	3037782	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147921636
61061	NC_009464	CTA	3	9	3037827	3037835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147921636
61062	NC_009464	GA	3	6	3037855	3037860	50 %	0 %	50 %	0 %	147921636
61063	NC_009464	CAG	2	6	3037870	3037875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147921636
61064	NC_009464	GAG	2	6	3037915	3037920	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	147921636
61065	NC_009464	GAG	2	6	3037978	3037983	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	147921636
61066	NC_009464	GCC	2	6	3037987	3037992	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147921636
61067	NC_009464	GCC	2	6	3037999	3038004	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147921636
61068	NC_009464	TCC	2	6	3038006	3038011	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	147921636
61069	NC_009464	AAG	2	6	3038059	3038064	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147921636
61070	NC_009464	ATAG	2	8	3038081	3038088	50 %	25 %	25 %	0 %	147921636
61071	NC_009464	ATC	2	6	3038168	3038173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147921636
61072	NC_009464	GCG	2	6	3038229	3038234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147921636
61073	NC_009464	AC	3	6	3038288	3038293	50 %	0 %	0 %	50 %	147921636
61074	NC_009464	ATA	2	6	3038337	3038342	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	147921636
61075	NC_009464	CCG	2	6	3038373	3038378	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147921637
61076	NC_009464	TAC	2	6	3038439	3038444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147921637
61077	NC_009464	TGC	2	6	3038451	3038456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147921637
61078	NC_009464	TCC	2	6	3038479	3038484	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	147921637
61079	NC_009464	GAA	3	9	3038572	3038580	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147921637
61080	NC_009464	CAG	2	6	3038601	3038606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147921637
61081	NC_009464	TTCGA	2	10	3038654	3038663	20 %	40 %	20 %	20 %	147921637
61082	NC_009464	GTT	3	9	3038756	3038764	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	147921637
61083	NC_009464	ACG	2	6	3038831	3038836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147921637
61084	NC_009464	TGT	2	6	3038854	3038859	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	147921637
61085	NC_009464	TCA	2	6	3038874	3038879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147921637
61086	NC_009464	AATC	2	8	3038915	3038922	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
61087	NC_009464	AT	3	6	3038929	3038934	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61088	NC_009464	TCA	2	6	3038947	3038952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61089	NC_009464	CCA	2	6	3039070	3039075	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
61090	NC_009464	TAC	2	6	3039134	3039139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61091	NC_009464	TAA	2	6	3039213	3039218	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61092	NC_009464	ATC	2	6	3039311	3039316	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147921638
61093	NC_009464	CAT	2	6	3039448	3039453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147921638
61094	NC_009464	GAC	2	6	3039470	3039475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147921638
61095	NC_009464	TCG	2	6	3039501	3039506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147921638
61096	NC_009464	CGA	2	6	3039559	3039564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147921638
61097	NC_009464	CGT	2	6	3039589	3039594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147921638
61098	NC_009464	TAA	2	6	3039725	3039730	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61099	NC_009464	A	7	7	3039729	3039735	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
61100	NC_009464	CGC	2	6	3039751	3039756	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
61101	NC_009464	CTG	2	6	3039837	3039842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147921639
61102	NC_009464	GTT	2	6	3039843	3039848	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	147921639
61103	NC_009464	TCG	2	6	3039959	3039964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147921639
61104	NC_009464	GAC	2	6	3039993	3039998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147921639
61105	NC_009464	CTT	2	6	3040044	3040049	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147921639
61106	NC_009464	GCT	2	6	3040109	3040114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147921639
61107	NC_009464	AGA	2	6	3040178	3040183	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147921639
61108	NC_009464	TGG	2	6	3040207	3040212	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147921639
61109	NC_009464	TC	3	6	3040316	3040321	0 %	50 %	0 %	50 %	147921639
61110	NC_009464	GTC	2	6	3040371	3040376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147921639
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61112	NC_009464	CGG	2	6	3040455	3040460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147921639
61113	NC_009464	CT	3	6	3040478	3040483	0 %	50 %	0 %	50 %	147921639
61114	NC_009464	CAG	2	6	3040488	3040493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147921639
61115	NC_009464	CAG	2	6	3040524	3040529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147921639
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61117	NC_009464	GTC	2	6	3040713	3040718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147921639
61118	NC_009464	GTA	2	6	3040743	3040748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147921639
61119	NC_009464	CT	3	6	3040765	3040770	0 %	50 %	0 %	50 %	147921639
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61122	NC_009464	GTC	2	6	3040953	3040958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147921639
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61224	NC_009464	TAG	2	6	3047054	3047059	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147921647
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61469	NC_009464	ATG	2	6	3059830	3059835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147921660
61470	NC_009464	TAATAC	2	12	3059849	3059860	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	147921660
61471	NC_009464	CTG	2	6	3059900	3059905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147921660
61472	NC_009464	GCA	2	6	3059963	3059968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147921660
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61477	NC_009464	TTAC	2	8	3060293	3060300	25 %	50 %	0 %	25 %	147921660
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61481	NC_009464	GCCAG	2	10	3060660	3060669	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
61482	NC_009464	CCTG	2	8	3060679	3060686	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
61483	NC_009464	TA	3	6	3060692	3060697	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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61497	NC_009464	TCG	2	6	3061288	3061293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147921661
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