MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium tuberculosis H37Rv complete genome

Total Repeats: 109734

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
105001	NC_000962	GC	3	6	4211774	4211779	0 %	0 %	50 %	50 %	15610901
105002	NC_000962	TGC	2	6	4211810	4211815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105003	NC_000962	GC	3	6	4211871	4211876	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
105004	NC_000962	GC	3	6	4211949	4211954	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
105005	NC_000962	GCT	2	6	4211973	4211978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105006	NC_000962	GCT	2	6	4211988	4211993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105007	NC_000962	GACA	2	8	4212160	4212167	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
105008	NC_000962	GATG	2	8	4212288	4212295	25 %	25 %	50 %	0 %	15610902
105009	NC_000962	TGG	2	6	4212359	4212364	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15610902
105010	NC_000962	GAT	2	6	4212388	4212393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15610902
105011	NC_000962	GCGG	2	8	4212401	4212408	0 %	0 %	75 %	25 %	15610902
105012	NC_000962	CCCG	2	8	4212457	4212464	0 %	0 %	25 %	75 %	15610902
105013	NC_000962	ATC	2	6	4212533	4212538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15610902
105014	NC_000962	CTT	2	6	4212559	4212564	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15610902
105015	NC_000962	CGG	2	6	4212585	4212590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15610902
105016	NC_000962	GCC	2	6	4212758	4212763	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15610902
105017	NC_000962	GCG	2	6	4212768	4212773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15610902
105018	NC_000962	GGA	2	6	4212785	4212790	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15610902
105019	NC_000962	CGA	2	6	4212808	4212813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15610902
105020	NC_000962	ACT	2	6	4212826	4212831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15610902
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105022	NC_000962	ACG	2	6	4212954	4212959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15610902
105023	NC_000962	GGC	2	6	4212961	4212966	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15610902
105024	NC_000962	TGC	2	6	4213064	4213069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15610903
105025	NC_000962	CAG	2	6	4213083	4213088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15610903
105026	NC_000962	GCT	2	6	4213154	4213159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15610903
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105028	NC_000962	CCAA	2	8	4213298	4213305	50 %	0 %	0 %	50 %	15610903
105029	NC_000962	CTG	2	6	4213315	4213320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15610903
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105033	NC_000962	CGAGG	2	10	4213608	4213617	20 %	0 %	60 %	20 %	15610903
105034	NC_000962	ACT	2	6	4213621	4213626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15610903
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105040	NC_000962	GCCG	2	8	4213791	4213798	0 %	0 %	50 %	50 %	15610903
105041	NC_000962	CG	3	6	4213813	4213818	0 %	0 %	50 %	50 %	15610903
105042	NC_000962	CGC	3	9	4213866	4213874	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15610903
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105044	NC_000962	TTC	2	6	4213984	4213989	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105045	NC_000962	GCC	2	6	4213992	4213997	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
105046	NC_000962	CG	3	6	4214006	4214011	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
105047	NC_000962	CGC	2	6	4214080	4214085	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15610904
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105053	NC_000962	CGA	2	6	4214168	4214173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15610904
105054	NC_000962	TCA	2	6	4214182	4214187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15610904
105055	NC_000962	CCGG	2	8	4214190	4214197	0 %	0 %	50 %	50 %	15610904
105056	NC_000962	CG	4	8	4214201	4214208	0 %	0 %	50 %	50 %	15610904
105057	NC_000962	AAGG	2	8	4214211	4214218	50 %	0 %	50 %	0 %	15610904
105058	NC_000962	CGA	2	6	4214246	4214251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15610904
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105062	NC_000962	GGA	2	6	4214576	4214581	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
105063	NC_000962	CTG	2	6	4214587	4214592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105064	NC_000962	GAC	2	6	4214617	4214622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15610905
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105069	NC_000962	GAC	2	6	4214754	4214759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15610905
105070	NC_000962	GAC	2	6	4214770	4214775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15610905
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105082	NC_000962	CAGAC	2	10	4215600	4215609	40 %	0 %	20 %	40 %	15610906
105083	NC_000962	CG	3	6	4215636	4215641	0 %	0 %	50 %	50 %	15610906
105084	NC_000962	GC	3	6	4215663	4215668	0 %	0 %	50 %	50 %	15610906
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105104	NC_000962	CCGGAT	2	12	4216559	4216570	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	15610907
105105	NC_000962	CG	3	6	4216575	4216580	0 %	0 %	50 %	50 %	15610907
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105116	NC_000962	GCC	2	6	4217257	4217262	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15610908
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105118	NC_000962	GACC	2	8	4217520	4217527	25 %	0 %	25 %	50 %	15610908
105119	NC_000962	ACCG	2	8	4217563	4217570	25 %	0 %	25 %	50 %	15610908
105120	NC_000962	CAA	2	6	4217598	4217603	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15610908
105121	NC_000962	CGT	2	6	4217616	4217621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15610908
105122	NC_000962	TCG	2	6	4217645	4217650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15610908
105123	NC_000962	CGA	2	6	4217682	4217687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15610908
105124	NC_000962	CA	3	6	4217747	4217752	50 %	0 %	0 %	50 %	15610908
105125	NC_000962	TGC	2	6	4217765	4217770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15610908
105126	NC_000962	CGC	2	6	4217916	4217921	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15610908
105127	NC_000962	CGA	2	6	4217922	4217927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15610908
105128	NC_000962	GCT	2	6	4217928	4217933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15610908
105129	NC_000962	GC	3	6	4217961	4217966	0 %	0 %	50 %	50 %	15610908
105130	NC_000962	TGC	2	6	4217988	4217993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15610908
105131	NC_000962	GCC	2	6	4218006	4218011	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15610908
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105140	NC_000962	GCC	2	6	4218628	4218633	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15610909
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105145	NC_000962	GCA	2	6	4218732	4218737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15610909
105146	NC_000962	TGC	2	6	4218740	4218745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15610909
105147	NC_000962	TCG	2	6	4218779	4218784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15610909
105148	NC_000962	GGC	2	6	4218818	4218823	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15610909
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105216	NC_000962	CGT	2	6	4221883	4221888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15610912
105217	NC_000962	GCA	2	6	4221899	4221904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15610912
105218	NC_000962	CGG	2	6	4221975	4221980	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15610912
105219	NC_000962	GCC	2	6	4221985	4221990	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15610912
105220	NC_000962	GCG	2	6	4222005	4222010	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15610912
105221	NC_000962	GTG	2	6	4222016	4222021	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15610912
105222	NC_000962	CTG	2	6	4222031	4222036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15610912
105223	NC_000962	GCC	2	6	4222058	4222063	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15610912
105224	NC_000962	CA	3	6	4222208	4222213	50 %	0 %	0 %	50 %	15610912
105225	NC_000962	CCCA	2	8	4222232	4222239	25 %	0 %	0 %	75 %	15610912
105226	NC_000962	ACC	2	6	4222272	4222277	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15610912
105227	NC_000962	CAT	2	6	4222330	4222335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15610912
105228	NC_000962	TCT	2	6	4222386	4222391	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15610912
105229	NC_000962	CAC	3	9	4222405	4222413	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15610912
105230	NC_000962	CGC	2	6	4222414	4222419	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15610912
105231	NC_000962	GCCA	2	8	4222441	4222448	25 %	0 %	25 %	50 %	15610912
105232	NC_000962	CTG	2	6	4222466	4222471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15610912
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105234	NC_000962	AACGCG	2	12	4222521	4222532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15610912
105235	NC_000962	CAA	2	6	4222549	4222554	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15610912
105236	NC_000962	GCG	2	6	4222566	4222571	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15610912
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105239	NC_000962	CAT	2	6	4222699	4222704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15610913
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105461	NC_000962	TCG	2	6	4231651	4231656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15610921
105462	NC_000962	GCA	2	6	4231664	4231669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15610921
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105464	NC_000962	CGC	3	9	4231814	4231822	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15610921
105465	NC_000962	TGC	2	6	4231834	4231839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15610921
105466	NC_000962	CGCGGT	2	12	4231853	4231864	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	15610921
105467	NC_000962	GCAC	2	8	4231878	4231885	25 %	0 %	25 %	50 %	15610921
105468	NC_000962	GCGGT	2	10	4231944	4231953	0 %	20 %	60 %	20 %	15610921
105469	NC_000962	GAC	2	6	4231968	4231973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15610921
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105472	NC_000962	CAG	2	6	4232072	4232077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15610921
105473	NC_000962	CA	3	6	4232113	4232118	50 %	0 %	0 %	50 %	15610921
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105482	NC_000962	GGC	2	6	4232450	4232455	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15610922
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105484	NC_000962	GGC	2	6	4232610	4232615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15610922
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105492	NC_000962	ACA	2	6	4232928	4232933	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15610922
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105494	NC_000962	GCC	2	6	4233121	4233126	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15610922
105495	NC_000962	CGG	2	6	4233174	4233179	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15610922
105496	NC_000962	ATC	2	6	4233214	4233219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15610922
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105498	NC_000962	ACCA	2	8	4233305	4233312	50 %	0 %	0 %	50 %	15610922
105499	NC_000962	CAT	2	6	4233325	4233330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15610922
105500	NC_000962	GGC	2	6	4233342	4233347	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15610922

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