MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycoplasma mycoides subsp. mycoides SC str. PG1 chromosome

Total Repeats: 38841

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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21002	NC_005364	TAT	2	6	645984	645989	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42561103
21003	NC_005364	TGT	2	6	645998	646003	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	42561103
21004	NC_005364	TTTAAC	2	12	646071	646082	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	42561103
21005	NC_005364	TTA	2	6	646093	646098	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42561103
21006	NC_005364	ACT	2	6	646111	646116	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	42561103
21007	NC_005364	T	6	6	646153	646158	0 %	100 %	0 %	0 %	42561103
21008	NC_005364	AAAT	2	8	646160	646167	75 %	25 %	0 %	0 %	42561103
21009	NC_005364	CTTTAT	2	12	646178	646189	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	42561103
21010	NC_005364	TGGT	2	8	646217	646224	0 %	50 %	50 %	0 %	42561103
21011	NC_005364	CTT	2	6	646247	646252	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	42561103
21012	NC_005364	GTATA	2	10	646253	646262	40 %	40 %	20 %	0 %	42561103
21013	NC_005364	TAT	2	6	646308	646313	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42561103
21014	NC_005364	ATTTA	2	10	646317	646326	40 %	60 %	0 %	0 %	42561103
21015	NC_005364	AT	3	6	646345	646350	50 %	50 %	0 %	0 %	42561103
21016	NC_005364	TCA	3	9	646360	646368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	42561103
21017	NC_005364	AAT	2	6	646369	646374	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	42561103
21018	NC_005364	T	7	7	646407	646413	0 %	100 %	0 %	0 %	42561103
21019	NC_005364	CTT	2	6	646418	646423	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	42561103
21020	NC_005364	T	6	6	646427	646432	0 %	100 %	0 %	0 %	42561103
21021	NC_005364	T	7	7	646445	646451	0 %	100 %	0 %	0 %	42561103
21022	NC_005364	CAA	3	9	646469	646477	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	42561103
21023	NC_005364	T	6	6	646536	646541	0 %	100 %	0 %	0 %	42561103
21024	NC_005364	T	7	7	646564	646570	0 %	100 %	0 %	0 %	42561103
21025	NC_005364	ATT	2	6	646587	646592	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42561103
21026	NC_005364	ATA	2	6	646658	646663	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	42561104
21027	NC_005364	CTT	2	6	646687	646692	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	42561104
21028	NC_005364	A	6	6	646698	646703	100 %	0 %	0 %	0 %	42561104
21029	NC_005364	TGGT	2	8	646715	646722	0 %	50 %	50 %	0 %	42561104
21030	NC_005364	TGGT	2	8	646793	646800	0 %	50 %	50 %	0 %	42561104
21031	NC_005364	GCT	2	6	646812	646817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	42561104
21032	NC_005364	TTA	2	6	646860	646865	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42561104
21033	NC_005364	TTGG	2	8	646942	646949	0 %	50 %	50 %	0 %	42561104
21034	NC_005364	AAATGC	2	12	647042	647053	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	42561104
21035	NC_005364	TTCA	2	8	647096	647103	25 %	50 %	0 %	25 %	42561104
21036	NC_005364	T	6	6	647106	647111	0 %	100 %	0 %	0 %	42561104
21037	NC_005364	TCTTGT	2	12	647190	647201	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	42561104
21038	NC_005364	TTGA	2	8	647214	647221	25 %	50 %	25 %	0 %	42561104
21039	NC_005364	GTT	2	6	647256	647261	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	42561104
21040	NC_005364	TAA	2	6	647327	647332	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	42561104
21041	NC_005364	TTC	2	6	647334	647339	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	42561104
21042	NC_005364	TA	3	6	647362	647367	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21043	NC_005364	ATTA	2	8	647404	647411	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21044	NC_005364	ATG	2	6	647414	647419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21045	NC_005364	A	6	6	647434	647439	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21046	NC_005364	TAT	2	6	647458	647463	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21047	NC_005364	A	9	9	647491	647499	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21048	NC_005364	TAA	2	6	647546	647551	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21049	NC_005364	TAT	2	6	647572	647577	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21050	NC_005364	AAGAA	2	10	647578	647587	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
21051	NC_005364	T	9	9	647596	647604	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21052	NC_005364	T	7	7	647606	647612	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21053	NC_005364	A	8	8	647616	647623	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21054	NC_005364	A	6	6	647626	647631	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21055	NC_005364	TTTCTT	2	12	647669	647680	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
21056	NC_005364	T	6	6	647679	647684	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21057	NC_005364	ATA	2	6	647697	647702	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21058	NC_005364	GAA	2	6	647709	647714	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21059	NC_005364	ATTG	2	8	647735	647742	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
21060	NC_005364	AAAG	2	8	647775	647782	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
21061	NC_005364	ATT	2	6	647878	647883	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21062	NC_005364	TGC	2	6	647885	647890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21063	NC_005364	CAA	2	6	647921	647926	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21064	NC_005364	GAA	2	6	648069	648074	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21065	NC_005364	AATA	2	8	648104	648111	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
21066	NC_005364	A	6	6	648159	648164	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21067	NC_005364	AGT	2	6	648188	648193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21068	NC_005364	ATT	2	6	648312	648317	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21069	NC_005364	T	6	6	648374	648379	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21070	NC_005364	TTA	2	6	648386	648391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21071	NC_005364	ATT	2	6	648439	648444	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21072	NC_005364	A	6	6	648471	648476	100 %	0 %	0 %	0 %	42561105
21073	NC_005364	TTA	2	6	648505	648510	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42561105
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21076	NC_005364	TAAT	2	8	648577	648584	50 %	50 %	0 %	0 %	42561105
21077	NC_005364	TAA	2	6	648629	648634	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	42561105
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21084	NC_005364	A	6	6	648843	648848	100 %	0 %	0 %	0 %	42561105
21085	NC_005364	ATT	2	6	648858	648863	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42561105
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21093	NC_005364	A	6	6	649247	649252	100 %	0 %	0 %	0 %	42561105
21094	NC_005364	ATG	2	6	649300	649305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42561105
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21096	NC_005364	AGA	2	6	649382	649387	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42561105
21097	NC_005364	A	6	6	649389	649394	100 %	0 %	0 %	0 %	42561105
21098	NC_005364	GAT	2	6	649395	649400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42561105
21099	NC_005364	AGA	2	6	649436	649441	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42561105
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21101	NC_005364	ATA	2	6	649490	649495	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	42561105
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21104	NC_005364	TCG	2	6	649698	649703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21105	NC_005364	TGG	2	6	649853	649858	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21106	NC_005364	GGGA	2	8	649862	649869	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
21107	NC_005364	AAT	2	6	650052	650057	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21108	NC_005364	A	6	6	650094	650099	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21109	NC_005364	T	8	8	650104	650111	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21110	NC_005364	A	6	6	650131	650136	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21111	NC_005364	TAAT	2	8	650141	650148	50 %	50 %	0 %	0 %	42561106
21112	NC_005364	AAT	2	6	650153	650158	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	42561106
21113	NC_005364	AAT	2	6	650236	650241	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	42561106
21114	NC_005364	TTA	2	6	650262	650267	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42561106
21115	NC_005364	TCT	2	6	650274	650279	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	42561106
21116	NC_005364	TCA	2	6	650310	650315	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	42561106
21117	NC_005364	ATC	2	6	650336	650341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	42561106
21118	NC_005364	TCA	2	6	650370	650375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	42561106
21119	NC_005364	A	6	6	650379	650384	100 %	0 %	0 %	0 %	42561106
21120	NC_005364	ATT	2	6	650390	650395	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42561106
21121	NC_005364	T	7	7	650405	650411	0 %	100 %	0 %	0 %	42561106
21122	NC_005364	ATC	2	6	650435	650440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	42561106
21123	NC_005364	T	8	8	650445	650452	0 %	100 %	0 %	0 %	42561106
21124	NC_005364	CTA	2	6	650500	650505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	42561106
21125	NC_005364	AT	3	6	650586	650591	50 %	50 %	0 %	0 %	42561106
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21127	NC_005364	ATT	2	6	650627	650632	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42561106
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21376	NC_005364	TAAAA	2	10	657496	657505	80 %	20 %	0 %	0 %	42561115
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