MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium tuberculosis H37Rv complete genome

Total Repeats: 109734

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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101002	NC_000962	AGCC	2	8	4048972	4048979	25 %	0 %	25 %	50 %	57117133
101003	NC_000962	GTC	2	6	4049005	4049010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	57117133
101004	NC_000962	GGC	2	6	4049017	4049022	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	57117133
101005	NC_000962	CTCG	2	8	4049076	4049083	0 %	25 %	25 %	50 %	57117133
101006	NC_000962	ACC	2	6	4049181	4049186	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	57117134
101007	NC_000962	CAT	2	6	4049212	4049217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	57117134
101008	NC_000962	CCG	2	6	4049266	4049271	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	57117134
101009	NC_000962	CAA	2	6	4049321	4049326	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	57117134
101010	NC_000962	CACC	2	8	4049353	4049360	25 %	0 %	0 %	75 %	57117134
101011	NC_000962	CAG	2	6	4049507	4049512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	57117134
101012	NC_000962	CCA	2	6	4049530	4049535	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	57117134
101013	NC_000962	CCGC	2	8	4049578	4049585	0 %	0 %	25 %	75 %	57117134
101014	NC_000962	TCGGCC	2	12	4049610	4049621	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	57117134
101015	NC_000962	GCCC	2	8	4049646	4049653	0 %	0 %	25 %	75 %	57117134
101016	NC_000962	CGT	2	6	4049662	4049667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	57117134
101017	NC_000962	CGC	2	6	4049693	4049698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	57117134
101018	NC_000962	CG	3	6	4049711	4049716	0 %	0 %	50 %	50 %	57117134
101019	NC_000962	TGC	2	6	4049747	4049752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	57117134
101020	NC_000962	GAC	2	6	4049762	4049767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	57117134
101021	NC_000962	CCG	2	6	4049791	4049796	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	57117134
101022	NC_000962	CAC	2	6	4049830	4049835	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	57117134
101023	NC_000962	CGA	2	6	4049842	4049847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	57117134
101024	NC_000962	TCG	2	6	4049892	4049897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	57117134
101025	NC_000962	CCG	2	6	4049913	4049918	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	57117134
101026	NC_000962	GTC	2	6	4049930	4049935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	57117134
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101029	NC_000962	CAC	2	6	4050118	4050123	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15610745
101030	NC_000962	T	6	6	4050145	4050150	0 %	100 %	0 %	0 %	15610745
101031	NC_000962	CG	3	6	4050224	4050229	0 %	0 %	50 %	50 %	15610745
101032	NC_000962	CGT	2	6	4050255	4050260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15610745
101033	NC_000962	CCA	2	6	4050300	4050305	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15610745
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101035	NC_000962	TCG	2	6	4050356	4050361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15610745
101036	NC_000962	TCG	2	6	4050368	4050373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15610745
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101038	NC_000962	TGCGC	2	10	4050559	4050568	0 %	20 %	40 %	40 %	15610745
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101040	NC_000962	GATGA	2	10	4050738	4050747	40 %	20 %	40 %	0 %	15610746
101041	NC_000962	CCG	2	6	4050777	4050782	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15610746
101042	NC_000962	ACCGG	2	10	4050823	4050832	20 %	0 %	40 %	40 %	15610746
101043	NC_000962	CGG	2	6	4050840	4050845	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15610746
101044	NC_000962	GGC	2	6	4050889	4050894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15610746
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101048	NC_000962	CAG	2	6	4051120	4051125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15610746
101049	NC_000962	GCC	2	6	4051190	4051195	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15610746
101050	NC_000962	TCG	2	6	4051217	4051222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15610746
101051	NC_000962	AGT	2	6	4051245	4051250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15610746
101052	NC_000962	GC	3	6	4051354	4051359	0 %	0 %	50 %	50 %	15610746
101053	NC_000962	TGG	2	6	4051365	4051370	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15610746
101054	NC_000962	GGT	2	6	4051396	4051401	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15610746
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101057	NC_000962	GC	3	6	4051430	4051435	0 %	0 %	50 %	50 %	15610746
101058	NC_000962	TCT	2	6	4051493	4051498	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15610746
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101061	NC_000962	CG	3	6	4051533	4051538	0 %	0 %	50 %	50 %	15610746
101062	NC_000962	GCCC	2	8	4051599	4051606	0 %	0 %	25 %	75 %	15610746
101063	NC_000962	TCT	3	9	4051623	4051631	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15610746
101064	NC_000962	TGA	2	6	4051641	4051646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15610746
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101066	NC_000962	GCC	2	6	4051666	4051671	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15610746
101067	NC_000962	TGA	2	6	4051710	4051715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15610746
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101070	NC_000962	TGA	2	6	4051755	4051760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15610746
101071	NC_000962	GCA	2	6	4051857	4051862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15610746
101072	NC_000962	CCGC	2	8	4051863	4051870	0 %	0 %	25 %	75 %	15610746
101073	NC_000962	CGGCC	2	10	4051916	4051925	0 %	0 %	40 %	60 %	15610746
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101098	NC_000962	TCG	2	6	4052714	4052719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15610746
101099	NC_000962	GTC	2	6	4052797	4052802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15610746
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101107	NC_000962	GAG	3	9	4053168	4053176	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15610747
101108	NC_000962	CCA	2	6	4053213	4053218	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15610747
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101110	NC_000962	CCA	2	6	4053324	4053329	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15610747
101111	NC_000962	GAG	3	9	4053390	4053398	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15610747
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101113	NC_000962	GAG	3	9	4053501	4053509	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15610747
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101115	NC_000962	GGC	2	6	4053792	4053797	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15610748
101116	NC_000962	AGC	2	6	4053887	4053892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15610749
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101118	NC_000962	CGGC	2	8	4053995	4054002	0 %	0 %	50 %	50 %	15610749
101119	NC_000962	GC	3	6	4054014	4054019	0 %	0 %	50 %	50 %	15610749
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101122	NC_000962	CTG	2	6	4054213	4054218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15610750
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101131	NC_000962	TA	3	6	4054862	4054867	50 %	50 %	0 %	0 %	15610751
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101184	NC_000962	CTAG	2	8	4056880	4056887	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
101185	NC_000962	CGA	2	6	4056925	4056930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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101221	NC_000962	GCA	2	6	4058632	4058637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15610753
101222	NC_000962	GGTGA	2	10	4058648	4058657	20 %	20 %	60 %	0 %	15610753
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101226	NC_000962	CGGCT	2	10	4058806	4058815	0 %	20 %	40 %	40 %	15610754
101227	NC_000962	ACG	2	6	4058816	4058821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15610754
101228	NC_000962	ACC	2	6	4058905	4058910	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15610754
101229	NC_000962	CAT	2	6	4058950	4058955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15610754
101230	NC_000962	TGG	2	6	4058963	4058968	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15610754
101231	NC_000962	TGC	2	6	4058981	4058986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15610754
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101233	NC_000962	ATG	2	6	4059055	4059060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15610754
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101461	NC_000962	CCAAC	2	10	4068511	4068520	40 %	0 %	0 %	60 %	15610765
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101463	NC_000962	CAG	2	6	4068635	4068640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15610765
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101465	NC_000962	CGC	2	6	4068656	4068661	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15610765
101466	NC_000962	TCCG	2	8	4068707	4068714	0 %	25 %	25 %	50 %	15610765
101467	NC_000962	GC	3	6	4068724	4068729	0 %	0 %	50 %	50 %	15610765
101468	NC_000962	GGT	2	6	4068785	4068790	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15610765
101469	NC_000962	GAT	2	6	4068794	4068799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15610765
101470	NC_000962	TGA	2	6	4068904	4068909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15610765
101471	NC_000962	CCG	2	6	4068978	4068983	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15610765
101472	NC_000962	CCA	2	6	4069006	4069011	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15610765
101473	NC_000962	TCA	2	6	4069015	4069020	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15610765
101474	NC_000962	CGA	2	6	4069085	4069090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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101476	NC_000962	CTA	2	6	4069143	4069148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101477	NC_000962	GCC	2	6	4069187	4069192	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15610766
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101489	NC_000962	CTG	2	6	4069649	4069654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15610766
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101496	NC_000962	GCC	2	6	4069844	4069849	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15610766
101497	NC_000962	TGA	2	6	4069854	4069859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15610766
101498	NC_000962	GCC	2	6	4069892	4069897	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15610766
101499	NC_000962	ATC	2	6	4069904	4069909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15610766
101500	NC_000962	GC	3	6	4069980	4069985	0 %	0 %	50 %	50 %	15610766

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