MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanocaldococcus jannaschii DSM 2661 plasmid large ECE

Total Repeats: 1623

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_001732	TTA	2	6	17731	17736	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
502	NC_001732	TTTGT	3	15	17749	17763	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
503	NC_001732	AGT	2	6	17770	17775	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
504	NC_001732	TTC	2	6	17902	17907	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
505	NC_001732	AGG	2	6	17918	17923	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
506	NC_001732	TAT	2	6	17948	17953	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
507	NC_001732	CAA	2	6	17962	17967	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
508	NC_001732	AAC	2	6	17974	17979	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
509	NC_001732	TTA	2	6	17990	17995	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
510	NC_001732	ACC	2	6	18007	18012	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
511	NC_001732	AAC	2	6	18098	18103	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
512	NC_001732	CA	4	8	18117	18124	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
513	NC_001732	ATA	2	6	18168	18173	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
514	NC_001732	TAA	2	6	18176	18181	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
515	NC_001732	TAC	2	6	18203	18208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
516	NC_001732	AAATA	2	10	18215	18224	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
517	NC_001732	CAC	2	6	18231	18236	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
518	NC_001732	AAAAC	2	10	18237	18246	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
519	NC_001732	AAT	2	6	18282	18287	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
520	NC_001732	A	6	6	18329	18334	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
521	NC_001732	A	6	6	18354	18359	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
522	NC_001732	ACGA	2	8	18363	18370	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
523	NC_001732	A	6	6	18374	18379	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
524	NC_001732	A	6	6	18396	18401	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
525	NC_001732	A	6	6	18424	18429	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
526	NC_001732	CAA	2	6	18473	18478	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
527	NC_001732	ATA	2	6	18479	18484	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
528	NC_001732	AAC	2	6	18505	18510	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
529	NC_001732	AACCCA	2	12	18528	18539	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
530	NC_001732	AACA	2	8	18549	18556	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
531	NC_001732	A	6	6	18556	18561	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
532	NC_001732	AAC	2	6	18583	18588	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
533	NC_001732	ATC	2	6	18596	18601	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
534	NC_001732	TAG	2	6	18607	18612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
535	NC_001732	AAC	2	6	18664	18669	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
536	NC_001732	A	7	7	18681	18687	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
537	NC_001732	AAAAG	2	10	18717	18726	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
538	NC_001732	TAC	2	6	18729	18734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
539	NC_001732	CCTAAT	2	12	18776	18787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
540	NC_001732	ATTA	2	8	18798	18805	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
541	NC_001732	TAA	2	6	18885	18890	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
542	NC_001732	ACA	2	6	18944	18949	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
543	NC_001732	AC	3	6	18969	18974	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
544	NC_001732	CA	3	6	19066	19071	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
545	NC_001732	TCC	2	6	19168	19173	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
546	NC_001732	ACA	2	6	19192	19197	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
547	NC_001732	ATT	2	6	19233	19238	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
548	NC_001732	CATA	2	8	19267	19274	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
549	NC_001732	A	6	6	19276	19281	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
550	NC_001732	ATT	2	6	19318	19323	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
551	NC_001732	GTTTA	2	10	19354	19363	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
552	NC_001732	TTA	2	6	19379	19384	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
553	NC_001732	ATT	2	6	19394	19399	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
554	NC_001732	TAA	2	6	19416	19421	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
555	NC_001732	GATT	2	8	19453	19460	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
556	NC_001732	A	7	7	19466	19472	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
557	NC_001732	TAT	2	6	19557	19562	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
558	NC_001732	ATA	2	6	19573	19578	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
559	NC_001732	AAT	2	6	19647	19652	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
560	NC_001732	A	6	6	19664	19669	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
561	NC_001732	TA	3	6	19699	19704	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
562	NC_001732	CAA	2	6	19732	19737	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
563	NC_001732	ATA	2	6	19769	19774	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
564	NC_001732	ATC	2	6	19796	19801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
565	NC_001732	ATTGA	2	10	19835	19844	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
566	NC_001732	TAAA	2	8	19906	19913	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
567	NC_001732	TTC	2	6	19919	19924	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
568	NC_001732	CTT	2	6	19990	19995	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
569	NC_001732	TCT	2	6	20016	20021	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
570	NC_001732	CTA	2	6	20052	20057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
571	NC_001732	CT	3	6	20059	20064	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
572	NC_001732	T	6	6	20076	20081	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
573	NC_001732	ACC	2	6	20122	20127	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
574	NC_001732	A	7	7	20129	20135	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
575	NC_001732	TACAA	2	10	20218	20227	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
576	NC_001732	ATA	2	6	20235	20240	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
577	NC_001732	CAATA	2	10	20244	20253	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
578	NC_001732	ATA	2	6	20310	20315	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
579	NC_001732	ACA	2	6	20323	20328	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
580	NC_001732	ATTA	2	8	20329	20336	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
581	NC_001732	ATA	2	6	20342	20347	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
582	NC_001732	ACTA	2	8	20382	20389	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
583	NC_001732	AAAATA	2	12	20395	20406	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
584	NC_001732	AGGGGA	2	12	20436	20447	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
585	NC_001732	AAT	2	6	20509	20514	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
586	NC_001732	A	6	6	20521	20526	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
587	NC_001732	GA	3	6	20563	20568	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
588	NC_001732	AAG	2	6	20578	20583	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
589	NC_001732	CTT	2	6	20613	20618	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
590	NC_001732	GAA	2	6	20630	20635	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
591	NC_001732	TAA	2	6	20661	20666	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
592	NC_001732	TAG	2	6	20667	20672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
593	NC_001732	ATG	2	6	20707	20712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
594	NC_001732	T	6	6	20787	20792	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
595	NC_001732	ATT	2	6	20853	20858	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
596	NC_001732	ATG	2	6	20997	21002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	10954507
597	NC_001732	TA	3	6	21045	21050	50 %	50 %	0 %	0 %	10954507
598	NC_001732	TAAC	2	8	21060	21067	50 %	25 %	0 %	25 %	10954507
599	NC_001732	AGT	2	6	21113	21118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	10954507
600	NC_001732	ATT	2	6	21143	21148	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10954507
601	NC_001732	GTA	2	6	21159	21164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	10954507
602	NC_001732	GATA	2	8	21172	21179	50 %	25 %	25 %	0 %	10954507
603	NC_001732	TGA	2	6	21208	21213	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	10954507
604	NC_001732	TTC	2	6	21214	21219	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	10954507
605	NC_001732	CAATA	2	10	21254	21263	60 %	20 %	0 %	20 %	10954507
606	NC_001732	ATG	2	6	21273	21278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	10954507
607	NC_001732	TGA	3	9	21328	21336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	10954507
608	NC_001732	TAG	2	6	21390	21395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	10954507
609	NC_001732	GTT	2	6	21448	21453	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	10954507
610	NC_001732	AGA	2	6	21466	21471	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10954507
611	NC_001732	AT	3	6	21490	21495	50 %	50 %	0 %	0 %	10954507
612	NC_001732	TGA	3	9	21515	21523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	10954508
613	NC_001732	ATA	2	6	21534	21539	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10954508
614	NC_001732	GGA	2	6	21590	21595	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	10954508
615	NC_001732	TTA	2	6	21598	21603	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10954508
616	NC_001732	GAT	2	6	21615	21620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	10954508
617	NC_001732	GTT	2	6	21638	21643	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	10954508
618	NC_001732	TAT	2	6	21720	21725	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10954508
619	NC_001732	TA	3	6	21739	21744	50 %	50 %	0 %	0 %	10954508
620	NC_001732	TA	3	6	21760	21765	50 %	50 %	0 %	0 %	10954508
621	NC_001732	TGA	2	6	21812	21817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	10954508
622	NC_001732	A	6	6	21822	21827	100 %	0 %	0 %	0 %	10954508
623	NC_001732	TTA	2	6	21837	21842	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10954508
624	NC_001732	TAT	2	6	21856	21861	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10954508
625	NC_001732	ATG	2	6	21877	21882	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	10954508
626	NC_001732	A	6	6	21901	21906	100 %	0 %	0 %	0 %	10954508
627	NC_001732	ATT	2	6	21916	21921	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10954508
628	NC_001732	ATT	2	6	21935	21940	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10954508
629	NC_001732	CAA	2	6	21962	21967	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	10954508
630	NC_001732	A	6	6	22000	22005	100 %	0 %	0 %	0 %	10954508
631	NC_001732	AGA	2	6	22021	22026	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10954508
632	NC_001732	TAA	2	6	22048	22053	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
633	NC_001732	TCT	2	6	22058	22063	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
634	NC_001732	AT	3	6	22087	22092	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
635	NC_001732	CA	3	6	22095	22100	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
636	NC_001732	TATGAA	2	12	22109	22120	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
637	NC_001732	ATT	2	6	22144	22149	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
638	NC_001732	TAA	2	6	22160	22165	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
639	NC_001732	TGT	2	6	22183	22188	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
640	NC_001732	T	6	6	22248	22253	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
641	NC_001732	ATTAT	2	10	22268	22277	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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