MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium tuberculosis H37Rv complete genome

Total Repeats: 109734

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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16002	NC_000962	GTG	2	6	649910	649915	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	57116754
16003	NC_000962	TG	3	6	649914	649919	0 %	50 %	50 %	0 %	57116754
16004	NC_000962	TCGG	2	8	649932	649939	0 %	25 %	50 %	25 %	57116754
16005	NC_000962	GCG	2	6	649947	649952	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	57116754
16006	NC_000962	GC	3	6	649959	649964	0 %	0 %	50 %	50 %	57116754
16007	NC_000962	GAC	2	6	650010	650015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	57116754
16008	NC_000962	GCG	2	6	650070	650075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	57116754
16009	NC_000962	CGGG	2	8	650104	650111	0 %	0 %	75 %	25 %	57116754
16010	NC_000962	CTA	2	6	650115	650120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	57116754
16011	NC_000962	CCA	2	6	650140	650145	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	57116754
16012	NC_000962	GTT	2	6	650150	650155	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	57116754
16013	NC_000962	GCGG	2	8	650204	650211	0 %	0 %	75 %	25 %	57116754
16014	NC_000962	GGT	2	6	650305	650310	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	57116754
16015	NC_000962	CGG	2	6	650336	650341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	57116754
16016	NC_000962	CAAA	2	8	650375	650382	75 %	0 %	0 %	25 %	57116754
16017	NC_000962	AGT	2	6	650451	650456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15607699
16018	NC_000962	GATC	2	8	650457	650464	25 %	25 %	25 %	25 %	15607699
16019	NC_000962	GCG	2	6	650465	650470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15607699
16020	NC_000962	CG	3	6	650505	650510	0 %	0 %	50 %	50 %	15607699
16021	NC_000962	GTTGC	2	10	650515	650524	0 %	40 %	40 %	20 %	15607699
16022	NC_000962	CAAGC	2	10	650592	650601	40 %	0 %	20 %	40 %	15607699
16023	NC_000962	GTT	2	6	650644	650649	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15607699
16024	NC_000962	CGT	2	6	650658	650663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607699
16025	NC_000962	GTC	2	6	650665	650670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607699
16026	NC_000962	CGA	2	6	650715	650720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607699
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16028	NC_000962	CGT	2	6	650761	650766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16029	NC_000962	AGC	2	6	650798	650803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607700
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16031	NC_000962	CG	3	6	650897	650902	0 %	0 %	50 %	50 %	15607700
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16034	NC_000962	CG	3	6	650941	650946	0 %	0 %	50 %	50 %	15607700
16035	NC_000962	CGC	2	6	650989	650994	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15607700
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16039	NC_000962	CGA	2	6	651105	651110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607700
16040	NC_000962	GCT	2	6	651191	651196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607700
16041	NC_000962	CGG	3	9	651216	651224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15607700
16042	NC_000962	GTG	2	6	651245	651250	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15607700
16043	NC_000962	CGC	2	6	651312	651317	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15607700
16044	NC_000962	GGC	2	6	651340	651345	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15607700
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16047	NC_000962	AT	3	6	651482	651487	50 %	50 %	0 %	0 %	15607700
16048	NC_000962	GCCG	2	8	651521	651528	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16049	NC_000962	CGG	2	6	651538	651543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15607701
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16051	NC_000962	CGA	2	6	651552	651557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607701
16052	NC_000962	GTC	3	9	651607	651615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607701
16053	NC_000962	TCA	2	6	651651	651656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15607701
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16056	NC_000962	CAG	2	6	651766	651771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607701
16057	NC_000962	CAG	2	6	651805	651810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607701
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16088	NC_000962	CTAC	2	8	653148	653155	25 %	25 %	0 %	50 %	15607702
16089	NC_000962	TGG	2	6	653174	653179	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15607702
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16094	NC_000962	TGGG	2	8	653348	653355	0 %	25 %	75 %	0 %	15607702
16095	NC_000962	CGA	2	6	653373	653378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607702
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16102	NC_000962	GC	3	6	653568	653573	0 %	0 %	50 %	50 %	15607702
16103	NC_000962	CTG	2	6	653575	653580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607702
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16108	NC_000962	AGG	2	6	653863	653868	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16109	NC_000962	TGA	2	6	653877	653882	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15607703
16110	NC_000962	CTG	2	6	653918	653923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607703
16111	NC_000962	GTT	2	6	653962	653967	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15607703
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16113	NC_000962	ACGTCT	2	12	654015	654026	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	15607703
16114	NC_000962	ATGC	2	8	654059	654066	25 %	25 %	25 %	25 %	15607703
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16117	NC_000962	CGTGC	2	10	654266	654275	0 %	20 %	40 %	40 %	15607703
16118	NC_000962	TG	3	6	654323	654328	0 %	50 %	50 %	0 %	15607703
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16122	NC_000962	TGGCGT	2	12	654540	654551	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	15607703
16123	NC_000962	CGG	2	6	654571	654576	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15607703
16124	NC_000962	GGC	2	6	654583	654588	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15607703
16125	NC_000962	GCC	2	6	654595	654600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15607703
16126	NC_000962	GCCA	2	8	654614	654621	25 %	0 %	25 %	50 %	15607703
16127	NC_000962	TGA	2	6	654630	654635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15607703
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16129	NC_000962	CGGAT	2	10	654662	654671	20 %	20 %	40 %	20 %	15607703
16130	NC_000962	CACC	2	8	654686	654693	25 %	0 %	0 %	75 %	15607703
16131	NC_000962	GC	3	6	654728	654733	0 %	0 %	50 %	50 %	15607703
16132	NC_000962	TGA	2	6	654767	654772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16133	NC_000962	GAG	2	6	654789	654794	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16134	NC_000962	TGGC	2	8	654811	654818	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
16135	NC_000962	GCG	2	6	654829	654834	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16136	NC_000962	TGA	2	6	655007	655012	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15607704
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16139	NC_000962	TCG	2	6	655126	655131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607704
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16142	NC_000962	GC	3	6	655283	655288	0 %	0 %	50 %	50 %	15607704
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16158	NC_000962	GGT	2	6	655887	655892	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15607704
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16160	NC_000962	TTG	2	6	655936	655941	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15607704
16161	NC_000962	CGA	2	6	655991	655996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16162	NC_000962	CCT	2	6	656033	656038	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15607705
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16168	NC_000962	AGT	2	6	656242	656247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15607705
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16189	NC_000962	GAC	2	6	657432	657437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607705
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16191	NC_000962	CGC	2	6	657540	657545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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16239	NC_000962	CAA	2	6	659421	659426	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16240	NC_000962	TCG	2	6	659462	659467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607708
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16242	NC_000962	T	6	6	659539	659544	0 %	100 %	0 %	0 %	15607708
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16244	NC_000962	CTG	2	6	659720	659725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607708
16245	NC_000962	CGA	3	9	659731	659739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607708
16246	NC_000962	CGC	2	6	659769	659774	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15607708
16247	NC_000962	CG	3	6	659794	659799	0 %	0 %	50 %	50 %	15607708
16248	NC_000962	GGCCG	2	10	659803	659812	0 %	0 %	60 %	40 %	15607708
16249	NC_000962	GCC	3	9	659825	659833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15607708
16250	NC_000962	TCCGG	2	10	659935	659944	0 %	20 %	40 %	40 %	15607708
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16253	NC_000962	CTG	2	6	660023	660028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607708
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16272	NC_000962	CGG	3	9	660592	660600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15607708
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16279	NC_000962	CCG	2	6	660950	660955	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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16294	NC_000962	CG	3	6	661357	661362	0 %	0 %	50 %	50 %	15607710
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16336	NC_000962	CGGC	2	8	663472	663479	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16337	NC_000962	TGGGCC	2	12	663496	663507	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	15607711
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16354	NC_000962	ATCG	2	8	664156	664163	25 %	25 %	25 %	25 %	15607711
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16489	NC_000962	CCGC	2	8	670002	670009	0 %	0 %	25 %	75 %	15607716
16490	NC_000962	TAC	2	6	670028	670033	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15607716
16491	NC_000962	TGC	2	6	670053	670058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607716
16492	NC_000962	CGA	2	6	670090	670095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607716
16493	NC_000962	GCC	2	6	670118	670123	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15607716
16494	NC_000962	CCG	2	6	670130	670135	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15607716
16495	NC_000962	GTC	2	6	670172	670177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607716
16496	NC_000962	TCA	2	6	670209	670214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15607716
16497	NC_000962	CGC	2	6	670249	670254	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15607716
16498	NC_000962	CGGC	2	8	670314	670321	0 %	0 %	50 %	50 %	15607716
16499	NC_000962	GGT	2	6	670351	670356	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15607716
16500	NC_000962	GGA	2	6	670372	670377	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15607716

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