MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium tuberculosis H37Rv complete genome

Total Repeats: 109734

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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16502	NC_000962	CGGG	2	8	670395	670402	0 %	0 %	75 %	25 %	15607716
16503	NC_000962	CGG	2	6	670435	670440	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15607716
16504	NC_000962	ACG	2	6	670461	670466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607716
16505	NC_000962	GCA	2	6	670477	670482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607716
16506	NC_000962	GCC	2	6	670484	670489	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15607716
16507	NC_000962	GTC	2	6	670529	670534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607716
16508	NC_000962	CGA	2	6	670561	670566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607716
16509	NC_000962	CGA	2	6	670591	670596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607716
16510	NC_000962	TTC	2	6	670626	670631	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15607716
16511	NC_000962	CTGAC	2	10	670659	670668	20 %	20 %	20 %	40 %	15607716
16512	NC_000962	TGC	2	6	670719	670724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607716
16513	NC_000962	ATC	2	6	670736	670741	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15607716
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16515	NC_000962	GC	3	6	670755	670760	0 %	0 %	50 %	50 %	15607716
16516	NC_000962	GGC	3	9	670836	670844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15607716
16517	NC_000962	GTAC	2	8	670993	671000	25 %	25 %	25 %	25 %	15607716
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16519	NC_000962	CGC	2	6	671053	671058	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15607716
16520	NC_000962	CGG	3	9	671061	671069	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15607716
16521	NC_000962	GCC	2	6	671115	671120	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15607716
16522	NC_000962	GAT	2	6	671159	671164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16523	NC_000962	AGGCA	2	10	671187	671196	40 %	0 %	40 %	20 %	15607717
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16545	NC_000962	GCCG	2	8	671972	671979	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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16740	NC_000962	CCGG	2	8	676429	676436	0 %	0 %	50 %	50 %	15607719
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16867	NC_000962	ATG	2	6	680471	680476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15607724
16868	NC_000962	CGC	2	6	680623	680628	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15607724
16869	NC_000962	CGG	2	6	680658	680663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15607724
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16875	NC_000962	TGG	2	6	680945	680950	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15607724
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16886	NC_000962	CGG	2	6	681546	681551	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15607724
16887	NC_000962	CAT	2	6	681574	681579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15607724
16888	NC_000962	GACCGT	2	12	681604	681615	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	15607724
16889	NC_000962	GAT	2	6	681628	681633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15607724
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16894	NC_000962	GTCG	2	8	681736	681743	0 %	25 %	50 %	25 %	15607724
16895	NC_000962	CAC	2	6	681793	681798	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15607724
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16898	NC_000962	TGC	2	6	681990	681995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607725
16899	NC_000962	GGC	2	6	682008	682013	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15607725
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16902	NC_000962	CGAGG	2	10	682071	682080	20 %	0 %	60 %	20 %	15607725
16903	NC_000962	GCC	2	6	682083	682088	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15607725
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16910	NC_000962	CAG	2	6	682425	682430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607725
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16915	NC_000962	GCA	2	6	682564	682569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607725
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16923	NC_000962	CGG	2	6	683000	683005	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15607725
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16927	NC_000962	CGT	2	6	683307	683312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607725
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16949	NC_000962	GCGG	2	8	684131	684138	0 %	0 %	75 %	25 %	15607725
16950	NC_000962	CGC	2	6	684177	684182	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15607725
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16952	NC_000962	GCA	2	6	684227	684232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607725
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16954	NC_000962	TTCA	2	8	684392	684399	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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16958	NC_000962	CGTG	2	8	684628	684635	0 %	25 %	50 %	25 %	15607726
16959	NC_000962	CGG	2	6	684641	684646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15607726
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16961	NC_000962	CGT	2	6	684706	684711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607726
16962	NC_000962	GCA	2	6	684714	684719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607726
16963	NC_000962	GAACG	2	10	684770	684779	40 %	0 %	40 %	20 %	15607726
16964	NC_000962	TGC	2	6	684798	684803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607726
16965	NC_000962	TGCG	2	8	684813	684820	0 %	25 %	50 %	25 %	15607726
16966	NC_000962	TGC	2	6	684934	684939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607726
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16970	NC_000962	GAA	2	6	685051	685056	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15607726
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16972	NC_000962	ACC	2	6	685132	685137	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15607726
16973	NC_000962	ATC	2	6	685147	685152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15607727
16974	NC_000962	CCG	2	6	685178	685183	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15607727
16975	NC_000962	CGG	2	6	685194	685199	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15607727
16976	NC_000962	ACTG	2	8	685218	685225	25 %	25 %	25 %	25 %	15607727
16977	NC_000962	CGG	2	6	685240	685245	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15607727
16978	NC_000962	TGC	2	6	685301	685306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607727
16979	NC_000962	ATC	2	6	685342	685347	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15607727
16980	NC_000962	CTG	2	6	685363	685368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607727
16981	NC_000962	GCC	2	6	685381	685386	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15607727
16982	NC_000962	CCGGCG	2	12	685394	685405	0 %	0 %	50 %	50 %	15607727
16983	NC_000962	ACC	2	6	685441	685446	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15607727
16984	NC_000962	CGATG	2	10	685521	685530	20 %	20 %	40 %	20 %	15607727
16985	NC_000962	TGG	2	6	685562	685567	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15607727
16986	NC_000962	TCG	2	6	685592	685597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607727
16987	NC_000962	TGGT	2	8	685634	685641	0 %	50 %	50 %	0 %	15607727
16988	NC_000962	CGGC	2	8	685676	685683	0 %	0 %	50 %	50 %	15607727
16989	NC_000962	ATC	2	6	685729	685734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15607727
16990	NC_000962	GGT	2	6	685737	685742	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15607727
16991	NC_000962	GGC	2	6	685807	685812	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15607727
16992	NC_000962	CCG	2	6	685829	685834	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15607727
16993	NC_000962	CGGGA	2	10	685911	685920	20 %	0 %	60 %	20 %	15607727
16994	NC_000962	TGG	2	6	685929	685934	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15607728
16995	NC_000962	GCC	2	6	685988	685993	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15607728
16996	NC_000962	CGG	3	9	686008	686016	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15607728
16997	NC_000962	CGT	2	6	686071	686076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607728
16998	NC_000962	CGT	2	6	686161	686166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607728
16999	NC_000962	CGG	2	6	686167	686172	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15607728
17000	NC_000962	ATC	2	6	686183	686188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15607728

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