MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium leprae TN chromosome

Total Repeats: 67017

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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3502	NC_002677	GCA	2	6	172561	172566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15826959
3503	NC_002677	CTG	2	6	172571	172576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15826959
3504	NC_002677	GGT	2	6	172591	172596	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15826959
3505	NC_002677	GAC	2	6	172602	172607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15826959
3506	NC_002677	GCA	2	6	172608	172613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15826959
3507	NC_002677	GGT	2	6	172635	172640	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15826959
3508	NC_002677	GGC	2	6	172689	172694	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15826959
3509	NC_002677	TGC	2	6	172709	172714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15826959
3510	NC_002677	CGG	2	6	172735	172740	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15826959
3511	NC_002677	GCA	2	6	172839	172844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15826959
3512	NC_002677	TCG	2	6	172960	172965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3513	NC_002677	GC	4	8	173003	173010	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3514	NC_002677	CTT	2	6	173016	173021	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3515	NC_002677	TCAGC	2	10	173170	173179	20 %	20 %	20 %	40 %	15826960
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3518	NC_002677	CGATCG	2	12	173279	173290	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	15826960
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3552	NC_002677	TTG	2	6	175463	175468	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15826962
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3558	NC_002677	CGC	2	6	175741	175746	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15826962
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3612	NC_002677	ATTG	2	8	179519	179526	25 %	50 %	25 %	0 %	15826964
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3619	NC_002677	GTTC	2	8	179967	179974	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3620	NC_002677	GGT	2	6	180012	180017	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3621	NC_002677	GCA	2	6	180045	180050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15826965
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3623	NC_002677	GCA	2	6	180066	180071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15826965
3624	NC_002677	CGT	2	6	180113	180118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15826965
3625	NC_002677	CGGTG	2	10	180140	180149	0 %	20 %	60 %	20 %	15826965
3626	NC_002677	CAG	2	6	180184	180189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15826965
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3629	NC_002677	TGT	2	6	180406	180411	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15826965
3630	NC_002677	GTG	2	6	180454	180459	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15826965
3631	NC_002677	ATGCGT	2	12	180460	180471	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	15826965
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3633	NC_002677	CAC	2	6	180491	180496	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15826965
3634	NC_002677	GGC	2	6	180509	180514	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15826965
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3639	NC_002677	TG	3	6	180816	180821	0 %	50 %	50 %	0 %	15826965
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3642	NC_002677	ATCG	2	8	181067	181074	25 %	25 %	25 %	25 %	15826965
3643	NC_002677	GCT	2	6	181103	181108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15826965
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3645	NC_002677	TACG	2	8	181169	181176	25 %	25 %	25 %	25 %	15826965
3646	NC_002677	ATT	2	6	181245	181250	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15826965
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3651	NC_002677	TAT	2	6	181430	181435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15826965
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3653	NC_002677	GCT	2	6	181593	181598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15826965
3654	NC_002677	GCC	2	6	181608	181613	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15826965
3655	NC_002677	GCA	2	6	181646	181651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15826965
3656	NC_002677	CGA	2	6	181958	181963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15826965
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3658	NC_002677	TGG	3	9	181987	181995	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15826965
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3661	NC_002677	GAG	2	6	182155	182160	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3662	NC_002677	AGA	2	6	182201	182206	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15826966
3663	NC_002677	A	6	6	182230	182235	100 %	0 %	0 %	0 %	15826966
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3689	NC_002677	CGGG	2	8	183505	183512	0 %	0 %	75 %	25 %	15826966
3690	NC_002677	GTC	2	6	183516	183521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15826966
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3731	NC_002677	TTG	2	6	185308	185313	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15826966
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3746	NC_002677	CGG	2	6	185871	185876	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15826966
3747	NC_002677	GCCT	2	8	185879	185886	0 %	25 %	25 %	50 %	15826966
3748	NC_002677	CGT	2	6	185937	185942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15826966
3749	NC_002677	GTCTGC	2	12	185958	185969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15826966
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3751	NC_002677	GCC	2	6	186022	186027	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15826966
3752	NC_002677	TGC	2	6	186035	186040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15826966
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3754	NC_002677	TGG	2	6	186074	186079	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15826966
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3759	NC_002677	GGTGGC	2	12	186432	186443	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	15826966
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3761	NC_002677	GTG	2	6	186532	186537	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15826966
3762	NC_002677	CAA	2	6	186628	186633	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15826966
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3766	NC_002677	GGT	2	6	186772	186777	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15826966
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3772	NC_002677	TGC	2	6	187181	187186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15826966
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3774	NC_002677	GCTG	2	8	187293	187300	0 %	25 %	50 %	25 %	15826966
3775	NC_002677	TAG	2	6	187410	187415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15826966
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3777	NC_002677	GGT	2	6	187485	187490	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15826966
3778	NC_002677	ATG	2	6	187511	187516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15826966
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3784	NC_002677	CTC	2	6	187719	187724	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15826966
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3789	NC_002677	AGC	2	6	187882	187887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15826966
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3797	NC_002677	CGG	2	6	188207	188212	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15826966
3798	NC_002677	GGCC	2	8	188218	188225	0 %	0 %	50 %	50 %	15826966
3799	NC_002677	GCC	2	6	188334	188339	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15826966
3800	NC_002677	GCC	2	6	188408	188413	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15826966
3801	NC_002677	TGA	2	6	188427	188432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15826966
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3803	NC_002677	TTC	2	6	188506	188511	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3804	NC_002677	ATGA	2	8	188551	188558	50 %	25 %	25 %	0 %	15826967
3805	NC_002677	CGT	2	6	188573	188578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15826967
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3821	NC_002677	GAAG	2	8	189400	189407	50 %	0 %	50 %	0 %	15826968
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3824	NC_002677	CGC	2	6	189487	189492	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15826968
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3830	NC_002677	GCA	2	6	189773	189778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15826968
3831	NC_002677	CGGCTA	2	12	189783	189794	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	15826968
3832	NC_002677	GCG	2	6	189860	189865	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15826968
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3834	NC_002677	CGC	2	6	189886	189891	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15826968
3835	NC_002677	GAC	2	6	189925	189930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15826968
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3847	NC_002677	TTTG	2	8	190521	190528	0 %	75 %	25 %	0 %	15826968
3848	NC_002677	ACGA	2	8	190547	190554	50 %	0 %	25 %	25 %	15826968
3849	NC_002677	CTG	2	6	190561	190566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15826968
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3851	NC_002677	CGT	2	6	190611	190616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15826968
3852	NC_002677	GCC	2	6	190640	190645	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15826968
3853	NC_002677	TGAC	2	8	190685	190692	25 %	25 %	25 %	25 %	15826968
3854	NC_002677	TGA	2	6	190743	190748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15826968
3855	NC_002677	TG	3	6	190784	190789	0 %	50 %	50 %	0 %	15826968
3856	NC_002677	CAC	2	6	190861	190866	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15826968
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3859	NC_002677	AC	3	6	191093	191098	50 %	0 %	0 %	50 %	15826968
3860	NC_002677	C	6	6	191248	191253	0 %	0 %	0 %	100 %	15826968
3861	NC_002677	ACC	2	6	191267	191272	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15826968
3862	NC_002677	GCG	2	6	191273	191278	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15826968
3863	NC_002677	GCC	2	6	191288	191293	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15826968
3864	NC_002677	GCGA	2	8	191294	191301	25 %	0 %	50 %	25 %	15826968
3865	NC_002677	CAG	2	6	191314	191319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15826968
3866	NC_002677	CAC	2	6	191326	191331	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15826968
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3991	NC_002677	GCA	2	6	197817	197822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15826970
3992	NC_002677	AGTC	2	8	197837	197844	25 %	25 %	25 %	25 %	15826970
3993	NC_002677	GAT	2	6	197989	197994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15826970
3994	NC_002677	GCC	2	6	198020	198025	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15826970
3995	NC_002677	TGGTG	2	10	198042	198051	0 %	40 %	60 %	0 %	15826970
3996	NC_002677	TGA	2	6	198081	198086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15826970
3997	NC_002677	ATC	2	6	198133	198138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15826970
3998	NC_002677	GTTT	2	8	198173	198180	0 %	75 %	25 %	0 %	15826970
3999	NC_002677	CTG	2	6	198253	198258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15826970
4000	NC_002677	CAG	2	6	198267	198272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15826970

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