MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanocella arvoryzae MRE50 chromosome

Total Repeats: 63788

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
53501	NC_009464	TC	3	6	2650599	2650604	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
53502	NC_009464	GCG	2	6	2650612	2650617	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
53503	NC_009464	ATA	2	6	2650647	2650652	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53504	NC_009464	CTG	2	6	2650702	2650707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53505	NC_009464	GGCA	2	8	2650715	2650722	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
53506	NC_009464	TCC	2	6	2650823	2650828	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	147921277
53507	NC_009464	CGG	2	6	2650865	2650870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147921277
53508	NC_009464	GC	3	6	2650891	2650896	0 %	0 %	50 %	50 %	147921277
53509	NC_009464	GAA	2	6	2650904	2650909	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147921277
53510	NC_009464	AGG	2	6	2650941	2650946	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	147921277
53511	NC_009464	CGTCT	2	10	2650982	2650991	0 %	40 %	20 %	40 %	147921277
53512	NC_009464	AAG	2	6	2651037	2651042	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147921277
53513	NC_009464	GCA	2	6	2651063	2651068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147921277
53514	NC_009464	GAG	2	6	2651079	2651084	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	147921277
53515	NC_009464	GCCC	2	8	2651127	2651134	0 %	0 %	25 %	75 %	147921277
53516	NC_009464	TGC	2	6	2651311	2651316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147921277
53517	NC_009464	CGA	2	6	2651381	2651386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147921277
53518	NC_009464	TTG	2	6	2651443	2651448	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	147921277
53519	NC_009464	CTG	2	6	2651478	2651483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147921277
53520	NC_009464	ACT	2	6	2651592	2651597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147921277
53521	NC_009464	TGG	2	6	2651606	2651611	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147921277
53522	NC_009464	TCA	2	6	2651620	2651625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147921277
53523	NC_009464	TGAC	2	8	2651656	2651663	25 %	25 %	25 %	25 %	147921277
53524	NC_009464	CATC	2	8	2651719	2651726	25 %	25 %	0 %	50 %	147921277
53525	NC_009464	TAT	2	6	2651751	2651756	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	147921277
53526	NC_009464	TGC	2	6	2651855	2651860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147921277
53527	NC_009464	GAA	2	6	2651904	2651909	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147921277
53528	NC_009464	GGCG	2	8	2651945	2651952	0 %	0 %	75 %	25 %	147921277
53529	NC_009464	TCA	2	6	2651974	2651979	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147921277
53530	NC_009464	TCG	2	6	2651989	2651994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147921277
53531	NC_009464	CGG	2	6	2652038	2652043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147921277
53532	NC_009464	G	6	6	2652063	2652068	0 %	0 %	100 %	0 %	147921277
53533	NC_009464	AAG	2	6	2652088	2652093	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147921277
53534	NC_009464	GCT	2	6	2652139	2652144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147921277
53535	NC_009464	AAC	2	6	2652156	2652161	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	147921277
53536	NC_009464	TCC	2	6	2652220	2652225	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	147921277
53537	NC_009464	CGG	2	6	2652278	2652283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147921277
53538	NC_009464	TCAGG	2	10	2652313	2652322	20 %	20 %	40 %	20 %	147921278
53539	NC_009464	GAT	2	6	2652510	2652515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147921278
53540	NC_009464	CT	4	8	2652546	2652553	0 %	50 %	0 %	50 %	147921278
53541	NC_009464	GGCG	2	8	2652557	2652564	0 %	0 %	75 %	25 %	147921278
53542	NC_009464	TCT	2	6	2652578	2652583	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147921278
53543	NC_009464	TGG	2	6	2652614	2652619	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147921278
53544	NC_009464	TGT	2	6	2652805	2652810	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53545	NC_009464	ATT	2	6	2652814	2652819	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53546	NC_009464	TGA	2	6	2652821	2652826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53547	NC_009464	GAA	2	6	2652853	2652858	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53548	NC_009464	GCC	2	6	2652866	2652871	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
53549	NC_009464	GAT	2	6	2652884	2652889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53550	NC_009464	CAG	2	6	2653079	2653084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147921279
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53552	NC_009464	GC	3	6	2653135	2653140	0 %	0 %	50 %	50 %	147921279
53553	NC_009464	AAC	2	6	2653167	2653172	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	147921279
53554	NC_009464	GGCCA	2	10	2653412	2653421	20 %	0 %	40 %	40 %	147921279
53555	NC_009464	TGT	2	6	2653525	2653530	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	147921279
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53559	NC_009464	CAA	2	6	2653960	2653965	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	147921281
53560	NC_009464	ACC	2	6	2653988	2653993	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147921281
53561	NC_009464	GTC	2	6	2654003	2654008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147921281
53562	NC_009464	CTG	2	6	2654027	2654032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147921281
53563	NC_009464	GGC	2	6	2654072	2654077	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147921281
53564	NC_009464	CGA	2	6	2654125	2654130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147921281
53565	NC_009464	CTG	2	6	2654284	2654289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147921281
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53567	NC_009464	GGC	2	6	2654324	2654329	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147921281
53568	NC_009464	CAT	2	6	2654344	2654349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147921281
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53571	NC_009464	CGATC	2	10	2654455	2654464	20 %	20 %	20 %	40 %	147921281
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53574	NC_009464	GAC	2	6	2654543	2654548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147921281
53575	NC_009464	A	6	6	2654569	2654574	100 %	0 %	0 %	0 %	147921281
53576	NC_009464	AGT	2	6	2654706	2654711	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53577	NC_009464	GAA	2	6	2654723	2654728	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53578	NC_009464	AGC	2	6	2654811	2654816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147921282
53579	NC_009464	GAGCAA	2	12	2654829	2654840	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	147921282
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53582	NC_009464	GCT	2	6	2654910	2654915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147921282
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53584	NC_009464	TCTA	2	8	2654939	2654946	25 %	50 %	0 %	25 %	147921282
53585	NC_009464	GGC	2	6	2654955	2654960	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147921282
53586	NC_009464	AGA	2	6	2654964	2654969	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147921282
53587	NC_009464	GAA	2	6	2654988	2654993	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147921282
53588	NC_009464	CGT	2	6	2655194	2655199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53589	NC_009464	TC	3	6	2655229	2655234	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
53590	NC_009464	ATA	2	6	2655300	2655305	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53591	NC_009464	CAT	2	6	2655356	2655361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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53596	NC_009464	CAGC	2	8	2655507	2655514	25 %	0 %	25 %	50 %	147921283
53597	NC_009464	CGTC	2	8	2655547	2655554	0 %	25 %	25 %	50 %	147921283
53598	NC_009464	TTG	2	6	2655593	2655598	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	147921283
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53600	NC_009464	GCT	2	6	2655688	2655693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147921283
53601	NC_009464	CGG	2	6	2655711	2655716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147921283
53602	NC_009464	A	7	7	2655731	2655737	100 %	0 %	0 %	0 %	147921283
53603	NC_009464	TC	3	6	2655794	2655799	0 %	50 %	0 %	50 %	147921283
53604	NC_009464	CTG	2	6	2655869	2655874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147921283
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53606	NC_009464	GCTG	2	8	2655936	2655943	0 %	25 %	50 %	25 %	147921283
53607	NC_009464	TGG	2	6	2656008	2656013	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147921283
53608	NC_009464	CTG	2	6	2656025	2656030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147921283
53609	NC_009464	CTG	3	9	2656043	2656051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147921283
53610	NC_009464	GCC	2	6	2656113	2656118	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147921283
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53613	NC_009464	CTC	2	6	2656215	2656220	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	147921283
53614	NC_009464	TGCCT	2	10	2656228	2656237	0 %	40 %	20 %	40 %	147921283
53615	NC_009464	CCG	2	6	2656263	2656268	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147921283
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