MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium tuberculosis CDC1551 chromosome

Total Repeats: 109576

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_002755	GTA	2	6	22198	22203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15839392
502	NC_002755	TGC	2	6	22206	22211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15839392
503	NC_002755	GAT	2	6	22213	22218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15839392
504	NC_002755	CG	3	6	22219	22224	0 %	0 %	50 %	50 %	15839392
505	NC_002755	TCA	2	6	22245	22250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15839392
506	NC_002755	ACC	2	6	22293	22298	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15839392
507	NC_002755	GCTG	2	8	22353	22360	0 %	25 %	50 %	25 %	15839392
508	NC_002755	CGGC	2	8	22373	22380	0 %	0 %	50 %	50 %	15839392
509	NC_002755	GTC	3	9	22405	22413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15839392
510	NC_002755	CGTAGT	2	12	22452	22463	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	15839392
511	NC_002755	CGA	2	6	22464	22469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15839392
512	NC_002755	CGA	3	9	22476	22484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15839392
513	NC_002755	GCC	3	9	22501	22509	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15839392
514	NC_002755	CAG	2	6	22618	22623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15839392
515	NC_002755	CCT	2	6	22725	22730	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15839392
516	NC_002755	TCG	2	6	22748	22753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15839392
517	NC_002755	GTC	2	6	22774	22779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15839392
518	NC_002755	GCA	2	6	22809	22814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15839392
519	NC_002755	CG	3	6	22821	22826	0 %	0 %	50 %	50 %	15839392
520	NC_002755	GC	3	6	22946	22951	0 %	0 %	50 %	50 %	15839392
521	NC_002755	CAG	2	6	22972	22977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15839392
522	NC_002755	TCG	2	6	22991	22996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15839392
523	NC_002755	GCCG	2	8	23044	23051	0 %	0 %	50 %	50 %	15839392
524	NC_002755	CCCA	2	8	23056	23063	25 %	0 %	0 %	75 %	15839392
525	NC_002755	GTT	2	6	23113	23118	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15839392
526	NC_002755	GC	3	6	23143	23148	0 %	0 %	50 %	50 %	15839392
527	NC_002755	CG	3	6	23172	23177	0 %	0 %	50 %	50 %	15839392
528	NC_002755	C	6	6	23207	23212	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
529	NC_002755	GC	3	6	23223	23228	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
530	NC_002755	TCG	2	6	23254	23259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
531	NC_002755	GTC	2	6	23337	23342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15839393
532	NC_002755	GTC	2	6	23444	23449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15839393
533	NC_002755	GTC	2	6	23468	23473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15839393
534	NC_002755	GC	3	6	23475	23480	0 %	0 %	50 %	50 %	15839393
535	NC_002755	CG	3	6	23514	23519	0 %	0 %	50 %	50 %	15839393
536	NC_002755	CAC	2	6	23540	23545	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15839393
537	NC_002755	CG	3	6	23574	23579	0 %	0 %	50 %	50 %	15839393
538	NC_002755	CAT	2	6	23615	23620	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15839393
539	NC_002755	CAA	2	6	23687	23692	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15839393
540	NC_002755	GGT	2	6	23816	23821	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
541	NC_002755	GAT	2	6	23876	23881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15839394
542	NC_002755	ATCAC	2	10	23901	23910	40 %	20 %	0 %	40 %	15839394
543	NC_002755	GTG	2	6	23952	23957	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15839394
544	NC_002755	TGG	2	6	23962	23967	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15839394
545	NC_002755	AC	3	6	24028	24033	50 %	0 %	0 %	50 %	15839394
546	NC_002755	GAT	2	6	24074	24079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15839394
547	NC_002755	CGT	2	6	24118	24123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15839394
548	NC_002755	CGG	2	6	24148	24153	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15839394
549	NC_002755	GCC	2	6	24161	24166	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15839394
550	NC_002755	GCTG	2	8	24195	24202	0 %	25 %	50 %	25 %	15839394
551	NC_002755	CGTAGT	2	12	24229	24240	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	15839394
552	NC_002755	CGGC	2	8	24243	24250	0 %	0 %	50 %	50 %	15839394
553	NC_002755	GAG	2	6	24274	24279	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15839394
554	NC_002755	GCC	3	9	24326	24334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15839394
555	NC_002755	GCCG	2	8	24343	24350	0 %	0 %	50 %	50 %	15839394
556	NC_002755	CGGG	2	8	24418	24425	0 %	0 %	75 %	25 %	15839394
557	NC_002755	CTC	2	6	24455	24460	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15839394
558	NC_002755	CCG	2	6	24495	24500	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15839394
559	NC_002755	GCC	2	6	24512	24517	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15839394
560	NC_002755	GCC	2	6	24536	24541	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15839394
561	NC_002755	GCCGG	2	10	24588	24597	0 %	0 %	60 %	40 %	15839394
562	NC_002755	AGG	2	6	24605	24610	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15839394
563	NC_002755	GCG	2	6	24625	24630	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15839394
564	NC_002755	C	6	6	24636	24641	0 %	0 %	0 %	100 %	15839394
565	NC_002755	CCTGGT	2	12	24667	24678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15839394
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567	NC_002755	C	6	6	24824	24829	0 %	0 %	0 %	100 %	15839394
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570	NC_002755	TCG	2	6	24909	24914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15839394
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572	NC_002755	CGG	2	6	25025	25030	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15839394
573	NC_002755	CGA	2	6	25091	25096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15839394
574	NC_002755	GAC	2	6	25109	25114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15839394
575	NC_002755	ATG	2	6	25236	25241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15839394
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577	NC_002755	GCA	2	6	25306	25311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15839394
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579	NC_002755	TCAA	2	8	25496	25503	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
580	NC_002755	GAGC	2	8	25524	25531	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
581	NC_002755	GGCC	2	8	25538	25545	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
582	NC_002755	CCG	2	6	25559	25564	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
583	NC_002755	CTA	2	6	25594	25599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
584	NC_002755	TCC	2	6	25611	25616	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
585	NC_002755	GTT	2	6	25618	25623	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
586	NC_002755	TCG	3	9	25738	25746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
587	NC_002755	GCC	2	6	25752	25757	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
588	NC_002755	GC	3	6	25902	25907	0 %	0 %	50 %	50 %	15839395
589	NC_002755	CGC	2	6	25925	25930	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15839395
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596	NC_002755	GTG	2	6	26181	26186	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15839395
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601	NC_002755	CGG	2	6	26308	26313	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15839395
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603	NC_002755	CG	3	6	26370	26375	0 %	0 %	50 %	50 %	15839395
604	NC_002755	CGA	2	6	26386	26391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15839395
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612	NC_002755	GCC	2	6	26726	26731	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15839395
613	NC_002755	CAGC	2	8	26770	26777	25 %	0 %	25 %	50 %	15839395
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618	NC_002755	CTT	2	6	26933	26938	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
619	NC_002755	CGAGC	2	10	26950	26959	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
620	NC_002755	CAC	2	6	27047	27052	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15839396
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626	NC_002755	GCT	2	6	27274	27279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15839396
627	NC_002755	GCG	2	6	27351	27356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
628	NC_002755	CGT	2	6	27367	27372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
629	NC_002755	CCT	2	6	27432	27437	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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631	NC_002755	GTA	2	6	27547	27552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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