MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium tuberculosis H37Rv complete genome

Total Repeats: 109734

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
103501	NC_000962	GCG	2	6	4150262	4150267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15610843
103502	NC_000962	GTG	2	6	4150282	4150287	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15610843
103503	NC_000962	CGG	2	6	4150399	4150404	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15610843
103504	NC_000962	CCG	2	6	4150415	4150420	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15610843
103505	NC_000962	GCC	2	6	4150426	4150431	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15610843
103506	NC_000962	CGGT	2	8	4150454	4150461	0 %	25 %	50 %	25 %	15610843
103507	NC_000962	CCG	2	6	4150491	4150496	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15610843
103508	NC_000962	ACCC	2	8	4150532	4150539	25 %	0 %	0 %	75 %	15610843
103509	NC_000962	GTA	2	6	4150570	4150575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15610843
103510	NC_000962	GCCG	2	8	4150593	4150600	0 %	0 %	50 %	50 %	15610843
103511	NC_000962	GGC	2	6	4150609	4150614	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15610843
103512	NC_000962	GCC	2	6	4150645	4150650	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15610843
103513	NC_000962	GC	3	6	4150651	4150656	0 %	0 %	50 %	50 %	15610843
103514	NC_000962	TGG	3	9	4150701	4150709	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15610843
103515	NC_000962	GCG	2	6	4150726	4150731	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15610843
103516	NC_000962	CAC	2	6	4150741	4150746	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15610843
103517	NC_000962	CGG	2	6	4150749	4150754	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15610843
103518	NC_000962	GGC	2	6	4150772	4150777	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15610843
103519	NC_000962	CAG	2	6	4150789	4150794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15610843
103520	NC_000962	TCG	2	6	4150841	4150846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15610843
103521	NC_000962	GCA	2	6	4150935	4150940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15610843
103522	NC_000962	GCA	2	6	4151034	4151039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15610843
103523	NC_000962	GCG	2	6	4151055	4151060	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
103524	NC_000962	GCGCCG	2	12	4151076	4151087	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
103525	NC_000962	CGG	2	6	4151188	4151193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15610844
103526	NC_000962	CAG	2	6	4151195	4151200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15610844
103527	NC_000962	GCC	2	6	4151226	4151231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15610844
103528	NC_000962	TCG	2	6	4151322	4151327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15610844
103529	NC_000962	CGG	3	9	4151332	4151340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15610844
103530	NC_000962	GCG	2	6	4151344	4151349	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15610844
103531	NC_000962	AGC	2	6	4151388	4151393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15610844
103532	NC_000962	CG	3	6	4151395	4151400	0 %	0 %	50 %	50 %	15610844
103533	NC_000962	CA	3	6	4151474	4151479	50 %	0 %	0 %	50 %	15610844
103534	NC_000962	GTCT	2	8	4151549	4151556	0 %	50 %	25 %	25 %	15610844
103535	NC_000962	CGT	2	6	4151566	4151571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15610844
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103537	NC_000962	CAC	2	6	4151594	4151599	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15610844
103538	NC_000962	CGG	3	9	4151630	4151638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15610844
103539	NC_000962	GC	3	6	4151647	4151652	0 %	0 %	50 %	50 %	15610844
103540	NC_000962	GCT	2	6	4151668	4151673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15610844
103541	NC_000962	ACG	2	6	4151752	4151757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15610844
103542	NC_000962	ACC	2	6	4151760	4151765	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15610844
103543	NC_000962	TCG	2	6	4151784	4151789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15610844
103544	NC_000962	GCA	2	6	4151791	4151796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15610844
103545	NC_000962	TGG	2	6	4151821	4151826	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15610844
103546	NC_000962	GAT	2	6	4151843	4151848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15610844
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103549	NC_000962	ACGCC	2	10	4151921	4151930	20 %	0 %	20 %	60 %	15610844
103550	NC_000962	GCC	2	6	4151958	4151963	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15610844
103551	NC_000962	CGG	2	6	4152001	4152006	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15610844
103552	NC_000962	AAC	2	6	4152009	4152014	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15610844
103553	NC_000962	GAA	2	6	4152113	4152118	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15610844
103554	NC_000962	TCG	2	6	4152147	4152152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15610844
103555	NC_000962	TGACC	2	10	4152166	4152175	20 %	20 %	20 %	40 %	15610844
103556	NC_000962	CCGTC	2	10	4152221	4152230	0 %	20 %	20 %	60 %	15610845
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103558	NC_000962	CGC	2	6	4152256	4152261	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15610845
103559	NC_000962	CCG	2	6	4152373	4152378	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15610845
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103562	NC_000962	CGG	3	9	4152517	4152525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15610845
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103565	NC_000962	CGTCGG	2	12	4152613	4152624	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	15610845
103566	NC_000962	CGA	2	6	4152673	4152678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15610845
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103569	NC_000962	ACG	2	6	4152787	4152792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15610845
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103583	NC_000962	ATGGCC	2	12	4153230	4153241	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	15610845
103584	NC_000962	CGG	2	6	4153267	4153272	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15610845
103585	NC_000962	AGC	2	6	4153275	4153280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15610845
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103587	NC_000962	CTG	2	6	4153316	4153321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15610845
103588	NC_000962	CAG	2	6	4153331	4153336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15610845
103589	NC_000962	GTC	2	6	4153337	4153342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15610845
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103596	NC_000962	GC	3	6	4153529	4153534	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
103597	NC_000962	CCA	2	6	4153556	4153561	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
103598	NC_000962	CTC	3	9	4153632	4153640	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
103599	NC_000962	CGC	2	6	4153644	4153649	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
103600	NC_000962	CCG	2	6	4153804	4153809	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345462027
103601	NC_000962	TCG	2	6	4153854	4153859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345462027
103602	NC_000962	GAG	2	6	4153890	4153895	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345462027
103603	NC_000962	ATCG	2	8	4153941	4153948	25 %	25 %	25 %	25 %	345462027
103604	NC_000962	GCCCG	2	10	4154011	4154020	0 %	0 %	40 %	60 %	345462027
103605	NC_000962	CTG	2	6	4154040	4154045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345462027
103606	NC_000962	GCCA	2	8	4154088	4154095	25 %	0 %	25 %	50 %	345462027
103607	NC_000962	CGACTT	2	12	4154099	4154110	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	345462027
103608	NC_000962	AG	3	6	4154115	4154120	50 %	0 %	50 %	0 %	345462027
103609	NC_000962	ATC	2	6	4154121	4154126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345462027
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103612	NC_000962	GCC	2	6	4154346	4154351	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345462027
103613	NC_000962	ATC	2	6	4154478	4154483	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345462027
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103731	NC_000962	CAA	2	6	4159260	4159265	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15610850
103732	NC_000962	GCA	2	6	4159269	4159274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15610850
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