MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanosphaera stadtmanae DSM 3091 chromosome

Total Repeats: 55123

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007681	T	7	7	8	14	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_007681	A	7	7	18	24	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_007681	A	8	8	59	66	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_007681	TAAAA	2	10	73	82	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_007681	AT	3	6	86	91	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_007681	GTAA	2	8	110	117	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_007681	AT	3	6	120	125	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_007681	A	6	6	137	142	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_007681	A	9	9	180	188	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_007681	T	9	9	220	228	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_007681	A	8	8	257	264	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_007681	T	6	6	280	285	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_007681	A	6	6	322	327	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_007681	TAT	2	6	332	337	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_007681	TTA	2	6	338	343	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_007681	TTAT	2	8	345	352	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_007681	TA	3	6	353	358	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_007681	TAT	2	6	362	367	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_007681	TTA	3	9	368	376	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_007681	TATT	2	8	381	388	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_007681	TAT	2	6	392	397	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_007681	TTA	3	9	398	406	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_007681	TAT	2	6	410	415	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_007681	TAT	2	6	422	427	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_007681	TATT	2	8	431	438	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_007681	TTTTA	2	10	439	448	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_007681	AT	4	8	449	456	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_007681	TTA	2	6	466	471	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_007681	AAT	2	6	485	490	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_007681	TATTTT	2	12	513	524	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_007681	CTT	2	6	535	540	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_007681	TTAT	2	8	565	572	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_007681	CT	3	6	597	602	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_007681	ATTA	2	8	632	639	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_007681	TAC	2	6	665	670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_007681	AATATA	2	12	672	683	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_007681	GGA	2	6	708	713	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_007681	AAT	2	6	721	726	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	84488832
39	NC_007681	AT	3	6	725	730	50 %	50 %	0 %	0 %	84488832
40	NC_007681	CAA	2	6	741	746	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	84488832
41	NC_007681	A	7	7	768	774	100 %	0 %	0 %	0 %	84488832
42	NC_007681	A	6	6	821	826	100 %	0 %	0 %	0 %	84488832
43	NC_007681	CCT	2	6	874	879	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	84488832
44	NC_007681	A	6	6	937	942	100 %	0 %	0 %	0 %	84488832
45	NC_007681	AGA	2	6	948	953	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	84488832
46	NC_007681	GCT	2	6	958	963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	84488832
47	NC_007681	CAA	2	6	1045	1050	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	84488832
48	NC_007681	AGT	2	6	1092	1097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	84488832
49	NC_007681	ATTT	2	8	1112	1119	25 %	75 %	0 %	0 %	84488832
50	NC_007681	TTTAAT	2	12	1143	1154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	84488832
51	NC_007681	ATG	2	6	1190	1195	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	84488832
52	NC_007681	AT	3	6	1202	1207	50 %	50 %	0 %	0 %	84488832
53	NC_007681	AGT	2	6	1297	1302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	84488832
54	NC_007681	TCC	2	6	1326	1331	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	84488832
55	NC_007681	CAA	2	6	1342	1347	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	84488832
56	NC_007681	AAAG	2	8	1363	1370	75 %	0 %	25 %	0 %	84488832
57	NC_007681	TGC	2	6	1434	1439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	84488832
58	NC_007681	AGA	2	6	1443	1448	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	84488832
59	NC_007681	TTA	2	6	1474	1479	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	84488832
60	NC_007681	TCT	2	6	1513	1518	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	84488832
61	NC_007681	GAA	2	6	1525	1530	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	84488832
62	NC_007681	AAG	2	6	1541	1546	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	84488832
63	NC_007681	ATA	2	6	1573	1578	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	84488832
64	NC_007681	TGT	3	9	1581	1589	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	84488832
65	NC_007681	CAA	3	9	1603	1611	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	84488832
66	NC_007681	ACTT	2	8	1630	1637	25 %	50 %	0 %	25 %	84488832
67	NC_007681	A	7	7	1641	1647	100 %	0 %	0 %	0 %	84488832
68	NC_007681	GAA	2	6	1651	1656	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	84488832
69	NC_007681	AGA	2	6	1720	1725	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	84488832
70	NC_007681	TTA	2	6	1736	1741	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	84488832
71	NC_007681	AT	3	6	1858	1863	50 %	50 %	0 %	0 %	84488832
72	NC_007681	CTA	2	6	1881	1886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_007681	T	6	6	1887	1892	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_007681	TAT	2	6	1906	1911	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_007681	TCTT	2	8	1962	1969	0 %	75 %	0 %	25 %	84488833
76	NC_007681	AAT	2	6	2032	2037	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	84488833
77	NC_007681	ATCA	2	8	2067	2074	50 %	25 %	0 %	25 %	84488833
78	NC_007681	T	6	6	2160	2165	0 %	100 %	0 %	0 %	84488833
79	NC_007681	TACT	2	8	2177	2184	25 %	50 %	0 %	25 %	84488833
80	NC_007681	CTA	2	6	2204	2209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	84488833
81	NC_007681	TTG	2	6	2228	2233	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	84488833
82	NC_007681	CA	3	6	2240	2245	50 %	0 %	0 %	50 %	84488833
83	NC_007681	CTC	2	6	2256	2261	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
84	NC_007681	TA	3	6	2274	2279	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_007681	AT	3	6	2294	2299	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_007681	T	7	7	2332	2338	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_007681	TCT	2	6	2365	2370	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_007681	CTT	2	6	2406	2411	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_007681	T	8	8	2410	2417	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_007681	TTA	2	6	2422	2427	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_007681	ATT	2	6	2486	2491	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_007681	T	8	8	2490	2497	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_007681	TTC	2	6	2511	2516	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_007681	T	6	6	2520	2525	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_007681	ATTT	2	8	2528	2535	25 %	75 %	0 %	0 %	84488834
96	NC_007681	TAT	2	6	2536	2541	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	84488834
97	NC_007681	TGCT	2	8	2581	2588	0 %	50 %	25 %	25 %	84488834
98	NC_007681	TCA	2	6	2633	2638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	84488834
99	NC_007681	ATG	2	6	2660	2665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	84488834
100	NC_007681	CTTTTA	2	12	2709	2720	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	84488834
101	NC_007681	TCTT	2	8	2743	2750	0 %	75 %	0 %	25 %	84488834
102	NC_007681	AT	4	8	2765	2772	50 %	50 %	0 %	0 %	84488834
103	NC_007681	CAT	2	6	2781	2786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	84488834
104	NC_007681	AATTT	2	10	2826	2835	40 %	60 %	0 %	0 %	84488834
105	NC_007681	TGG	2	6	2857	2862	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	84488834
106	NC_007681	TAAAC	2	10	2921	2930	60 %	20 %	0 %	20 %	84488834
107	NC_007681	CAA	2	6	2961	2966	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	84488834
108	NC_007681	T	6	6	2981	2986	0 %	100 %	0 %	0 %	84488834
109	NC_007681	TA	3	6	3012	3017	50 %	50 %	0 %	0 %	84488834
110	NC_007681	TGT	2	6	3041	3046	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	84488834
111	NC_007681	CAA	2	6	3081	3086	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	84488834
112	NC_007681	AGC	2	6	3103	3108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	84488834
113	NC_007681	ATA	2	6	3174	3179	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	84488834
114	NC_007681	CAA	2	6	3222	3227	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	84488834
115	NC_007681	TAA	2	6	3304	3309	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	84488834
116	NC_007681	AT	4	8	3378	3385	50 %	50 %	0 %	0 %	84488834
117	NC_007681	ATATT	2	10	3417	3426	40 %	60 %	0 %	0 %	84488834
118	NC_007681	CTAAA	2	10	3429	3438	60 %	20 %	0 %	20 %	84488834
119	NC_007681	TTC	2	6	3529	3534	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	84488835
120	NC_007681	TTA	2	6	3604	3609	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	84488835
121	NC_007681	GT	3	6	3635	3640	0 %	50 %	50 %	0 %	84488835
122	NC_007681	ACC	2	6	3654	3659	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	84488835
123	NC_007681	TA	3	6	3773	3778	50 %	50 %	0 %	0 %	84488835
124	NC_007681	ATT	2	6	3820	3825	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	84488835
125	NC_007681	TCT	2	6	3835	3840	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	84488835
126	NC_007681	CAA	2	6	3875	3880	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	84488835
127	NC_007681	A	6	6	3888	3893	100 %	0 %	0 %	0 %	84488835
128	NC_007681	TAG	2	6	3894	3899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	84488835
129	NC_007681	ACT	2	6	3900	3905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	84488835
130	NC_007681	CAA	2	6	3926	3931	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	84488835
131	NC_007681	TAC	2	6	3935	3940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	84488835
132	NC_007681	TAA	2	6	3987	3992	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	84488835
133	NC_007681	TAT	2	6	4148	4153	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	84488835
134	NC_007681	CTA	2	6	4181	4186	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	84488835
135	NC_007681	TAT	3	9	4210	4218	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_007681	TATT	2	8	4233	4240	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_007681	TAAT	2	8	4254	4261	50 %	50 %	0 %	0 %	84488836
138	NC_007681	TCC	2	6	4278	4283	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	84488836
139	NC_007681	TTTAA	2	10	4296	4305	40 %	60 %	0 %	0 %	84488836
140	NC_007681	AAT	2	6	4376	4381	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	84488836
141	NC_007681	ATA	2	6	4391	4396	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	84488836
142	NC_007681	TCA	2	6	4410	4415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	84488836
143	NC_007681	T	8	8	4419	4426	0 %	100 %	0 %	0 %	84488836
144	NC_007681	ATAA	2	8	4428	4435	75 %	25 %	0 %	0 %	84488836
145	NC_007681	T	7	7	4452	4458	0 %	100 %	0 %	0 %	84488836
146	NC_007681	TTG	2	6	4507	4512	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	84488836
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459	NC_007681	ATA	3	9	14993	15001	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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461	NC_007681	ATT	2	6	15009	15014	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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