MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycoplasma mycoides subsp. mycoides SC str. PG1 chromosome

Total Repeats: 38841

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005364	AT	3	6	7	12	50 %	50 %	0 %	0 %	42560561
2	NC_005364	T	6	6	27	32	0 %	100 %	0 %	0 %	42560561
3	NC_005364	TAA	2	6	51	56	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	42560561
4	NC_005364	TAA	2	6	135	140	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	42560561
5	NC_005364	TGA	2	6	147	152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42560561
6	NC_005364	TA	3	6	169	174	50 %	50 %	0 %	0 %	42560561
7	NC_005364	AATA	2	8	180	187	75 %	25 %	0 %	0 %	42560561
8	NC_005364	TTG	3	9	215	223	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	42560561
9	NC_005364	A	6	6	285	290	100 %	0 %	0 %	0 %	42560561
10	NC_005364	A	6	6	340	345	100 %	0 %	0 %	0 %	42560561
11	NC_005364	A	6	6	370	375	100 %	0 %	0 %	0 %	42560561
12	NC_005364	ATC	2	6	388	393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	42560561
13	NC_005364	A	6	6	397	402	100 %	0 %	0 %	0 %	42560561
14	NC_005364	A	7	7	406	412	100 %	0 %	0 %	0 %	42560561
15	NC_005364	GTAA	2	8	484	491	50 %	25 %	25 %	0 %	42560561
16	NC_005364	TTTA	2	8	520	527	25 %	75 %	0 %	0 %	42560561
17	NC_005364	TTA	2	6	556	561	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42560561
18	NC_005364	A	6	6	570	575	100 %	0 %	0 %	0 %	42560561
19	NC_005364	AGTT	2	8	606	613	25 %	50 %	25 %	0 %	42560561
20	NC_005364	GTG	2	6	620	625	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	42560561
21	NC_005364	AT	3	6	650	655	50 %	50 %	0 %	0 %	42560561
22	NC_005364	A	6	6	659	664	100 %	0 %	0 %	0 %	42560561
23	NC_005364	AAAAT	2	10	689	698	80 %	20 %	0 %	0 %	42560561
24	NC_005364	ATG	2	6	707	712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42560561
25	NC_005364	ATTA	2	8	714	721	50 %	50 %	0 %	0 %	42560561
26	NC_005364	TGA	2	6	723	728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42560561
27	NC_005364	A	6	6	752	757	100 %	0 %	0 %	0 %	42560561
28	NC_005364	T	6	6	769	774	0 %	100 %	0 %	0 %	42560561
29	NC_005364	TAA	2	6	783	788	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	42560561
30	NC_005364	GTT	2	6	810	815	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	42560561
31	NC_005364	T	7	7	814	820	0 %	100 %	0 %	0 %	42560561
32	NC_005364	ATT	2	6	840	845	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42560561
33	NC_005364	ATA	2	6	857	862	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	42560561
34	NC_005364	ATTA	2	8	864	871	50 %	50 %	0 %	0 %	42560561
35	NC_005364	ATA	2	6	914	919	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	42560561
36	NC_005364	AACAGC	2	12	921	932	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	42560561
37	NC_005364	A	6	6	940	945	100 %	0 %	0 %	0 %	42560561
38	NC_005364	AATT	2	8	990	997	50 %	50 %	0 %	0 %	42560561
39	NC_005364	ATT	3	9	1007	1015	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42560561
40	NC_005364	GAT	2	6	1018	1023	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42560561
41	NC_005364	CAA	2	6	1069	1074	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	42560561
42	NC_005364	AGA	2	6	1080	1085	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42560561
43	NC_005364	A	6	6	1085	1090	100 %	0 %	0 %	0 %	42560561
44	NC_005364	TTA	2	6	1091	1096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42560561
45	NC_005364	A	7	7	1162	1168	100 %	0 %	0 %	0 %	42560561
46	NC_005364	GTT	2	6	1177	1182	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	42560561
47	NC_005364	AAGT	2	8	1230	1237	50 %	25 %	25 %	0 %	42560561
48	NC_005364	GAA	2	6	1312	1317	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42560561
49	NC_005364	TGG	2	6	1320	1325	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	42560561
50	NC_005364	CA	3	6	1333	1338	50 %	0 %	0 %	50 %	42560561
51	NC_005364	TTA	2	6	1343	1348	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42560561
52	NC_005364	GAAA	2	8	1354	1361	75 %	0 %	25 %	0 %	42560561
53	NC_005364	A	7	7	1377	1383	100 %	0 %	0 %	0 %	42560561
54	NC_005364	A	6	6	1395	1400	100 %	0 %	0 %	0 %	42560561
55	NC_005364	GAA	2	6	1416	1421	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42560561
56	NC_005364	TTA	2	6	1465	1470	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_005364	TAA	2	6	1501	1506	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_005364	TAGAAA	3	18	1509	1526	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_005364	TAGTAA	2	12	1527	1538	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_005364	TA	3	6	1539	1544	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_005364	ATT	2	6	1554	1559	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_005364	AATA	2	8	1613	1620	75 %	25 %	0 %	0 %	42560562
63	NC_005364	TTA	2	6	1629	1634	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42560562
64	NC_005364	AGC	2	6	1649	1654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	42560562
65	NC_005364	TATT	2	8	1697	1704	25 %	75 %	0 %	0 %	42560562
66	NC_005364	TTCT	2	8	1750	1757	0 %	75 %	0 %	25 %	42560562
67	NC_005364	AAT	2	6	1773	1778	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	42560562
68	NC_005364	TTA	2	6	1818	1823	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42560562
69	NC_005364	AAG	2	6	1850	1855	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42560562
70	NC_005364	GAT	2	6	1860	1865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42560562
71	NC_005364	AATT	2	8	1900	1907	50 %	50 %	0 %	0 %	42560562
72	NC_005364	AGA	2	6	1952	1957	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42560562
73	NC_005364	GAATT	2	10	1987	1996	40 %	40 %	20 %	0 %	42560562
74	NC_005364	A	7	7	2019	2025	100 %	0 %	0 %	0 %	42560562
75	NC_005364	AATG	2	8	2048	2055	50 %	25 %	25 %	0 %	42560562
76	NC_005364	ATA	2	6	2059	2064	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	42560562
77	NC_005364	A	6	6	2064	2069	100 %	0 %	0 %	0 %	42560562
78	NC_005364	TTTAAA	2	12	2084	2095	50 %	50 %	0 %	0 %	42560562
79	NC_005364	ACTA	2	8	2096	2103	50 %	25 %	0 %	25 %	42560562
80	NC_005364	T	6	6	2116	2121	0 %	100 %	0 %	0 %	42560562
81	NC_005364	CAA	2	6	2122	2127	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	42560562
82	NC_005364	TAA	3	9	2171	2179	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	42560562
83	NC_005364	TTG	2	6	2266	2271	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	42560562
84	NC_005364	AT	3	6	2276	2281	50 %	50 %	0 %	0 %	42560562
85	NC_005364	TAATT	2	10	2315	2324	40 %	60 %	0 %	0 %	42560562
86	NC_005364	CAA	2	6	2359	2364	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	42560562
87	NC_005364	TAT	2	6	2375	2380	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42560562
88	NC_005364	GATTT	2	10	2419	2428	20 %	60 %	20 %	0 %	42560562
89	NC_005364	GAT	2	6	2436	2441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42560562
90	NC_005364	GAA	2	6	2523	2528	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42560562
91	NC_005364	TGA	2	6	2534	2539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42560562
92	NC_005364	AACTAA	2	12	2632	2643	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	42560562
93	NC_005364	TAA	2	6	2669	2674	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	42560562
94	NC_005364	ATG	2	6	2680	2685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42560562
95	NC_005364	TTC	2	6	2704	2709	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	42560562
96	NC_005364	ATTTTT	2	12	2742	2753	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_005364	AAAT	2	8	2755	2762	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_005364	TTG	2	6	2791	2796	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	42560563
99	NC_005364	CAAA	2	8	2856	2863	75 %	0 %	0 %	25 %	42560563
100	NC_005364	TAAA	2	8	2875	2882	75 %	25 %	0 %	0 %	42560563
101	NC_005364	A	7	7	2880	2886	100 %	0 %	0 %	0 %	42560563
102	NC_005364	GAA	2	6	2901	2906	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42560563
103	NC_005364	TAA	3	9	2909	2917	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	42560563
104	NC_005364	ATT	2	6	2928	2933	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42560563
105	NC_005364	A	7	7	2958	2964	100 %	0 %	0 %	0 %	42560563
106	NC_005364	TAT	2	6	2975	2980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42560563
107	NC_005364	ATT	2	6	2983	2988	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42560563
108	NC_005364	ATA	2	6	2992	2997	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	42560563
109	NC_005364	A	6	6	3018	3023	100 %	0 %	0 %	0 %	42560563
110	NC_005364	GAT	2	6	3024	3029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42560563
111	NC_005364	ATAA	2	8	3030	3037	75 %	25 %	0 %	0 %	42560563
112	NC_005364	A	7	7	3045	3051	100 %	0 %	0 %	0 %	42560563
113	NC_005364	TGA	2	6	3071	3076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42560563
114	NC_005364	ATT	2	6	3105	3110	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42560563
115	NC_005364	AAT	2	6	3120	3125	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	42560563
116	NC_005364	TA	3	6	3147	3152	50 %	50 %	0 %	0 %	42560563
117	NC_005364	TTTA	2	8	3163	3170	25 %	75 %	0 %	0 %	42560563
118	NC_005364	AATAG	2	10	3177	3186	60 %	20 %	20 %	0 %	42560563
119	NC_005364	ATA	3	9	3211	3219	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	42560563
120	NC_005364	TGAA	2	8	3252	3259	50 %	25 %	25 %	0 %	42560563
121	NC_005364	TGA	2	6	3269	3274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42560563
122	NC_005364	A	7	7	3279	3285	100 %	0 %	0 %	0 %	42560563
123	NC_005364	AAT	2	6	3295	3300	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	42560563
124	NC_005364	A	6	6	3308	3313	100 %	0 %	0 %	0 %	42560564
125	NC_005364	ATTTAA	2	12	3339	3350	50 %	50 %	0 %	0 %	42560564
126	NC_005364	TTG	2	6	3360	3365	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	42560564
127	NC_005364	CAAAA	2	10	3377	3386	80 %	0 %	0 %	20 %	42560564
128	NC_005364	AATT	2	8	3390	3397	50 %	50 %	0 %	0 %	42560564
129	NC_005364	ATT	2	6	3530	3535	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42560564
130	NC_005364	TAA	2	6	3570	3575	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	42560564
131	NC_005364	A	6	6	3591	3596	100 %	0 %	0 %	0 %	42560564
132	NC_005364	TAT	2	6	3601	3606	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42560564
133	NC_005364	TTA	2	6	3619	3624	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42560564
134	NC_005364	TA	3	6	3623	3628	50 %	50 %	0 %	0 %	42560564
135	NC_005364	TTTA	2	8	3640	3647	25 %	75 %	0 %	0 %	42560564
136	NC_005364	TTAC	2	8	3668	3675	25 %	50 %	0 %	25 %	42560564
137	NC_005364	AAG	2	6	3699	3704	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42560564
138	NC_005364	GTA	2	6	3720	3725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42560564
139	NC_005364	AAT	2	6	3746	3751	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	42560564
140	NC_005364	TAA	2	6	3802	3807	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	42560564
141	NC_005364	ATT	2	6	3845	3850	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42560564
142	NC_005364	ATG	2	6	3888	3893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42560564
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410	NC_005364	TAT	2	6	12396	12401	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42560569
411	NC_005364	CTT	2	6	12405	12410	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	42560569
412	NC_005364	T	7	7	12441	12447	0 %	100 %	0 %	0 %	42560569
413	NC_005364	TA	3	6	12465	12470	50 %	50 %	0 %	0 %	42560569
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