MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium leprae TN chromosome

Total Repeats: 67017

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_002677	CAG	2	6	318159	318164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6502	NC_002677	GAG	2	6	318209	318214	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6503	NC_002677	CA	3	6	318290	318295	50 %	0 %	0 %	50 %	15827039
6504	NC_002677	GC	3	6	318330	318335	0 %	0 %	50 %	50 %	15827039
6505	NC_002677	CGGT	2	8	318386	318393	0 %	25 %	50 %	25 %	15827039
6506	NC_002677	GCG	2	6	318449	318454	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15827039
6507	NC_002677	TGC	2	6	318467	318472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15827039
6508	NC_002677	GACC	2	8	318489	318496	25 %	0 %	25 %	50 %	15827039
6509	NC_002677	GAA	2	6	318508	318513	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15827039
6510	NC_002677	ACC	3	9	318517	318525	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15827039
6511	NC_002677	TCA	2	6	318554	318559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15827039
6512	NC_002677	GGT	2	6	318612	318617	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15827039
6513	NC_002677	GTT	2	6	318630	318635	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15827039
6514	NC_002677	TGA	2	6	318806	318811	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15827039
6515	NC_002677	GCTG	2	8	318815	318822	0 %	25 %	50 %	25 %	15827039
6516	NC_002677	GAT	2	6	318843	318848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15827039
6517	NC_002677	CTT	2	6	318909	318914	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15827039
6518	NC_002677	GCAA	2	8	319013	319020	50 %	0 %	25 %	25 %	15827039
6519	NC_002677	CGG	2	6	319088	319093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15827039
6520	NC_002677	TTG	2	6	319217	319222	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15827039
6521	NC_002677	GCCA	2	8	319266	319273	25 %	0 %	25 %	50 %	15827039
6522	NC_002677	CCG	2	6	319287	319292	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15827039
6523	NC_002677	GCT	2	6	319311	319316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15827039
6524	NC_002677	TGA	2	6	319341	319346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15827039
6525	NC_002677	GGC	2	6	319429	319434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15827039
6526	NC_002677	GT	3	6	319513	319518	0 %	50 %	50 %	0 %	15827039
6527	NC_002677	TCA	3	9	319535	319543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15827039
6528	NC_002677	TGGC	2	8	319544	319551	0 %	25 %	50 %	25 %	15827039
6529	NC_002677	CGAC	2	8	319565	319572	25 %	0 %	25 %	50 %	15827039
6530	NC_002677	GCG	2	6	319582	319587	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15827039
6531	NC_002677	TCGCTG	2	12	319661	319672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15827039
6532	NC_002677	CCG	2	6	319697	319702	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15827039
6533	NC_002677	GTG	2	6	319771	319776	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15827039
6534	NC_002677	GCG	2	6	319821	319826	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15827039
6535	NC_002677	TGA	2	6	319875	319880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6536	NC_002677	GCT	2	6	319961	319966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15827040
6537	NC_002677	CAA	2	6	320013	320018	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15827040
6538	NC_002677	CGG	2	6	320030	320035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15827040
6539	NC_002677	TGG	2	6	320048	320053	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15827040
6540	NC_002677	GTG	2	6	320074	320079	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15827040
6541	NC_002677	ACG	2	6	320096	320101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15827040
6542	NC_002677	GAC	2	6	320123	320128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15827040
6543	NC_002677	GCC	2	6	320173	320178	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15827040
6544	NC_002677	CGC	3	9	320207	320215	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15827040
6545	NC_002677	GTCGAG	2	12	320241	320252	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	15827040
6546	NC_002677	GTC	2	6	320253	320258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15827040
6547	NC_002677	GAT	3	9	320265	320273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15827040
6548	NC_002677	TAG	2	6	320304	320309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15827040
6549	NC_002677	CTG	2	6	320316	320321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15827040
6550	NC_002677	CCA	2	6	320354	320359	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15827040
6551	NC_002677	GAC	2	6	320388	320393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15827040
6552	NC_002677	ACC	2	6	320518	320523	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15827040
6553	NC_002677	ACC	2	6	320534	320539	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15827040
6554	NC_002677	CG	3	6	320565	320570	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6555	NC_002677	ACTCGG	2	12	320579	320590	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	15827041
6556	NC_002677	GCG	2	6	320593	320598	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15827041
6557	NC_002677	CGTC	2	8	320669	320676	0 %	25 %	25 %	50 %	15827041
6558	NC_002677	GCCTCG	2	12	320821	320832	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	15827041
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6560	NC_002677	CGA	3	9	320906	320914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15827041
6561	NC_002677	GAC	2	6	320931	320936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15827041
6562	NC_002677	CAG	2	6	320937	320942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15827041
6563	NC_002677	ATG	2	6	320953	320958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15827041
6564	NC_002677	CGGAT	2	10	320965	320974	20 %	20 %	40 %	20 %	15827041
6565	NC_002677	CTC	2	6	321102	321107	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15827041
6566	NC_002677	CGG	2	6	321125	321130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15827041
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6570	NC_002677	CATCCA	2	12	321329	321340	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
6571	NC_002677	GCC	2	6	321454	321459	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6572	NC_002677	GTC	2	6	321562	321567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6573	NC_002677	TGG	2	6	321579	321584	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6574	NC_002677	GGC	2	6	321667	321672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6575	NC_002677	CGA	2	6	321685	321690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6576	NC_002677	GTG	2	6	321700	321705	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6577	NC_002677	CGC	2	6	321709	321714	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6578	NC_002677	CACC	2	8	321834	321841	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
6579	NC_002677	TGC	2	6	321863	321868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6580	NC_002677	TCC	2	6	321897	321902	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6581	NC_002677	ATC	2	6	321915	321920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6582	NC_002677	CCG	2	6	322011	322016	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6583	NC_002677	TGG	2	6	322046	322051	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6584	NC_002677	CGC	2	6	322086	322091	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6585	NC_002677	GT	4	8	322119	322126	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6586	NC_002677	GGC	3	9	322228	322236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6587	NC_002677	AT	3	6	322241	322246	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6588	NC_002677	TTTGT	2	10	322294	322303	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
6589	NC_002677	CTGG	2	8	322309	322316	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6590	NC_002677	TCA	2	6	322329	322334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6591	NC_002677	CCG	2	6	322357	322362	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6592	NC_002677	AGC	2	6	322372	322377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6593	NC_002677	CGA	2	6	322410	322415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15827042
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6595	NC_002677	GTG	2	6	322515	322520	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15827042
6596	NC_002677	TCG	2	6	322664	322669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15827042
6597	NC_002677	TGA	2	6	322680	322685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15827042
6598	NC_002677	TTGGG	2	10	322687	322696	0 %	40 %	60 %	0 %	15827042
6599	NC_002677	GAT	2	6	322759	322764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15827042
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6602	NC_002677	TCG	2	6	323076	323081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6603	NC_002677	GAC	2	6	323149	323154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15827043
6604	NC_002677	GTGTT	2	10	323174	323183	0 %	60 %	40 %	0 %	15827043
6605	NC_002677	CAG	2	6	323197	323202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15827043
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6607	NC_002677	CACATC	2	12	323272	323283	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	15827043
6608	NC_002677	AAT	2	6	323293	323298	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15827043
6609	NC_002677	GGC	2	6	323321	323326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15827043
6610	NC_002677	GTGAT	2	10	323345	323354	20 %	40 %	40 %	0 %	15827043
6611	NC_002677	TCTT	2	8	323360	323367	0 %	75 %	0 %	25 %	15827043
6612	NC_002677	CAG	2	6	323638	323643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15827044
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6617	NC_002677	CA	3	6	323762	323767	50 %	0 %	0 %	50 %	15827044
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6620	NC_002677	ACC	3	9	323919	323927	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15827044
6621	NC_002677	GT	3	6	324027	324032	0 %	50 %	50 %	0 %	15827044
6622	NC_002677	CCG	2	6	324061	324066	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15827044
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