MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium tuberculosis H37Rv complete genome

Total Repeats: 109734

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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13502	NC_000962	TGG	2	6	554173	554178	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15607604
13503	NC_000962	GCG	2	6	554185	554190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15607604
13504	NC_000962	CGG	2	6	554191	554196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15607604
13505	NC_000962	TCC	2	6	554261	554266	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15607604
13506	NC_000962	GTG	2	6	554268	554273	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15607604
13507	NC_000962	CGG	2	6	554328	554333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15607605
13508	NC_000962	GCG	2	6	554356	554361	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15607605
13509	NC_000962	CGT	2	6	554366	554371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607605
13510	NC_000962	AGC	2	6	554488	554493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607605
13511	NC_000962	GGCG	2	8	554501	554508	0 %	0 %	75 %	25 %	15607605
13512	NC_000962	GC	3	6	554595	554600	0 %	0 %	50 %	50 %	15607605
13513	NC_000962	GAT	2	6	554609	554614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15607605
13514	NC_000962	GCC	2	6	554687	554692	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15607605
13515	NC_000962	AGT	2	6	554698	554703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15607605
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13517	NC_000962	CCA	2	6	554807	554812	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15607605
13518	NC_000962	CG	3	6	554857	554862	0 %	0 %	50 %	50 %	15607605
13519	NC_000962	GTT	2	6	554887	554892	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15607606
13520	NC_000962	TGC	2	6	554914	554919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607606
13521	NC_000962	TCG	2	6	554925	554930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607606
13522	NC_000962	GCCC	2	8	554940	554947	0 %	0 %	25 %	75 %	15607606
13523	NC_000962	CAGCC	2	10	555090	555099	20 %	0 %	20 %	60 %	15607606
13524	NC_000962	GGC	2	6	555134	555139	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15607606
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13526	NC_000962	GCC	2	6	555260	555265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15607606
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13543	NC_000962	GTC	2	6	556100	556105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607606
13544	NC_000962	GCA	3	9	556153	556161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607606
13545	NC_000962	CGT	2	6	556183	556188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607606
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13547	NC_000962	GAG	2	6	556435	556440	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13548	NC_000962	A	6	6	556470	556475	100 %	0 %	0 %	0 %	15607607
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13550	NC_000962	CG	3	6	556548	556553	0 %	0 %	50 %	50 %	15607607
13551	NC_000962	CGGCTG	2	12	556557	556568	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	15607607
13552	NC_000962	GAG	2	6	556629	556634	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15607607
13553	NC_000962	ACCC	2	8	556635	556642	25 %	0 %	0 %	75 %	15607607
13554	NC_000962	TGG	2	6	556666	556671	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15607607
13555	NC_000962	TGC	2	6	556702	556707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607607
13556	NC_000962	GGT	2	6	556741	556746	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15607607
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13565	NC_000962	TGTC	2	8	557528	557535	0 %	50 %	25 %	25 %	57116734
13566	NC_000962	CAG	2	6	557566	557571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	57116734
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13568	NC_000962	CGT	2	6	557628	557633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	57116734
13569	NC_000962	GAG	2	6	557656	557661	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	57116734
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13573	NC_000962	CAG	2	6	557761	557766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	57116734
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13579	NC_000962	CTGG	2	8	557961	557968	0 %	25 %	50 %	25 %	57116734
13580	NC_000962	GGC	2	6	558001	558006	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	57116734
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13587	NC_000962	GCTCG	2	10	558160	558169	0 %	20 %	40 %	40 %	57116734
13588	NC_000962	GGT	2	6	558195	558200	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	57116734
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13590	NC_000962	CGA	2	6	558249	558254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	57116734
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13592	NC_000962	TGGA	2	8	558373	558380	25 %	25 %	50 %	0 %	57116734
13593	NC_000962	GCC	2	6	558403	558408	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	57116734
13594	NC_000962	CGA	2	6	558498	558503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	57116734
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13601	NC_000962	TCG	2	6	558763	558768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	57116734
13602	NC_000962	ACC	2	6	558769	558774	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	57116734
13603	NC_000962	GCG	2	6	558844	558849	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13604	NC_000962	GAG	2	6	558884	558889	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13605	NC_000962	GCGAT	2	10	558899	558908	20 %	20 %	40 %	20 %	15607609
13606	NC_000962	GCCG	2	8	558999	559006	0 %	0 %	50 %	50 %	15607609
13607	NC_000962	CGAGCG	2	12	559080	559091	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	15607609
13608	NC_000962	CAC	2	6	559119	559124	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15607609
13609	NC_000962	GTC	2	6	559219	559224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607609
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13611	NC_000962	CCA	2	6	559289	559294	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15607609
13612	NC_000962	AGC	2	6	559295	559300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607609
13613	NC_000962	TTC	2	6	559324	559329	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15607609
13614	NC_000962	TGC	2	6	559343	559348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607609
13615	NC_000962	CGA	2	6	559380	559385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607609
13616	NC_000962	GCC	3	9	559387	559395	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15607609
13617	NC_000962	GC	3	6	559396	559401	0 %	0 %	50 %	50 %	15607609
13618	NC_000962	GGA	2	6	559404	559409	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15607609
13619	NC_000962	GTT	2	6	559558	559563	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15607609
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13621	NC_000962	TGC	2	6	559691	559696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607609
13622	NC_000962	GAAA	2	8	559721	559728	75 %	0 %	25 %	0 %	15607609
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13641	NC_000962	GC	3	6	560833	560838	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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13740	NC_000962	GAC	2	6	564617	564622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	448824745
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13867	NC_000962	CGAT	2	8	570194	570201	25 %	25 %	25 %	25 %	15607622
13868	NC_000962	CCTT	2	8	570226	570233	0 %	50 %	0 %	50 %	15607622
13869	NC_000962	TG	3	6	570286	570291	0 %	50 %	50 %	0 %	15607622
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13871	NC_000962	CGT	2	6	570350	570355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607622
13872	NC_000962	AGT	2	6	570431	570436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15607622
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13899	NC_000962	ATG	2	6	571590	571595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15607623
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13904	NC_000962	GC	3	6	571675	571680	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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13982	NC_000962	GCT	2	6	575021	575026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607626
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13985	NC_000962	GGC	2	6	575108	575113	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15607626
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13987	NC_000962	GGCA	2	8	575189	575196	25 %	0 %	50 %	25 %	15607626
13988	NC_000962	GCG	2	6	575240	575245	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15607626
13989	NC_000962	GC	3	6	575251	575256	0 %	0 %	50 %	50 %	15607626
13990	NC_000962	CG	3	6	575320	575325	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13991	NC_000962	GTCCG	2	10	575397	575406	0 %	20 %	40 %	40 %	15607627
13992	NC_000962	CG	3	6	575427	575432	0 %	0 %	50 %	50 %	15607627
13993	NC_000962	GCA	2	6	575465	575470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607627
13994	NC_000962	GAC	2	6	575471	575476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607627
13995	NC_000962	GCT	2	6	575491	575496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607627
13996	NC_000962	CGG	2	6	575542	575547	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15607627
13997	NC_000962	TGC	2	6	575562	575567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607627
13998	NC_000962	GGT	2	6	575644	575649	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15607627
13999	NC_000962	GTG	2	6	575681	575686	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15607627
14000	NC_000962	CCCA	2	8	575723	575730	25 %	0 %	0 %	75 %	15607627

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