MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium tuberculosis H37Rv complete genome

Total Repeats: 109734

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_000962	GCT	2	6	534370	534375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607586
13002	NC_000962	CGGTC	2	10	534385	534394	0 %	20 %	40 %	40 %	15607586
13003	NC_000962	TCA	2	6	534442	534447	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15607587
13004	NC_000962	TC	3	6	534532	534537	0 %	50 %	0 %	50 %	15607587
13005	NC_000962	CCA	2	6	534561	534566	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15607587
13006	NC_000962	AGGT	2	8	534569	534576	25 %	25 %	50 %	0 %	15607587
13007	NC_000962	CAG	2	6	534580	534585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607587
13008	NC_000962	GCG	2	6	534606	534611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15607587
13009	NC_000962	CCA	2	6	534643	534648	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15607587
13010	NC_000962	AGT	2	6	534666	534671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15607587
13011	NC_000962	ATG	2	6	534707	534712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15607587
13012	NC_000962	AAC	2	6	534878	534883	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15607587
13013	NC_000962	AGG	2	6	534887	534892	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15607587
13014	NC_000962	GCA	2	6	534942	534947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607587
13015	NC_000962	TCC	2	6	534965	534970	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15607587
13016	NC_000962	TAG	2	6	535036	535041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15607587
13017	NC_000962	CGG	2	6	535080	535085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15607587
13018	NC_000962	CGACGG	2	12	535086	535097	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	15607587
13019	NC_000962	CGA	2	6	535098	535103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607587
13020	NC_000962	CGA	2	6	535125	535130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607587
13021	NC_000962	GCG	2	6	535147	535152	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15607587
13022	NC_000962	CAC	2	6	535177	535182	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15607587
13023	NC_000962	ACG	2	6	535214	535219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607587
13024	NC_000962	G	6	6	535228	535233	0 %	0 %	100 %	0 %	15607588
13025	NC_000962	TCG	2	6	535333	535338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607588
13026	NC_000962	CGC	2	6	535363	535368	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15607588
13027	NC_000962	CGA	2	6	535433	535438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607588
13028	NC_000962	GT	3	6	535450	535455	0 %	50 %	50 %	0 %	15607588
13029	NC_000962	GAT	2	6	535470	535475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15607588
13030	NC_000962	GGT	2	6	535556	535561	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15607588
13031	NC_000962	GCG	2	6	535621	535626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15607588
13032	NC_000962	ATC	2	6	535663	535668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15607588
13033	NC_000962	ACT	2	6	535678	535683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15607588
13034	NC_000962	GCCG	2	8	535746	535753	0 %	0 %	50 %	50 %	15607588
13035	NC_000962	AGCC	2	8	535770	535777	25 %	0 %	25 %	50 %	15607588
13036	NC_000962	TGC	2	6	535780	535785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607588
13037	NC_000962	C	6	6	535817	535822	0 %	0 %	0 %	100 %	15607588
13038	NC_000962	CG	3	6	535830	535835	0 %	0 %	50 %	50 %	15607588
13039	NC_000962	CTG	2	6	535884	535889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607588
13040	NC_000962	AGC	2	6	535906	535911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607588
13041	NC_000962	GCG	2	6	535923	535928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15607588
13042	NC_000962	CAG	2	6	535971	535976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607588
13043	NC_000962	TCG	2	6	536011	536016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607588
13044	NC_000962	AGCG	2	8	536140	536147	25 %	0 %	50 %	25 %	15607588
13045	NC_000962	CGA	2	6	536205	536210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607588
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13047	NC_000962	GC	3	6	536308	536313	0 %	0 %	50 %	50 %	15607588
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13050	NC_000962	AGC	2	6	536386	536391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607588
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13052	NC_000962	CG	3	6	536429	536434	0 %	0 %	50 %	50 %	15607588
13053	NC_000962	TGC	2	6	536472	536477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607588
13054	NC_000962	CTGG	2	8	536487	536494	0 %	25 %	50 %	25 %	15607588
13055	NC_000962	CAC	2	6	536513	536518	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15607589
13056	NC_000962	GC	3	6	536561	536566	0 %	0 %	50 %	50 %	15607589
13057	NC_000962	CCA	3	9	536569	536577	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15607589
13058	NC_000962	CAT	2	6	536603	536608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15607589
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13060	NC_000962	CGG	2	6	536679	536684	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15607589
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13062	NC_000962	GTA	2	6	536744	536749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15607589
13063	NC_000962	TGA	2	6	536760	536765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15607589
13064	NC_000962	CAC	2	6	536795	536800	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15607589
13065	NC_000962	CGGC	2	8	536809	536816	0 %	0 %	50 %	50 %	15607589
13066	NC_000962	CCG	2	6	536838	536843	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15607589
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13071	NC_000962	GTC	2	6	537062	537067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607589
13072	NC_000962	CCA	2	6	537095	537100	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15607589
13073	NC_000962	GTG	2	6	537161	537166	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15607589
13074	NC_000962	GTG	2	6	537195	537200	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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13102	NC_000962	GTC	2	6	538243	538248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607590
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13105	NC_000962	CGA	2	6	538365	538370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607590
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13108	NC_000962	GGC	2	6	538483	538488	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15607590
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13110	NC_000962	TCG	2	6	538528	538533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607590
13111	NC_000962	TGC	2	6	538541	538546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607590
13112	NC_000962	CGGC	2	8	538564	538571	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13113	NC_000962	GACG	2	8	538574	538581	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
13114	NC_000962	GCT	2	6	538603	538608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607591
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13116	NC_000962	CGGG	2	8	538661	538668	0 %	0 %	75 %	25 %	15607591
13117	NC_000962	CCA	2	6	538690	538695	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15607591
13118	NC_000962	AGT	2	6	538709	538714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15607591
13119	NC_000962	GCG	2	6	538715	538720	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15607591
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13121	NC_000962	TGG	2	6	538779	538784	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15607591
13122	NC_000962	GCC	2	6	538879	538884	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15607591
13123	NC_000962	GAT	2	6	538894	538899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15607591
13124	NC_000962	TGC	2	6	539033	539038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607591
13125	NC_000962	AGC	2	6	539042	539047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607591
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13127	NC_000962	TGA	2	6	539124	539129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15607591
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13135	NC_000962	GC	3	6	539396	539401	0 %	0 %	50 %	50 %	15607591
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13148	NC_000962	GGTA	2	8	540242	540249	25 %	25 %	50 %	0 %	15607591
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13153	NC_000962	GCC	2	6	540366	540371	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15607591
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13182	NC_000962	CCG	2	6	541622	541627	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15607592
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13185	NC_000962	ACG	2	6	541802	541807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607592
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13190	NC_000962	AGCCT	2	10	542011	542020	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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13195	NC_000962	CGCTGG	2	12	542242	542253	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	15607593
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13211	NC_000962	CTT	2	6	542921	542926	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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13214	NC_000962	GC	4	8	543088	543095	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13215	NC_000962	TG	3	6	543124	543129	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13216	NC_000962	ATGG	2	8	543191	543198	25 %	25 %	50 %	0 %	57116732
13217	NC_000962	CCG	2	6	543204	543209	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	57116732
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13222	NC_000962	GTC	2	6	543278	543283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	57116732
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13225	NC_000962	TGC	2	6	543380	543385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	57116732
13226	NC_000962	TGCC	2	8	543390	543397	0 %	25 %	25 %	50 %	57116732
13227	NC_000962	CGG	2	6	543439	543444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	57116732
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13230	NC_000962	TGG	2	6	543487	543492	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	57116732
13231	NC_000962	GGC	2	6	543515	543520	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	57116732
13232	NC_000962	TGG	2	6	543544	543549	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	57116732
13233	NC_000962	TTC	2	6	543558	543563	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	57116732
13234	NC_000962	GGC	2	6	543623	543628	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	57116732
13235	NC_000962	CAC	2	6	543629	543634	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	57116732
13236	NC_000962	CGG	2	6	543664	543669	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	57116732
13237	NC_000962	CCG	2	6	543696	543701	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	57116732
13238	NC_000962	AAT	2	6	543744	543749	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	57116732
13239	NC_000962	GAC	2	6	543771	543776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	57116732
13240	NC_000962	ATC	2	6	543798	543803	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	57116732
13241	NC_000962	CGG	2	6	543806	543811	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	57116732
13242	NC_000962	TGG	2	6	543891	543896	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	57116732
13243	NC_000962	CTT	2	6	543915	543920	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	57116732
13244	NC_000962	GCT	2	6	543944	543949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	57116732
13245	NC_000962	AC	3	6	544011	544016	50 %	0 %	0 %	50 %	57116732
13246	NC_000962	TGC	2	6	544018	544023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	57116732
13247	NC_000962	CTGG	2	8	544034	544041	0 %	25 %	50 %	25 %	57116732
13248	NC_000962	TGG	2	6	544060	544065	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	57116732
13249	NC_000962	C	6	6	544140	544145	0 %	0 %	0 %	100 %	57116732
13250	NC_000962	GCC	2	6	544239	544244	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	57116732
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13253	NC_000962	CGG	2	6	544310	544315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	57116732
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13255	NC_000962	CGC	2	6	544397	544402	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	57116732
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13259	NC_000962	GCG	3	9	544470	544478	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	57116732
13260	NC_000962	CGA	2	6	544496	544501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	57116732
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13262	NC_000962	CCGGC	2	10	544519	544528	0 %	0 %	40 %	60 %	57116732
13263	NC_000962	CCG	2	6	544533	544538	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	57116732
13264	NC_000962	GGGC	2	8	544577	544584	0 %	0 %	75 %	25 %	57116732
13265	NC_000962	GCAA	2	8	544602	544609	50 %	0 %	25 %	25 %	57116732
13266	NC_000962	GCCG	2	8	544625	544632	0 %	0 %	50 %	50 %	57116732
13267	NC_000962	CGA	2	6	544649	544654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	57116732
13268	NC_000962	TGC	2	6	544684	544689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	57116732
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13271	NC_000962	CAC	2	6	544949	544954	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15607595
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13276	NC_000962	AATC	2	8	545257	545264	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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13278	NC_000962	TGG	2	6	545307	545312	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13279	NC_000962	ACA	2	6	545313	545318	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13280	NC_000962	CGA	2	6	545440	545445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607596
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13296	NC_000962	TGA	2	6	545909	545914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15607597
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13324	NC_000962	TCG	2	6	547063	547068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13353	NC_000962	GCCA	2	8	548193	548200	25 %	0 %	25 %	50 %	15607598
13354	NC_000962	CAA	2	6	548264	548269	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15607598
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13360	NC_000962	TGG	2	6	548515	548520	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15607598
13361	NC_000962	CGG	2	6	548521	548526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15607598
13362	NC_000962	TCG	2	6	548655	548660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607598
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13486	NC_000962	CG	4	8	553650	553657	0 %	0 %	50 %	50 %	15607603
13487	NC_000962	AGC	2	6	553698	553703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607603
13488	NC_000962	ACG	2	6	553722	553727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607603
13489	NC_000962	TGG	3	9	553728	553736	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15607603
13490	NC_000962	TGG	2	6	553803	553808	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15607603
13491	NC_000962	TGGG	2	8	553833	553840	0 %	25 %	75 %	0 %	15607603
13492	NC_000962	ACG	2	6	553854	553859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607603
13493	NC_000962	GCT	2	6	553867	553872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607603
13494	NC_000962	CACC	2	8	553936	553943	25 %	0 %	0 %	75 %	15607603
13495	NC_000962	GC	3	6	554024	554029	0 %	0 %	50 %	50 %	15607604
13496	NC_000962	C	6	6	554041	554046	0 %	0 %	0 %	100 %	15607604
13497	NC_000962	ATC	2	6	554049	554054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15607604
13498	NC_000962	GGT	2	6	554067	554072	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15607604
13499	NC_000962	CTGG	2	8	554093	554100	0 %	25 %	50 %	25 %	15607604
13500	NC_000962	GAC	2	6	554126	554131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607604

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