MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanocella arvoryzae MRE50 chromosome

Total Repeats: 63788

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_009464	TGC	2	6	235317	235322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147918906
4502	NC_009464	ACT	2	6	235373	235378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4503	NC_009464	CAA	2	6	235436	235441	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	147918907
4504	NC_009464	AAGG	2	8	235485	235492	50 %	0 %	50 %	0 %	147918907
4505	NC_009464	CGA	2	6	235510	235515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147918907
4506	NC_009464	ATA	2	6	235561	235566	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	147918907
4507	NC_009464	GCG	2	6	235618	235623	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147918907
4508	NC_009464	TCT	2	6	235682	235687	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147918907
4509	NC_009464	CATGC	2	10	235793	235802	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
4510	NC_009464	CA	3	6	235830	235835	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4511	NC_009464	GGCCG	2	10	235928	235937	0 %	0 %	60 %	40 %	147918908
4512	NC_009464	ATC	2	6	236009	236014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147918908
4513	NC_009464	CTC	2	6	236069	236074	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	147918908
4514	NC_009464	ACG	2	6	236136	236141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147918908
4515	NC_009464	GGA	2	6	236167	236172	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	147918908
4516	NC_009464	CGG	2	6	236220	236225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147918908
4517	NC_009464	GA	3	6	236248	236253	50 %	0 %	50 %	0 %	147918908
4518	NC_009464	CGA	2	6	236263	236268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147918908
4519	NC_009464	CAG	2	6	236335	236340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147918908
4520	NC_009464	AAG	2	6	236365	236370	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147918908
4521	NC_009464	CAG	2	6	236419	236424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147918908
4522	NC_009464	ACG	2	6	236628	236633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4523	NC_009464	AACA	2	8	236711	236718	75 %	0 %	0 %	25 %	147918909
4524	NC_009464	GA	3	6	236724	236729	50 %	0 %	50 %	0 %	147918909
4525	NC_009464	GCCG	2	8	236744	236751	0 %	0 %	50 %	50 %	147918909
4526	NC_009464	GA	3	6	236760	236765	50 %	0 %	50 %	0 %	147918909
4527	NC_009464	GAG	2	6	236798	236803	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	147918909
4528	NC_009464	GGC	2	6	236816	236821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147918909
4529	NC_009464	GA	3	6	236832	236837	50 %	0 %	50 %	0 %	147918909
4530	NC_009464	TGCT	2	8	236945	236952	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4531	NC_009464	AAC	2	6	236965	236970	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4532	NC_009464	ATTTTA	2	12	236972	236983	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4533	NC_009464	AAAT	2	8	237021	237028	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4534	NC_009464	TAA	2	6	237089	237094	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4535	NC_009464	ATA	2	6	237162	237167	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4536	NC_009464	GAAAA	2	10	237200	237209	80 %	0 %	20 %	0 %	147918910
4537	NC_009464	GAA	2	6	237284	237289	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147918910
4538	NC_009464	AGG	2	6	237301	237306	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	147918910
4539	NC_009464	GGC	2	6	237314	237319	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147918910
4540	NC_009464	ACT	2	6	237335	237340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147918910
4541	NC_009464	GCA	2	6	237441	237446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147918910
4542	NC_009464	T	6	6	237490	237495	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4543	NC_009464	CGCC	2	8	237617	237624	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4544	NC_009464	TGA	2	6	237663	237668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147918911
4545	NC_009464	CGCTG	2	10	237673	237682	0 %	20 %	40 %	40 %	147918911
4546	NC_009464	GTG	2	6	237729	237734	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147918911
4547	NC_009464	TG	3	6	237733	237738	0 %	50 %	50 %	0 %	147918911
4548	NC_009464	GTG	3	9	237736	237744	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147918911
4549	NC_009464	TGGG	2	8	237747	237754	0 %	25 %	75 %	0 %	147918911
4550	NC_009464	TG	3	6	237762	237767	0 %	50 %	50 %	0 %	147918911
4551	NC_009464	GGGC	2	8	237793	237800	0 %	0 %	75 %	25 %	147918911
4552	NC_009464	TTG	2	6	237844	237849	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	147918911
4553	NC_009464	TGT	2	6	237907	237912	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	147918912
4554	NC_009464	ATG	2	6	238011	238016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147918912
4555	NC_009464	TGTT	2	8	238081	238088	0 %	75 %	25 %	0 %	147918912
4556	NC_009464	CAC	2	6	238267	238272	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147918912
4557	NC_009464	AAC	2	6	238311	238316	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	147918912
4558	NC_009464	AGG	2	6	238323	238328	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	147918912
4559	NC_009464	TCC	2	6	238446	238451	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	147918912
4560	NC_009464	CCA	2	6	238474	238479	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147918912
4561	NC_009464	TTC	2	6	238536	238541	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147918912
4562	NC_009464	TCT	2	6	238585	238590	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147918912
4563	NC_009464	ATA	2	6	238640	238645	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	147918912
4564	NC_009464	GTA	2	6	238656	238661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147918912
4565	NC_009464	AAC	2	6	238725	238730	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	147918912
4566	NC_009464	GCT	2	6	238814	238819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147918912
4567	NC_009464	TCC	2	6	238842	238847	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	147918912
4568	NC_009464	TCT	2	6	238855	238860	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147918912
4569	NC_009464	AGG	2	6	238881	238886	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	147918912
4570	NC_009464	ACCA	2	8	238891	238898	50 %	0 %	0 %	50 %	147918912
4571	NC_009464	AC	3	6	238953	238958	50 %	0 %	0 %	50 %	147918912
4572	NC_009464	TTA	2	6	239000	239005	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4573	NC_009464	CA	3	6	239033	239038	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4574	NC_009464	C	6	6	239058	239063	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4575	NC_009464	ACC	2	6	239066	239071	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4576	NC_009464	CAACC	2	10	239074	239083	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
4577	NC_009464	GTC	2	6	239124	239129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4578	NC_009464	CAGCG	2	10	239219	239228	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
4579	NC_009464	CAGCG	2	10	239272	239281	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
4580	NC_009464	TTA	2	6	239381	239386	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4581	NC_009464	TAA	2	6	239439	239444	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4582	NC_009464	TGC	2	6	239466	239471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147918913
4583	NC_009464	CGA	2	6	239496	239501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147918913
4584	NC_009464	CCG	2	6	239557	239562	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147918913
4585	NC_009464	CAT	2	6	239616	239621	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147918913
4586	NC_009464	ATG	2	6	239637	239642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147918913
4587	NC_009464	GCC	2	6	239658	239663	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147918913
4588	NC_009464	GTC	2	6	239671	239676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147918913
4589	NC_009464	CAG	2	6	239718	239723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147918913
4590	NC_009464	ACG	2	6	239737	239742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147918913
4591	NC_009464	ATC	2	6	239761	239766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147918913
4592	NC_009464	TGA	2	6	239819	239824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147918913
4593	NC_009464	GAA	2	6	239826	239831	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147918913
4594	NC_009464	GTG	2	6	239894	239899	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147918913
4595	NC_009464	GCCA	2	8	239916	239923	25 %	0 %	25 %	50 %	147918913
4596	NC_009464	GAT	2	6	240003	240008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147918913
4597	NC_009464	TCC	2	6	240026	240031	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	147918913
4598	NC_009464	ATG	3	9	240082	240090	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147918913
4599	NC_009464	GAG	2	6	240102	240107	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	147918913
4600	NC_009464	CTGAT	2	10	240122	240131	20 %	40 %	20 %	20 %	147918913
4601	NC_009464	GTC	2	6	240189	240194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147918913
4602	NC_009464	TGC	2	6	240230	240235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147918913
4603	NC_009464	TAA	2	6	240333	240338	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	147918913
4604	NC_009464	A	6	6	240360	240365	100 %	0 %	0 %	0 %	147918913
4605	NC_009464	CAC	2	6	240393	240398	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147918913
4606	NC_009464	TCGA	2	8	240436	240443	25 %	25 %	25 %	25 %	147918913
4607	NC_009464	CAT	2	6	240459	240464	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147918913
4608	NC_009464	GGT	2	6	240480	240485	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147918913
4609	NC_009464	TGAT	2	8	240502	240509	25 %	50 %	25 %	0 %	147918913
4610	NC_009464	AGC	2	6	240523	240528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147918913
4611	NC_009464	AAT	2	6	240540	240545	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	147918913
4612	NC_009464	GCG	2	6	240569	240574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147918913
4613	NC_009464	TAA	2	6	240618	240623	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	147918913
4614	NC_009464	TAA	2	6	240639	240644	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	147918913
4615	NC_009464	AG	3	6	240688	240693	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4616	NC_009464	CAG	2	6	240845	240850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147918914
4617	NC_009464	CAGCA	2	10	240965	240974	40 %	0 %	20 %	40 %	147918914
4618	NC_009464	CGAC	2	8	240985	240992	25 %	0 %	25 %	50 %	147918914
4619	NC_009464	CCG	2	6	240999	241004	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147918914
4620	NC_009464	CAG	3	9	241240	241248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147918914
4621	NC_009464	TCT	2	6	241297	241302	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147918914
4622	NC_009464	TCC	2	6	241414	241419	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	147918914
4623	NC_009464	TGC	3	9	241580	241588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4624	NC_009464	A	6	6	241591	241596	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4992	NC_009464	AGT	2	6	261090	261095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147918935
4993	NC_009464	TGC	2	6	261107	261112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147918935
4994	NC_009464	GTC	2	6	261114	261119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147918935
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4996	NC_009464	TC	3	6	261260	261265	0 %	50 %	0 %	50 %	147918935
4997	NC_009464	CTG	2	6	261277	261282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147918935
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