MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium tuberculosis H37Rv complete genome

Total Repeats: 109734

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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92006	NC_000962	CGCC	2	8	3721829	3721836	0 %	0 %	25 %	75 %	15610471
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92118	NC_000962	TCG	2	6	3726551	3726556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15610476
92119	NC_000962	GGC	2	6	3726585	3726590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15610476
92120	NC_000962	TTC	2	6	3726613	3726618	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15610476
92121	NC_000962	CTG	2	6	3726649	3726654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15610476
92122	NC_000962	CGG	2	6	3726662	3726667	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15610476
92123	NC_000962	TCG	2	6	3726704	3726709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15610476
92124	NC_000962	ACA	2	6	3726710	3726715	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15610476
92125	NC_000962	CGCCA	2	10	3726720	3726729	20 %	0 %	20 %	60 %	15610476
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92130	NC_000962	TCG	2	6	3726824	3726829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15610476
92131	NC_000962	CGG	2	6	3726831	3726836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15610476
92132	NC_000962	CAC	2	6	3726873	3726878	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15610476
92133	NC_000962	GTG	2	6	3726901	3726906	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15610476
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92135	NC_000962	CGG	2	6	3726974	3726979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15610476
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92140	NC_000962	CGG	2	6	3727200	3727205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15610476
92141	NC_000962	AGC	2	6	3727331	3727336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15610476
92142	NC_000962	CGA	2	6	3727392	3727397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15610476
92143	NC_000962	GGC	2	6	3727464	3727469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15610476
92144	NC_000962	ACCC	2	8	3727505	3727512	25 %	0 %	0 %	75 %	15610477
92145	NC_000962	CCG	2	6	3727522	3727527	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15610477
92146	NC_000962	CGA	2	6	3727586	3727591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15610477
92147	NC_000962	GTG	3	9	3727644	3727652	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15610477
92148	NC_000962	CCG	2	6	3727693	3727698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15610477
92149	NC_000962	CCACC	2	10	3727706	3727715	20 %	0 %	0 %	80 %	15610477
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92151	NC_000962	GGCCG	2	10	3727736	3727745	0 %	0 %	60 %	40 %	15610477
92152	NC_000962	ACC	2	6	3727761	3727766	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15610477
92153	NC_000962	CGG	2	6	3727796	3727801	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15610477
92154	NC_000962	CGC	2	6	3727937	3727942	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15610477
92155	NC_000962	CGT	2	6	3727943	3727948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15610477
92156	NC_000962	CGG	2	6	3727949	3727954	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15610477
92157	NC_000962	GCG	2	6	3727963	3727968	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15610477
92158	NC_000962	GGT	2	6	3727985	3727990	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15610477
92159	NC_000962	TGC	2	6	3728020	3728025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15610477
92160	NC_000962	CGGT	2	8	3728029	3728036	0 %	25 %	50 %	25 %	15610477
92161	NC_000962	GCG	2	6	3728113	3728118	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15610477
92162	NC_000962	CGCC	2	8	3728162	3728169	0 %	0 %	25 %	75 %	15610477
92163	NC_000962	CACCT	2	10	3728178	3728187	20 %	20 %	0 %	60 %	15610477
92164	NC_000962	CAACCA	2	12	3728222	3728233	50 %	0 %	0 %	50 %	15610477
92165	NC_000962	CGGC	2	8	3728251	3728258	0 %	0 %	50 %	50 %	15610477
92166	NC_000962	ACG	2	6	3728362	3728367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15610477
92167	NC_000962	CGGCCG	2	12	3728369	3728380	0 %	0 %	50 %	50 %	15610477
92168	NC_000962	CGG	2	6	3728381	3728386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15610477
92169	NC_000962	GC	3	6	3728402	3728407	0 %	0 %	50 %	50 %	15610477
92170	NC_000962	GGT	3	9	3728420	3728428	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15610477
92171	NC_000962	GGC	2	6	3728430	3728435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15610477
92172	NC_000962	GCA	2	6	3728468	3728473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15610477
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92174	NC_000962	GTC	2	6	3728514	3728519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15610477
92175	NC_000962	ACG	2	6	3728536	3728541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15610477
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92177	NC_000962	CGG	2	6	3728619	3728624	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15610477
92178	NC_000962	GCT	2	6	3728722	3728727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15610478
92179	NC_000962	GCCG	2	8	3728728	3728735	0 %	0 %	50 %	50 %	15610478
92180	NC_000962	CCGC	2	8	3728736	3728743	0 %	0 %	25 %	75 %	15610478
92181	NC_000962	ACC	2	6	3728780	3728785	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15610478
92182	NC_000962	TGC	2	6	3728847	3728852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15610478
92183	NC_000962	TGC	2	6	3728854	3728859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15610478
92184	NC_000962	GCT	2	6	3728878	3728883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15610478
92185	NC_000962	CCG	2	6	3728889	3728894	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15610478
92186	NC_000962	GAC	2	6	3728909	3728914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15610478
92187	NC_000962	TGG	2	6	3728934	3728939	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15610478
92188	NC_000962	CCCG	2	8	3728963	3728970	0 %	0 %	25 %	75 %	15610478
92189	NC_000962	CGGG	2	8	3729003	3729010	0 %	0 %	75 %	25 %	15610478
92190	NC_000962	CGA	2	6	3729037	3729042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15610478
92191	NC_000962	GGCTG	2	10	3729045	3729054	0 %	20 %	60 %	20 %	15610478
92192	NC_000962	ATC	2	6	3729074	3729079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15610478
92193	NC_000962	TGG	2	6	3729195	3729200	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15610478
92194	NC_000962	TCACC	2	10	3729219	3729228	20 %	20 %	0 %	60 %	15610478
92195	NC_000962	TG	3	6	3729332	3729337	0 %	50 %	50 %	0 %	15610478
92196	NC_000962	CGC	2	6	3729356	3729361	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
92197	NC_000962	CCGGTG	2	12	3729371	3729382	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	57117092
92198	NC_000962	GC	3	6	3729453	3729458	0 %	0 %	50 %	50 %	57117092
92199	NC_000962	AC	3	6	3729468	3729473	50 %	0 %	0 %	50 %	57117092
92200	NC_000962	CCGCG	2	10	3729483	3729492	0 %	0 %	40 %	60 %	57117092
92201	NC_000962	AGC	2	6	3729548	3729553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	57117092
92202	NC_000962	CGC	2	6	3729618	3729623	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	57117092
92203	NC_000962	CCG	2	6	3729626	3729631	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	57117092
92204	NC_000962	GAA	2	6	3729637	3729642	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57117092
92205	NC_000962	CGA	2	6	3729646	3729651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	57117092
92206	NC_000962	GGT	2	6	3729661	3729666	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	57117092
92207	NC_000962	CGGG	2	8	3729684	3729691	0 %	0 %	75 %	25 %	57117092
92208	NC_000962	AGC	2	6	3729719	3729724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	57117092
92209	NC_000962	GAAGGC	2	12	3729775	3729786	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	57117092
92210	NC_000962	TGGAT	2	10	3729887	3729896	20 %	40 %	40 %	0 %	57117092
92211	NC_000962	CAG	2	6	3729961	3729966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	57117092
92212	NC_000962	TGA	2	6	3730023	3730028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57117092
92213	NC_000962	CAG	2	6	3730033	3730038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	57117092
92214	NC_000962	GAT	2	6	3730057	3730062	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57117092
92215	NC_000962	CGG	2	6	3730204	3730209	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	57117092
92216	NC_000962	GCC	2	6	3730219	3730224	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	57117092
92217	NC_000962	GAT	2	6	3730282	3730287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57117092
92218	NC_000962	GCC	2	6	3730297	3730302	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	57117092
92219	NC_000962	ATG	2	6	3730337	3730342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57117092
92220	NC_000962	CAAC	2	8	3730480	3730487	50 %	0 %	0 %	50 %	57117092
92221	NC_000962	ACCC	2	8	3730587	3730594	25 %	0 %	0 %	75 %	57117092
92222	NC_000962	AAC	2	6	3730601	3730606	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	57117092
92223	NC_000962	C	6	6	3730665	3730670	0 %	0 %	0 %	100 %	57117092
92224	NC_000962	AAC	2	6	3730721	3730726	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	57117092
92225	NC_000962	ACC	2	6	3730753	3730758	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	57117092
92226	NC_000962	TTG	2	6	3730970	3730975	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	57117092
92227	NC_000962	CCG	2	6	3730976	3730981	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	57117092
92228	NC_000962	GCC	2	6	3730987	3730992	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	57117092
92229	NC_000962	CAA	2	6	3731128	3731133	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	57117092
92230	NC_000962	CTG	2	6	3731143	3731148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	57117092
92231	NC_000962	CCCAAC	2	12	3731186	3731197	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	57117092
92232	NC_000962	CCCA	2	8	3731284	3731291	25 %	0 %	0 %	75 %	57117092
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92234	NC_000962	CGA	2	6	3731386	3731391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	57117092
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