MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium tuberculosis H37Rv complete genome

Total Repeats: 109734

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2502	NC_000962	CTC	2	6	105078	105083	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15607237
2503	NC_000962	AGG	2	6	105294	105299	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2504	NC_000962	GGC	2	6	105308	105313	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2505	NC_000962	ATGG	2	8	105320	105327	25 %	25 %	50 %	0 %	57116689
2506	NC_000962	ACC	2	6	105332	105337	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	57116689
2507	NC_000962	TTG	2	6	105388	105393	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	57116689
2508	NC_000962	GCA	2	6	105398	105403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	57116689
2509	NC_000962	TTG	2	6	105456	105461	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	57116689
2510	NC_000962	CAG	2	6	105476	105481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	57116689
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2512	NC_000962	CTGGC	2	10	105531	105540	0 %	20 %	40 %	40 %	57116689
2513	NC_000962	CCG	2	6	105571	105576	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	57116689
2514	NC_000962	GCTGCC	2	12	105591	105602	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	57116689
2515	NC_000962	CAG	2	6	105634	105639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	57116689
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2519	NC_000962	GCC	2	6	105753	105758	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	57116689
2520	NC_000962	GCC	2	6	105768	105773	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	57116689
2521	NC_000962	CG	3	6	105837	105842	0 %	0 %	50 %	50 %	57116689
2522	NC_000962	CGG	2	6	105845	105850	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	57116689
2523	NC_000962	GTC	2	6	105987	105992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	57116689
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2529	NC_000962	CGC	2	6	106157	106162	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	57116689
2530	NC_000962	TGGCTG	2	12	106198	106209	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	57116689
2531	NC_000962	CGG	2	6	106222	106227	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	57116689
2532	NC_000962	CGG	2	6	106235	106240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	57116689
2533	NC_000962	GCCC	2	8	106243	106250	0 %	0 %	25 %	75 %	57116689
2534	NC_000962	CGCC	2	8	106264	106271	0 %	0 %	25 %	75 %	57116689
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2542	NC_000962	GTC	2	6	106646	106651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	57116689
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2544	NC_000962	TGC	2	6	106678	106683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	57116689
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2554	NC_000962	CAT	2	6	107480	107485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15607239
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2557	NC_000962	TCGA	2	8	107915	107922	25 %	25 %	25 %	25 %	15607240
2558	NC_000962	ACT	2	6	107925	107930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15607240
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2560	NC_000962	CAT	2	6	107967	107972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15607240
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2563	NC_000962	CGG	2	6	108100	108105	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15607240
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2570	NC_000962	TCG	2	6	108508	108513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607241
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2580	NC_000962	CGG	2	6	108869	108874	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15607241
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2582	NC_000962	CGG	2	6	108887	108892	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15607241
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2587	NC_000962	CTGAA	2	10	108982	108991	40 %	20 %	20 %	20 %	15607241
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2594	NC_000962	TGG	2	6	109445	109450	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15607241
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2602	NC_000962	CGC	2	6	109800	109805	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15607242
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2605	NC_000962	CTG	2	6	109900	109905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607242
2606	NC_000962	AGC	2	6	109910	109915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607242
2607	NC_000962	TG	3	6	109998	110003	0 %	50 %	50 %	0 %	15607242
2608	NC_000962	CCG	2	6	110102	110107	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15607243
2609	NC_000962	CACC	2	8	110363	110370	25 %	0 %	0 %	75 %	15607243
2610	NC_000962	CTG	2	6	110376	110381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607243
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2619	NC_000962	GCG	2	6	110727	110732	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15607243
2620	NC_000962	TCTGA	2	10	110811	110820	20 %	40 %	20 %	20 %	15607243
2621	NC_000962	GAG	2	6	110949	110954	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15607243
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2623	NC_000962	CGGTC	2	10	111086	111095	0 %	20 %	40 %	40 %	15607243
2624	NC_000962	GAA	2	6	111126	111131	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15607243
2625	NC_000962	AC	3	6	111186	111191	50 %	0 %	0 %	50 %	15607243
2626	NC_000962	GGC	2	6	111233	111238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15607243
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2629	NC_000962	CGA	3	9	111467	111475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607243
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2631	NC_000962	CA	3	6	111683	111688	50 %	0 %	0 %	50 %	15607243
2632	NC_000962	AC	3	6	111693	111698	50 %	0 %	0 %	50 %	15607243
2633	NC_000962	CTG	2	6	111705	111710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607243
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2652	NC_000962	GTC	2	6	112305	112310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607243
2653	NC_000962	CGACGG	2	12	112349	112360	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	15607243
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2656	NC_000962	GTC	2	6	112673	112678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607243
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2729	NC_000962	CGGG	2	8	115500	115507	0 %	0 %	75 %	25 %	15607243
2730	NC_000962	CGG	2	6	115541	115546	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15607243
2731	NC_000962	GT	3	6	115581	115586	0 %	50 %	50 %	0 %	15607243
2732	NC_000962	GC	3	6	115589	115594	0 %	0 %	50 %	50 %	15607243
2733	NC_000962	CGA	2	6	115625	115630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607243
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2735	NC_000962	CCGG	2	8	115794	115801	0 %	0 %	50 %	50 %	15607243
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2739	NC_000962	CGA	2	6	116024	116029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607243
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2744	NC_000962	ACC	2	6	116091	116096	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15607243
2745	NC_000962	GC	3	6	116117	116122	0 %	0 %	50 %	50 %	15607243
2746	NC_000962	TGC	2	6	116125	116130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607243
2747	NC_000962	CGT	2	6	116134	116139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607243
2748	NC_000962	CGA	2	6	116140	116145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607243
2749	NC_000962	CGAC	2	8	116178	116185	25 %	0 %	25 %	50 %	15607243
2750	NC_000962	CCG	2	6	116287	116292	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15607243
2751	NC_000962	ACGG	2	8	116321	116328	25 %	0 %	50 %	25 %	15607243
2752	NC_000962	CTG	2	6	116331	116336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607243
2753	NC_000962	TGC	2	6	116380	116385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607243
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2755	NC_000962	GCGG	2	8	116423	116430	0 %	0 %	75 %	25 %	15607243
2756	NC_000962	CGA	2	6	116435	116440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607243
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2773	NC_000962	GC	3	6	117127	117132	0 %	0 %	50 %	50 %	15607243
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2778	NC_000962	TGC	2	6	117343	117348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607243
2779	NC_000962	CCGA	3	12	117405	117416	25 %	0 %	25 %	50 %	15607243
2780	NC_000962	GCG	2	6	117435	117440	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15607243
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2783	NC_000962	CG	3	6	117692	117697	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2784	NC_000962	CTG	2	6	117804	117809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607244
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2869	NC_000962	CCGA	2	8	121653	121660	25 %	0 %	25 %	50 %	15607245
2870	NC_000962	GTC	2	6	121680	121685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607245
2871	NC_000962	GC	3	6	121691	121696	0 %	0 %	50 %	50 %	15607245
2872	NC_000962	AAC	2	6	121809	121814	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15607245
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2874	NC_000962	AAC	2	6	121839	121844	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15607245
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2882	NC_000962	CTC	2	6	122178	122183	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2883	NC_000962	CGC	2	6	122397	122402	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15607246
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2886	NC_000962	TGC	2	6	122432	122437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607246
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2962	NC_000962	GCT	2	6	125423	125428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607248
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2966	NC_000962	GC	4	8	125629	125636	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2967	NC_000962	CGT	2	6	125691	125696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607249
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2990	NC_000962	CG	3	6	126679	126684	0 %	0 %	50 %	50 %	15607249
2991	NC_000962	CCG	2	6	126686	126691	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15607249
2992	NC_000962	GGCG	2	8	126704	126711	0 %	0 %	75 %	25 %	15607249
2993	NC_000962	CAC	2	6	126750	126755	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15607249
2994	NC_000962	GCGTCG	2	12	126868	126879	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	15607249
2995	NC_000962	TCA	2	6	126886	126891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15607249
2996	NC_000962	GGT	2	6	126894	126899	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15607249
2997	NC_000962	TGCGC	2	10	126914	126923	0 %	20 %	40 %	40 %	15607249
2998	NC_000962	CGG	2	6	127088	127093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15607249
2999	NC_000962	CAC	2	6	127131	127136	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15607249
3000	NC_000962	CTA	2	6	127156	127161	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15607249

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