MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanospirillum hungatei JF-1 chromosome

Total Repeats: 74198

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_007796	ATC	2	6	51003	51008	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	88601352
1002	NC_007796	CAT	2	6	51026	51031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	88601352
1003	NC_007796	AG	3	6	51181	51186	50 %	0 %	50 %	0 %	88601353
1004	NC_007796	GCT	2	6	51187	51192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	88601353
1005	NC_007796	GTG	2	6	51197	51202	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	88601353
1006	NC_007796	ATT	2	6	51225	51230	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	88601353
1007	NC_007796	A	6	6	51365	51370	100 %	0 %	0 %	0 %	88601353
1008	NC_007796	AT	3	6	51385	51390	50 %	50 %	0 %	0 %	88601353
1009	NC_007796	GTG	2	6	51400	51405	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	88601353
1010	NC_007796	AGC	2	6	51573	51578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	88601353
1011	NC_007796	T	6	6	51611	51616	0 %	100 %	0 %	0 %	88601353
1012	NC_007796	GGA	2	6	51750	51755	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	88601353
1013	NC_007796	CTT	2	6	51762	51767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	88601353
1014	NC_007796	T	6	6	51766	51771	0 %	100 %	0 %	0 %	88601353
1015	NC_007796	ATT	2	6	51835	51840	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	88601353
1016	NC_007796	TC	3	6	51855	51860	0 %	50 %	0 %	50 %	88601353
1017	NC_007796	T	6	6	51892	51897	0 %	100 %	0 %	0 %	88601353
1018	NC_007796	TCAC	3	12	51921	51932	25 %	25 %	0 %	50 %	88601353
1019	NC_007796	CAT	2	6	52012	52017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	88601353
1020	NC_007796	ATGGC	2	10	52030	52039	20 %	20 %	40 %	20 %	88601353
1021	NC_007796	AGA	2	6	52077	52082	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	88601353
1022	NC_007796	ACCT	2	8	52084	52091	25 %	25 %	0 %	50 %	88601353
1023	NC_007796	TC	3	6	52098	52103	0 %	50 %	0 %	50 %	88601353
1024	NC_007796	GTA	2	6	52264	52269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	88601353
1025	NC_007796	ATG	2	6	52283	52288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	88601353
1026	NC_007796	CAG	2	6	52292	52297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	88601353
1027	NC_007796	ATG	2	6	52331	52336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	88601353
1028	NC_007796	TG	3	6	52529	52534	0 %	50 %	50 %	0 %	88601353
1029	NC_007796	TG	3	6	52541	52546	0 %	50 %	50 %	0 %	88601353
1030	NC_007796	AAGA	2	8	52548	52555	75 %	0 %	25 %	0 %	88601353
1031	NC_007796	GAT	2	6	52585	52590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	88601353
1032	NC_007796	TGA	2	6	52605	52610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	88601353
1033	NC_007796	GTA	2	6	52639	52644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	88601353
1034	NC_007796	GAG	2	6	52654	52659	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	88601353
1035	NC_007796	AGG	2	6	52664	52669	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	88601353
1036	NC_007796	AAT	3	9	52729	52737	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	88601353
1037	NC_007796	AGT	2	6	52833	52838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	88601353
1038	NC_007796	TGA	3	9	52854	52862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	88601353
1039	NC_007796	CT	3	6	52895	52900	0 %	50 %	0 %	50 %	88601353
1040	NC_007796	GCA	3	9	52974	52982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	88601353
1041	NC_007796	AT	3	6	52995	53000	50 %	50 %	0 %	0 %	88601353
1042	NC_007796	TTCTTT	2	12	53011	53022	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1043	NC_007796	T	6	6	53074	53079	0 %	100 %	0 %	0 %	88601354
1044	NC_007796	AGT	2	6	53092	53097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	88601354
1045	NC_007796	TGC	2	6	53128	53133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	88601354
1046	NC_007796	AAG	2	6	53211	53216	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	88601354
1047	NC_007796	TAT	2	6	53281	53286	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	88601354
1048	NC_007796	TGA	2	6	53322	53327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	88601354
1049	NC_007796	AAG	2	6	53328	53333	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	88601354
1050	NC_007796	GGA	2	6	53402	53407	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	88601355
1051	NC_007796	CCT	2	6	53413	53418	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	88601355
1052	NC_007796	CT	3	6	53417	53422	0 %	50 %	0 %	50 %	88601355
1053	NC_007796	TCA	2	6	53445	53450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	88601355
1054	NC_007796	A	6	6	53458	53463	100 %	0 %	0 %	0 %	88601355
1055	NC_007796	A	6	6	53482	53487	100 %	0 %	0 %	0 %	88601355
1056	NC_007796	TGA	2	6	53499	53504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	88601355
1057	NC_007796	TCT	2	6	53514	53519	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	88601355
1058	NC_007796	ATGG	2	8	53550	53557	25 %	25 %	50 %	0 %	88601355
1059	NC_007796	CAGG	2	8	53566	53573	25 %	0 %	50 %	25 %	88601355
1060	NC_007796	TTCA	2	8	53642	53649	25 %	50 %	0 %	25 %	88601355
1061	NC_007796	GCAG	2	8	53700	53707	25 %	0 %	50 %	25 %	88601355
1062	NC_007796	GAT	2	6	53713	53718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	88601355
1063	NC_007796	ATC	2	6	53743	53748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	88601355
1064	NC_007796	GAA	2	6	53830	53835	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	88601355
1065	NC_007796	GAA	3	9	53839	53847	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	88601355
1066	NC_007796	CTC	2	6	53859	53864	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	88601355
1067	NC_007796	ATT	2	6	53886	53891	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	88601355
1068	NC_007796	CTCTG	2	10	53896	53905	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
1069	NC_007796	CTCA	2	8	53931	53938	25 %	25 %	0 %	50 %	88601356
1070	NC_007796	TCT	2	6	53971	53976	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	88601356
1071	NC_007796	CAC	2	6	53988	53993	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	88601356
1072	NC_007796	ATT	2	6	54035	54040	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	88601356
1073	NC_007796	GATCT	2	10	54120	54129	20 %	40 %	20 %	20 %	88601356
1074	NC_007796	TCA	2	6	54139	54144	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	88601356
1075	NC_007796	GGA	2	6	54176	54181	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	88601356
1076	NC_007796	GAT	2	6	54182	54187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	88601356
1077	NC_007796	GAT	2	6	54202	54207	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	88601356
1078	NC_007796	AGG	2	6	54262	54267	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	88601356
1079	NC_007796	CTGA	2	8	54299	54306	25 %	25 %	25 %	25 %	88601356
1080	NC_007796	TCA	2	6	54459	54464	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	88601356
1081	NC_007796	CTG	2	6	54501	54506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	88601356
1082	NC_007796	TCA	2	6	54530	54535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	88601356
1083	NC_007796	CCTCTT	2	12	54536	54547	0 %	50 %	0 %	50 %	88601356
1084	NC_007796	ATGG	2	8	54606	54613	25 %	25 %	50 %	0 %	88601356
1085	NC_007796	CGA	2	6	54622	54627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	88601356
1086	NC_007796	CT	3	6	54643	54648	0 %	50 %	0 %	50 %	88601356
1087	NC_007796	AAAC	2	8	54680	54687	75 %	0 %	0 %	25 %	88601357
1088	NC_007796	TGA	2	6	54693	54698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	88601357
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1090	NC_007796	TGG	2	6	54800	54805	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	88601357
1091	NC_007796	GA	3	6	54809	54814	50 %	0 %	50 %	0 %	88601357
1092	NC_007796	GTT	2	6	54826	54831	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	88601357
1093	NC_007796	ATT	2	6	54839	54844	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	88601357
1094	NC_007796	TTC	2	6	54860	54865	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	88601357
1095	NC_007796	GTAT	2	8	54898	54905	25 %	50 %	25 %	0 %	88601357
1096	NC_007796	TAT	2	6	54946	54951	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	88601357
1097	NC_007796	ATG	2	6	55025	55030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	88601358
1098	NC_007796	TC	3	6	55222	55227	0 %	50 %	0 %	50 %	88601358
1099	NC_007796	T	6	6	55229	55234	0 %	100 %	0 %	0 %	88601358
1100	NC_007796	TGA	2	6	55288	55293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	88601358
1101	NC_007796	TATC	2	8	55294	55301	25 %	50 %	0 %	25 %	88601358
1102	NC_007796	ATCG	2	8	55312	55319	25 %	25 %	25 %	25 %	88601358
1103	NC_007796	GCG	2	6	55344	55349	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	88601358
1104	NC_007796	TC	3	6	55380	55385	0 %	50 %	0 %	50 %	88601358
1105	NC_007796	GTCG	2	8	55418	55425	0 %	25 %	50 %	25 %	88601358
1106	NC_007796	GAT	2	6	55453	55458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	88601358
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1108	NC_007796	TGA	2	6	55480	55485	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	88601358
1109	NC_007796	GGA	3	9	55592	55600	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	88601358
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1111	NC_007796	TAT	2	6	55718	55723	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	88601358
1112	NC_007796	ATG	2	6	55803	55808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	88601358
1113	NC_007796	GTCA	2	8	55826	55833	25 %	25 %	25 %	25 %	88601358
1114	NC_007796	AGG	2	6	55842	55847	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	88601358
1115	NC_007796	TTCA	2	8	55880	55887	25 %	50 %	0 %	25 %	88601358
1116	NC_007796	GA	3	6	55896	55901	50 %	0 %	50 %	0 %	88601358
1117	NC_007796	AT	3	6	55926	55931	50 %	50 %	0 %	0 %	88601358
1118	NC_007796	CAGA	2	8	55954	55961	50 %	0 %	25 %	25 %	88601358
1119	NC_007796	ACCG	2	8	55984	55991	25 %	0 %	25 %	50 %	88601358
1120	NC_007796	GAT	2	6	56005	56010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	88601358
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1129	NC_007796	TGA	2	6	56362	56367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	88601358
1130	NC_007796	ATC	2	6	56369	56374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	88601358
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1132	NC_007796	TGA	2	6	56455	56460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	88601358
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1134	NC_007796	ATT	2	6	56569	56574	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	88601358
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1147	NC_007796	TCTG	2	8	57090	57097	0 %	50 %	25 %	25 %	88601358
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1244	NC_007796	TC	3	6	61412	61417	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1245	NC_007796	AT	3	6	61433	61438	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1248	NC_007796	TGT	2	6	61616	61621	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	88601364
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1250	NC_007796	CAT	2	6	61687	61692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	88601364
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1252	NC_007796	GCA	2	6	61830	61835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	88601364
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1254	NC_007796	TGA	2	6	61856	61861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	88601364
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1256	NC_007796	AGC	2	6	61982	61987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	88601364
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