MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium tuberculosis H37Rv complete genome

Total Repeats: 109734

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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10002	NC_000962	CAG	3	9	407126	407134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607480
10003	NC_000962	GC	4	8	407150	407157	0 %	0 %	50 %	50 %	15607480
10004	NC_000962	TCG	2	6	407170	407175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607480
10005	NC_000962	GGC	2	6	407249	407254	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15607480
10006	NC_000962	CAGC	2	8	407285	407292	25 %	0 %	25 %	50 %	15607480
10007	NC_000962	AAC	2	6	407295	407300	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15607480
10008	NC_000962	CGT	2	6	407323	407328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607480
10009	NC_000962	TCG	2	6	407397	407402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607480
10010	NC_000962	CGCGG	2	10	407489	407498	0 %	0 %	60 %	40 %	15607480
10011	NC_000962	TCG	2	6	407571	407576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607480
10012	NC_000962	CCG	2	6	407611	407616	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15607480
10013	NC_000962	GTG	3	9	407666	407674	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15607480
10014	NC_000962	CGA	2	6	407683	407688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607480
10015	NC_000962	CAT	2	6	407701	407706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15607480
10016	NC_000962	GACT	2	8	407708	407715	25 %	25 %	25 %	25 %	15607480
10017	NC_000962	CGC	2	6	407723	407728	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15607480
10018	NC_000962	GT	3	6	407730	407735	0 %	50 %	50 %	0 %	15607480
10019	NC_000962	GAC	2	6	407736	407741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607480
10020	NC_000962	GCA	2	6	407808	407813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607480
10021	NC_000962	CAT	2	6	407849	407854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15607480
10022	NC_000962	TCG	2	6	407877	407882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607480
10023	NC_000962	GGC	2	6	407884	407889	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15607480
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10025	NC_000962	CGAG	2	8	408016	408023	25 %	0 %	50 %	25 %	15607480
10026	NC_000962	GGT	2	6	408073	408078	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15607480
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10030	NC_000962	CGG	2	6	408197	408202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15607480
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10033	NC_000962	GT	3	6	408253	408258	0 %	50 %	50 %	0 %	15607480
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10040	NC_000962	TGC	2	6	408441	408446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607480
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10042	NC_000962	CGG	2	6	408544	408549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10043	NC_000962	AGG	2	6	408622	408627	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10044	NC_000962	CGC	2	6	408699	408704	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15607481
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10051	NC_000962	CTT	2	6	409337	409342	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10052	NC_000962	CGC	2	6	409409	409414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15607482
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10054	NC_000962	CGC	2	6	409474	409479	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15607482
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10114	NC_000962	GACC	2	8	411539	411546	25 %	0 %	25 %	50 %	15607483
10115	NC_000962	CAATGC	2	12	411572	411583	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	15607483
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10118	NC_000962	CG	3	6	411735	411740	0 %	0 %	50 %	50 %	15607483
10119	NC_000962	GTGC	2	8	411750	411757	0 %	25 %	50 %	25 %	15607483
10120	NC_000962	GGT	2	6	411824	411829	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15607483
10121	NC_000962	GCG	2	6	411872	411877	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15607483
10122	NC_000962	CAG	2	6	411891	411896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607483
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10124	NC_000962	GCA	2	6	411920	411925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607483
10125	NC_000962	CTG	2	6	411955	411960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607483
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10185	NC_000962	CAACG	2	10	414286	414295	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
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10233	NC_000962	CGCC	2	8	416576	416583	0 %	0 %	25 %	75 %	57116723
10234	NC_000962	GGT	2	6	416609	416614	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	57116723
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10237	NC_000962	GGAC	2	8	416720	416727	25 %	0 %	50 %	25 %	57116723
10238	NC_000962	GCA	2	6	416731	416736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	57116723
10239	NC_000962	GC	4	8	416749	416756	0 %	0 %	50 %	50 %	57116723
10240	NC_000962	CCG	2	6	416812	416817	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	57116723
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10242	NC_000962	CAC	2	6	416863	416868	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	57116723
10243	NC_000962	CG	3	6	416926	416931	0 %	0 %	50 %	50 %	57116723
10244	NC_000962	TCG	2	6	416940	416945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	57116723
10245	NC_000962	TGG	2	6	416980	416985	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10246	NC_000962	CTT	2	6	416986	416991	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10247	NC_000962	CG	3	6	416996	417001	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10248	NC_000962	ATCG	2	8	417084	417091	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10249	NC_000962	TGT	2	6	417105	417110	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10250	NC_000962	GCCA	2	8	417175	417182	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10251	NC_000962	GTCC	2	8	417201	417208	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10252	NC_000962	ACGG	2	8	417287	417294	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10253	NC_000962	GC	4	8	417311	417318	0 %	0 %	50 %	50 %	15607488
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10272	NC_000962	TGC	2	6	418265	418270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607488
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10350	NC_000962	GGGA	2	8	421828	421835	25 %	0 %	75 %	0 %	15607492
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10365	NC_000962	AAC	2	6	422415	422420	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15607492
10366	NC_000962	GC	3	6	422551	422556	0 %	0 %	50 %	50 %	57116724
10367	NC_000962	GCC	2	6	422590	422595	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	57116724
10368	NC_000962	ACG	2	6	422663	422668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	57116724
10369	NC_000962	CGC	2	6	422674	422679	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	57116724
10370	NC_000962	CGG	3	9	422688	422696	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	57116724
10371	NC_000962	CGG	2	6	422700	422705	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	57116724
10372	NC_000962	CGG	2	6	422739	422744	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	57116724
10373	NC_000962	CGC	2	6	422796	422801	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	57116724
10374	NC_000962	CGG	2	6	422811	422816	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	57116724
10375	NC_000962	ACC	2	6	422818	422823	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	57116724
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10377	NC_000962	GAGACC	2	12	422902	422913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	57116724
10378	NC_000962	GCC	2	6	422932	422937	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	57116724
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10380	NC_000962	ATC	2	6	423124	423129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	57116724
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10382	NC_000962	ACC	2	6	423166	423171	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	57116724
10383	NC_000962	CCCG	2	8	423198	423205	0 %	0 %	25 %	75 %	57116724
10384	NC_000962	GCG	2	6	423260	423265	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	57116724
10385	NC_000962	CGA	2	6	423330	423335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	57116724
10386	NC_000962	TCACCG	2	12	423338	423349	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	57116724
10387	NC_000962	GCG	2	6	423500	423505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	57116724
10388	NC_000962	GCC	2	6	423534	423539	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	57116724
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10392	NC_000962	GCAT	2	8	423706	423713	25 %	25 %	25 %	25 %	15607494
10393	NC_000962	GGCG	2	8	423774	423781	0 %	0 %	75 %	25 %	15607494
10394	NC_000962	TGC	2	6	423808	423813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607494
10395	NC_000962	GCA	2	6	423821	423826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607494
10396	NC_000962	ATT	2	6	423870	423875	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15607494
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10399	NC_000962	GTC	2	6	423996	424001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607494
10400	NC_000962	GAGC	2	8	424018	424025	25 %	0 %	50 %	25 %	15607494
10401	NC_000962	GC	3	6	424024	424029	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10402	NC_000962	GAGC	2	8	424069	424076	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10403	NC_000962	GC	3	6	424075	424080	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10404	NC_000962	GAGC	2	8	424120	424127	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10405	NC_000962	GC	3	6	424126	424131	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10406	NC_000962	GTT	2	6	424159	424164	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10407	NC_000962	CAG	2	6	424288	424293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	57116725
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10412	NC_000962	GAA	2	6	424434	424439	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57116725
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10429	NC_000962	TGCCGA	2	12	425352	425363	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	448824742
10430	NC_000962	GTTTCC	2	12	425365	425376	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	448824742
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10437	NC_000962	CGA	2	6	425893	425898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	448824742
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10444	NC_000962	GACC	2	8	426111	426118	25 %	0 %	25 %	50 %	448824742
10445	NC_000962	GATGGT	2	12	426274	426285	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	448824742
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10484	NC_000962	TGT	2	6	428589	428594	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	448824742
10485	NC_000962	TGC	2	6	428595	428600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	448824742
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