MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium tuberculosis H37Rv complete genome

Total Repeats: 109734

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_000962	GAG	2	6	228225	228230	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15607335
5502	NC_000962	GC	3	6	228273	228278	0 %	0 %	50 %	50 %	15607335
5503	NC_000962	CGG	2	6	228293	228298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15607335
5504	NC_000962	CAACGC	2	12	228300	228311	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	15607335
5505	NC_000962	GTT	2	6	228347	228352	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15607335
5506	NC_000962	GAC	2	6	228360	228365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607335
5507	NC_000962	AGG	2	6	228406	228411	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15607335
5508	NC_000962	TGC	2	6	228412	228417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607335
5509	NC_000962	CGC	2	6	228456	228461	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15607335
5510	NC_000962	CGA	2	6	228533	228538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607335
5511	NC_000962	GT	3	6	228627	228632	0 %	50 %	50 %	0 %	15607335
5512	NC_000962	GCA	2	6	228665	228670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607335
5513	NC_000962	CACC	2	8	228702	228709	25 %	0 %	0 %	75 %	15607335
5514	NC_000962	CGC	2	6	228726	228731	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15607335
5515	NC_000962	CTG	2	6	228732	228737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607335
5516	NC_000962	CTG	2	6	228768	228773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607335
5517	NC_000962	TGG	2	6	228775	228780	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15607335
5518	NC_000962	CTG	2	6	228801	228806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607335
5519	NC_000962	CGC	2	6	228846	228851	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15607335
5520	NC_000962	TGG	2	6	228870	228875	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15607335
5521	NC_000962	CGT	2	6	228983	228988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607335
5522	NC_000962	GCCTGG	2	12	229006	229017	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	15607335
5523	NC_000962	GAC	2	6	229029	229034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607335
5524	NC_000962	CCG	2	6	229063	229068	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15607335
5525	NC_000962	GTG	2	6	229125	229130	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15607335
5526	NC_000962	TGG	2	6	229147	229152	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15607335
5527	NC_000962	GCT	2	6	229154	229159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607335
5528	NC_000962	CAC	2	6	229193	229198	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15607335
5529	NC_000962	CGG	2	6	229257	229262	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15607335
5530	NC_000962	CGG	2	6	229309	229314	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15607335
5531	NC_000962	GAC	2	6	229380	229385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607335
5532	NC_000962	GCT	2	6	229415	229420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607335
5533	NC_000962	TAC	2	6	229428	229433	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15607335
5534	NC_000962	ACC	2	6	229464	229469	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15607335
5535	NC_000962	TCGG	2	8	229515	229522	0 %	25 %	50 %	25 %	15607335
5536	NC_000962	TGT	2	6	229555	229560	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15607335
5537	NC_000962	CGA	2	6	229592	229597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607335
5538	NC_000962	GCG	2	6	229608	229613	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15607335
5539	NC_000962	GGC	2	6	229616	229621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15607335
5540	NC_000962	GCT	2	6	229637	229642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607335
5541	NC_000962	CGT	2	6	229657	229662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607335
5542	NC_000962	CGG	2	6	229666	229671	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15607335
5543	NC_000962	GTG	2	6	229693	229698	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15607335
5544	NC_000962	CCGG	2	8	229776	229783	0 %	0 %	50 %	50 %	15607335
5545	NC_000962	GGT	2	6	229790	229795	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15607335
5546	NC_000962	TCG	2	6	229798	229803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607335
5547	NC_000962	TGG	2	6	229840	229845	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15607335
5548	NC_000962	ACGG	2	8	229993	230000	25 %	0 %	50 %	25 %	15607335
5549	NC_000962	GAT	2	6	230057	230062	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15607335
5550	NC_000962	CCG	2	6	230119	230124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15607335
5551	NC_000962	CTG	3	9	230178	230186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607335
5552	NC_000962	GTG	2	6	230226	230231	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15607335
5553	NC_000962	CACCCT	2	12	230240	230251	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	15607335
5554	NC_000962	GAC	2	6	230264	230269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607335
5555	NC_000962	GCT	2	6	230373	230378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607335
5556	NC_000962	GGC	2	6	230402	230407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15607335
5557	NC_000962	AACT	2	8	230625	230632	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5558	NC_000962	TGT	2	6	230765	230770	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5559	NC_000962	GGAA	2	8	230800	230807	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5560	NC_000962	CAC	2	6	230808	230813	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5561	NC_000962	G	6	6	230815	230820	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5562	NC_000962	GAG	2	6	230866	230871	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5563	NC_000962	TCC	2	6	230876	230881	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5564	NC_000962	GGT	2	6	230928	230933	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15607336
5565	NC_000962	GCGA	2	8	230935	230942	25 %	0 %	50 %	25 %	15607336
5566	NC_000962	GC	3	6	231000	231005	0 %	0 %	50 %	50 %	15607336
5567	NC_000962	CCA	2	6	231047	231052	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15607336
5568	NC_000962	GTC	3	9	231124	231132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607336
5569	NC_000962	CGA	2	6	231135	231140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607336
5570	NC_000962	GAT	2	6	231165	231170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15607336
5571	NC_000962	GTT	2	6	231189	231194	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15607336
5572	NC_000962	TCG	2	6	231224	231229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607336
5573	NC_000962	CCG	2	6	231245	231250	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15607336
5574	NC_000962	GCC	2	6	231254	231259	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15607336
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5577	NC_000962	GCC	2	6	231340	231345	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15607336
5578	NC_000962	TGC	2	6	231371	231376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607336
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5580	NC_000962	CGCA	2	8	231490	231497	25 %	0 %	25 %	50 %	15607336
5581	NC_000962	TGCGC	2	10	231510	231519	0 %	20 %	40 %	40 %	15607336
5582	NC_000962	TGAT	2	8	231532	231539	25 %	50 %	25 %	0 %	15607336
5583	NC_000962	ACGT	2	8	231552	231559	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5584	NC_000962	GGCCG	2	10	231562	231571	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
5585	NC_000962	GTG	2	6	231583	231588	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5586	NC_000962	ACAT	2	8	231619	231626	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5587	NC_000962	GCG	2	6	231641	231646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5588	NC_000962	TGG	2	6	231669	231674	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15607337
5589	NC_000962	TGC	2	6	231732	231737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607337
5590	NC_000962	GCG	2	6	231744	231749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15607337
5591	NC_000962	ACT	2	6	231771	231776	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15607337
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5593	NC_000962	G	6	6	231859	231864	0 %	0 %	100 %	0 %	15607337
5594	NC_000962	GCT	2	6	231871	231876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607337
5595	NC_000962	CAG	2	6	231902	231907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607337
5596	NC_000962	CGC	2	6	231943	231948	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15607337
5597	NC_000962	GGCG	2	8	231961	231968	0 %	0 %	75 %	25 %	15607337
5598	NC_000962	CG	3	6	232003	232008	0 %	0 %	50 %	50 %	15607337
5599	NC_000962	GCG	2	6	232013	232018	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15607337
5600	NC_000962	CCG	2	6	232073	232078	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15607337
5601	NC_000962	GCG	2	6	232147	232152	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15607337
5602	NC_000962	CGC	2	6	232161	232166	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15607337
5603	NC_000962	CTG	3	9	232196	232204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607337
5604	NC_000962	GAT	2	6	232227	232232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15607337
5605	NC_000962	TCG	2	6	232289	232294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607338
5606	NC_000962	CGA	2	6	232302	232307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607338
5607	NC_000962	CAA	2	6	232368	232373	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15607338
5608	NC_000962	AAC	2	6	232399	232404	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15607338
5609	NC_000962	GCC	2	6	232430	232435	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15607338
5610	NC_000962	GAG	2	6	232453	232458	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15607338
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5612	NC_000962	TCT	2	6	232535	232540	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15607338
5613	NC_000962	CGG	4	12	232545	232556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15607338
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5615	NC_000962	GCG	2	6	232586	232591	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15607338
5616	NC_000962	CGG	2	6	232680	232685	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15607338
5617	NC_000962	CG	3	6	232691	232696	0 %	0 %	50 %	50 %	15607338
5618	NC_000962	TCG	2	6	232727	232732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607338
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5620	NC_000962	GAT	2	6	232812	232817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15607338
5621	NC_000962	GATC	2	8	232821	232828	25 %	25 %	25 %	25 %	15607338
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5623	NC_000962	GGC	2	6	232902	232907	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15607338
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5746	NC_000962	GGC	2	6	237718	237723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15607341
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5781	NC_000962	GCCA	2	8	239173	239180	25 %	0 %	25 %	50 %	15607343
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5991	NC_000962	ACC	2	6	247784	247789	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15607348
5992	NC_000962	CGGC	2	8	247853	247860	0 %	0 %	50 %	50 %	15607348
5993	NC_000962	CAG	2	6	247882	247887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607348
5994	NC_000962	CGGC	2	8	247930	247937	0 %	0 %	50 %	50 %	15607348
5995	NC_000962	TCA	3	9	248109	248117	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15607348
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5998	NC_000962	GAC	2	6	248223	248228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607349
5999	NC_000962	GCA	2	6	248237	248242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607349
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