MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycoplasma mycoides subsp. mycoides SC str. PG1 chromosome

Total Repeats: 38841

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
17501	NC_005364	ATT	2	6	540066	540071	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42561010
17502	NC_005364	CAT	2	6	540077	540082	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	42561010
17503	NC_005364	A	7	7	540104	540110	100 %	0 %	0 %	0 %	42561010
17504	NC_005364	A	7	7	540112	540118	100 %	0 %	0 %	0 %	42561010
17505	NC_005364	AAT	2	6	540125	540130	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	42561010
17506	NC_005364	TATT	2	8	540155	540162	25 %	75 %	0 %	0 %	42561010
17507	NC_005364	AATG	2	8	540176	540183	50 %	25 %	25 %	0 %	42561010
17508	NC_005364	ATT	2	6	540231	540236	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42561010
17509	NC_005364	TGA	2	6	540248	540253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42561010
17510	NC_005364	TCA	2	6	540278	540283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	42561010
17511	NC_005364	TA	3	6	540318	540323	50 %	50 %	0 %	0 %	42561010
17512	NC_005364	ATCA	2	8	540346	540353	50 %	25 %	0 %	25 %	42561010
17513	NC_005364	ACT	2	6	540360	540365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	42561010
17514	NC_005364	GAA	2	6	540411	540416	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42561010
17515	NC_005364	GCT	3	9	540441	540449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	42561010
17516	NC_005364	AAG	2	6	540463	540468	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42561010
17517	NC_005364	ATT	2	6	540474	540479	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42561010
17518	NC_005364	TGA	2	6	540506	540511	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42561010
17519	NC_005364	A	6	6	540511	540516	100 %	0 %	0 %	0 %	42561010
17520	NC_005364	TTTAGA	2	12	540536	540547	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	42561010
17521	NC_005364	CAA	2	6	540561	540566	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	42561010
17522	NC_005364	TCA	2	6	540567	540572	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	42561010
17523	NC_005364	CAAT	2	8	540579	540586	50 %	25 %	0 %	25 %	42561010
17524	NC_005364	GAT	2	6	540591	540596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42561010
17525	NC_005364	A	6	6	540706	540711	100 %	0 %	0 %	0 %	42561010
17526	NC_005364	CAAT	2	8	540745	540752	50 %	25 %	0 %	25 %	42561010
17527	NC_005364	GTT	2	6	540774	540779	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	42561010
17528	NC_005364	TTG	2	6	540829	540834	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	42561010
17529	NC_005364	A	6	6	540861	540866	100 %	0 %	0 %	0 %	42561010
17530	NC_005364	GAA	2	6	540888	540893	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42561010
17531	NC_005364	A	6	6	540903	540908	100 %	0 %	0 %	0 %	42561010
17532	NC_005364	CAA	2	6	540912	540917	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	42561010
17533	NC_005364	AATT	2	8	540922	540929	50 %	50 %	0 %	0 %	42561010
17534	NC_005364	GAAA	2	8	540982	540989	75 %	0 %	25 %	0 %	42561010
17535	NC_005364	A	7	7	540987	540993	100 %	0 %	0 %	0 %	42561010
17536	NC_005364	TGA	2	6	540998	541003	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42561010
17537	NC_005364	T	6	6	541049	541054	0 %	100 %	0 %	0 %	42561010
17538	NC_005364	CAAT	2	8	541081	541088	50 %	25 %	0 %	25 %	42561010
17539	NC_005364	GCT	2	6	541092	541097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	42561010
17540	NC_005364	TTA	2	6	541108	541113	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42561010
17541	NC_005364	GAT	2	6	541131	541136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42561010
17542	NC_005364	TAC	2	6	541175	541180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	42561010
17543	NC_005364	ACT	2	6	541224	541229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	42561010
17544	NC_005364	GTT	2	6	541237	541242	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	42561010
17545	NC_005364	GAA	2	6	541260	541265	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42561010
17546	NC_005364	GTT	2	6	541266	541271	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	42561010
17547	NC_005364	AAT	2	6	541287	541292	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	42561010
17548	NC_005364	ATTG	2	8	541326	541333	25 %	50 %	25 %	0 %	42561010
17549	NC_005364	TAG	2	6	541354	541359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42561010
17550	NC_005364	A	7	7	541387	541393	100 %	0 %	0 %	0 %	42561010
17551	NC_005364	TAC	2	6	541400	541405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	42561010
17552	NC_005364	AAAC	2	8	541433	541440	75 %	0 %	0 %	25 %	42561010
17553	NC_005364	ATT	2	6	541461	541466	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42561010
17554	NC_005364	TAT	2	6	541522	541527	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42561010
17555	NC_005364	ATTAAA	2	12	541545	541556	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	42561010
17556	NC_005364	ACAA	2	8	541574	541581	75 %	0 %	0 %	25 %	42561010
17557	NC_005364	A	6	6	541639	541644	100 %	0 %	0 %	0 %	42561010
17558	NC_005364	ATA	2	6	541649	541654	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17559	NC_005364	A	6	6	541654	541659	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17560	NC_005364	ATTTT	2	10	541673	541682	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
17561	NC_005364	AAT	2	6	541764	541769	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	42561011
17562	NC_005364	AAT	2	6	541808	541813	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	42561011
17563	NC_005364	AGCTTC	2	12	541883	541894	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	42561011
17564	NC_005364	ATA	2	6	541939	541944	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	42561011
17565	NC_005364	TCC	2	6	541970	541975	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	42561011
17566	NC_005364	ATA	2	6	541978	541983	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	42561011
17567	NC_005364	T	7	7	541999	542005	0 %	100 %	0 %	0 %	42561011
17568	NC_005364	TGG	2	6	542009	542014	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	42561011
17569	NC_005364	AATT	2	8	542066	542073	50 %	50 %	0 %	0 %	42561011
17570	NC_005364	CCA	2	6	542085	542090	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	42561011
17571	NC_005364	A	6	6	542101	542106	100 %	0 %	0 %	0 %	42561011
17572	NC_005364	TTA	2	6	542121	542126	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42561011
17573	NC_005364	AAT	2	6	542135	542140	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	42561011
17574	NC_005364	CAATAT	2	12	542164	542175	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	42561011
17575	NC_005364	AAT	2	6	542180	542185	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	42561011
17576	NC_005364	TTG	2	6	542225	542230	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	42561011
17577	NC_005364	ATA	2	6	542234	542239	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	42561011
17578	NC_005364	TTC	2	6	542267	542272	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	42561011
17579	NC_005364	GTT	2	6	542313	542318	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	42561011
17580	NC_005364	ATT	2	6	542325	542330	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42561011
17581	NC_005364	TTC	2	6	542387	542392	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	42561011
17582	NC_005364	TTC	2	6	542434	542439	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	42561011
17583	NC_005364	TAA	2	6	542444	542449	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	42561011
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17585	NC_005364	T	7	7	542509	542515	0 %	100 %	0 %	0 %	42561011
17586	NC_005364	AATT	2	8	542578	542585	50 %	50 %	0 %	0 %	42561011
17587	NC_005364	ATT	2	6	542640	542645	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42561011
17588	NC_005364	GATTCA	2	12	542646	542657	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	42561011
17589	NC_005364	TA	3	6	542668	542673	50 %	50 %	0 %	0 %	42561011
17590	NC_005364	TAAA	2	8	542680	542687	75 %	25 %	0 %	0 %	42561011
17591	NC_005364	TAA	2	6	542867	542872	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	42561011
17592	NC_005364	ATTTT	2	10	542877	542886	20 %	80 %	0 %	0 %	42561011
17593	NC_005364	T	6	6	542883	542888	0 %	100 %	0 %	0 %	42561011
17594	NC_005364	TTC	2	6	542891	542896	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	42561011
17595	NC_005364	ATT	2	6	542900	542905	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42561011
17596	NC_005364	TTTTG	2	10	542922	542931	0 %	80 %	20 %	0 %	42561011
17597	NC_005364	ACC	2	6	542957	542962	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	42561011
17598	NC_005364	T	6	6	543030	543035	0 %	100 %	0 %	0 %	42561011
17599	NC_005364	CAT	3	9	543049	543057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	42561011
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17601	NC_005364	AAT	2	6	543071	543076	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	42561011
17602	NC_005364	CTA	2	6	543124	543129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	42561011
17603	NC_005364	CAA	2	6	543145	543150	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	42561011
17604	NC_005364	T	6	6	543160	543165	0 %	100 %	0 %	0 %	42561011
17605	NC_005364	GATT	2	8	543187	543194	25 %	50 %	25 %	0 %	42561011
17606	NC_005364	ATT	2	6	543242	543247	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42561011
17607	NC_005364	T	6	6	543272	543277	0 %	100 %	0 %	0 %	42561011
17608	NC_005364	TTC	2	6	543350	543355	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	42561011
17609	NC_005364	TAA	2	6	543364	543369	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	42561011
17610	NC_005364	CAA	2	6	543385	543390	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	42561011
17611	NC_005364	CCA	2	6	543393	543398	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	42561011
17612	NC_005364	ATT	2	6	543410	543415	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42561011
17613	NC_005364	ACTT	2	8	543425	543432	25 %	50 %	0 %	25 %	42561011
17614	NC_005364	GCT	2	6	543453	543458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	42561011
17615	NC_005364	T	6	6	543458	543463	0 %	100 %	0 %	0 %	42561011
17616	NC_005364	TATT	2	8	543546	543553	25 %	75 %	0 %	0 %	42561011
17617	NC_005364	AAT	2	6	543556	543561	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	42561011
17618	NC_005364	TAA	2	6	543584	543589	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	42561011
17619	NC_005364	T	7	7	543615	543621	0 %	100 %	0 %	0 %	42561011
17620	NC_005364	TCA	2	6	543645	543650	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	42561011
17621	NC_005364	T	7	7	543656	543662	0 %	100 %	0 %	0 %	42561011
17622	NC_005364	AGC	2	6	543668	543673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	42561011
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