MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium tuberculosis H37Rv complete genome

Total Repeats: 109734

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_000962	CCA	2	6	147684	147689	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15607262
3502	NC_000962	CGC	2	6	147705	147710	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15607262
3503	NC_000962	GCG	2	6	147731	147736	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15607262
3504	NC_000962	TCC	2	6	147777	147782	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3505	NC_000962	GTG	2	6	147804	147809	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3506	NC_000962	CAG	2	6	147815	147820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3507	NC_000962	GTA	2	6	147824	147829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3508	NC_000962	GCC	2	6	147849	147854	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3509	NC_000962	GGGTC	2	10	147863	147872	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
3510	NC_000962	AGT	2	6	147878	147883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3511	NC_000962	CGT	2	6	147897	147902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3512	NC_000962	GC	3	6	147993	147998	0 %	0 %	50 %	50 %	15607263
3513	NC_000962	GCG	2	6	148011	148016	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15607263
3514	NC_000962	CAC	2	6	148068	148073	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15607263
3515	NC_000962	ATC	2	6	148085	148090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15607263
3516	NC_000962	CGA	2	6	148102	148107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607263
3517	NC_000962	CGT	2	6	148160	148165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607263
3518	NC_000962	CGG	2	6	148183	148188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15607263
3519	NC_000962	TGG	2	6	148282	148287	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15607263
3520	NC_000962	GCC	2	6	148364	148369	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3521	NC_000962	GCGT	2	8	148443	148450	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3522	NC_000962	GGT	2	6	148463	148468	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3523	NC_000962	GC	3	6	148478	148483	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3524	NC_000962	GCC	2	6	148509	148514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15607264
3525	NC_000962	GAC	2	6	148583	148588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607264
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3530	NC_000962	CGA	2	6	148805	148810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607264
3531	NC_000962	ATC	2	6	148821	148826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15607264
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3533	NC_000962	CCG	2	6	148878	148883	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15607265
3534	NC_000962	CGA	2	6	148897	148902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607265
3535	NC_000962	CAAG	2	8	148927	148934	50 %	0 %	25 %	25 %	15607265
3536	NC_000962	AGG	2	6	148935	148940	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15607265
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3542	NC_000962	GCT	2	6	149158	149163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607265
3543	NC_000962	CGA	2	6	149176	149181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607265
3544	NC_000962	GCC	2	6	149235	149240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3545	NC_000962	GGT	2	6	149338	149343	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3546	NC_000962	CTCGGT	2	12	149374	149385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3547	NC_000962	GTC	2	6	149474	149479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3548	NC_000962	GGT	2	6	149500	149505	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3549	NC_000962	GCGG	2	8	149509	149516	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3550	NC_000962	GT	3	6	149526	149531	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3551	NC_000962	TGG	2	6	149564	149569	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	57116692
3552	NC_000962	ATCGG	2	10	149593	149602	20 %	20 %	40 %	20 %	57116692
3553	NC_000962	GCC	2	6	149620	149625	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	57116692
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3555	NC_000962	CGG	2	6	149675	149680	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	57116692
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3558	NC_000962	GCC	2	6	149797	149802	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	57116692
3559	NC_000962	AGC	3	9	149816	149824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	57116692
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3561	NC_000962	GCT	2	6	149856	149861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	57116692
3562	NC_000962	CGG	2	6	149916	149921	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	57116692
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3605	NC_000962	GCGG	2	8	150652	150659	0 %	0 %	75 %	25 %	57116692
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3625	NC_000962	GGT	2	6	151333	151338	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15607267
3626	NC_000962	ACA	2	6	151362	151367	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15607267
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3629	NC_000962	CGG	2	6	151566	151571	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15607267
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3634	NC_000962	CGT	2	6	151780	151785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607267
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3643	NC_000962	TCG	2	6	152218	152223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3644	NC_000962	ACC	2	6	152229	152234	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3645	NC_000962	GCCG	2	8	152236	152243	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3646	NC_000962	ATTGG	2	10	152248	152257	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
3647	NC_000962	GCC	3	9	152423	152431	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15607268
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3652	NC_000962	GCC	2	6	152587	152592	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15607268
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3654	NC_000962	CGG	2	6	152617	152622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15607268
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3696	NC_000962	AGCGA	2	10	154204	154213	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
3697	NC_000962	GAG	3	9	154215	154223	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3727	NC_000962	CGCC	2	8	155578	155585	0 %	0 %	25 %	75 %	15607269
3728	NC_000962	CCGG	2	8	155602	155609	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3729	NC_000962	GCGT	3	12	155630	155641	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3730	NC_000962	GA	3	6	155674	155679	50 %	0 %	50 %	0 %	15607270
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3735	NC_000962	CGT	2	6	155848	155853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607270
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3737	NC_000962	TCG	2	6	155869	155874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607270
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3745	NC_000962	CGG	2	6	156158	156163	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15607270
3746	NC_000962	GGA	2	6	156170	156175	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15607270
3747	NC_000962	CTG	2	6	156192	156197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607270
3748	NC_000962	GTC	2	6	156246	156251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607270
3749	NC_000962	TCGCGG	2	12	156268	156279	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	15607270
3750	NC_000962	TACC	2	8	156308	156315	25 %	25 %	0 %	50 %	15607270
3751	NC_000962	TCAA	2	8	156340	156347	50 %	25 %	0 %	25 %	15607270
3752	NC_000962	AGGCG	2	10	156387	156396	20 %	0 %	60 %	20 %	15607270
3753	NC_000962	CA	3	6	156523	156528	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3754	NC_000962	GCA	2	6	156532	156537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3755	NC_000962	GCT	2	6	156552	156557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3761	NC_000962	TGGT	2	8	156756	156763	0 %	50 %	50 %	0 %	57116693
3762	NC_000962	TGT	2	6	156799	156804	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	57116693
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3778	NC_000962	GGCC	2	8	157475	157482	0 %	0 %	50 %	50 %	57116693
3779	NC_000962	AGCC	2	8	157535	157542	25 %	0 %	25 %	50 %	57116693
3780	NC_000962	GAA	2	6	157589	157594	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57116693
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3782	NC_000962	ACG	2	6	157633	157638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3783	NC_000962	AC	3	6	157666	157671	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3784	NC_000962	AC	3	6	157761	157766	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3785	NC_000962	GGCT	2	8	157776	157783	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3786	NC_000962	GCG	2	6	157789	157794	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3787	NC_000962	CGCA	2	8	157802	157809	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3788	NC_000962	GA	3	6	157838	157843	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3789	NC_000962	GTCG	2	8	157861	157868	0 %	25 %	50 %	25 %	15607272
3790	NC_000962	GCC	3	9	157877	157885	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15607272
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3793	NC_000962	CGA	2	6	158229	158234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607272
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3796	NC_000962	GCCA	2	8	158349	158356	25 %	0 %	25 %	50 %	15607273
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3818	NC_000962	ACG	2	6	159088	159093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607273
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3820	NC_000962	TGA	2	6	159130	159135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15607273
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3831	NC_000962	GTC	2	6	159754	159759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607274
3832	NC_000962	GCACC	2	10	159807	159816	20 %	0 %	20 %	60 %	15607274
3833	NC_000962	ACCG	2	8	159838	159845	25 %	0 %	25 %	50 %	15607274
3834	NC_000962	CGG	2	6	159882	159887	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15607274
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3844	NC_000962	CGG	3	9	160162	160170	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15607274
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3850	NC_000962	CA	3	6	160562	160567	50 %	0 %	0 %	50 %	15607274
3851	NC_000962	CGG	2	6	160587	160592	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15607274
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3853	NC_000962	GAC	2	6	160642	160647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607274
3854	NC_000962	ACCC	2	8	160648	160655	25 %	0 %	0 %	75 %	15607274
3855	NC_000962	TGC	2	6	160698	160703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607274
3856	NC_000962	CCG	2	6	160706	160711	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15607274
3857	NC_000962	CGG	2	6	160743	160748	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15607274
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3859	NC_000962	GCA	2	6	160808	160813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3860	NC_000962	GC	3	6	160890	160895	0 %	0 %	50 %	50 %	15607275
3861	NC_000962	CCGCA	2	10	160985	160994	20 %	0 %	20 %	60 %	15607275
3862	NC_000962	GTT	2	6	161006	161011	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15607275
3863	NC_000962	CGA	2	6	161014	161019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607275
3864	NC_000962	CCA	2	6	161027	161032	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15607275
3865	NC_000962	CGG	2	6	161042	161047	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15607275
3866	NC_000962	CGCGG	2	10	161064	161073	0 %	0 %	60 %	40 %	15607275
3867	NC_000962	CGG	2	6	161081	161086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15607275
3868	NC_000962	GGC	2	6	161087	161092	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15607275
3869	NC_000962	CGC	2	6	161127	161132	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15607275
3870	NC_000962	CG	3	6	161193	161198	0 %	0 %	50 %	50 %	15607275
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3995	NC_000962	CG	3	6	165926	165931	0 %	0 %	50 %	50 %	15607281
3996	NC_000962	CGA	2	6	165964	165969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607281
3997	NC_000962	CGA	2	6	166039	166044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607281
3998	NC_000962	CTA	2	6	166048	166053	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15607281
3999	NC_000962	TG	3	6	166055	166060	0 %	50 %	50 %	0 %	15607281
4000	NC_000962	TCCC	2	8	166087	166094	0 %	25 %	0 %	75 %	15607281

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