MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium tuberculosis H37Rv complete genome

Total Repeats: 109734

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_000962	CGGG	2	8	43206	43213	0 %	0 %	75 %	25 %	57116684
1002	NC_000962	GGC	2	6	43247	43252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	57116684
1003	NC_000962	GCA	2	6	43257	43262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	57116684
1004	NC_000962	CGG	2	6	43284	43289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	57116684
1005	NC_000962	CAC	2	6	43297	43302	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	57116684
1006	NC_000962	GCC	2	6	43324	43329	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	57116684
1007	NC_000962	GC	3	6	43348	43353	0 %	0 %	50 %	50 %	57116684
1008	NC_000962	CGT	2	6	43403	43408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1009	NC_000962	GTG	2	6	43480	43485	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_000962	GGC	2	6	43589	43594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15607183
1011	NC_000962	CGA	2	6	43606	43611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607183
1012	NC_000962	CCG	2	6	43644	43649	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15607183
1013	NC_000962	GAC	2	6	43763	43768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607183
1014	NC_000962	CGAC	2	8	43845	43852	25 %	0 %	25 %	50 %	15607183
1015	NC_000962	TGG	2	6	43875	43880	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15607183
1016	NC_000962	TGC	2	6	43890	43895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607183
1017	NC_000962	CCG	2	6	43926	43931	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15607183
1018	NC_000962	CGT	2	6	43984	43989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607183
1019	NC_000962	CGC	2	6	43997	44002	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15607183
1020	NC_000962	CGA	2	6	44036	44041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607183
1021	NC_000962	ACC	2	6	44051	44056	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15607183
1022	NC_000962	CAA	2	6	44128	44133	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15607183
1023	NC_000962	GC	3	6	44135	44140	0 %	0 %	50 %	50 %	15607183
1024	NC_000962	GGC	2	6	44192	44197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15607183
1025	NC_000962	GAGC	2	8	44225	44232	25 %	0 %	50 %	25 %	15607183
1026	NC_000962	CGA	2	6	44242	44247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607183
1027	NC_000962	CCG	2	6	44328	44333	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15607183
1028	NC_000962	GAT	2	6	44389	44394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15607183
1029	NC_000962	GCT	2	6	44419	44424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607183
1030	NC_000962	CGA	2	6	44425	44430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607183
1031	NC_000962	CAC	2	6	44566	44571	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15607183
1032	NC_000962	CGA	2	6	44632	44637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607183
1033	NC_000962	CGC	2	6	44644	44649	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15607183
1034	NC_000962	CGG	3	9	44686	44694	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15607183
1035	NC_000962	CGC	2	6	44713	44718	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15607183
1036	NC_000962	CGC	2	6	44734	44739	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15607183
1037	NC_000962	TCT	2	6	44784	44789	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15607183
1038	NC_000962	GGTAC	2	10	44862	44871	20 %	20 %	40 %	20 %	15607183
1039	NC_000962	GGGACT	2	12	44907	44918	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	15607183
1040	NC_000962	CGG	2	6	44959	44964	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15607183
1041	NC_000962	CAG	2	6	45039	45044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607183
1042	NC_000962	TCG	2	6	45057	45062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607183
1043	NC_000962	TCGAA	2	10	45094	45103	40 %	20 %	20 %	20 %	15607183
1044	NC_000962	CGA	2	6	45196	45201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607183
1045	NC_000962	ACT	2	6	45237	45242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15607183
1046	NC_000962	CGA	2	6	45262	45267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607183
1047	NC_000962	GGGC	2	8	45384	45391	0 %	0 %	75 %	25 %	15607183
1048	NC_000962	CGGC	2	8	45479	45486	0 %	0 %	50 %	50 %	15607183
1049	NC_000962	GAC	2	6	45500	45505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607183
1050	NC_000962	CGG	2	6	45529	45534	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15607183
1051	NC_000962	CTG	2	6	45557	45562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607183
1052	NC_000962	GCTTAC	2	12	45656	45667	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	15607183
1053	NC_000962	GC	3	6	45674	45679	0 %	0 %	50 %	50 %	15607183
1054	NC_000962	GAA	2	6	45793	45798	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15607183
1055	NC_000962	TGT	2	6	45907	45912	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15607183
1056	NC_000962	GTC	2	6	45950	45955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607183
1057	NC_000962	GCACC	2	10	46024	46033	20 %	0 %	20 %	60 %	15607183
1058	NC_000962	TCG	2	6	46035	46040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607183
1059	NC_000962	AGA	2	6	46048	46053	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15607183
1060	NC_000962	ACC	2	6	46107	46112	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15607183
1061	NC_000962	AAG	2	6	46118	46123	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15607183
1062	NC_000962	GCC	2	6	46145	46150	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15607183
1063	NC_000962	GAG	2	6	46199	46204	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15607183
1064	NC_000962	ACC	2	6	46226	46231	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15607183
1065	NC_000962	GCC	2	6	46265	46270	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15607183
1066	NC_000962	TCG	2	6	46275	46280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607183
1067	NC_000962	GTG	3	9	46331	46339	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15607183
1068	NC_000962	GCC	2	6	46340	46345	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15607183
1069	NC_000962	CGA	2	6	46351	46356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607183
1070	NC_000962	GCC	2	6	46370	46375	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15607183
1071	NC_000962	CGA	2	6	46384	46389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607183
1072	NC_000962	GCCG	2	8	46442	46449	0 %	0 %	50 %	50 %	15607183
1073	NC_000962	CGG	2	6	46479	46484	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1074	NC_000962	CGC	2	6	46534	46539	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1075	NC_000962	CGG	2	6	46546	46551	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1076	NC_000962	TTGC	2	8	46606	46613	0 %	50 %	25 %	25 %	15607184
1077	NC_000962	AGC	2	6	46705	46710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607184
1078	NC_000962	CG	3	6	46722	46727	0 %	0 %	50 %	50 %	15607184
1079	NC_000962	CCGC	2	8	46754	46761	0 %	0 %	25 %	75 %	15607184
1080	NC_000962	GCG	2	6	46766	46771	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15607184
1081	NC_000962	CCGC	2	8	46787	46794	0 %	0 %	25 %	75 %	15607184
1082	NC_000962	TCT	2	6	46832	46837	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15607184
1083	NC_000962	GCC	2	6	46841	46846	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15607184
1084	NC_000962	GGT	3	9	46857	46865	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15607184
1085	NC_000962	GGTC	2	8	46895	46902	0 %	25 %	50 %	25 %	15607184
1086	NC_000962	GCA	2	6	46997	47002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607184
1087	NC_000962	CGGTG	2	10	47058	47067	0 %	20 %	60 %	20 %	15607184
1088	NC_000962	ACA	2	6	47197	47202	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15607184
1089	NC_000962	TCATG	2	10	47204	47213	20 %	40 %	20 %	20 %	15607184
1090	NC_000962	CTAC	2	8	47219	47226	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1091	NC_000962	GCT	2	6	47336	47341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1092	NC_000962	ATCGG	2	10	47351	47360	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1093	NC_000962	GAG	2	6	47379	47384	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15607185
1094	NC_000962	CGGG	2	8	47446	47453	0 %	0 %	75 %	25 %	15607185
1095	NC_000962	CGG	3	9	47463	47471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15607185
1096	NC_000962	GCAG	2	8	47519	47526	25 %	0 %	50 %	25 %	15607185
1097	NC_000962	GCG	2	6	47559	47564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15607185
1098	NC_000962	CGT	2	6	47590	47595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607185
1099	NC_000962	TGG	2	6	47656	47661	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15607185
1100	NC_000962	TCG	2	6	47685	47690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607185
1101	NC_000962	GGC	2	6	47804	47809	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15607185
1102	NC_000962	TGG	2	6	47866	47871	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15607185
1103	NC_000962	CGC	2	6	47896	47901	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15607185
1104	NC_000962	CGT	2	6	47926	47931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607185
1105	NC_000962	T	6	6	48090	48095	0 %	100 %	0 %	0 %	15607185
1106	NC_000962	CGC	2	6	48358	48363	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15607186
1107	NC_000962	CGG	2	6	48373	48378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15607186
1108	NC_000962	GTGC	2	8	48419	48426	0 %	25 %	50 %	25 %	15607186
1109	NC_000962	CGG	2	6	48460	48465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15607186
1110	NC_000962	CCG	4	12	48522	48533	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15607186
1111	NC_000962	CGG	3	9	48557	48565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15607186
1112	NC_000962	GCAGC	2	10	48598	48607	20 %	0 %	40 %	40 %	15607186
1113	NC_000962	GTC	2	6	48614	48619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607186
1114	NC_000962	GGC	2	6	48622	48627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15607186
1115	NC_000962	TCG	2	6	48657	48662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607186
1116	NC_000962	CCCGA	2	10	48681	48690	20 %	0 %	20 %	60 %	15607186
1117	NC_000962	GCCG	2	8	48703	48710	0 %	0 %	50 %	50 %	15607186
1118	NC_000962	AGC	2	6	48747	48752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607186
1119	NC_000962	AAG	2	6	48879	48884	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15607186
1120	NC_000962	CGG	2	6	48927	48932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15607186
1121	NC_000962	G	6	6	48958	48963	0 %	0 %	100 %	0 %	15607186
1122	NC_000962	TGC	2	6	48966	48971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607186
1123	NC_000962	GT	3	6	49048	49053	0 %	50 %	50 %	0 %	15607187
1124	NC_000962	GC	3	6	49083	49088	0 %	0 %	50 %	50 %	15607187
1125	NC_000962	CGA	2	6	49123	49128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607187
1126	NC_000962	CGG	2	6	49168	49173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15607187
1127	NC_000962	CGA	2	6	49196	49201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607187
1128	NC_000962	GCC	2	6	49202	49207	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15607187
1129	NC_000962	CGT	2	6	49243	49248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607187
1130	NC_000962	CGG	2	6	49320	49325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15607187
1131	NC_000962	CGC	2	6	49339	49344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15607187
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1133	NC_000962	CGG	2	6	49459	49464	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15607187
1134	NC_000962	CGA	2	6	49504	49509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607187
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1140	NC_000962	CAGCG	2	10	49806	49815	20 %	0 %	40 %	40 %	15607187
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1143	NC_000962	GTG	2	6	50000	50005	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1144	NC_000962	GAT	2	6	50027	50032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15607188
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1251	NC_000962	CAT	2	6	54121	54126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	57116685
1252	NC_000962	CGG	2	6	54156	54161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	57116685
1253	NC_000962	AGC	2	6	54192	54197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	57116685
1254	NC_000962	GTT	2	6	54217	54222	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	57116685
1255	NC_000962	CGG	2	6	54236	54241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	57116685
1256	NC_000962	CGG	2	6	54258	54263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	57116685
1257	NC_000962	TGG	2	6	54312	54317	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	57116685
1258	NC_000962	CT	3	6	54327	54332	0 %	50 %	0 %	50 %	57116685
1259	NC_000962	GCG	2	6	54347	54352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	57116685
1260	NC_000962	GCC	2	6	54373	54378	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	57116685
1261	NC_000962	CGA	2	6	54469	54474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	57116685
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1264	NC_000962	GCG	2	6	54536	54541	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	57116685
1265	NC_000962	GCC	2	6	54590	54595	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	57116685
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1267	NC_000962	TAC	2	6	54635	54640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	57116685
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1269	NC_000962	TGG	2	6	54717	54722	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	57116685
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1272	NC_000962	GCTCAA	2	12	54883	54894	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	57116685
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1284	NC_000962	ACCG	2	8	55504	55511	25 %	0 %	25 %	50 %	57116685
1285	NC_000962	GGT	2	6	55517	55522	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	57116685
1286	NC_000962	GCC	7	21	55534	55554	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	57116685
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1289	NC_000962	CCCG	2	8	55666	55673	0 %	0 %	25 %	75 %	57116685
1290	NC_000962	CGC	3	9	55686	55694	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	57116685
1291	NC_000962	GC	3	6	55703	55708	0 %	0 %	50 %	50 %	15607193
1292	NC_000962	AGC	2	6	55717	55722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607193
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1306	NC_000962	TGG	2	6	56369	56374	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15607193
1307	NC_000962	CGA	2	6	56438	56443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607193
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1310	NC_000962	TGT	2	6	56528	56533	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15607193
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1312	NC_000962	GCT	2	6	56550	56555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607193
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1330	NC_000962	TGG	2	6	57140	57145	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15607193
1331	NC_000962	CGG	2	6	57186	57191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15607193
1332	NC_000962	CGA	2	6	57222	57227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607193
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1334	NC_000962	CGT	2	6	57281	57286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607193
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1337	NC_000962	TGC	2	6	57399	57404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1361	NC_000962	CGACC	2	10	58221	58230	20 %	0 %	20 %	60 %	15607195
1362	NC_000962	CGA	2	6	58233	58238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607195
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1367	NC_000962	GAA	3	9	58536	58544	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1368	NC_000962	GCC	2	6	58553	58558	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1369	NC_000962	AGG	2	6	58575	58580	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1370	NC_000962	ACC	2	6	58598	58603	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15607196
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1372	NC_000962	TCC	2	6	58746	58751	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15607196
1373	NC_000962	GGC	2	6	58771	58776	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15607196
1374	NC_000962	G	6	6	58803	58808	0 %	0 %	100 %	0 %	15607196
1375	NC_000962	GCGG	2	8	58824	58831	0 %	0 %	75 %	25 %	15607196
1376	NC_000962	AGC	2	6	58836	58841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607196
1377	NC_000962	TCGAGG	2	12	58881	58892	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	15607196
1378	NC_000962	CTTCG	2	10	58908	58917	0 %	40 %	20 %	40 %	15607196
1379	NC_000962	CAA	2	6	58936	58941	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15607196
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1381	NC_000962	CCGGCG	2	12	58979	58990	0 %	0 %	50 %	50 %	15607196
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