MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium tuberculosis H37Rv complete genome

Total Repeats: 109734

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_000962	TGC	2	6	63613	63618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607201
1502	NC_000962	GCC	2	6	63639	63644	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15607201
1503	NC_000962	TCG	2	6	63666	63671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607201
1504	NC_000962	GAC	2	6	63713	63718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607201
1505	NC_000962	GCC	2	6	63732	63737	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15607201
1506	NC_000962	GCC	2	6	63740	63745	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15607201
1507	NC_000962	GT	3	6	63791	63796	0 %	50 %	50 %	0 %	15607201
1508	NC_000962	TCA	2	6	63867	63872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15607201
1509	NC_000962	TAC	2	6	63884	63889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15607201
1510	NC_000962	AAGG	2	8	63891	63898	50 %	0 %	50 %	0 %	15607201
1511	NC_000962	AGG	3	9	63896	63904	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_000962	CCT	2	6	63932	63937	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15607202
1513	NC_000962	CGC	2	6	64017	64022	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15607202
1514	NC_000962	TCG	3	9	64090	64098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607202
1515	NC_000962	CAT	2	6	64127	64132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15607202
1516	NC_000962	CCA	2	6	64141	64146	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15607202
1517	NC_000962	CAG	2	6	64317	64322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607202
1518	NC_000962	C	6	6	64349	64354	0 %	0 %	0 %	100 %	15607202
1519	NC_000962	GC	3	6	64409	64414	0 %	0 %	50 %	50 %	15607202
1520	NC_000962	GCG	2	6	64433	64438	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15607202
1521	NC_000962	CAG	2	6	64446	64451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607202
1522	NC_000962	CGC	2	6	64452	64457	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15607202
1523	NC_000962	CCGATC	2	12	64534	64545	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	15607202
1524	NC_000962	AACC	2	8	64668	64675	50 %	0 %	0 %	50 %	15607202
1525	NC_000962	ACT	2	6	64686	64691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15607202
1526	NC_000962	GCT	2	6	64811	64816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607202
1527	NC_000962	CGA	2	6	64919	64924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607202
1528	NC_000962	TCG	2	6	64979	64984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1529	NC_000962	GCT	2	6	65026	65031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	448814824
1530	NC_000962	CGGA	2	8	65032	65039	25 %	0 %	50 %	25 %	448814824
1531	NC_000962	ACC	2	6	65054	65059	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	448814824
1532	NC_000962	GGC	2	6	65064	65069	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	448814824
1533	NC_000962	CCG	2	6	65088	65093	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	448814824
1534	NC_000962	ACTTCA	2	12	65338	65349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	448814824
1535	NC_000962	CGG	2	6	65380	65385	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1536	NC_000962	TGCCG	2	10	65481	65490	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
1537	NC_000962	GCC	2	6	65533	65538	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1538	NC_000962	GTC	2	6	65631	65636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	57116687
1539	NC_000962	ATT	2	6	65664	65669	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	57116687
1540	NC_000962	TCA	2	6	65684	65689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	57116687
1541	NC_000962	CG	3	6	65704	65709	0 %	0 %	50 %	50 %	57116687
1542	NC_000962	CCT	2	6	65722	65727	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	57116687
1543	NC_000962	CGG	2	6	65856	65861	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	57116687
1544	NC_000962	CGC	2	6	65869	65874	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	57116687
1545	NC_000962	GC	3	6	65873	65878	0 %	0 %	50 %	50 %	57116687
1546	NC_000962	CCG	2	6	65888	65893	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	57116687
1547	NC_000962	CCG	2	6	65954	65959	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	57116687
1548	NC_000962	CGG	2	6	65968	65973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	57116687
1549	NC_000962	GCG	2	6	65996	66001	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	57116687
1550	NC_000962	GGC	2	6	66004	66009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	57116687
1551	NC_000962	CGA	2	6	66147	66152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	57116687
1552	NC_000962	TCG	2	6	66156	66161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	57116687
1553	NC_000962	GCTG	2	8	66297	66304	0 %	25 %	50 %	25 %	57116687
1554	NC_000962	GCC	2	6	66320	66325	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	57116687
1555	NC_000962	CG	5	10	66350	66359	0 %	0 %	50 %	50 %	57116687
1556	NC_000962	ACC	2	6	66389	66394	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	57116687
1557	NC_000962	GGCGA	2	10	66413	66422	20 %	0 %	60 %	20 %	57116687
1558	NC_000962	CAC	2	6	66544	66549	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	57116687
1559	NC_000962	GC	3	6	66561	66566	0 %	0 %	50 %	50 %	57116687
1560	NC_000962	CGGA	2	8	66606	66613	25 %	0 %	50 %	25 %	57116687
1561	NC_000962	CGTCGG	2	12	66736	66747	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
1562	NC_000962	GGT	2	6	66821	66826	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1563	NC_000962	TGC	2	6	66859	66864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1564	NC_000962	GCC	2	6	66962	66967	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15607205
1565	NC_000962	GCC	2	6	66977	66982	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15607205
1566	NC_000962	CTGG	2	8	67029	67036	0 %	25 %	50 %	25 %	15607205
1567	NC_000962	TTC	2	6	67045	67050	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15607205
1568	NC_000962	GAC	2	6	67079	67084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607205
1569	NC_000962	CGG	2	6	67143	67148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15607205
1570	NC_000962	AAC	2	6	67208	67213	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15607205
1571	NC_000962	ACG	2	6	67317	67322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607205
1572	NC_000962	CCA	2	6	67323	67328	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15607205
1573	NC_000962	CGGG	2	8	67330	67337	0 %	0 %	75 %	25 %	15607205
1574	NC_000962	CGCC	2	8	67347	67354	0 %	0 %	25 %	75 %	15607205
1575	NC_000962	CGGC	2	8	67389	67396	0 %	0 %	50 %	50 %	15607205
1576	NC_000962	CGGT	2	8	67425	67432	0 %	25 %	50 %	25 %	15607205
1577	NC_000962	GCG	2	6	67452	67457	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15607205
1578	NC_000962	CGTCGG	2	12	67506	67517	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	15607205
1579	NC_000962	TGC	2	6	67521	67526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607205
1580	NC_000962	ACC	2	6	67560	67565	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15607205
1581	NC_000962	GCGGTG	2	12	67587	67598	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	15607205
1582	NC_000962	CGT	2	6	67660	67665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607205
1583	NC_000962	CCG	2	6	67731	67736	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15607205
1584	NC_000962	CCGG	2	8	67811	67818	0 %	0 %	50 %	50 %	15607205
1585	NC_000962	GGC	2	6	67823	67828	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15607205
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1588	NC_000962	CGC	2	6	67944	67949	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15607205
1589	NC_000962	CGG	2	6	67960	67965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15607205
1590	NC_000962	ACG	2	6	67979	67984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607205
1591	NC_000962	CGG	2	6	68016	68021	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15607205
1592	NC_000962	GC	3	6	68079	68084	0 %	0 %	50 %	50 %	15607205
1593	NC_000962	GGC	2	6	68231	68236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15607205
1594	NC_000962	CCG	2	6	68264	68269	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15607205
1595	NC_000962	AGC	2	6	68361	68366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607205
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1597	NC_000962	CTG	2	6	68485	68490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1598	NC_000962	GCC	3	9	68509	68517	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1599	NC_000962	GCC	2	6	68532	68537	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1600	NC_000962	TCG	2	6	68585	68590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1601	NC_000962	AGG	2	6	68609	68614	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1602	NC_000962	CTG	2	6	68671	68676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607206
1603	NC_000962	GGCA	2	8	68682	68689	25 %	0 %	50 %	25 %	15607206
1604	NC_000962	TGC	2	6	68705	68710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607206
1605	NC_000962	CTG	2	6	68794	68799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607206
1606	NC_000962	TGG	2	6	68834	68839	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15607206
1607	NC_000962	TGCT	2	8	68849	68856	0 %	50 %	25 %	25 %	15607206
1608	NC_000962	CTG	2	6	68863	68868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607206
1609	NC_000962	TCGC	2	8	68874	68881	0 %	25 %	25 %	50 %	15607206
1610	NC_000962	CGA	2	6	68898	68903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607206
1611	NC_000962	GCCG	2	8	68948	68955	0 %	0 %	50 %	50 %	15607206
1612	NC_000962	GGTGT	2	10	68989	68998	0 %	40 %	60 %	0 %	15607206
1613	NC_000962	TTCG	2	8	69012	69019	0 %	50 %	25 %	25 %	15607206
1614	NC_000962	GTT	2	6	69036	69041	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15607206
1615	NC_000962	CGGT	2	8	69124	69131	0 %	25 %	50 %	25 %	15607206
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1617	NC_000962	CTG	2	6	69283	69288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607206
1618	NC_000962	TGT	2	6	69323	69328	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15607206
1619	NC_000962	TGG	2	6	69407	69412	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15607206
1620	NC_000962	TG	3	6	69425	69430	0 %	50 %	50 %	0 %	15607206
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1622	NC_000962	CTG	2	6	69493	69498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607206
1623	NC_000962	GCT	2	6	69534	69539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607206
1624	NC_000962	CGC	2	6	69567	69572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15607206
1625	NC_000962	AT	3	6	69588	69593	50 %	50 %	0 %	0 %	15607206
1626	NC_000962	ATCGG	2	10	69626	69635	20 %	20 %	40 %	20 %	15607206
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1885	NC_000962	GC	3	6	80958	80963	0 %	0 %	50 %	50 %	15607214
1886	NC_000962	GGTC	2	8	80999	81006	0 %	25 %	50 %	25 %	15607214
1887	NC_000962	GC	4	8	81078	81085	0 %	0 %	50 %	50 %	15607214
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1889	NC_000962	TCG	2	6	81357	81362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607214
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1979	NC_000962	GTGG	2	8	84964	84971	0 %	25 %	75 %	0 %	15607217
1980	NC_000962	CGG	2	6	85002	85007	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15607217
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1984	NC_000962	CAT	2	6	85156	85161	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15607217
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1987	NC_000962	CAGA	2	8	85267	85274	50 %	0 %	25 %	25 %	15607218
1988	NC_000962	TTC	2	6	85375	85380	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15607218
1989	NC_000962	CGG	3	9	85383	85391	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15607218
1990	NC_000962	CGG	2	6	85423	85428	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15607218
1991	NC_000962	CG	3	6	85445	85450	0 %	0 %	50 %	50 %	15607218
1992	NC_000962	GCC	2	6	85464	85469	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15607218
1993	NC_000962	CTTC	2	8	85522	85529	0 %	50 %	0 %	50 %	15607218
1994	NC_000962	C	6	6	85536	85541	0 %	0 %	0 %	100 %	15607218
1995	NC_000962	GTC	2	6	85556	85561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607218
1996	NC_000962	CTT	2	6	85611	85616	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1997	NC_000962	CCA	2	6	85689	85694	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15607219
1998	NC_000962	GC	3	6	85733	85738	0 %	0 %	50 %	50 %	15607219
1999	NC_000962	GAA	2	6	85777	85782	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15607219
2000	NC_000962	CCG	2	6	85791	85796	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15607219

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