MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanosarcina barkeri str. fusaro plasmid 1

Total Repeats: 829

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007349	AG	3	6	28	33	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_007349	A	6	6	53	58	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_007349	TC	3	6	90	95	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_007349	TGC	2	6	100	105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_007349	TCTG	2	8	120	127	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6	NC_007349	TCT	2	6	247	252	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	73663827
7	NC_007349	GAAAG	2	10	302	311	60 %	0 %	40 %	0 %	73663827
8	NC_007349	AAAT	2	8	382	389	75 %	25 %	0 %	0 %	73663827
9	NC_007349	T	7	7	409	415	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_007349	TA	3	6	456	461	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_007349	ATT	2	6	470	475	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_007349	TTTTTA	2	12	507	518	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_007349	TA	3	6	534	539	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_007349	ATT	3	9	633	641	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_007349	TAT	2	6	651	656	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_007349	TTC	2	6	658	663	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_007349	AAT	2	6	677	682	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_007349	ATT	2	6	700	705	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_007349	AAG	2	6	741	746	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_007349	AGT	2	6	777	782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73663828
21	NC_007349	AGGA	2	8	1003	1010	50 %	0 %	50 %	0 %	73663828
22	NC_007349	TAC	2	6	1021	1026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73663828
23	NC_007349	ATT	2	6	1042	1047	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73663828
24	NC_007349	TAT	2	6	1146	1151	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73663828
25	NC_007349	CCTG	2	8	1165	1172	0 %	25 %	25 %	50 %	73663828
26	NC_007349	T	6	6	1316	1321	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_007349	A	6	6	1322	1327	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_007349	TA	3	6	1459	1464	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_007349	T	7	7	1481	1487	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_007349	T	6	6	1511	1516	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_007349	ATTT	2	8	1518	1525	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_007349	T	6	6	1666	1671	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_007349	GAAT	2	8	1880	1887	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_007349	AAAT	2	8	1917	1924	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_007349	T	6	6	1938	1943	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_007349	T	6	6	1972	1977	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_007349	TTAA	2	8	2012	2019	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_007349	AAG	2	6	2053	2058	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	73663829
39	NC_007349	GCCT	2	8	2074	2081	0 %	25 %	25 %	50 %	73663829
40	NC_007349	GA	3	6	2097	2102	50 %	0 %	50 %	0 %	73663829
41	NC_007349	TCAAT	2	10	2138	2147	40 %	40 %	0 %	20 %	73663829
42	NC_007349	ACT	2	6	2166	2171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73663829
43	NC_007349	A	7	7	2184	2190	100 %	0 %	0 %	0 %	73663829
44	NC_007349	TAC	2	6	2294	2299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73663829
45	NC_007349	TTG	2	6	2310	2315	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	73663829
46	NC_007349	GAAC	2	8	2323	2330	50 %	0 %	25 %	25 %	73663829
47	NC_007349	CTA	2	6	2358	2363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73663829
48	NC_007349	TTC	2	6	2466	2471	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	73663829
49	NC_007349	A	6	6	2472	2477	100 %	0 %	0 %	0 %	73663829
50	NC_007349	TAC	2	6	2538	2543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73663829
51	NC_007349	CT	3	6	2585	2590	0 %	50 %	0 %	50 %	73663829
52	NC_007349	ATC	2	6	2658	2663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73663829
53	NC_007349	TCT	2	6	2774	2779	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	73663829
54	NC_007349	AAAAC	2	10	2855	2864	80 %	0 %	0 %	20 %	73663829
55	NC_007349	TATCAA	2	12	2887	2898	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	73663829
56	NC_007349	GGA	2	6	2986	2991	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_007349	AAG	2	6	2999	3004	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_007349	ATTA	2	8	3050	3057	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_007349	ATGTA	2	10	3083	3092	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
60	NC_007349	GA	3	6	3118	3123	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_007349	ATT	2	6	3133	3138	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_007349	A	6	6	3225	3230	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_007349	TATAA	2	10	3250	3259	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_007349	A	6	6	3258	3263	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_007349	TTTAA	2	10	3312	3321	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_007349	ATT	2	6	3329	3334	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_007349	TAA	2	6	3339	3344	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_007349	AAAG	2	8	3364	3371	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_007349	ATT	2	6	3409	3414	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_007349	ATG	2	6	3421	3426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_007349	TAT	2	6	3430	3435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_007349	AT	3	6	3442	3447	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_007349	TAA	2	6	3455	3460	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_007349	AATA	2	8	3461	3468	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_007349	AAC	2	6	3492	3497	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_007349	TATT	2	8	3516	3523	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_007349	TGT	2	6	3528	3533	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_007349	TTA	2	6	3593	3598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_007349	AAT	2	6	3732	3737	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_007349	GAT	2	6	3802	3807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_007349	A	6	6	3822	3827	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_007349	ACTT	2	8	3906	3913	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
83	NC_007349	AT	4	8	4020	4027	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_007349	CA	3	6	4056	4061	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_007349	TA	3	6	4084	4089	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_007349	TACA	2	8	4100	4107	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
87	NC_007349	TCAA	2	8	4110	4117	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
88	NC_007349	AAGT	2	8	4158	4165	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NC_007349	AT	3	6	4184	4189	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_007349	CTT	2	6	4218	4223	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_007349	A	6	6	4264	4269	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_007349	TGA	2	6	4283	4288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_007349	AAG	2	6	4337	4342	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_007349	AGCA	2	8	4382	4389	50 %	0 %	25 %	25 %	73663830
95	NC_007349	TTATT	2	10	4462	4471	20 %	80 %	0 %	0 %	73663830
96	NC_007349	GAT	2	6	4498	4503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73663830
97	NC_007349	CCT	2	6	4515	4520	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	73663830
98	NC_007349	TC	3	6	4550	4555	0 %	50 %	0 %	50 %	73663830
99	NC_007349	AG	3	6	4593	4598	50 %	0 %	50 %	0 %	73663830
100	NC_007349	A	6	6	4607	4612	100 %	0 %	0 %	0 %	73663830
101	NC_007349	TGC	2	6	4668	4673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	73663830
102	NC_007349	TAC	2	6	4683	4688	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73663830
103	NC_007349	GTT	2	6	4705	4710	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	73663830
104	NC_007349	T	6	6	4709	4714	0 %	100 %	0 %	0 %	73663830
105	NC_007349	ATA	2	6	4847	4852	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73663830
106	NC_007349	AATA	2	8	4858	4865	75 %	25 %	0 %	0 %	73663830
107	NC_007349	CTT	2	6	4868	4873	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	73663830
108	NC_007349	CA	3	6	4986	4991	50 %	0 %	0 %	50 %	73663830
109	NC_007349	CTT	2	6	5003	5008	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	73663830
110	NC_007349	CAG	2	6	5029	5034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	73663830
111	NC_007349	GGA	2	6	5063	5068	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	73663830
112	NC_007349	TTA	3	9	5073	5081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73663830
113	NC_007349	T	8	8	5097	5104	0 %	100 %	0 %	0 %	73663830
114	NC_007349	ATT	2	6	5134	5139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73663830
115	NC_007349	GAA	2	6	5267	5272	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	73663830
116	NC_007349	CTT	2	6	5360	5365	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	73663830
117	NC_007349	CT	3	6	5396	5401	0 %	50 %	0 %	50 %	73663830
118	NC_007349	TAA	2	6	5412	5417	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73663830
119	NC_007349	GTTGCA	2	12	5582	5593	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	73663830
120	NC_007349	CTA	2	6	5643	5648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73663830
121	NC_007349	ACT	2	6	5669	5674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73663830
122	NC_007349	T	7	7	5743	5749	0 %	100 %	0 %	0 %	73663830
123	NC_007349	TAA	2	6	5775	5780	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73663830
124	NC_007349	ATA	2	6	5855	5860	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73663830
125	NC_007349	CTT	2	6	5874	5879	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	73663830
126	NC_007349	TTC	3	9	6031	6039	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_007349	T	6	6	6054	6059	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_007349	ATT	3	9	6089	6097	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_007349	CTT	2	6	6128	6133	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_007349	T	6	6	6144	6149	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_007349	ATA	2	6	6158	6163	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_007349	AT	3	6	6175	6180	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_007349	ATCT	2	8	6215	6222	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
134	NC_007349	AAT	2	6	6252	6257	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_007349	GGGC	2	8	6292	6299	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
136	NC_007349	TCGAG	2	10	6313	6322	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
137	NC_007349	TAA	2	6	6326	6331	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_007349	ACA	2	6	6386	6391	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_007349	TCAAAA	2	12	6454	6465	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
140	NC_007349	GATT	2	8	6473	6480	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
141	NC_007349	TCG	2	6	6490	6495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_007349	ACG	2	6	6613	6618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_007349	TCA	2	6	6628	6633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_007349	A	6	6	6633	6638	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_007349	TTC	2	6	6715	6720	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_007349	G	6	6	6733	6738	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
147	NC_007349	T	6	6	6757	6762	0 %	100 %	0 %	0 %	73663831
148	NC_007349	TTA	2	6	6800	6805	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73663831
149	NC_007349	GAAA	2	8	6983	6990	75 %	0 %	25 %	0 %	73663831
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285	NC_007349	ATTTT	2	10	14062	14071	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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422	NC_007349	CAT	2	6	21032	21037	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73663838
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435	NC_007349	TA	3	6	21382	21387	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
436	NC_007349	A	7	7	21397	21403	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
437	NC_007349	TA	3	6	21404	21409	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
438	NC_007349	TAT	2	6	21413	21418	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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464	NC_007349	AT	3	6	22813	22818	50 %	50 %	0 %	0 %	73663839
465	NC_007349	ATT	2	6	22883	22888	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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471	NC_007349	CTT	2	6	23275	23280	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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483	NC_007349	T	7	7	23981	23987	0 %	100 %	0 %	0 %	73663841
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