MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium tuberculosis H37Rv complete genome

Total Repeats: 109734

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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12006	NC_000962	CGA	2	6	492073	492078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607549
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12121	NC_000962	CGA	2	6	497499	497504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607552
12122	NC_000962	GTC	2	6	497548	497553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607552
12123	NC_000962	GCT	2	6	497577	497582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607552
12124	NC_000962	CCA	2	6	497589	497594	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15607552
12125	NC_000962	CAC	2	6	497611	497616	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15607552
12126	NC_000962	CA	3	6	497680	497685	50 %	0 %	0 %	50 %	15607552
12127	NC_000962	GTTG	2	8	497748	497755	0 %	50 %	50 %	0 %	15607552
12128	NC_000962	GAC	2	6	497821	497826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607552
12129	NC_000962	TGC	2	6	497994	497999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607552
12130	NC_000962	CGA	2	6	498012	498017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607552
12131	NC_000962	CG	5	10	498027	498036	0 %	0 %	50 %	50 %	15607552
12132	NC_000962	TCGGCC	2	12	498056	498067	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	15607552
12133	NC_000962	TGG	2	6	498069	498074	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15607552
12134	NC_000962	CGG	2	6	498124	498129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15607552
12135	NC_000962	GCAGCG	2	12	498174	498185	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	15607552
12136	NC_000962	GCG	2	6	498252	498257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15607552
12137	NC_000962	GCC	2	6	498269	498274	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15607552
12138	NC_000962	AGG	2	6	498281	498286	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15607552
12139	NC_000962	TCA	2	6	498297	498302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15607552
12140	NC_000962	GGC	2	6	498348	498353	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15607553
12141	NC_000962	CAC	2	6	498366	498371	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15607553
12142	NC_000962	GCC	2	6	498372	498377	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15607553
12143	NC_000962	GC	3	6	498383	498388	0 %	0 %	50 %	50 %	15607553
12144	NC_000962	TCG	2	6	498466	498471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607553
12145	NC_000962	GCC	2	6	498581	498586	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15607553
12146	NC_000962	GGC	2	6	498638	498643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15607553
12147	NC_000962	TCG	2	6	498715	498720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607553
12148	NC_000962	TCG	2	6	498745	498750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607553
12149	NC_000962	CCCA	2	8	498859	498866	25 %	0 %	0 %	75 %	15607553
12150	NC_000962	CAC	2	6	498867	498872	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15607553
12151	NC_000962	GC	3	6	498890	498895	0 %	0 %	50 %	50 %	15607553
12152	NC_000962	GCCA	2	8	498937	498944	25 %	0 %	25 %	50 %	15607553
12153	NC_000962	GGT	2	6	498972	498977	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15607553
12154	NC_000962	ACC	2	6	498982	498987	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15607553
12155	NC_000962	GGT	2	6	499020	499025	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15607553
12156	NC_000962	TCG	2	6	499082	499087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607553
12157	NC_000962	GAC	2	6	499120	499125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607553
12158	NC_000962	GCCC	2	8	499137	499144	0 %	0 %	25 %	75 %	15607553
12159	NC_000962	GTT	2	6	499146	499151	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15607553
12160	NC_000962	TCG	2	6	499228	499233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607553
12161	NC_000962	CGC	2	6	499304	499309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15607553
12162	NC_000962	CGGCT	2	10	499311	499320	0 %	20 %	40 %	40 %	15607553
12163	NC_000962	GGC	2	6	499338	499343	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15607553
12164	NC_000962	GTG	2	6	499366	499371	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15607553
12165	NC_000962	CTG	2	6	499431	499436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607553
12166	NC_000962	TGG	3	9	499448	499456	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15607553
12167	NC_000962	GCC	2	6	499486	499491	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15607553
12168	NC_000962	GTC	2	6	499525	499530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607553
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12170	NC_000962	CGG	2	6	499562	499567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15607553
12171	NC_000962	GTG	2	6	499770	499775	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15607554
12172	NC_000962	GCG	2	6	499783	499788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15607554
12173	NC_000962	TGC	3	9	499861	499869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607554
12174	NC_000962	CG	3	6	499875	499880	0 %	0 %	50 %	50 %	15607554
12175	NC_000962	GGC	2	6	499896	499901	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15607554
12176	NC_000962	CGAG	2	8	499969	499976	25 %	0 %	50 %	25 %	15607554
12177	NC_000962	CCG	2	6	499990	499995	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15607554
12178	NC_000962	GGT	2	6	500018	500023	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15607554
12179	NC_000962	CCG	2	6	500026	500031	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15607554
12180	NC_000962	CGA	2	6	500045	500050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607554
12181	NC_000962	ACC	2	6	500067	500072	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15607554
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12183	NC_000962	CGA	2	6	500240	500245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607554
12184	NC_000962	CGG	2	6	500247	500252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15607554
12185	NC_000962	CGC	2	6	500332	500337	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15607554
12186	NC_000962	GCT	2	6	500357	500362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607554
12187	NC_000962	GCT	2	6	500379	500384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607555
12188	NC_000962	GCC	2	6	500387	500392	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15607555
12189	NC_000962	GTC	2	6	500401	500406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607555
12190	NC_000962	CAC	3	9	500425	500433	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15607555
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12192	NC_000962	GCC	2	6	500485	500490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15607555
12193	NC_000962	GTC	2	6	500509	500514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607555
12194	NC_000962	GCC	2	6	500515	500520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15607555
12195	NC_000962	CGG	2	6	500526	500531	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15607555
12196	NC_000962	CGG	3	9	500622	500630	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15607555
12197	NC_000962	GCA	2	6	500633	500638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607555
12198	NC_000962	GTGG	2	8	500653	500660	0 %	25 %	75 %	0 %	15607555
12199	NC_000962	GCA	2	6	500733	500738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607555
12200	NC_000962	GCCG	2	8	500746	500753	0 %	0 %	50 %	50 %	15607555
12201	NC_000962	CG	3	6	500752	500757	0 %	0 %	50 %	50 %	15607555
12202	NC_000962	GGC	2	6	500830	500835	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15607555
12203	NC_000962	GAT	2	6	500902	500907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15607555
12204	NC_000962	CCG	2	6	500915	500920	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15607555
12205	NC_000962	GGC	2	6	500926	500931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15607555
12206	NC_000962	CGC	2	6	500952	500957	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15607555
12207	NC_000962	GC	3	6	501031	501036	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12208	NC_000962	GC	3	6	501089	501094	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12209	NC_000962	AC	3	6	501162	501167	50 %	0 %	0 %	50 %	15607556
12210	NC_000962	GCTG	2	8	501174	501181	0 %	25 %	50 %	25 %	15607556
12211	NC_000962	CGG	3	9	501186	501194	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15607556
12212	NC_000962	GCC	2	6	501223	501228	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15607556
12213	NC_000962	CGA	2	6	501261	501266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607556
12214	NC_000962	G	6	6	501269	501274	0 %	0 %	100 %	0 %	15607556
12215	NC_000962	CGG	2	6	501288	501293	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15607556
12216	NC_000962	CA	3	6	501305	501310	50 %	0 %	0 %	50 %	15607556
12217	NC_000962	GTT	2	6	501336	501341	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15607556
12218	NC_000962	TGG	3	9	501431	501439	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15607556
12219	NC_000962	GCGA	2	8	501635	501642	25 %	0 %	50 %	25 %	15607556
12220	NC_000962	AGC	2	6	501670	501675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607556
12221	NC_000962	GGT	2	6	501699	501704	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15607556
12222	NC_000962	TGC	2	6	501773	501778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607556
12223	NC_000962	AG	3	6	501815	501820	50 %	0 %	50 %	0 %	15607556
12224	NC_000962	GAC	2	6	501842	501847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607556
12225	NC_000962	GTC	2	6	501880	501885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607556
12226	NC_000962	GGT	2	6	501924	501929	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15607556
12227	NC_000962	TGC	2	6	501968	501973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607556
12228	NC_000962	GCC	2	6	502159	502164	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15607556
12229	NC_000962	TCG	2	6	502171	502176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607557
12230	NC_000962	AGGTCG	2	12	502192	502203	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	15607557
12231	NC_000962	ACC	2	6	502212	502217	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15607557
12232	NC_000962	CGC	2	6	502220	502225	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15607557
12233	NC_000962	GCT	2	6	502226	502231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607557
12234	NC_000962	CCA	2	6	502306	502311	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15607557
12235	NC_000962	GGT	2	6	502346	502351	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15607557
12236	NC_000962	CGG	2	6	502354	502359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15607557
12237	NC_000962	TCA	2	6	502415	502420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15607558
12238	NC_000962	ACC	2	6	502489	502494	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15607558
12239	NC_000962	CGA	2	6	502674	502679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607558
12240	NC_000962	TGG	2	6	502730	502735	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15607558
12241	NC_000962	ACG	2	6	502736	502741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607558
12242	NC_000962	CGA	2	6	502767	502772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607558
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12362	NC_000962	CG	3	6	507815	507820	0 %	0 %	50 %	50 %	15607563
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12364	NC_000962	CAC	2	6	507916	507921	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15607563
12365	NC_000962	AGC	2	6	507967	507972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607563
12366	NC_000962	CGA	2	6	508007	508012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607563
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12370	NC_000962	CAG	2	6	508145	508150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607563
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12380	NC_000962	CGG	2	6	508650	508655	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15607564
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12407	NC_000962	TCG	2	6	509888	509893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607564
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12412	NC_000962	AGCGC	2	10	510334	510343	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
12413	NC_000962	ACGG	2	8	510357	510364	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
12414	NC_000962	TCGCC	2	10	510391	510400	0 %	20 %	20 %	60 %	15607565
12415	NC_000962	TGG	2	6	510423	510428	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15607565
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12420	NC_000962	GTG	2	6	510693	510698	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12421	NC_000962	CGA	2	6	510720	510725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607566
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12479	NC_000962	TCG	2	6	512911	512916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607566
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12482	NC_000962	ACC	2	6	512959	512964	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15607566
12483	NC_000962	GAT	2	6	512982	512987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15607566
12484	NC_000962	CTC	2	6	513003	513008	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15607566
12485	NC_000962	GTC	2	6	513036	513041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607566
12486	NC_000962	CTG	2	6	513075	513080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607566
12487	NC_000962	CAA	2	6	513084	513089	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15607566
12488	NC_000962	GCTG	2	8	513119	513126	0 %	25 %	50 %	25 %	15607566
12489	NC_000962	ACCGA	2	10	513154	513163	40 %	0 %	20 %	40 %	15607566
12490	NC_000962	CG	3	6	513249	513254	0 %	0 %	50 %	50 %	15607566
12491	NC_000962	CGC	2	6	513308	513313	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15607566
12492	NC_000962	CGAC	2	8	513422	513429	25 %	0 %	25 %	50 %	15607566
12493	NC_000962	CGA	2	6	513476	513481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607566
12494	NC_000962	CAG	2	6	513492	513497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607566
12495	NC_000962	GCC	2	6	513517	513522	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15607566
12496	NC_000962	GGT	2	6	513528	513533	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15607566
12497	NC_000962	CCGGG	2	10	513536	513545	0 %	0 %	60 %	40 %	15607566
12498	NC_000962	GCA	2	6	513566	513571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607566
12499	NC_000962	CAC	2	6	513596	513601	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15607566
12500	NC_000962	GCC	2	6	513637	513642	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15607566

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