MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium leprae TN chromosome

Total Repeats: 67017

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_002677	TGC	2	6	198284	198289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15826970
4002	NC_002677	CAC	2	6	198291	198296	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15826970
4003	NC_002677	CTG	2	6	198346	198351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15826970
4004	NC_002677	GTG	2	6	198448	198453	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15826970
4005	NC_002677	ACG	2	6	198467	198472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15826970
4006	NC_002677	TTG	2	6	198521	198526	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15826970
4007	NC_002677	ATC	2	6	198628	198633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15826970
4008	NC_002677	GAC	2	6	198634	198639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15826970
4009	NC_002677	GTG	2	6	198673	198678	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15826970
4010	NC_002677	GGC	2	6	198742	198747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15826970
4011	NC_002677	TGA	2	6	198810	198815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15826970
4012	NC_002677	CGG	2	6	198918	198923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15826970
4013	NC_002677	CCG	2	6	198980	198985	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15826970
4014	NC_002677	AGCG	2	8	198998	199005	25 %	0 %	50 %	25 %	15826970
4015	NC_002677	TGC	2	6	199007	199012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15826970
4016	NC_002677	CGG	2	6	199161	199166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15826970
4017	NC_002677	TCG	2	6	199172	199177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15826970
4018	NC_002677	TCG	2	6	199230	199235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15826970
4019	NC_002677	TAC	2	6	199249	199254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15826970
4020	NC_002677	GTA	2	6	199454	199459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15826970
4021	NC_002677	CCG	2	6	199497	199502	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15826970
4022	NC_002677	GGT	2	6	199525	199530	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15826970
4023	NC_002677	GGT	2	6	199534	199539	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15826970
4024	NC_002677	TTC	2	6	199549	199554	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15826970
4025	NC_002677	CG	3	6	199599	199604	0 %	0 %	50 %	50 %	15826970
4026	NC_002677	GCC	2	6	199651	199656	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15826970
4027	NC_002677	GTG	2	6	199669	199674	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15826970
4028	NC_002677	CGG	3	9	199766	199774	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15826970
4029	NC_002677	CGA	2	6	199868	199873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15826970
4030	NC_002677	AGC	2	6	199914	199919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15826970
4031	NC_002677	TCT	2	6	199920	199925	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15826970
4032	NC_002677	CGG	2	6	199952	199957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15826970
4033	NC_002677	GCGCC	2	10	199989	199998	0 %	0 %	40 %	60 %	15826970
4034	NC_002677	G	7	7	200071	200077	0 %	0 %	100 %	0 %	15826970
4035	NC_002677	GCT	2	6	200268	200273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15826970
4036	NC_002677	GCG	2	6	200307	200312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15826970
4037	NC_002677	ACAA	2	8	200467	200474	75 %	0 %	0 %	25 %	15826970
4038	NC_002677	GCTG	2	8	200511	200518	0 %	25 %	50 %	25 %	15826970
4039	NC_002677	AGG	3	9	200519	200527	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15826970
4040	NC_002677	GCA	2	6	200533	200538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15826970
4041	NC_002677	GA	3	6	200636	200641	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4042	NC_002677	TTTG	2	8	200664	200671	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4043	NC_002677	TGCA	2	8	200697	200704	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4044	NC_002677	TGC	2	6	200733	200738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4045	NC_002677	CACAT	2	10	200772	200781	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
4046	NC_002677	T	6	6	200787	200792	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4047	NC_002677	GCT	2	6	200838	200843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4048	NC_002677	TC	3	6	200857	200862	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4049	NC_002677	TCCACA	2	12	200890	200901	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
4050	NC_002677	TGG	2	6	200965	200970	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4051	NC_002677	AGT	2	6	201109	201114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4052	NC_002677	GCG	2	6	201162	201167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4053	NC_002677	TGAA	2	8	201218	201225	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4054	NC_002677	CCA	3	9	201259	201267	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4055	NC_002677	AGCA	2	8	201297	201304	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4056	NC_002677	ACG	2	6	201377	201382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4057	NC_002677	GCT	2	6	201398	201403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4058	NC_002677	AGTT	2	8	201454	201461	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4059	NC_002677	CGG	2	6	201542	201547	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4060	NC_002677	AGC	2	6	201551	201556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4061	NC_002677	CTG	2	6	201591	201596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4062	NC_002677	TTGG	2	8	201636	201643	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4063	NC_002677	TAC	2	6	201707	201712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4064	NC_002677	GCT	2	6	201758	201763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4065	NC_002677	TC	3	6	201800	201805	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4066	NC_002677	GA	3	6	201877	201882	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4067	NC_002677	TGC	2	6	201936	201941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4068	NC_002677	TGG	2	6	201995	202000	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4069	NC_002677	GCA	2	6	202009	202014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4070	NC_002677	GCA	2	6	202060	202065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4071	NC_002677	CTG	2	6	202081	202086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4072	NC_002677	TGC	2	6	202098	202103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4073	NC_002677	CG	3	6	202110	202115	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4074	NC_002677	GTG	2	6	202131	202136	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4075	NC_002677	GCT	2	6	202137	202142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4076	NC_002677	CT	3	6	202141	202146	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4077	NC_002677	CG	3	6	202162	202167	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4078	NC_002677	TGT	2	6	202184	202189	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4079	NC_002677	TCG	2	6	202239	202244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4080	NC_002677	GACCA	2	10	202296	202305	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
4081	NC_002677	GT	3	6	202396	202401	0 %	50 %	50 %	0 %	15826971
4082	NC_002677	ATC	2	6	202404	202409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15826971
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4085	NC_002677	GAG	2	6	202567	202572	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4086	NC_002677	CAA	2	6	202590	202595	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4087	NC_002677	TGGT	2	8	202655	202662	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4088	NC_002677	AACCCG	2	12	202708	202719	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
4089	NC_002677	GTG	2	6	202760	202765	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4090	NC_002677	CGC	2	6	202793	202798	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4091	NC_002677	GC	3	6	202797	202802	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4092	NC_002677	ATT	2	6	202804	202809	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4093	NC_002677	TGT	2	6	202836	202841	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4094	NC_002677	GT	3	6	202930	202935	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4095	NC_002677	TGG	2	6	202955	202960	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4096	NC_002677	GGTC	2	8	203003	203010	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4097	NC_002677	GGCG	2	8	203011	203018	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4098	NC_002677	TCG	2	6	203120	203125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4099	NC_002677	TCC	2	6	203137	203142	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4100	NC_002677	CCG	2	6	203164	203169	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4101	NC_002677	AAT	2	6	203186	203191	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4102	NC_002677	CGT	2	6	203233	203238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4103	NC_002677	CTG	2	6	203255	203260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4104	NC_002677	CTA	2	6	203362	203367	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4105	NC_002677	TGC	2	6	203391	203396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4106	NC_002677	GTC	2	6	203446	203451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4107	NC_002677	TCG	2	6	203484	203489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4108	NC_002677	GC	3	6	203527	203532	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4109	NC_002677	GTG	2	6	203555	203560	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4110	NC_002677	GTG	2	6	203597	203602	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4111	NC_002677	TG	3	6	203670	203675	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4112	NC_002677	T	7	7	203689	203695	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4113	NC_002677	A	7	7	203698	203704	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4114	NC_002677	GAA	2	6	203816	203821	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4115	NC_002677	CCG	2	6	203850	203855	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4116	NC_002677	AATC	2	8	203916	203923	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4117	NC_002677	TCAC	2	8	203945	203952	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4118	NC_002677	TCTG	2	8	203992	203999	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4119	NC_002677	CAG	2	6	204039	204044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4120	NC_002677	TGA	2	6	204106	204111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4121	NC_002677	CAG	2	6	204218	204223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4122	NC_002677	CGT	2	6	204229	204234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4123	NC_002677	GCG	2	6	204340	204345	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4124	NC_002677	ATTG	2	8	204362	204369	25 %	50 %	25 %	0 %	15826972
4125	NC_002677	GAT	2	6	204431	204436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15826972
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4130	NC_002677	TG	3	6	204710	204715	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4131	NC_002677	TTG	2	6	204741	204746	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4163	NC_002677	TCC	2	6	206474	206479	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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4264	NC_002677	GCA	2	6	211629	211634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15826973
4265	NC_002677	GC	3	6	211718	211723	0 %	0 %	50 %	50 %	15826973
4266	NC_002677	GCA	2	6	211797	211802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15826973
4267	NC_002677	AGC	2	6	211856	211861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15826973
4268	NC_002677	CGA	2	6	211950	211955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15826973
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4270	NC_002677	TTG	2	6	212066	212071	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15826973
4271	NC_002677	CGA	2	6	212082	212087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15826973
4272	NC_002677	CGG	2	6	212100	212105	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15826973
4273	NC_002677	CAGC	2	8	212125	212132	25 %	0 %	25 %	50 %	15826973
4274	NC_002677	CGG	2	6	212241	212246	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15826973
4275	NC_002677	ACC	2	6	212335	212340	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15826973
4276	NC_002677	GAC	2	6	212353	212358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15826973
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4279	NC_002677	CGA	2	6	212472	212477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15826973
4280	NC_002677	GT	3	6	212510	212515	0 %	50 %	50 %	0 %	15826973
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4282	NC_002677	GTT	2	6	212574	212579	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15826973
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4285	NC_002677	TTGC	2	8	212796	212803	0 %	50 %	25 %	25 %	15826973
4286	NC_002677	CTG	2	6	213066	213071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4287	NC_002677	TTG	2	6	213074	213079	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4288	NC_002677	GCT	2	6	213142	213147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4289	NC_002677	AAC	2	6	213206	213211	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15826974
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4294	NC_002677	ACC	2	6	213431	213436	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15826974
4295	NC_002677	AG	3	6	213512	213517	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4296	NC_002677	AGC	2	6	213559	213564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4297	NC_002677	CCCGTA	2	12	213585	213596	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
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4299	NC_002677	GCT	2	6	213641	213646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4300	NC_002677	GAA	2	6	213724	213729	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4301	NC_002677	TGC	2	6	213815	213820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4302	NC_002677	AC	4	8	213862	213869	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4303	NC_002677	GCC	2	6	213910	213915	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4304	NC_002677	AAC	2	6	214028	214033	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15826975
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4309	NC_002677	CGG	2	6	214251	214256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4320	NC_002677	GAT	2	6	214682	214687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15826976
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4343	NC_002677	GAC	2	6	215781	215786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15826976
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4350	NC_002677	GGA	2	6	216188	216193	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15826976
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4354	NC_002677	GTA	2	6	216343	216348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15826976
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4356	NC_002677	TCCGG	2	10	216418	216427	0 %	20 %	40 %	40 %	15826976
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4360	NC_002677	GCA	2	6	216753	216758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4361	NC_002677	AGC	2	6	216791	216796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4363	NC_002677	GTACT	2	10	216848	216857	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
4364	NC_002677	GAT	2	6	216869	216874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4365	NC_002677	GCTG	2	8	216876	216883	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4366	NC_002677	CGG	2	6	216903	216908	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4367	NC_002677	CGGT	2	8	216933	216940	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4368	NC_002677	GTG	2	6	216973	216978	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4369	NC_002677	G	6	6	216995	217000	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4370	NC_002677	GAT	2	6	217071	217076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4371	NC_002677	GGA	2	6	217126	217131	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4372	NC_002677	CACGG	2	10	217203	217212	20 %	0 %	40 %	40 %	15826977
4373	NC_002677	AGC	2	6	217236	217241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15826977
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4376	NC_002677	GCA	2	6	217495	217500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15826977
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4378	NC_002677	TGA	2	6	217663	217668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15826977
4379	NC_002677	TGC	2	6	217778	217783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15826977
4380	NC_002677	CGG	2	6	217798	217803	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15826977
4381	NC_002677	TGGT	2	8	217840	217847	0 %	50 %	50 %	0 %	15826977
4382	NC_002677	CGGCG	2	10	217869	217878	0 %	0 %	60 %	40 %	15826977
4383	NC_002677	GCT	2	6	217911	217916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15826977
4384	NC_002677	TCG	2	6	217953	217958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15826977
4385	NC_002677	GTC	3	9	218003	218011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15826977
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4387	NC_002677	CGT	2	6	218101	218106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15826977
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