MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanocella arvoryzae MRE50 chromosome

Total Repeats: 63788

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
57001	NC_009464	T	6	6	2827062	2827067	0 %	100 %	0 %	0 %	147921438
57002	NC_009464	AAT	2	6	2827104	2827109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	147921438
57003	NC_009464	TGG	2	6	2827217	2827222	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147921438
57004	NC_009464	CATT	2	8	2827228	2827235	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
57005	NC_009464	CAG	2	6	2827309	2827314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57006	NC_009464	AAGA	2	8	2827363	2827370	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
57007	NC_009464	TTC	2	6	2827389	2827394	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57008	NC_009464	GGCAG	2	10	2827428	2827437	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
57009	NC_009464	ATGG	2	8	2827441	2827448	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
57010	NC_009464	ATCT	2	8	2827468	2827475	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
57011	NC_009464	GGC	2	6	2827504	2827509	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
57012	NC_009464	GTT	2	6	2827562	2827567	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57013	NC_009464	TA	4	8	2827772	2827779	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57014	NC_009464	TA	3	6	2827808	2827813	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57015	NC_009464	CGAA	2	8	2827914	2827921	50 %	0 %	25 %	25 %	147921439
57016	NC_009464	CGA	2	6	2827924	2827929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147921439
57017	NC_009464	CGCC	2	8	2827933	2827940	0 %	0 %	25 %	75 %	147921439
57018	NC_009464	GGA	2	6	2827954	2827959	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	147921439
57019	NC_009464	CGT	2	6	2828035	2828040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147921439
57020	NC_009464	AAG	2	6	2828117	2828122	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147921439
57021	NC_009464	GAT	2	6	2828155	2828160	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147921439
57022	NC_009464	GAT	2	6	2828251	2828256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147921439
57023	NC_009464	GGA	2	6	2828269	2828274	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	147921439
57024	NC_009464	GAG	2	6	2828279	2828284	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	147921439
57025	NC_009464	CGA	2	6	2828296	2828301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147921439
57026	NC_009464	GAAAGT	2	12	2828347	2828358	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	147921439
57027	NC_009464	GCG	2	6	2828424	2828429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147921440
57028	NC_009464	GGC	2	6	2828439	2828444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147921440
57029	NC_009464	TCA	2	6	2828452	2828457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147921440
57030	NC_009464	GGT	2	6	2828492	2828497	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147921440
57031	NC_009464	GCC	2	6	2828535	2828540	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147921440
57032	NC_009464	CAT	2	6	2828573	2828578	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147921440
57033	NC_009464	AAG	2	6	2828628	2828633	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147921440
57034	NC_009464	AGA	2	6	2828668	2828673	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147921440
57035	NC_009464	TCA	2	6	2828722	2828727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147921440
57036	NC_009464	TCC	2	6	2828800	2828805	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	147921440
57037	NC_009464	TCA	2	6	2828809	2828814	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147921440
57038	NC_009464	AAG	2	6	2828853	2828858	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147921440
57039	NC_009464	AGA	2	6	2828866	2828871	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147921440
57040	NC_009464	GCG	2	6	2828890	2828895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147921440
57041	NC_009464	CAT	2	6	2828912	2828917	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147921440
57042	NC_009464	GGC	2	6	2828973	2828978	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147921440
57043	NC_009464	ACA	2	6	2828989	2828994	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	147921440
57044	NC_009464	ATC	2	6	2828997	2829002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147921440
57045	NC_009464	GCCA	2	8	2829012	2829019	25 %	0 %	25 %	50 %	147921440
57046	NC_009464	AAG	2	6	2829024	2829029	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147921440
57047	NC_009464	TCA	2	6	2829145	2829150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147921440
57048	NC_009464	ATG	2	6	2829183	2829188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147921440
57049	NC_009464	GTC	2	6	2829225	2829230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147921440
57050	NC_009464	ATC	2	6	2829300	2829305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147921440
57051	NC_009464	CGG	2	6	2829311	2829316	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147921440
57052	NC_009464	CAT	3	9	2829332	2829340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147921440
57053	NC_009464	AAG	2	6	2829351	2829356	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147921440
57054	NC_009464	TTC	2	6	2829357	2829362	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147921440
57055	NC_009464	GCG	2	6	2829427	2829432	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147921440
57056	NC_009464	CTG	3	9	2829456	2829464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147921440
57057	NC_009464	CGA	2	6	2829547	2829552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147921440
57058	NC_009464	CGG	2	6	2829574	2829579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147921440
57059	NC_009464	ACA	2	6	2829640	2829645	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	147921440
57060	NC_009464	AGA	2	6	2829863	2829868	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147921440
57061	NC_009464	AAG	2	6	2829876	2829881	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147921440
57062	NC_009464	AGA	2	6	2830018	2830023	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147921440
57063	NC_009464	CCG	2	6	2830054	2830059	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147921440
57064	NC_009464	CAG	3	9	2830110	2830118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147921440
57065	NC_009464	CAG	2	6	2830122	2830127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147921440
57066	NC_009464	GCA	2	6	2830134	2830139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147921440
57067	NC_009464	GCAG	2	8	2830142	2830149	25 %	0 %	50 %	25 %	147921440
57068	NC_009464	GCA	3	9	2830151	2830159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147921440
57069	NC_009464	CGG	2	6	2830163	2830168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147921440
57070	NC_009464	CAG	2	6	2830170	2830175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147921440
57071	NC_009464	CGT	2	6	2830208	2830213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147921440
57072	NC_009464	GTC	2	6	2830230	2830235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147921440
57073	NC_009464	AAAT	2	8	2830245	2830252	75 %	25 %	0 %	0 %	147921440
57074	NC_009464	GTA	2	6	2830271	2830276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57075	NC_009464	GAC	2	6	2830339	2830344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147921441
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57078	NC_009464	GAG	2	6	2830411	2830416	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	147921441
57079	NC_009464	CGA	2	6	2830455	2830460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147921441
57080	NC_009464	CAA	2	6	2830530	2830535	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	147921441
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57082	NC_009464	GGC	3	9	2830606	2830614	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147921441
57083	NC_009464	GTC	3	9	2830702	2830710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147921441
57084	NC_009464	CAC	2	6	2830770	2830775	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147921441
57085	NC_009464	GGC	2	6	2831023	2831028	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147921441
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57088	NC_009464	CGA	2	6	2831142	2831147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147921441
57089	NC_009464	CGGC	2	8	2831192	2831199	0 %	0 %	50 %	50 %	147921441
57090	NC_009464	CAGA	2	8	2831203	2831210	50 %	0 %	25 %	25 %	147921441
57091	NC_009464	CAGC	2	8	2831316	2831323	25 %	0 %	25 %	50 %	147921441
57092	NC_009464	GCC	2	6	2831347	2831352	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147921441
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57094	NC_009464	CT	3	6	2831515	2831520	0 %	50 %	0 %	50 %	147921442
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57097	NC_009464	CGATCT	2	12	2831707	2831718	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	147921442
57098	NC_009464	GGAG	2	8	2831731	2831738	25 %	0 %	75 %	0 %	147921442
57099	NC_009464	CGT	2	6	2831788	2831793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147921442
57100	NC_009464	TCG	2	6	2831901	2831906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147921442
57101	NC_009464	AGC	2	6	2831917	2831922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147921442
57102	NC_009464	CAG	2	6	2831948	2831953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147921442
57103	NC_009464	TCCC	2	8	2832034	2832041	0 %	25 %	0 %	75 %	147921442
57104	NC_009464	GAG	2	6	2832149	2832154	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	147921442
57105	NC_009464	TCA	2	6	2832190	2832195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147921442
57106	NC_009464	CCG	2	6	2832222	2832227	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147921442
57107	NC_009464	CGGC	2	8	2832228	2832235	0 %	0 %	50 %	50 %	147921442
57108	NC_009464	ACC	2	6	2832259	2832264	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147921443
57109	NC_009464	TATC	2	8	2832324	2832331	25 %	50 %	0 %	25 %	147921443
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57112	NC_009464	GAC	2	6	2832391	2832396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147921443
57113	NC_009464	CAG	2	6	2832421	2832426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147921443
57114	NC_009464	TCC	3	9	2832434	2832442	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	147921443
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57116	NC_009464	CCA	2	6	2832495	2832500	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147921443
57117	NC_009464	ACC	2	6	2832584	2832589	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147921443
57118	NC_009464	TCCAGG	2	12	2832644	2832655	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	147921443
57119	NC_009464	ACC	2	6	2832656	2832661	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147921443
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57122	NC_009464	CGT	2	6	2832810	2832815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147921443
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57284	NC_009464	AG	3	6	2842239	2842244	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
57285	NC_009464	AG	3	6	2842265	2842270	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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57330	NC_009464	GCAG	2	8	2845312	2845319	25 %	0 %	50 %	25 %	147921452
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57345	NC_009464	CT	3	6	2846120	2846125	0 %	50 %	0 %	50 %	147921452
57346	NC_009464	CTT	2	6	2846135	2846140	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147921452
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57349	NC_009464	TCT	2	6	2846548	2846553	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147921453
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57351	NC_009464	CTG	2	6	2846655	2846660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147921453
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57463	NC_009464	CAC	2	6	2852229	2852234	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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57465	NC_009464	TCC	2	6	2852454	2852459	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
57466	NC_009464	CT	3	6	2852486	2852491	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
57467	NC_009464	CT	3	6	2852503	2852508	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
57468	NC_009464	TC	3	6	2852528	2852533	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
57469	NC_009464	TGT	2	6	2852561	2852566	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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57471	NC_009464	GGA	2	6	2852679	2852684	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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57495	NC_009464	GCAGG	2	10	2854104	2854113	20 %	0 %	60 %	20 %	147921461
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57499	NC_009464	CTTC	2	8	2854273	2854280	0 %	50 %	0 %	50 %	147921462
57500	NC_009464	GCC	3	9	2854295	2854303	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147921462

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