MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanocella arvoryzae MRE50 chromosome

Total Repeats: 63788

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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54002	NC_009464	CGG	2	6	2673757	2673762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147921298
54003	NC_009464	ACCG	2	8	2673877	2673884	25 %	0 %	25 %	50 %	147921298
54004	NC_009464	GCT	2	6	2673885	2673890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147921298
54005	NC_009464	GTA	2	6	2673928	2673933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147921298
54006	NC_009464	CTG	2	6	2673934	2673939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147921298
54007	NC_009464	CGG	2	6	2673958	2673963	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147921298
54008	NC_009464	CGC	2	6	2673982	2673987	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147921298
54009	NC_009464	GCC	2	6	2674019	2674024	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147921298
54010	NC_009464	CAT	2	6	2674063	2674068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147921298
54011	NC_009464	TA	3	6	2674174	2674179	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54012	NC_009464	GCCCT	2	10	2674188	2674197	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
54013	NC_009464	CGT	2	6	2674293	2674298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147921299
54014	NC_009464	GTT	2	6	2674420	2674425	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	147921299
54015	NC_009464	CTC	2	6	2674576	2674581	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	147921299
54016	NC_009464	GCC	2	6	2674615	2674620	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147921299
54017	NC_009464	TGCC	2	8	2674626	2674633	0 %	25 %	25 %	50 %	147921299
54018	NC_009464	GCC	2	6	2674649	2674654	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147921299
54019	NC_009464	AGC	2	6	2674676	2674681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147921299
54020	NC_009464	CCA	2	6	2674686	2674691	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147921299
54021	NC_009464	CAG	2	6	2674696	2674701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147921299
54022	NC_009464	CTT	2	6	2674723	2674728	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147921299
54023	NC_009464	CAG	2	6	2674771	2674776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147921299
54024	NC_009464	ACG	2	6	2674811	2674816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147921299
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54026	NC_009464	ATG	2	6	2674901	2674906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147921299
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54030	NC_009464	TGC	3	9	2675020	2675028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147921299
54031	NC_009464	ATG	2	6	2675030	2675035	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147921299
54032	NC_009464	CTGG	2	8	2675095	2675102	0 %	25 %	50 %	25 %	147921299
54033	NC_009464	GAG	2	6	2675158	2675163	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	147921299
54034	NC_009464	TGA	2	6	2675187	2675192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147921299
54035	NC_009464	GAG	2	6	2675239	2675244	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	147921299
54036	NC_009464	GAT	2	6	2675256	2675261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147921299
54037	NC_009464	TCA	2	6	2675347	2675352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54038	NC_009464	GAT	2	6	2675362	2675367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147921300
54039	NC_009464	CTA	2	6	2675440	2675445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147921300
54040	NC_009464	CTGGAG	2	12	2675519	2675530	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	147921300
54041	NC_009464	GGC	2	6	2675579	2675584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147921300
54042	NC_009464	GCG	2	6	2675660	2675665	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
54043	NC_009464	T	6	6	2675749	2675754	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54044	NC_009464	TA	3	6	2675958	2675963	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54045	NC_009464	CCA	2	6	2675994	2675999	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147921301
54046	NC_009464	GAC	2	6	2676044	2676049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147921301
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54049	NC_009464	CACGGC	2	12	2676161	2676172	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	147921301
54050	NC_009464	GAT	2	6	2676301	2676306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147921301
54051	NC_009464	GCG	2	6	2676482	2676487	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147921301
54052	NC_009464	GAA	2	6	2676631	2676636	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147921301
54053	NC_009464	TTA	2	6	2676641	2676646	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	147921301
54054	NC_009464	T	6	6	2676690	2676695	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54055	NC_009464	CGCTG	2	10	2676761	2676770	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
54056	NC_009464	CGCTG	2	10	2676813	2676822	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
54057	NC_009464	TGAT	2	8	2676851	2676858	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
54058	NC_009464	CTG	2	6	2676872	2676877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54059	NC_009464	TAC	2	6	2676889	2676894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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54061	NC_009464	ATT	2	6	2676964	2676969	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54062	NC_009464	T	6	6	2676968	2676973	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54063	NC_009464	ATC	2	6	2676997	2677002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54064	NC_009464	CAGCG	2	10	2677080	2677089	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
54065	NC_009464	CAC	2	6	2677105	2677110	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54066	NC_009464	CAGCG	2	10	2677133	2677142	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
54067	NC_009464	TC	3	6	2677204	2677209	0 %	50 %	0 %	50 %	147921302
54068	NC_009464	GTT	2	6	2677233	2677238	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	147921302
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54071	NC_009464	AGT	2	6	2677520	2677525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147921302
54072	NC_009464	CTG	2	6	2677556	2677561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147921302
54073	NC_009464	GTC	2	6	2677572	2677577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147921302
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54088	NC_009464	ACCC	2	8	2678413	2678420	25 %	0 %	0 %	75 %	147921302
54089	NC_009464	AAT	2	6	2678468	2678473	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	147921302
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54104	NC_009464	CGG	2	6	2679292	2679297	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147921303
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54112	NC_009464	ATC	2	6	2679758	2679763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147921303
54113	NC_009464	TG	3	6	2679793	2679798	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
54114	NC_009464	GCA	2	6	2679894	2679899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147921304
54115	NC_009464	GAC	2	6	2680026	2680031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147921304
54116	NC_009464	TCA	2	6	2680082	2680087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147921304
54117	NC_009464	CAT	2	6	2680092	2680097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147921304
54118	NC_009464	GGCACC	2	12	2680168	2680179	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	147921304
54119	NC_009464	GCT	2	6	2680194	2680199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147921304
54120	NC_009464	T	6	6	2680233	2680238	0 %	100 %	0 %	0 %	147921304
54121	NC_009464	ATT	2	6	2680306	2680311	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	147921304
54122	NC_009464	GCC	2	6	2680458	2680463	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147921305
54123	NC_009464	AGT	2	6	2680492	2680497	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147921305
54124	NC_009464	GTT	2	6	2680512	2680517	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	147921305
54125	NC_009464	CTT	2	6	2680543	2680548	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147921305
54126	NC_009464	AT	3	6	2680614	2680619	50 %	50 %	0 %	0 %	147921305
54127	NC_009464	ATA	2	6	2680975	2680980	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54128	NC_009464	GTA	2	6	2680983	2680988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54129	NC_009464	ACC	2	6	2680999	2681004	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54130	NC_009464	GGC	2	6	2681128	2681133	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147921306
54131	NC_009464	CGA	2	6	2681156	2681161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147921306
54132	NC_009464	GCG	2	6	2681162	2681167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147921306
54133	NC_009464	AAGA	2	8	2681243	2681250	75 %	0 %	25 %	0 %	147921307
54134	NC_009464	ACG	2	6	2681253	2681258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147921307
54135	NC_009464	AGGGC	2	10	2681466	2681475	20 %	0 %	60 %	20 %	147921307
54136	NC_009464	TCA	2	6	2681523	2681528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147921307
54137	NC_009464	CGC	2	6	2681533	2681538	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147921307
54138	NC_009464	CAA	2	6	2681641	2681646	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	147921307
54139	NC_009464	GCAGGT	2	12	2681671	2681682	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	147921307
54140	NC_009464	AGG	2	6	2681709	2681714	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	147921307
54141	NC_009464	ATC	2	6	2681717	2681722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147921307
54142	NC_009464	GCT	2	6	2681766	2681771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147921307
54143	NC_009464	TAT	2	6	2681886	2681891	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	147921308
54144	NC_009464	ACG	2	6	2681912	2681917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147921308
54145	NC_009464	GGA	2	6	2682027	2682032	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	147921308
54146	NC_009464	ACG	2	6	2682041	2682046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147921308
54147	NC_009464	TCC	2	6	2682055	2682060	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	147921308
54148	NC_009464	GCT	2	6	2682132	2682137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147921308
54149	NC_009464	CGA	2	6	2682182	2682187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147921308
54150	NC_009464	CGG	2	6	2682210	2682215	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147921308
54151	NC_009464	GAG	2	6	2682292	2682297	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	147921308
54152	NC_009464	GAG	2	6	2682334	2682339	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	147921308
54153	NC_009464	ATG	2	6	2682377	2682382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147921308
54154	NC_009464	CAA	2	6	2682566	2682571	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	147921309
54155	NC_009464	GAA	3	9	2682615	2682623	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147921309
54156	NC_009464	TCA	2	6	2682724	2682729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147921309
54157	NC_009464	ATC	2	6	2682948	2682953	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147921309
54158	NC_009464	TGC	2	6	2683027	2683032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147921309
54159	NC_009464	GC	3	6	2683198	2683203	0 %	0 %	50 %	50 %	147921310
54160	NC_009464	CAC	2	6	2683220	2683225	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147921310
54161	NC_009464	TGCA	2	8	2683233	2683240	25 %	25 %	25 %	25 %	147921310
54162	NC_009464	ATC	2	6	2683266	2683271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147921310
54163	NC_009464	AAG	2	6	2683281	2683286	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147921310
54164	NC_009464	AGATC	2	10	2683430	2683439	40 %	20 %	20 %	20 %	147921310
54165	NC_009464	GGCAAG	2	12	2683470	2683481	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	147921310
54166	NC_009464	TCCC	2	8	2683508	2683515	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
54167	NC_009464	ATA	2	6	2683548	2683553	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54168	NC_009464	CTC	2	6	2683577	2683582	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	147921311
54169	NC_009464	TC	3	6	2683617	2683622	0 %	50 %	0 %	50 %	147921311
54170	NC_009464	CGG	2	6	2683632	2683637	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147921311
54171	NC_009464	CTT	2	6	2683641	2683646	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147921311
54172	NC_009464	ACC	2	6	2683650	2683655	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147921311
54173	NC_009464	TCA	2	6	2683676	2683681	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147921311
54174	NC_009464	GCT	2	6	2683734	2683739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147921311
54175	NC_009464	CAT	2	6	2683782	2683787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147921311
54176	NC_009464	CTGC	2	8	2683791	2683798	0 %	25 %	25 %	50 %	147921311
54177	NC_009464	GCT	2	6	2683854	2683859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147921311
54178	NC_009464	GCCTTC	2	12	2683867	2683878	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	147921311
54179	NC_009464	TCG	2	6	2684009	2684014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147921311
54180	NC_009464	CTT	2	6	2684052	2684057	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147921311
54181	NC_009464	GCT	2	6	2684190	2684195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147921311
54182	NC_009464	TCA	2	6	2684216	2684221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147921311
54183	NC_009464	TCA	2	6	2684243	2684248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147921311
54184	NC_009464	GTC	2	6	2684266	2684271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147921311
54185	NC_009464	T	7	7	2684341	2684347	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54186	NC_009464	GGGC	2	8	2684394	2684401	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
54187	NC_009464	CGG	2	6	2684442	2684447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
54188	NC_009464	GCA	2	6	2684455	2684460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147921312
54189	NC_009464	TGG	2	6	2684511	2684516	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147921312
54190	NC_009464	CT	3	6	2684542	2684547	0 %	50 %	0 %	50 %	147921312
54191	NC_009464	TGAT	2	8	2684580	2684587	25 %	50 %	25 %	0 %	147921312
54192	NC_009464	GAT	2	6	2684698	2684703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147921312
54193	NC_009464	CAA	2	6	2684767	2684772	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	147921312
54194	NC_009464	ACA	2	6	2684934	2684939	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	147921312
54195	NC_009464	CAT	2	6	2684980	2684985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147921312
54196	NC_009464	AG	3	6	2685187	2685192	50 %	0 %	50 %	0 %	147921313
54197	NC_009464	AT	3	6	2685244	2685249	50 %	50 %	0 %	0 %	147921313
54198	NC_009464	CGG	2	6	2685254	2685259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147921313
54199	NC_009464	TTC	2	6	2685274	2685279	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147921313
54200	NC_009464	GAA	2	6	2685285	2685290	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147921313
54201	NC_009464	AGA	2	6	2685299	2685304	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147921313
54202	NC_009464	CAG	2	6	2685402	2685407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147921313
54203	NC_009464	CAT	2	6	2685423	2685428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147921313
54204	NC_009464	GCG	2	6	2685473	2685478	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147921313
54205	NC_009464	CAG	2	6	2685538	2685543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147921313
54206	NC_009464	T	6	6	2685585	2685590	0 %	100 %	0 %	0 %	147921313
54207	NC_009464	ACG	2	6	2685734	2685739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147921313
54208	NC_009464	TA	3	6	2685930	2685935	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54209	NC_009464	CAG	2	6	2685978	2685983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147921314
54210	NC_009464	GAG	2	6	2686105	2686110	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	147921314
54211	NC_009464	CAGG	2	8	2686164	2686171	25 %	0 %	50 %	25 %	147921314
54212	NC_009464	GGC	2	6	2686179	2686184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147921314
54213	NC_009464	A	6	6	2686210	2686215	100 %	0 %	0 %	0 %	147921314
54214	NC_009464	GCT	2	6	2686239	2686244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147921314
54215	NC_009464	CCT	2	6	2686263	2686268	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	147921314
54216	NC_009464	GCT	2	6	2686317	2686322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147921314
54217	NC_009464	GAGG	2	8	2686416	2686423	25 %	0 %	75 %	0 %	147921314
54218	NC_009464	GAG	2	6	2686441	2686446	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	147921314
54219	NC_009464	GGC	2	6	2686530	2686535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147921314
54220	NC_009464	TAC	2	6	2686682	2686687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147921315
54221	NC_009464	GAT	2	6	2686771	2686776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147921315
54222	NC_009464	C	6	6	2686847	2686852	0 %	0 %	0 %	100 %	147921315
54223	NC_009464	GACAT	2	10	2686853	2686862	40 %	20 %	20 %	20 %	147921315
54224	NC_009464	TCG	2	6	2686884	2686889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147921315
54225	NC_009464	AG	3	6	2686926	2686931	50 %	0 %	50 %	0 %	147921316
54226	NC_009464	ATC	2	6	2687080	2687085	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147921316
54227	NC_009464	GCA	2	6	2687102	2687107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147921316
54228	NC_009464	CA	3	6	2687106	2687111	50 %	0 %	0 %	50 %	147921316
54229	NC_009464	GCC	2	6	2687153	2687158	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147921316
54230	NC_009464	TGC	2	6	2687232	2687237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147921316
54231	NC_009464	CT	3	6	2687290	2687295	0 %	50 %	0 %	50 %	147921316
54232	NC_009464	CCTG	2	8	2687348	2687355	0 %	25 %	25 %	50 %	147921316
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54339	NC_009464	GT	3	6	2693495	2693500	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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54341	NC_009464	CA	3	6	2693548	2693553	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
54342	NC_009464	CCA	2	6	2693589	2693594	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147921322
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