MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanocella arvoryzae MRE50 chromosome

Total Repeats: 63788

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
58001	NC_009464	GCAGA	2	10	2878031	2878040	40 %	0 %	40 %	20 %	147921486
58002	NC_009464	CAA	2	6	2878060	2878065	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	147921486
58003	NC_009464	CAA	2	6	2878075	2878080	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	147921486
58004	NC_009464	T	7	7	2878153	2878159	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
58005	NC_009464	ATA	2	6	2878182	2878187	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58006	NC_009464	TAT	2	6	2878188	2878193	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58007	NC_009464	CCG	2	6	2878340	2878345	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
58008	NC_009464	TTA	2	6	2878405	2878410	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58009	NC_009464	TTTTA	2	10	2878416	2878425	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
58010	NC_009464	ATA	3	9	2878495	2878503	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58011	NC_009464	TATT	2	8	2878504	2878511	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
58012	NC_009464	AGC	2	6	2878580	2878585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147921487
58013	NC_009464	CGG	2	6	2878643	2878648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147921487
58014	NC_009464	GAG	2	6	2878693	2878698	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	147921487
58015	NC_009464	ATTGC	2	10	2878744	2878753	20 %	40 %	20 %	20 %	147921487
58016	NC_009464	CAG	2	6	2878818	2878823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147921487
58017	NC_009464	GAT	2	6	2878982	2878987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147921487
58018	NC_009464	ACC	2	6	2878998	2879003	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147921487
58019	NC_009464	AGC	2	6	2879027	2879032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147921487
58020	NC_009464	CTG	2	6	2879038	2879043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147921487
58021	NC_009464	CCAG	2	8	2879203	2879210	25 %	0 %	25 %	50 %	147921487
58022	NC_009464	CCGC	2	8	2879228	2879235	0 %	0 %	25 %	75 %	147921487
58023	NC_009464	ACG	2	6	2879277	2879282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147921487
58024	NC_009464	CAG	2	6	2879309	2879314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58025	NC_009464	GAT	2	6	2879348	2879353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58026	NC_009464	CT	3	6	2879368	2879373	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
58027	NC_009464	CCT	2	6	2879412	2879417	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
58028	NC_009464	CTA	2	6	2879449	2879454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58029	NC_009464	TAT	2	6	2879478	2879483	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58030	NC_009464	A	6	6	2879493	2879498	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58031	NC_009464	TAGT	2	8	2879518	2879525	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
58032	NC_009464	TTAT	2	8	2879530	2879537	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
58033	NC_009464	T	7	7	2879541	2879547	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
58034	NC_009464	ATA	2	6	2879582	2879587	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	147921488
58035	NC_009464	TATT	2	8	2879588	2879595	25 %	75 %	0 %	0 %	147921488
58036	NC_009464	TGCTC	2	10	2879665	2879674	0 %	40 %	20 %	40 %	147921488
58037	NC_009464	GCA	2	6	2879771	2879776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147921488
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58040	NC_009464	TTA	2	6	2879911	2879916	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	147921488
58041	NC_009464	ACG	2	6	2879964	2879969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147921488
58042	NC_009464	CTG	2	6	2879976	2879981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147921488
58043	NC_009464	CAC	2	6	2880133	2880138	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147921488
58044	NC_009464	GGA	2	6	2880161	2880166	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	147921488
58045	NC_009464	GT	3	6	2880210	2880215	0 %	50 %	50 %	0 %	147921488
58046	NC_009464	GCA	2	6	2880219	2880224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147921488
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58048	NC_009464	G	6	6	2880281	2880286	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
58049	NC_009464	CGG	2	6	2880320	2880325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147921489
58050	NC_009464	ACT	2	6	2880331	2880336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147921489
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58052	NC_009464	TTC	2	6	2880361	2880366	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147921489
58053	NC_009464	CTG	2	6	2880388	2880393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147921489
58054	NC_009464	TCA	2	6	2880407	2880412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147921489
58055	NC_009464	TAG	2	6	2880419	2880424	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147921489
58056	NC_009464	TCA	2	6	2880425	2880430	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147921489
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58060	NC_009464	CTG	2	6	2880646	2880651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147921489
58061	NC_009464	GGC	2	6	2880652	2880657	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147921489
58062	NC_009464	GAC	2	6	2880691	2880696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147921489
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58071	NC_009464	AG	3	6	2881497	2881502	50 %	0 %	50 %	0 %	147921490
58072	NC_009464	CGA	2	6	2881674	2881679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147921490
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58103	NC_009464	G	6	6	2883059	2883064	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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58106	NC_009464	T	6	6	2883155	2883160	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
58107	NC_009464	ATT	2	6	2883188	2883193	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	147921494
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58112	NC_009464	ATC	2	6	2883518	2883523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147921495
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58137	NC_009464	CCCG	2	8	2884779	2884786	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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58215	NC_009464	ATC	2	6	2888747	2888752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147921500
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58218	NC_009464	CGA	2	6	2888907	2888912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147921500
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58221	NC_009464	GA	3	6	2889052	2889057	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
58222	NC_009464	TAA	3	9	2889093	2889101	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	147921501
58223	NC_009464	CGG	2	6	2889127	2889132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147921501
58224	NC_009464	TCG	2	6	2889183	2889188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147921501
58225	NC_009464	GATCCA	2	12	2889217	2889228	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	147921501
58226	NC_009464	CGA	2	6	2889289	2889294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147921501
58227	NC_009464	TCA	2	6	2889540	2889545	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147921501
58228	NC_009464	GCA	2	6	2889550	2889555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147921501
58229	NC_009464	CAT	2	6	2889559	2889564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147921501
58230	NC_009464	TCG	2	6	2889576	2889581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147921501
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58465	NC_009464	CTC	2	6	2901586	2901591	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	147921511
58466	NC_009464	ATC	2	6	2901596	2901601	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147921511
58467	NC_009464	GCC	2	6	2901653	2901658	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147921511
58468	NC_009464	CAC	2	6	2901664	2901669	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147921511
58469	NC_009464	GTC	2	6	2901704	2901709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147921511
58470	NC_009464	CGC	2	6	2901724	2901729	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147921511
58471	NC_009464	CAT	2	6	2901784	2901789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147921511
58472	NC_009464	CCG	2	6	2901818	2901823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147921511
58473	NC_009464	ATCG	2	8	2901827	2901834	25 %	25 %	25 %	25 %	147921511
58474	NC_009464	CCAG	2	8	2901862	2901869	25 %	0 %	25 %	50 %	147921511
58475	NC_009464	GGC	2	6	2901874	2901879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147921511
58476	NC_009464	GGC	2	6	2901917	2901922	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147921511
58477	NC_009464	AGCATC	2	12	2901950	2901961	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	147921511
58478	NC_009464	ATTG	2	8	2902099	2902106	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
58479	NC_009464	CGCTG	2	10	2902136	2902145	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
58480	NC_009464	ATT	2	6	2902154	2902159	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58481	NC_009464	TG	3	6	2902187	2902192	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
58482	NC_009464	CGCTG	2	10	2902211	2902220	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
58483	NC_009464	CA	3	6	2902229	2902234	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
58484	NC_009464	GATT	2	8	2902250	2902257	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
58485	NC_009464	CTG	2	6	2902270	2902275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58486	NC_009464	TAC	2	6	2902286	2902291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58487	NC_009464	TAT	3	9	2902314	2902322	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58488	NC_009464	T	6	6	2902364	2902369	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
58489	NC_009464	ATC	2	6	2902387	2902392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58490	NC_009464	ATC	2	6	2902444	2902449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58491	NC_009464	CAT	2	6	2902458	2902463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58492	NC_009464	TG	3	6	2902474	2902479	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
58493	NC_009464	CAGCG	2	10	2902488	2902497	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
58494	NC_009464	CAC	2	6	2902514	2902519	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
58495	NC_009464	CAGCG	2	10	2902542	2902551	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
58496	NC_009464	ATT	2	6	2902558	2902563	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58497	NC_009464	A	6	6	2902564	2902569	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58498	NC_009464	AAG	2	6	2902578	2902583	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147921512
58499	NC_009464	TGA	2	6	2902608	2902613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147921512
58500	NC_009464	TGA	2	6	2902620	2902625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147921512

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