MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanocella arvoryzae MRE50 chromosome

Total Repeats: 63788

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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50002	NC_009464	TCTT	2	8	2478057	2478064	0 %	75 %	0 %	25 %	147921122
50003	NC_009464	GACAT	2	10	2478129	2478138	40 %	20 %	20 %	20 %	147921122
50004	NC_009464	TGA	2	6	2478256	2478261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147921122
50005	NC_009464	TTC	2	6	2478276	2478281	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147921122
50006	NC_009464	CTTCGT	2	12	2478284	2478295	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	147921122
50007	NC_009464	CGT	2	6	2478316	2478321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147921122
50008	NC_009464	GCTTT	2	10	2478337	2478346	0 %	60 %	20 %	20 %	147921122
50009	NC_009464	TCG	2	6	2478390	2478395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147921122
50010	NC_009464	GCC	2	6	2478407	2478412	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147921122
50011	NC_009464	CGCT	2	8	2478422	2478429	0 %	25 %	25 %	50 %	147921122
50012	NC_009464	TCT	2	6	2478458	2478463	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147921122
50013	NC_009464	TC	3	6	2478475	2478480	0 %	50 %	0 %	50 %	147921122
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50016	NC_009464	CGG	2	6	2478565	2478570	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147921122
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50019	NC_009464	CCTG	2	8	2478760	2478767	0 %	25 %	25 %	50 %	147921122
50020	NC_009464	GCA	2	6	2478802	2478807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147921122
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50034	NC_009464	GTCG	2	8	2479513	2479520	0 %	25 %	50 %	25 %	147921123
50035	NC_009464	GAG	2	6	2479597	2479602	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	147921123
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50039	NC_009464	TACCGC	2	12	2480065	2480076	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	147921123
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50043	NC_009464	TGA	3	9	2480220	2480228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147921123
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50045	NC_009464	ATG	2	6	2480372	2480377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147921123
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50114	NC_009464	TA	3	6	2484388	2484393	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50115	NC_009464	T	6	6	2484426	2484431	0 %	100 %	0 %	0 %	147921126
50116	NC_009464	ACG	2	6	2484441	2484446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147921126
50117	NC_009464	CCA	2	6	2484499	2484504	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147921126
50118	NC_009464	AAG	2	6	2484524	2484529	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147921126
50119	NC_009464	CGA	2	6	2484535	2484540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147921126
50120	NC_009464	CAC	2	6	2484578	2484583	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147921126
50121	NC_009464	TCT	2	6	2484720	2484725	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147921126
50122	NC_009464	GACT	2	8	2484760	2484767	25 %	25 %	25 %	25 %	147921126
50123	NC_009464	TCG	2	6	2484771	2484776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147921126
50124	NC_009464	GCTG	2	8	2484808	2484815	0 %	25 %	50 %	25 %	147921126
50125	NC_009464	TGA	2	6	2484826	2484831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147921126
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50127	NC_009464	GATG	2	8	2485021	2485028	25 %	25 %	50 %	0 %	147921126
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50130	NC_009464	TGC	2	6	2485122	2485127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147921126
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50136	NC_009464	TCG	2	6	2485428	2485433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147921126
50137	NC_009464	CCGG	2	8	2485437	2485444	0 %	0 %	50 %	50 %	147921126
50138	NC_009464	GA	3	6	2485452	2485457	50 %	0 %	50 %	0 %	147921126
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50140	NC_009464	TGC	2	6	2485566	2485571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147921126
50141	NC_009464	TTA	2	6	2485580	2485585	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50142	NC_009464	CGCCGG	2	12	2485635	2485646	0 %	0 %	50 %	50 %	147921127
50143	NC_009464	GCC	2	6	2485647	2485652	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147921127
50144	NC_009464	TTG	2	6	2485728	2485733	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	147921127
50145	NC_009464	GCC	2	6	2485753	2485758	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147921127
50146	NC_009464	TG	3	6	2485823	2485828	0 %	50 %	50 %	0 %	147921127
50147	NC_009464	GATCAG	2	12	2485882	2485893	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
50148	NC_009464	AAAT	2	8	2485906	2485913	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
50149	NC_009464	GGC	2	6	2485968	2485973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
50150	NC_009464	TCA	2	6	2486008	2486013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50151	NC_009464	ATC	3	9	2486036	2486044	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50152	NC_009464	TCC	2	6	2486077	2486082	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
50153	NC_009464	CT	3	6	2486109	2486114	0 %	50 %	0 %	50 %	147921128
50154	NC_009464	CT	3	6	2486126	2486131	0 %	50 %	0 %	50 %	147921128
50155	NC_009464	TC	3	6	2486151	2486156	0 %	50 %	0 %	50 %	147921128
50156	NC_009464	T	6	6	2486253	2486258	0 %	100 %	0 %	0 %	147921128
50157	NC_009464	AG	3	6	2486273	2486278	50 %	0 %	50 %	0 %	147921128
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50161	NC_009464	TTA	2	6	2486473	2486478	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50162	NC_009464	A	6	6	2486562	2486567	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50163	NC_009464	TAA	2	6	2486607	2486612	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	147921129
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50179	NC_009464	TGA	2	6	2487427	2487432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147921129
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50183	NC_009464	GTGTTG	3	18	2487616	2487633	0 %	50 %	50 %	0 %	147921129
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50186	NC_009464	GTTGGT	2	12	2487750	2487761	0 %	50 %	50 %	0 %	147921129
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50188	NC_009464	GGT	2	6	2487880	2487885	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147921129
50189	NC_009464	GCA	2	6	2487943	2487948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147921129
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50192	NC_009464	CGA	2	6	2488078	2488083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147921129
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50197	NC_009464	GACC	2	8	2488343	2488350	25 %	0 %	25 %	50 %	147921129
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50199	NC_009464	CGT	2	6	2488426	2488431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147921129
50200	NC_009464	AGCC	2	8	2488433	2488440	25 %	0 %	25 %	50 %	147921129
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50202	NC_009464	GAT	2	6	2488478	2488483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147921129
50203	NC_009464	GTGCC	2	10	2488497	2488506	0 %	20 %	40 %	40 %	147921129
50204	NC_009464	GTC	2	6	2488511	2488516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147921129
50205	NC_009464	TAC	2	6	2488718	2488723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147921129
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50207	NC_009464	GAT	2	6	2488793	2488798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147921129
50208	NC_009464	CCT	2	6	2488852	2488857	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	147921129
50209	NC_009464	GGC	2	6	2488862	2488867	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147921129
50210	NC_009464	TATC	2	8	2488903	2488910	25 %	50 %	0 %	25 %	147921129
50211	NC_009464	TCT	2	6	2488912	2488917	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147921129
50212	NC_009464	TA	3	6	2488928	2488933	50 %	50 %	0 %	0 %	147921129
50213	NC_009464	CT	3	6	2489073	2489078	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
50214	NC_009464	GCT	2	6	2489093	2489098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50215	NC_009464	TAT	2	6	2489138	2489143	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	147921130
50216	NC_009464	TAT	3	9	2489146	2489154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	147921130
50217	NC_009464	AAG	2	6	2489200	2489205	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147921130
50218	NC_009464	GAG	2	6	2489217	2489222	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	147921130
50219	NC_009464	TA	3	6	2489278	2489283	50 %	50 %	0 %	0 %	147921130
50220	NC_009464	TA	3	6	2489305	2489310	50 %	50 %	0 %	0 %	147921130
50221	NC_009464	TGG	2	6	2489357	2489362	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147921130
50222	NC_009464	ATC	2	6	2489465	2489470	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147921131
50223	NC_009464	GTCT	2	8	2489528	2489535	0 %	50 %	25 %	25 %	147921131
50224	NC_009464	CCT	2	6	2489585	2489590	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	147921131
50225	NC_009464	TGA	2	6	2489622	2489627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147921131
50226	NC_009464	AAG	2	6	2489657	2489662	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147921131
50227	NC_009464	CGT	2	6	2489680	2489685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147921131
50228	NC_009464	GGA	2	6	2489686	2489691	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	147921131
50229	NC_009464	GAT	2	6	2489924	2489929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147921131
50230	NC_009464	GCCA	2	8	2489954	2489961	25 %	0 %	25 %	50 %	147921131
50231	NC_009464	AAG	2	6	2490012	2490017	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147921131
50232	NC_009464	TTA	2	6	2490091	2490096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	147921131
50233	NC_009464	ACG	2	6	2490159	2490164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147921131
50234	NC_009464	TCA	2	6	2490183	2490188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147921131
50235	NC_009464	AGCA	2	8	2490191	2490198	50 %	0 %	25 %	25 %	147921131
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50297	NC_009464	CTG	2	6	2494736	2494741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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50462	NC_009464	TA	5	10	2503659	2503668	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50463	NC_009464	AGC	2	6	2503725	2503730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147921143
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50465	NC_009464	TCG	2	6	2503743	2503748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147921143
50466	NC_009464	AGCC	2	8	2503750	2503757	25 %	0 %	25 %	50 %	147921143
50467	NC_009464	GCT	2	6	2503822	2503827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147921143
50468	NC_009464	CGC	2	6	2503917	2503922	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147921143
50469	NC_009464	TGA	2	6	2503953	2503958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147921143
50470	NC_009464	CGCC	2	8	2503959	2503966	0 %	0 %	25 %	75 %	147921143
50471	NC_009464	GCAGC	2	10	2503981	2503990	20 %	0 %	40 %	40 %	147921143
50472	NC_009464	TGG	2	6	2504010	2504015	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147921143
50473	NC_009464	TC	3	6	2504046	2504051	0 %	50 %	0 %	50 %	147921143
50474	NC_009464	GCT	2	6	2504083	2504088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147921143
50475	NC_009464	AATGG	2	10	2504106	2504115	40 %	20 %	40 %	0 %	147921143
50476	NC_009464	GAA	2	6	2504243	2504248	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147921143
50477	NC_009464	CGA	2	6	2504251	2504256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147921143
50478	NC_009464	GGA	2	6	2504281	2504286	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	147921143
50479	NC_009464	CAG	2	6	2504297	2504302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147921143
50480	NC_009464	CAG	2	6	2504327	2504332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147921143
50481	NC_009464	TCG	2	6	2504403	2504408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147921143
50482	NC_009464	CTC	2	6	2504447	2504452	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	147921143
50483	NC_009464	CCA	2	6	2504482	2504487	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147921143
50484	NC_009464	TCG	2	6	2504550	2504555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147921143
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50487	NC_009464	ATC	2	6	2504767	2504772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147921144
50488	NC_009464	CGC	2	6	2504865	2504870	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147921144
50489	NC_009464	AAG	2	6	2504879	2504884	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147921144
50490	NC_009464	CTG	2	6	2504896	2504901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147921144
50491	NC_009464	CAA	2	6	2504934	2504939	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	147921144
50492	NC_009464	GGC	2	6	2504944	2504949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147921144
50493	NC_009464	AGC	2	6	2504973	2504978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147921144
50494	NC_009464	TCT	2	6	2505029	2505034	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147921144
50495	NC_009464	CAGGT	2	10	2505199	2505208	20 %	20 %	40 %	20 %	147921144
50496	NC_009464	AGCT	2	8	2505224	2505231	25 %	25 %	25 %	25 %	147921144
50497	NC_009464	ACA	2	6	2505299	2505304	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	147921144
50498	NC_009464	CGC	2	6	2505321	2505326	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147921144
50499	NC_009464	ACG	2	6	2505341	2505346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147921144
50500	NC_009464	TCA	2	6	2505386	2505391	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147921144

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