MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mannheimia succiniciproducens MBEL55E chromosome

Total Repeats: 47348

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_006300	AAG	2	6	221821	221826	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	52424298
4502	NC_006300	ATA	2	6	221867	221872	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	52424298
4503	NC_006300	TTA	2	6	221895	221900	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	52424298
4504	NC_006300	TTTA	2	8	221908	221915	25 %	75 %	0 %	0 %	52424298
4505	NC_006300	A	6	6	221942	221947	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4506	NC_006300	A	8	8	221951	221958	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4507	NC_006300	TTC	2	6	222067	222072	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	52424299
4508	NC_006300	CG	3	6	222090	222095	0 %	0 %	50 %	50 %	52424299
4509	NC_006300	T	6	6	222106	222111	0 %	100 %	0 %	0 %	52424299
4510	NC_006300	TTCG	2	8	222163	222170	0 %	50 %	25 %	25 %	52424299
4511	NC_006300	TTC	2	6	222265	222270	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	52424299
4512	NC_006300	TGA	2	6	222274	222279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	52424299
4513	NC_006300	CCG	2	6	222287	222292	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	52424299
4514	NC_006300	CGA	2	6	222339	222344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	52424299
4515	NC_006300	ATA	2	6	222474	222479	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	52424299
4516	NC_006300	TCA	2	6	222509	222514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	52424299
4517	NC_006300	TCT	2	6	222536	222541	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	52424299
4518	NC_006300	CCG	2	6	222545	222550	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	52424299
4519	NC_006300	CGATTT	2	12	222558	222569	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	52424299
4520	NC_006300	TTC	2	6	222628	222633	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	52424299
4521	NC_006300	TTC	2	6	222640	222645	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	52424299
4522	NC_006300	GAG	2	6	222665	222670	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	52424299
4523	NC_006300	GAC	2	6	222678	222683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	52424299
4524	NC_006300	TAA	2	6	222736	222741	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	52424299
4525	NC_006300	T	6	6	222742	222747	0 %	100 %	0 %	0 %	52424299
4526	NC_006300	GC	4	8	222842	222849	0 %	0 %	50 %	50 %	52424299
4527	NC_006300	ATG	2	6	222885	222890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	52424299
4528	NC_006300	CCG	2	6	222893	222898	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	52424299
4529	NC_006300	GCC	2	6	222935	222940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	52424299
4530	NC_006300	CA	3	6	222973	222978	50 %	0 %	0 %	50 %	52424299
4531	NC_006300	TAA	2	6	223072	223077	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	52424299
4532	NC_006300	ACCTT	2	10	223223	223232	20 %	40 %	0 %	40 %	52424300
4533	NC_006300	CAA	2	6	223233	223238	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	52424300
4534	NC_006300	CCG	3	9	223253	223261	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	52424300
4535	NC_006300	TTC	2	6	223474	223479	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	52424300
4536	NC_006300	TCG	2	6	223511	223516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	52424300
4537	NC_006300	TGC	2	6	223609	223614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	52424300
4538	NC_006300	TCT	2	6	223643	223648	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	52424300
4539	NC_006300	CCG	2	6	223706	223711	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	52424300
4540	NC_006300	TAG	2	6	223764	223769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	52424300
4541	NC_006300	TAA	2	6	223852	223857	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	52424300
4542	NC_006300	GCAA	2	8	223867	223874	50 %	0 %	25 %	25 %	52424300
4543	NC_006300	T	6	6	223969	223974	0 %	100 %	0 %	0 %	52424300
4544	NC_006300	TTTTC	2	10	223992	224001	0 %	80 %	0 %	20 %	52424300
4545	NC_006300	TTG	2	6	224006	224011	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	52424300
4546	NC_006300	AGT	2	6	224067	224072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	52424300
4547	NC_006300	TTG	2	6	224229	224234	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	52424300
4548	NC_006300	ATA	2	6	224348	224353	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	52424300
4549	NC_006300	ATA	2	6	224372	224377	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4550	NC_006300	ATTT	2	8	224450	224457	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4551	NC_006300	A	6	6	224508	224513	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4552	NC_006300	T	6	6	224530	224535	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4553	NC_006300	TTA	2	6	224590	224595	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	52424301
4554	NC_006300	TCG	2	6	224628	224633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	52424301
4555	NC_006300	ATT	2	6	224669	224674	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	52424301
4556	NC_006300	T	6	6	224673	224678	0 %	100 %	0 %	0 %	52424301
4557	NC_006300	CAGC	2	8	224681	224688	25 %	0 %	25 %	50 %	52424301
4558	NC_006300	TTTCA	2	10	224705	224714	20 %	60 %	0 %	20 %	52424301
4559	NC_006300	CGGT	2	8	224716	224723	0 %	25 %	50 %	25 %	52424301
4560	NC_006300	CTG	2	6	224747	224752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	52424301
4561	NC_006300	TAA	2	6	224816	224821	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	52424301
4562	NC_006300	GGGCTT	2	12	224826	224837	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	52424301
4563	NC_006300	AT	3	6	224844	224849	50 %	50 %	0 %	0 %	52424301
4564	NC_006300	TTC	2	6	224864	224869	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	52424301
4565	NC_006300	T	6	6	224966	224971	0 %	100 %	0 %	0 %	52424301
4566	NC_006300	CGG	2	6	224992	224997	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	52424301
4567	NC_006300	AGG	2	6	225043	225048	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	52424301
4568	NC_006300	ATA	2	6	225071	225076	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	52424301
4569	NC_006300	AAT	2	6	225251	225256	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	52424301
4570	NC_006300	AGG	2	6	225276	225281	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	52424301
4571	NC_006300	TAAA	2	8	225346	225353	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4572	NC_006300	GTT	2	6	225356	225361	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4573	NC_006300	CAC	2	6	225367	225372	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4574	NC_006300	TGA	2	6	225495	225500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	52424302
4575	NC_006300	TAA	2	6	225582	225587	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	52424302
4576	NC_006300	TAT	2	6	225591	225596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	52424302
4577	NC_006300	TCA	2	6	225786	225791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	52424303
4578	NC_006300	T	6	6	225842	225847	0 %	100 %	0 %	0 %	52424303
4579	NC_006300	TGT	2	6	225887	225892	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	52424303
4580	NC_006300	CGT	2	6	225937	225942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	52424303
4581	NC_006300	TGA	2	6	225963	225968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	52424303
4582	NC_006300	AT	3	6	225969	225974	50 %	50 %	0 %	0 %	52424303
4583	NC_006300	GCC	2	6	225980	225985	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	52424303
4584	NC_006300	CGC	3	9	226001	226009	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	52424303
4585	NC_006300	GCC	2	6	226079	226084	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	52424303
4586	NC_006300	AAT	2	6	226115	226120	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	52424303
4587	NC_006300	T	6	6	226178	226183	0 %	100 %	0 %	0 %	52424303
4588	NC_006300	CCG	2	6	226200	226205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	52424303
4589	NC_006300	T	6	6	226262	226267	0 %	100 %	0 %	0 %	52424303
4590	NC_006300	GGC	2	6	226271	226276	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	52424303
4591	NC_006300	T	8	8	226453	226460	0 %	100 %	0 %	0 %	52424303
4592	NC_006300	GTT	2	6	226468	226473	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	52424303
4593	NC_006300	TCA	2	6	226492	226497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	52424303
4594	NC_006300	T	6	6	226584	226589	0 %	100 %	0 %	0 %	52424303
4595	NC_006300	TTG	2	6	226785	226790	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	52424303
4596	NC_006300	TCAT	2	8	226797	226804	25 %	50 %	0 %	25 %	52424303
4597	NC_006300	AGTT	2	8	226817	226824	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4598	NC_006300	A	6	6	226843	226848	100 %	0 %	0 %	0 %	52424304
4599	NC_006300	A	8	8	226865	226872	100 %	0 %	0 %	0 %	52424304
4600	NC_006300	T	6	6	226875	226880	0 %	100 %	0 %	0 %	52424304
4601	NC_006300	AGA	3	9	226940	226948	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	52424304
4602	NC_006300	GTTA	2	8	226957	226964	25 %	50 %	25 %	0 %	52424304
4603	NC_006300	AAC	2	6	226983	226988	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	52424305
4604	NC_006300	AAAC	2	8	227060	227067	75 %	0 %	0 %	25 %	52424305
4605	NC_006300	ATT	2	6	227069	227074	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	52424305
4606	NC_006300	TTCG	2	8	227082	227089	0 %	50 %	25 %	25 %	52424305
4607	NC_006300	GCC	2	6	227168	227173	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	52424305
4608	NC_006300	A	7	7	227178	227184	100 %	0 %	0 %	0 %	52424305
4609	NC_006300	TGG	2	6	227208	227213	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	52424305
4610	NC_006300	GGC	2	6	227245	227250	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	52424305
4611	NC_006300	CAC	2	6	227257	227262	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	52424305
4612	NC_006300	AAC	2	6	227283	227288	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	52424305
4613	NC_006300	TGC	2	6	227355	227360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	52424305
4614	NC_006300	AAC	2	6	227414	227419	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	52424305
4615	NC_006300	TCAA	2	8	227508	227515	50 %	25 %	0 %	25 %	52424305
4616	NC_006300	GAC	2	6	227549	227554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	52424305
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4618	NC_006300	TAA	2	6	227638	227643	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	52424305
4619	NC_006300	AAT	2	6	227717	227722	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	52424305
4620	NC_006300	TTA	2	6	227819	227824	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	52424305
4621	NC_006300	CCG	2	6	227885	227890	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	52424305
4622	NC_006300	GAA	2	6	227894	227899	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	52424305
4623	NC_006300	TTAT	2	8	227923	227930	25 %	75 %	0 %	0 %	52424305
4624	NC_006300	A	7	7	227934	227940	100 %	0 %	0 %	0 %	52424305
4625	NC_006300	GC	3	6	227944	227949	0 %	0 %	50 %	50 %	52424305
4626	NC_006300	A	6	6	227957	227962	100 %	0 %	0 %	0 %	52424305
4627	NC_006300	GTC	2	6	227993	227998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	52424305
4628	NC_006300	ATA	2	6	228018	228023	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	52424305
4629	NC_006300	CAA	2	6	228076	228081	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	52424305
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4631	NC_006300	AC	3	6	228190	228195	50 %	0 %	0 %	50 %	52424305
4632	NC_006300	A	6	6	228225	228230	100 %	0 %	0 %	0 %	52424305
4633	NC_006300	TTA	2	6	228260	228265	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	52424305
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4635	NC_006300	ATT	2	6	228369	228374	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4636	NC_006300	AAT	2	6	228492	228497	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	52424306
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4649	NC_006300	A	6	6	229081	229086	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4650	NC_006300	CTGCG	2	10	229145	229154	0 %	20 %	40 %	40 %	52424307
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4658	NC_006300	GCA	2	6	229620	229625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	52424307
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4664	NC_006300	CGG	2	6	229892	229897	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4665	NC_006300	GAAAT	2	10	229948	229957	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
4666	NC_006300	A	6	6	230048	230053	100 %	0 %	0 %	0 %	52424308
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4751	NC_006300	TTCA	2	8	234549	234556	25 %	50 %	0 %	25 %	52424311
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4753	NC_006300	AGA	2	6	234582	234587	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	52424311
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4755	NC_006300	AAG	2	6	234734	234739	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	52424311
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4761	NC_006300	T	7	7	235130	235136	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4762	NC_006300	TAT	2	6	235221	235226	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	52424312
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4774	NC_006300	TAA	2	6	235814	235819	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4775	NC_006300	AT	3	6	235835	235840	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4864	NC_006300	A	6	6	239833	239838	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4881	NC_006300	ACA	2	6	240822	240827	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	52424318
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4997	NC_006300	CGAAC	2	10	246062	246071	40 %	0 %	20 %	40 %	52424326
4998	NC_006300	CGT	2	6	246080	246085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	52424326
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5000	NC_006300	GTGAT	2	10	246144	246153	20 %	40 %	40 %	0 %	52424326

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