MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium avium 104 chromosome

Total Repeats: 152979

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_008595	CCG	3	9	181083	181091	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118462360
5002	NC_008595	GCC	2	6	181178	181183	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118462360
5003	NC_008595	CGTG	2	8	181191	181198	0 %	25 %	50 %	25 %	118462360
5004	NC_008595	CGC	2	6	181260	181265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118462360
5005	NC_008595	GAC	2	6	181282	181287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118462360
5006	NC_008595	CCG	3	9	181329	181337	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118462360
5007	NC_008595	GGC	2	6	181351	181356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118462360
5008	NC_008595	GCC	3	9	181367	181375	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118462360
5009	NC_008595	GTGG	2	8	181387	181394	0 %	25 %	75 %	0 %	118462360
5010	NC_008595	GC	3	6	181410	181415	0 %	0 %	50 %	50 %	118462360
5011	NC_008595	ACGCCG	2	12	181437	181448	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	118462360
5012	NC_008595	CAG	2	6	181451	181456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118462360
5013	NC_008595	GC	3	6	181468	181473	0 %	0 %	50 %	50 %	118462360
5014	NC_008595	CGC	2	6	181477	181482	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118462360
5015	NC_008595	GCC	3	9	181499	181507	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118462360
5016	NC_008595	CGT	2	6	181537	181542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118462360
5017	NC_008595	CGA	2	6	181543	181548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118462360
5018	NC_008595	GCC	2	6	181582	181587	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118462360
5019	NC_008595	CGC	3	9	181590	181598	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118462360
5020	NC_008595	GGT	2	6	181627	181632	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118462360
5021	NC_008595	CTG	2	6	181661	181666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118462360
5022	NC_008595	CCA	2	6	181725	181730	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	118462360
5023	NC_008595	TTC	2	6	181754	181759	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118462360
5024	NC_008595	CGA	3	9	181780	181788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118462360
5025	NC_008595	CCG	2	6	181819	181824	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118462360
5026	NC_008595	GCC	2	6	181882	181887	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118462360
5027	NC_008595	GGA	2	6	181894	181899	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118462360
5028	NC_008595	GCTG	2	8	181908	181915	0 %	25 %	50 %	25 %	118462360
5029	NC_008595	GCG	2	6	181916	181921	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118462360
5030	NC_008595	C	6	6	181943	181948	0 %	0 %	0 %	100 %	118462360
5031	NC_008595	CGG	2	6	181958	181963	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118462360
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5033	NC_008595	GCC	2	6	182034	182039	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118464437
5034	NC_008595	CGC	2	6	182054	182059	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118464437
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5036	NC_008595	GCCG	2	8	182099	182106	0 %	0 %	50 %	50 %	118464437
5037	NC_008595	CGG	2	6	182150	182155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118464437
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5039	NC_008595	GCC	2	6	182178	182183	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118464437
5040	NC_008595	GGC	2	6	182194	182199	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118464437
5041	NC_008595	GGC	2	6	182219	182224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118464437
5042	NC_008595	ACG	3	9	182237	182245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118464437
5043	NC_008595	CGG	2	6	182313	182318	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118464437
5044	NC_008595	GCTGCG	2	12	182367	182378	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	118464437
5045	NC_008595	GAC	2	6	182386	182391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118464437
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5047	NC_008595	CGGCG	2	10	182427	182436	0 %	0 %	60 %	40 %	118464437
5048	NC_008595	GGC	2	6	182445	182450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118464437
5049	NC_008595	TG	3	6	182551	182556	0 %	50 %	50 %	0 %	118464437
5050	NC_008595	CGC	2	6	182573	182578	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118464437
5051	NC_008595	GCC	2	6	182593	182598	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118464437
5052	NC_008595	CCA	2	6	182636	182641	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	118464437
5053	NC_008595	CCG	2	6	182661	182666	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5054	NC_008595	ATG	2	6	182801	182806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118463694
5055	NC_008595	CCCAA	2	10	182919	182928	40 %	0 %	0 %	60 %	118465828
5056	NC_008595	TCG	3	9	182942	182950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118465828
5057	NC_008595	GTG	2	6	182959	182964	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118465828
5058	NC_008595	CCT	2	6	182994	182999	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118465828
5059	NC_008595	CTG	2	6	183007	183012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118465828
5060	NC_008595	CAG	2	6	183031	183036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118465828
5061	NC_008595	CGC	2	6	183037	183042	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118465828
5062	NC_008595	GC	3	6	183069	183074	0 %	0 %	50 %	50 %	118465828
5063	NC_008595	AGT	2	6	183078	183083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118465828
5064	NC_008595	CTC	2	6	183136	183141	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118465828
5065	NC_008595	GTC	2	6	183151	183156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118465828
5066	NC_008595	GAC	3	9	183163	183171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118465828
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5068	NC_008595	TCG	2	6	183230	183235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118465828
5069	NC_008595	ATCC	2	8	183247	183254	25 %	25 %	0 %	50 %	118465828
5070	NC_008595	GCACGG	2	12	183255	183266	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	118465828
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5073	NC_008595	GCGG	2	8	183310	183317	0 %	0 %	75 %	25 %	118465173
5074	NC_008595	CGGG	2	8	183338	183345	0 %	0 %	75 %	25 %	118465173
5075	NC_008595	GGGGC	2	10	183368	183377	0 %	0 %	80 %	20 %	118465173
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5085	NC_008595	CAG	2	6	183591	183596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118465173
5086	NC_008595	CAG	2	6	183615	183620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118465173
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5089	NC_008595	GCCG	2	8	183678	183685	0 %	0 %	50 %	50 %	118465173
5090	NC_008595	TCAGCG	2	12	183716	183727	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	118465173
5091	NC_008595	TGG	2	6	183728	183733	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118465173
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5095	NC_008595	TGGT	2	8	183910	183917	0 %	50 %	50 %	0 %	118465173
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5104	NC_008595	GTC	2	6	184269	184274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118465173
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5110	NC_008595	CCGG	2	8	184404	184411	0 %	0 %	50 %	50 %	118465173
5111	NC_008595	GCC	3	9	184419	184427	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118465173
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5117	NC_008595	GGC	2	6	184539	184544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118465173
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5119	NC_008595	CAG	2	6	184622	184627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5120	NC_008595	CGC	2	6	184628	184633	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5121	NC_008595	TGC	2	6	184682	184687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5122	NC_008595	GCT	2	6	184740	184745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118467339
5123	NC_008595	CAA	2	6	184777	184782	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	118467339
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5197	NC_008595	CGAC	2	8	186803	186810	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5198	NC_008595	GCACCG	2	12	186845	186856	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	118463325
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5200	NC_008595	AGG	2	6	186880	186885	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118463325
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5223	NC_008595	CGA	2	6	187825	187830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118463108
5224	NC_008595	GC	3	6	187883	187888	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5225	NC_008595	GC	3	6	187973	187978	0 %	0 %	50 %	50 %	118463146
5226	NC_008595	AGCG	2	8	187979	187986	25 %	0 %	50 %	25 %	118463146
5227	NC_008595	GGA	2	6	188041	188046	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118463146
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5230	NC_008595	CGCC	2	8	188176	188183	0 %	0 %	25 %	75 %	118463146
5231	NC_008595	CGA	2	6	188188	188193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118463146
5232	NC_008595	ATC	2	6	188198	188203	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118463146
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5234	NC_008595	TCT	2	6	188223	188228	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118463146
5235	NC_008595	ACG	2	6	188238	188243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118463146
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5238	NC_008595	GCG	2	6	188348	188353	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118463146
5239	NC_008595	CGGCGC	2	12	188374	188385	0 %	0 %	50 %	50 %	118463146
5240	NC_008595	GC	3	6	188407	188412	0 %	0 %	50 %	50 %	118463146
5241	NC_008595	CG	3	6	188422	188427	0 %	0 %	50 %	50 %	118463146
5242	NC_008595	CGA	2	6	188476	188481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118463146
5243	NC_008595	CG	3	6	188500	188505	0 %	0 %	50 %	50 %	118463146
5244	NC_008595	GC	3	6	188533	188538	0 %	0 %	50 %	50 %	118463146
5245	NC_008595	CACCGC	2	12	188560	188571	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	118463146
5246	NC_008595	CGT	2	6	188607	188612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5247	NC_008595	CCT	2	6	188618	188623	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5248	NC_008595	ATGA	2	8	188639	188646	50 %	25 %	25 %	0 %	118466118
5249	NC_008595	ACG	2	6	188649	188654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118466118
5250	NC_008595	CCG	2	6	188688	188693	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118466118
5251	NC_008595	TGC	3	9	188697	188705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118466118
5252	NC_008595	CGG	2	6	188752	188757	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118466118
5253	NC_008595	GGT	2	6	188836	188841	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118466118
5254	NC_008595	CGA	2	6	188842	188847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118466118
5255	NC_008595	CGA	2	6	188868	188873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118466118
5256	NC_008595	CACC	2	8	188956	188963	25 %	0 %	0 %	75 %	118466118
5257	NC_008595	GGCC	2	8	189001	189008	0 %	0 %	50 %	50 %	118466118
5258	NC_008595	CG	3	6	189035	189040	0 %	0 %	50 %	50 %	118466118
5259	NC_008595	CGC	2	6	189063	189068	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118466118
5260	NC_008595	CGA	2	6	189079	189084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118466118
5261	NC_008595	CGA	2	6	189127	189132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118466118
5262	NC_008595	GGTC	2	8	189144	189151	0 %	25 %	50 %	25 %	118466118
5263	NC_008595	CGGCC	2	10	189244	189253	0 %	0 %	40 %	60 %	118466118
5264	NC_008595	GAA	2	6	189319	189324	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118466118
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5267	NC_008595	CGG	2	6	189382	189387	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118466118
5268	NC_008595	TCG	2	6	189498	189503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118466118
5269	NC_008595	GCT	2	6	189538	189543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118466118
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5271	NC_008595	GC	3	6	189575	189580	0 %	0 %	50 %	50 %	118466118
5272	NC_008595	GC	3	6	189584	189589	0 %	0 %	50 %	50 %	118466118
5273	NC_008595	ACC	2	6	189594	189599	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	118466118
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5276	NC_008595	GAG	2	6	189716	189721	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118466118
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5278	NC_008595	CGGCG	2	10	189746	189755	0 %	0 %	60 %	40 %	118466118
5279	NC_008595	CCGAC	2	10	189765	189774	20 %	0 %	20 %	60 %	118466118
5280	NC_008595	CGT	2	6	189775	189780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118466118
5281	NC_008595	CGC	2	6	189832	189837	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118466118
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5288	NC_008595	CCGATC	2	12	190097	190108	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	118466118
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5291	NC_008595	GACC	2	8	190195	190202	25 %	0 %	25 %	50 %	118466118
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5301	NC_008595	CGT	2	6	190597	190602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118464045
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5316	NC_008595	ATC	2	6	191289	191294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118464045
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5485	NC_008595	GCGG	2	8	196753	196760	0 %	0 %	75 %	25 %	118465940
5486	NC_008595	GGT	4	12	196778	196789	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118465940
5487	NC_008595	CGA	2	6	196792	196797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118465940
5488	NC_008595	GTCC	2	8	196805	196812	0 %	25 %	25 %	50 %	118465940
5489	NC_008595	CG	3	6	196813	196818	0 %	0 %	50 %	50 %	118465940
5490	NC_008595	GCG	2	6	196857	196862	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118465940
5491	NC_008595	GC	3	6	196914	196919	0 %	0 %	50 %	50 %	118465940
5492	NC_008595	TCG	2	6	196924	196929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118465940
5493	NC_008595	CTG	2	6	196976	196981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118465940
5494	NC_008595	GCT	2	6	197026	197031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118465940
5495	NC_008595	GC	3	6	197059	197064	0 %	0 %	50 %	50 %	118465940
5496	NC_008595	CGG	2	6	197065	197070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118465940
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5498	NC_008595	CCCA	2	8	197094	197101	25 %	0 %	0 %	75 %	118465940
5499	NC_008595	GAC	2	6	197111	197116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118465940
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