MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium tuberculosis H37Rv complete genome

Total Repeats: 109734

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_000962	GAT	2	6	449752	449757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15607514
11002	NC_000962	ATC	2	6	449782	449787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15607514
11003	NC_000962	CAC	2	6	449812	449817	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15607514
11004	NC_000962	CA	3	6	449842	449847	50 %	0 %	0 %	50 %	15607514
11005	NC_000962	GCCC	2	8	449907	449914	0 %	0 %	25 %	75 %	15607514
11006	NC_000962	GC	4	8	449946	449953	0 %	0 %	50 %	50 %	15607514
11007	NC_000962	GAT	2	6	450061	450066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15607514
11008	NC_000962	CAC	2	6	450108	450113	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15607514
11009	NC_000962	CAC	2	6	450181	450186	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15607514
11010	NC_000962	GTC	2	6	450193	450198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607514
11011	NC_000962	CTC	2	6	450214	450219	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15607514
11012	NC_000962	CGA	2	6	450222	450227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607514
11013	NC_000962	CGT	2	6	450238	450243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607514
11014	NC_000962	TGGCCC	2	12	450248	450259	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	15607514
11015	NC_000962	GCA	2	6	450279	450284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607514
11016	NC_000962	ATGTCC	2	12	450344	450355	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	15607514
11017	NC_000962	CGC	2	6	450414	450419	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15607514
11018	NC_000962	GC	3	6	450418	450423	0 %	0 %	50 %	50 %	15607514
11019	NC_000962	CGC	2	6	450425	450430	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15607514
11020	NC_000962	CCA	2	6	450615	450620	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15607514
11021	NC_000962	CGA	2	6	450627	450632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607514
11022	NC_000962	GAAC	2	8	450655	450662	50 %	0 %	25 %	25 %	15607514
11023	NC_000962	CCG	2	6	450677	450682	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15607514
11024	NC_000962	TTG	2	6	450689	450694	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15607514
11025	NC_000962	GGC	2	6	450721	450726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15607514
11026	NC_000962	GAA	2	6	450757	450762	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15607514
11027	NC_000962	GGC	2	6	450859	450864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15607514
11028	NC_000962	ATG	2	6	450878	450883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15607514
11029	NC_000962	TCC	2	6	450926	450931	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15607514
11030	NC_000962	CAG	3	9	450952	450960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607514
11031	NC_000962	TTG	2	6	451004	451009	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15607514
11032	NC_000962	GCC	3	9	451015	451023	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15607514
11033	NC_000962	CCA	2	6	451068	451073	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15607514
11034	NC_000962	GCG	2	6	451098	451103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15607514
11035	NC_000962	CTGG	2	8	451105	451112	0 %	25 %	50 %	25 %	15607514
11036	NC_000962	CTG	2	6	451210	451215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607514
11037	NC_000962	ACG	2	6	451220	451225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607514
11038	NC_000962	CGC	3	9	451252	451260	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15607514
11039	NC_000962	ACG	2	6	451358	451363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607514
11040	NC_000962	GTCGAC	2	12	451381	451392	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	15607514
11041	NC_000962	GCAT	2	8	451399	451406	25 %	25 %	25 %	25 %	15607514
11042	NC_000962	CGT	2	6	451494	451499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607514
11043	NC_000962	GGC	2	6	451531	451536	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15607514
11044	NC_000962	CAC	2	6	451552	451557	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15607514
11045	NC_000962	CGT	2	6	451668	451673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607514
11046	NC_000962	CAT	2	6	451720	451725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15607514
11047	NC_000962	GCT	2	6	451743	451748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607514
11048	NC_000962	GCC	2	6	451831	451836	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15607515
11049	NC_000962	GTG	2	6	451858	451863	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15607515
11050	NC_000962	TCG	2	6	451915	451920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607515
11051	NC_000962	CAG	2	6	451938	451943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607515
11052	NC_000962	GC	4	8	451945	451952	0 %	0 %	50 %	50 %	15607515
11053	NC_000962	CCA	2	6	452132	452137	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15607515
11054	NC_000962	CAG	2	6	452214	452219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607515
11055	NC_000962	CGG	2	6	452237	452242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15607515
11056	NC_000962	TGGT	2	8	452279	452286	0 %	50 %	50 %	0 %	15607515
11057	NC_000962	GCC	2	6	452307	452312	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15607516
11058	NC_000962	GC	3	6	452314	452319	0 %	0 %	50 %	50 %	15607516
11059	NC_000962	CGG	3	9	452332	452340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15607516
11060	NC_000962	GCGCG	2	10	452428	452437	0 %	0 %	60 %	40 %	15607516
11061	NC_000962	ACCC	2	8	452537	452544	25 %	0 %	0 %	75 %	15607516
11062	NC_000962	GCG	2	6	452547	452552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15607516
11063	NC_000962	CCG	2	6	452615	452620	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15607516
11064	NC_000962	GTC	2	6	452726	452731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607516
11065	NC_000962	ACC	2	6	452862	452867	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15607516
11066	NC_000962	CCG	2	6	452911	452916	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15607516
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11068	NC_000962	TTG	2	6	452982	452987	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15607516
11069	NC_000962	CCG	2	6	452991	452996	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15607516
11070	NC_000962	ACG	2	6	453000	453005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607516
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11074	NC_000962	ACC	2	6	453102	453107	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15607516
11075	NC_000962	CTCC	2	8	453112	453119	0 %	25 %	0 %	75 %	15607516
11076	NC_000962	CAA	2	6	453131	453136	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15607516
11077	NC_000962	TGG	2	6	453157	453162	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11078	NC_000962	GCC	2	6	453211	453216	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11079	NC_000962	CAT	2	6	453274	453279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15607517
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11081	NC_000962	GAT	2	6	453338	453343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15607517
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11083	NC_000962	ATCC	2	8	453458	453465	25 %	25 %	0 %	50 %	15607517
11084	NC_000962	GTC	2	6	453467	453472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607517
11085	NC_000962	TCG	2	6	453588	453593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607517
11086	NC_000962	ACC	2	6	453596	453601	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15607517
11087	NC_000962	CGA	3	9	453640	453648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607517
11088	NC_000962	GC	3	6	453668	453673	0 %	0 %	50 %	50 %	15607517
11089	NC_000962	TGGCG	2	10	453674	453683	0 %	20 %	60 %	20 %	15607517
11090	NC_000962	CG	3	6	453689	453694	0 %	0 %	50 %	50 %	15607517
11091	NC_000962	GAAC	2	8	453725	453732	50 %	0 %	25 %	25 %	15607517
11092	NC_000962	GCG	3	9	453747	453755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15607517
11093	NC_000962	GCGCG	2	10	453788	453797	0 %	0 %	60 %	40 %	15607517
11094	NC_000962	CGC	2	6	453831	453836	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15607517
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11098	NC_000962	GC	3	6	454039	454044	0 %	0 %	50 %	50 %	15607517
11099	NC_000962	GTC	2	6	454049	454054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607517
11100	NC_000962	CGA	2	6	454099	454104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607517
11101	NC_000962	GAT	2	6	454112	454117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15607517
11102	NC_000962	GCC	2	6	454118	454123	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15607517
11103	NC_000962	TCG	2	6	454152	454157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607517
11104	NC_000962	CGG	2	6	454204	454209	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15607517
11105	NC_000962	GCC	2	6	454238	454243	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15607517
11106	NC_000962	ACC	2	6	454278	454283	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15607517
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11108	NC_000962	CGG	2	6	454354	454359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15607517
11109	NC_000962	CACG	2	8	454390	454397	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
11110	NC_000962	CGG	2	6	454449	454454	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15607518
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11113	NC_000962	CGG	2	6	454597	454602	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15607518
11114	NC_000962	CG	3	6	454619	454624	0 %	0 %	50 %	50 %	15607518
11115	NC_000962	CAA	3	9	454643	454651	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15607518
11116	NC_000962	GCC	2	6	454673	454678	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15607518
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11119	NC_000962	CGC	2	6	454729	454734	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15607518
11120	NC_000962	TCTCG	2	10	454755	454764	0 %	40 %	20 %	40 %	15607518
11121	NC_000962	CGA	2	6	454768	454773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607518
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11124	NC_000962	CGGCC	2	10	454852	454861	0 %	0 %	40 %	60 %	15607518
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11207	NC_000962	GCG	2	6	458420	458425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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11231	NC_000962	CTG	2	6	459221	459226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607524
11232	NC_000962	TCGA	2	8	459238	459245	25 %	25 %	25 %	25 %	15607524
11233	NC_000962	CGA	2	6	459273	459278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607524
11234	NC_000962	GGC	2	6	459336	459341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11235	NC_000962	CGT	2	6	459512	459517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607525
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11237	NC_000962	CTG	2	6	459564	459569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607525
11238	NC_000962	CTGCAG	2	12	459651	459662	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	15607525
11239	NC_000962	CCG	2	6	459663	459668	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15607525
11240	NC_000962	CGA	2	6	459707	459712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607525
11241	NC_000962	CGT	2	6	459755	459760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607525
11242	NC_000962	TGA	2	6	459770	459775	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15607525
11243	NC_000962	GC	3	6	459793	459798	0 %	0 %	50 %	50 %	15607525
11244	NC_000962	TCG	2	6	459910	459915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607525
11245	NC_000962	GCA	3	9	459923	459931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607525
11246	NC_000962	TCG	2	6	459964	459969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607525
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11249	NC_000962	CGGG	2	8	460043	460050	0 %	0 %	75 %	25 %	15607525
11250	NC_000962	TCG	3	9	460120	460128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607525
11251	NC_000962	CCCGG	2	10	460227	460236	0 %	0 %	40 %	60 %	15607525
11252	NC_000962	CCGCA	2	10	460242	460251	20 %	0 %	20 %	60 %	15607525
11253	NC_000962	GCA	2	6	460316	460321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607525
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11255	NC_000962	CCGG	2	8	460351	460358	0 %	0 %	50 %	50 %	15607525
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11261	NC_000962	CTT	2	6	460464	460469	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15607525
11262	NC_000962	CGG	2	6	460502	460507	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15607525
11263	NC_000962	GCT	2	6	460565	460570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607525
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11265	NC_000962	GTG	2	6	460621	460626	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15607525
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11270	NC_000962	TCG	2	6	460813	460818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607525
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11274	NC_000962	TCC	2	6	460966	460971	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15607525
11275	NC_000962	GCG	2	6	461017	461022	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15607525
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11277	NC_000962	GGCGCC	2	12	461139	461150	0 %	0 %	50 %	50 %	15607525
11278	NC_000962	TCG	2	6	461167	461172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607525
11279	NC_000962	TGA	2	6	461180	461185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15607525
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11296	NC_000962	CGT	2	6	461873	461878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607525
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11298	NC_000962	CAG	2	6	461898	461903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607525
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11302	NC_000962	GCC	2	6	461965	461970	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15607525
11303	NC_000962	GTC	2	6	461980	461985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607525
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11305	NC_000962	CCG	3	9	462098	462106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11306	NC_000962	CGC	2	6	462110	462115	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11307	NC_000962	CGA	2	6	462188	462193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607526
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11310	NC_000962	GC	3	6	462335	462340	0 %	0 %	50 %	50 %	15607526
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11314	NC_000962	GGAC	2	8	462481	462488	25 %	0 %	50 %	25 %	15607526
11315	NC_000962	CGA	2	6	462494	462499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607526
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11345	NC_000962	CGA	2	6	463716	463721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607527
11346	NC_000962	CG	3	6	463755	463760	0 %	0 %	50 %	50 %	15607527
11347	NC_000962	ATCG	2	8	463822	463829	25 %	25 %	25 %	25 %	15607527
11348	NC_000962	ACGC	2	8	463864	463871	25 %	0 %	25 %	50 %	15607527
11349	NC_000962	CGC	2	6	463940	463945	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15607527
11350	NC_000962	GCGCG	2	10	464007	464016	0 %	0 %	60 %	40 %	15607527
11351	NC_000962	CCGGCG	2	12	464069	464080	0 %	0 %	50 %	50 %	15607527
11352	NC_000962	GGC	2	6	464100	464105	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15607527
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11354	NC_000962	GGCG	2	8	464199	464206	0 %	0 %	75 %	25 %	15607527
11355	NC_000962	ACG	2	6	464239	464244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607527
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11357	NC_000962	GGCG	2	8	464266	464273	0 %	0 %	75 %	25 %	15607527
11358	NC_000962	TGG	2	6	464282	464287	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15607527
11359	NC_000962	CTG	2	6	464308	464313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607527
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11361	NC_000962	G	6	6	464357	464362	0 %	0 %	100 %	0 %	15607527
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11363	NC_000962	CCGG	2	8	464484	464491	0 %	0 %	50 %	50 %	15607527
11364	NC_000962	CGA	2	6	464505	464510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607527
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11488	NC_000962	CGG	2	6	469131	469136	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15607530
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11491	NC_000962	TGA	2	6	469212	469217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15607530
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