MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanocaldococcus jannaschii DSM 2661 plasmid large ECE

Total Repeats: 1623

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_001732	ATA	2	6	60	65	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_001732	TCA	2	6	85	90	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_001732	TTA	2	6	108	113	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_001732	TAAT	2	8	139	146	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_001732	A	6	6	193	198	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_001732	ATT	2	6	203	208	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_001732	AAC	2	6	259	264	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_001732	TAT	2	6	298	303	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10954493
9	NC_001732	GAA	2	6	401	406	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10954493
10	NC_001732	T	6	6	419	424	0 %	100 %	0 %	0 %	10954493
11	NC_001732	ATA	3	9	425	433	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10954493
12	NC_001732	ATG	2	6	459	464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	10954493
13	NC_001732	ACAA	2	8	500	507	75 %	0 %	0 %	25 %	10954493
14	NC_001732	ATG	2	6	567	572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	10954493
15	NC_001732	GAA	2	6	599	604	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10954493
16	NC_001732	TTA	2	6	646	651	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10954493
17	NC_001732	AT	3	6	657	662	50 %	50 %	0 %	0 %	10954493
18	NC_001732	ATT	2	6	694	699	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10954493
19	NC_001732	TTA	2	6	732	737	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10954493
20	NC_001732	GAA	2	6	770	775	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10954493
21	NC_001732	AAT	2	6	782	787	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10954493
22	NC_001732	A	6	6	792	797	100 %	0 %	0 %	0 %	10954493
23	NC_001732	TAA	2	6	867	872	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10954493
24	NC_001732	ACT	2	6	921	926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10954493
25	NC_001732	ATAA	2	8	932	939	75 %	25 %	0 %	0 %	10954493
26	NC_001732	GAA	2	6	947	952	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10954493
27	NC_001732	TGA	2	6	975	980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	10954493
28	NC_001732	GAA	2	6	1040	1045	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10954493
29	NC_001732	TAT	2	6	1080	1085	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10954494
30	NC_001732	CTTG	2	8	1088	1095	0 %	50 %	25 %	25 %	10954494
31	NC_001732	CA	3	6	1154	1159	50 %	0 %	0 %	50 %	10954494
32	NC_001732	ATT	2	6	1215	1220	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10954494
33	NC_001732	ATA	3	9	1238	1246	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10954494
34	NC_001732	TAC	2	6	1261	1266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10954494
35	NC_001732	T	6	6	1286	1291	0 %	100 %	0 %	0 %	10954494
36	NC_001732	TTG	2	6	1312	1317	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	10954494
37	NC_001732	TTC	2	6	1331	1336	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	10954494
38	NC_001732	ATA	2	6	1347	1352	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10954494
39	NC_001732	CCA	2	6	1355	1360	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	10954494
40	NC_001732	ATC	2	6	1428	1433	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10954494
41	NC_001732	ATA	2	6	1447	1452	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10954494
42	NC_001732	TCA	3	9	1459	1467	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10954494
43	NC_001732	TTCT	2	8	1531	1538	0 %	75 %	0 %	25 %	10954495
44	NC_001732	CAAC	2	8	1592	1599	50 %	0 %	0 %	50 %	10954495
45	NC_001732	TC	3	6	1607	1612	0 %	50 %	0 %	50 %	10954495
46	NC_001732	TCA	2	6	1624	1629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10954495
47	NC_001732	ACC	2	6	1671	1676	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	10954495
48	NC_001732	ACC	2	6	1704	1709	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_001732	CTT	2	6	1756	1761	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_001732	TATAA	2	10	1766	1775	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_001732	ACT	2	6	1815	1820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_001732	ATAATT	2	12	1905	1916	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_001732	AGA	3	9	1948	1956	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10954496
54	NC_001732	AAC	2	6	1988	1993	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	10954496
55	NC_001732	TTAT	2	8	2007	2014	25 %	75 %	0 %	0 %	10954496
56	NC_001732	GAA	3	9	2019	2027	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10954496
57	NC_001732	TTA	2	6	2077	2082	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10954496
58	NC_001732	CAA	2	6	2142	2147	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	10954496
59	NC_001732	ATCATT	2	12	2201	2212	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	10954496
60	NC_001732	TTAA	2	8	2228	2235	50 %	50 %	0 %	0 %	10954496
61	NC_001732	TAT	2	6	2250	2255	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10954496
62	NC_001732	A	6	6	2287	2292	100 %	0 %	0 %	0 %	10954496
63	NC_001732	ACAAAA	2	12	2294	2305	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	10954496
64	NC_001732	TTA	2	6	2307	2312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10954496
65	NC_001732	TCA	2	6	2321	2326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10954496
66	NC_001732	ATG	2	6	2333	2338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	10954496
67	NC_001732	GA	3	6	2340	2345	50 %	0 %	50 %	0 %	10954496
68	NC_001732	GTTG	2	8	2458	2465	0 %	50 %	50 %	0 %	10954496
69	NC_001732	AG	3	6	2550	2555	50 %	0 %	50 %	0 %	10954496
70	NC_001732	T	6	6	2563	2568	0 %	100 %	0 %	0 %	10954496
71	NC_001732	TGA	2	6	2589	2594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	10954496
72	NC_001732	GAG	2	6	2606	2611	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	10954496
73	NC_001732	CAA	2	6	2613	2618	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	10954496
74	NC_001732	CA	3	6	2657	2662	50 %	0 %	0 %	50 %	10954496
75	NC_001732	GA	3	6	2667	2672	50 %	0 %	50 %	0 %	10954496
76	NC_001732	A	6	6	2719	2724	100 %	0 %	0 %	0 %	10954496
77	NC_001732	TTGA	2	8	2726	2733	25 %	50 %	25 %	0 %	10954496
78	NC_001732	AG	3	6	2746	2751	50 %	0 %	50 %	0 %	10954496
79	NC_001732	A	6	6	2782	2787	100 %	0 %	0 %	0 %	10954496
80	NC_001732	TTTTA	2	10	2822	2831	20 %	80 %	0 %	0 %	10954496
81	NC_001732	GAG	2	6	2882	2887	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	10954496
82	NC_001732	TGG	2	6	3005	3010	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	10954496
83	NC_001732	ATGATA	2	12	3045	3056	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	10954496
84	NC_001732	A	6	6	3056	3061	100 %	0 %	0 %	0 %	10954496
85	NC_001732	TTG	2	6	3069	3074	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	10954496
86	NC_001732	AT	3	6	3116	3121	50 %	50 %	0 %	0 %	10954496
87	NC_001732	TTG	2	6	3147	3152	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	10954496
88	NC_001732	GAT	2	6	3158	3163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	10954496
89	NC_001732	TTG	2	6	3183	3188	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	10954496
90	NC_001732	AGA	2	6	3192	3197	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10954496
91	NC_001732	TAT	2	6	3225	3230	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10954496
92	NC_001732	GGA	2	6	3238	3243	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	10954496
93	NC_001732	ATT	2	6	3279	3284	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10954489
94	NC_001732	GAA	2	6	3289	3294	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10954489
95	NC_001732	ATA	3	9	3301	3309	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10954489
96	NC_001732	A	6	6	3316	3321	100 %	0 %	0 %	0 %	10954489
97	NC_001732	AG	3	6	3327	3332	50 %	0 %	50 %	0 %	10954489
98	NC_001732	ATC	2	6	3351	3356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10954489
99	NC_001732	GAAA	2	8	3372	3379	75 %	0 %	25 %	0 %	10954489
100	NC_001732	AAC	2	6	3407	3412	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	10954489
101	NC_001732	AGA	2	6	3437	3442	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10954489
102	NC_001732	CTA	2	6	3456	3461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_001732	ATT	2	6	3467	3472	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_001732	AGA	2	6	3473	3478	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_001732	ATG	2	6	3481	3486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_001732	TTA	2	6	3504	3509	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_001732	T	8	8	3547	3554	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_001732	ATT	2	6	3570	3575	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_001732	AT	3	6	3598	3603	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_001732	TGA	2	6	3675	3680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_001732	A	6	6	3680	3685	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_001732	A	6	6	3690	3695	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_001732	TAATT	2	10	3752	3761	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_001732	TCCA	2	8	3833	3840	25 %	25 %	0 %	50 %	10954497
115	NC_001732	TA	3	6	3856	3861	50 %	50 %	0 %	0 %	10954497
116	NC_001732	TAT	2	6	3904	3909	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10954497
117	NC_001732	TCC	2	6	3917	3922	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	10954497
118	NC_001732	CTC	2	6	3938	3943	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	10954497
119	NC_001732	CTTC	2	8	3969	3976	0 %	50 %	0 %	50 %	10954497
120	NC_001732	T	6	6	4066	4071	0 %	100 %	0 %	0 %	10954497
121	NC_001732	TTC	2	6	4075	4080	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	10954497
122	NC_001732	AAT	2	6	4109	4114	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10954497
123	NC_001732	ATT	2	6	4204	4209	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_001732	AAAT	2	8	4248	4255	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_001732	ATTT	2	8	4277	4284	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_001732	T	6	6	4309	4314	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_001732	AAGAAC	2	12	4351	4362	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
128	NC_001732	TA	3	6	4369	4374	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_001732	AAC	2	6	4400	4405	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_001732	TAA	2	6	4422	4427	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_001732	CAA	2	6	4433	4438	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_001732	ACTA	2	8	4439	4446	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
133	NC_001732	T	6	6	4448	4453	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_001732	A	6	6	4459	4464	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_001732	TCCC	2	8	4574	4581	0 %	25 %	0 %	75 %	10954498
136	NC_001732	T	6	6	4660	4665	0 %	100 %	0 %	0 %	10954498
137	NC_001732	TTA	2	6	4679	4684	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10954498
138	NC_001732	CTT	2	6	4746	4751	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	10954498
139	NC_001732	T	6	6	4759	4764	0 %	100 %	0 %	0 %	10954498
140	NC_001732	ATC	2	6	4832	4837	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10954498
141	NC_001732	AAT	2	6	4875	4880	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10954498
142	NC_001732	CCT	2	6	4912	4917	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	10954498
143	NC_001732	T	7	7	4923	4929	0 %	100 %	0 %	0 %	10954498
144	NC_001732	AGT	2	6	4954	4959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	10954498
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186	NC_001732	T	7	7	6581	6587	0 %	100 %	0 %	0 %	10954499
187	NC_001732	T	6	6	6612	6617	0 %	100 %	0 %	0 %	10954499
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271	NC_001732	TTA	2	6	9846	9851	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10954503
272	NC_001732	ACA	2	6	9945	9950	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
273	NC_001732	TCC	2	6	9951	9956	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
274	NC_001732	T	6	6	10009	10014	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
275	NC_001732	A	7	7	10024	10030	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
276	NC_001732	TTA	2	6	10106	10111	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
277	NC_001732	TAAA	2	8	10125	10132	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
278	NC_001732	A	6	6	10186	10191	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
279	NC_001732	TGATA	2	10	10235	10244	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
280	NC_001732	CTG	2	6	10355	10360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
281	NC_001732	CTA	2	6	10366	10371	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
282	NC_001732	AT	3	6	10412	10417	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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411	NC_001732	A	6	6	14479	14484	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
412	NC_001732	AG	3	6	14509	14514	50 %	0 %	50 %	0 %	10954505
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