MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium tuberculosis H37Rv complete genome

Total Repeats: 109734

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5002	NC_000962	CGA	2	6	207690	207695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607317
5003	NC_000962	GGT	2	6	207736	207741	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15607317
5004	NC_000962	TGG	2	6	207801	207806	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15607317
5005	NC_000962	TGT	2	6	207876	207881	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15607317
5006	NC_000962	CGG	3	9	207942	207950	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15607317
5007	NC_000962	GGC	3	9	207958	207966	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15607317
5008	NC_000962	GGT	2	6	208003	208008	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15607317
5009	NC_000962	AATG	2	8	208016	208023	50 %	25 %	25 %	0 %	15607317
5010	NC_000962	CG	3	6	208040	208045	0 %	0 %	50 %	50 %	15607317
5011	NC_000962	CCGC	2	8	208153	208160	0 %	0 %	25 %	75 %	15607317
5012	NC_000962	TGT	2	6	208269	208274	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15607317
5013	NC_000962	ACC	2	6	208297	208302	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15607317
5014	NC_000962	CG	3	6	208350	208355	0 %	0 %	50 %	50 %	15607317
5015	NC_000962	CGA	2	6	208369	208374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607317
5016	NC_000962	TGA	2	6	208386	208391	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15607317
5017	NC_000962	CGT	2	6	208426	208431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607318
5018	NC_000962	GCT	2	6	208455	208460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607318
5019	NC_000962	AGC	2	6	208590	208595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607318
5020	NC_000962	CCACG	2	10	208698	208707	20 %	0 %	20 %	60 %	15607318
5021	NC_000962	TGG	2	6	208841	208846	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15607318
5022	NC_000962	GGT	2	6	208884	208889	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15607318
5023	NC_000962	CAG	2	6	208947	208952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607318
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5025	NC_000962	GCC	2	6	209076	209081	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15607319
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5027	NC_000962	GGC	2	6	209133	209138	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15607319
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5029	NC_000962	GC	3	6	209258	209263	0 %	0 %	50 %	50 %	15607319
5030	NC_000962	GTG	2	6	209265	209270	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15607319
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5037	NC_000962	CAAA	2	8	209431	209438	75 %	0 %	0 %	25 %	15607319
5038	NC_000962	TGC	2	6	209474	209479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607319
5039	NC_000962	ACACCA	2	12	209521	209532	50 %	0 %	0 %	50 %	15607319
5040	NC_000962	ACC	2	6	209535	209540	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15607319
5041	NC_000962	CG	3	6	209609	209614	0 %	0 %	50 %	50 %	15607319
5042	NC_000962	GAC	2	6	209633	209638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607319
5043	NC_000962	CGC	2	6	209659	209664	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15607319
5044	NC_000962	CCG	2	6	209684	209689	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5045	NC_000962	GCCA	2	8	209713	209720	25 %	0 %	25 %	50 %	15607320
5046	NC_000962	C	6	6	209841	209846	0 %	0 %	0 %	100 %	15607320
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5053	NC_000962	CAC	2	6	210140	210145	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15607320
5054	NC_000962	ATC	2	6	210157	210162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15607320
5055	NC_000962	GTC	2	6	210163	210168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607320
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5057	NC_000962	TTGG	2	8	210240	210247	0 %	50 %	50 %	0 %	15607320
5058	NC_000962	C	6	6	210319	210324	0 %	0 %	0 %	100 %	15607320
5059	NC_000962	GAA	2	6	210342	210347	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15607320
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5062	NC_000962	GC	3	6	210465	210470	0 %	0 %	50 %	50 %	15607320
5063	NC_000962	TGA	2	6	210530	210535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15607320
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5109	NC_000962	GCAGG	2	10	212457	212466	20 %	0 %	60 %	20 %	15607322
5110	NC_000962	CG	3	6	212491	212496	0 %	0 %	50 %	50 %	15607322
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5113	NC_000962	TCG	2	6	212590	212595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607322
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5120	NC_000962	GTG	2	6	212892	212897	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15607322
5121	NC_000962	CGT	2	6	212958	212963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607322
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5123	NC_000962	CCA	2	6	213081	213086	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15607323
5124	NC_000962	CGG	2	6	213102	213107	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15607323
5125	NC_000962	CGG	2	6	213171	213176	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15607323
5126	NC_000962	CGG	2	6	213289	213294	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15607323
5127	NC_000962	CGG	2	6	213312	213317	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15607323
5128	NC_000962	CGG	2	6	213420	213425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15607323
5129	NC_000962	GCA	2	6	213465	213470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607323
5130	NC_000962	GCA	2	6	213531	213536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607323
5131	NC_000962	GCA	3	9	213543	213551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607323
5132	NC_000962	TGC	2	6	213578	213583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607323
5133	NC_000962	GCC	2	6	213587	213592	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15607323
5134	NC_000962	CGA	2	6	213624	213629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607323
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5138	NC_000962	CCA	2	6	213699	213704	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15607323
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5142	NC_000962	CAGG	2	8	213781	213788	25 %	0 %	50 %	25 %	15607323
5143	NC_000962	TGG	2	6	213792	213797	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15607323
5144	NC_000962	GCA	2	6	213864	213869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607323
5145	NC_000962	CGT	2	6	213894	213899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607323
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5152	NC_000962	CGC	2	6	214217	214222	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	57116702
5153	NC_000962	CGGC	2	8	214251	214258	0 %	0 %	50 %	50 %	57116702
5154	NC_000962	ACC	2	6	214278	214283	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	57116702
5155	NC_000962	GA	3	6	214321	214326	50 %	0 %	50 %	0 %	57116702
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5162	NC_000962	GGT	2	6	214615	214620	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	57116702
5163	NC_000962	ACA	2	6	214629	214634	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	57116702
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5165	NC_000962	CCGG	2	8	214664	214671	0 %	0 %	50 %	50 %	57116702
5166	NC_000962	CG	3	6	214679	214684	0 %	0 %	50 %	50 %	57116702
5167	NC_000962	CTG	2	6	214685	214690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	57116702
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5169	NC_000962	TGC	2	6	214746	214751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	57116702
5170	NC_000962	TG	3	6	214805	214810	0 %	50 %	50 %	0 %	57116702
5171	NC_000962	CGA	2	6	214891	214896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	57116702
5172	NC_000962	GCCGA	2	10	214928	214937	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
5173	NC_000962	CTG	2	6	215005	215010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607325
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5176	NC_000962	CACCAT	2	12	215157	215168	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	15607325
5177	NC_000962	GCG	2	6	215173	215178	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15607325
5178	NC_000962	CGG	2	6	215225	215230	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15607325
5179	NC_000962	ACG	2	6	215234	215239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607325
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5181	NC_000962	CCTCG	2	10	215364	215373	0 %	20 %	20 %	60 %	15607325
5182	NC_000962	CGA	2	6	215393	215398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607325
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5184	NC_000962	TAC	2	6	215557	215562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15607325
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5187	NC_000962	AGCC	2	8	215595	215602	25 %	0 %	25 %	50 %	15607325
5188	NC_000962	TCG	2	6	215620	215625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607325
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5190	NC_000962	AAC	2	6	215674	215679	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15607325
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5192	NC_000962	TCGGT	3	15	215864	215878	0 %	40 %	40 %	20 %	15607326
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5200	NC_000962	CGT	2	6	216194	216199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607326
5201	NC_000962	AGG	2	6	216208	216213	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15607326
5202	NC_000962	CGA	3	9	216274	216282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607327
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5204	NC_000962	TTG	2	6	216413	216418	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15607327
5205	NC_000962	CCG	2	6	216486	216491	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15607327
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5208	NC_000962	GC	3	6	216608	216613	0 %	0 %	50 %	50 %	15607327
5209	NC_000962	GTT	2	6	216658	216663	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15607327
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5212	NC_000962	CGA	3	9	216720	216728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607327
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5214	NC_000962	TTG	2	6	216812	216817	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15607327
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5220	NC_000962	GTGCG	2	10	217018	217027	0 %	20 %	60 %	20 %	15607327
5221	NC_000962	ACCG	2	8	217064	217071	25 %	0 %	25 %	50 %	15607327
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5223	NC_000962	CGG	2	6	217130	217135	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15607327
5224	NC_000962	GCGCCG	2	12	217181	217192	0 %	0 %	50 %	50 %	15607327
5225	NC_000962	TGC	3	9	217245	217253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607327
5226	NC_000962	GCT	2	6	217264	217269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607327
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5228	NC_000962	CGG	2	6	217309	217314	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15607327
5229	NC_000962	G	6	6	217369	217374	0 %	0 %	100 %	0 %	15607327
5230	NC_000962	CTG	2	6	217436	217441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607327
5231	NC_000962	TGAG	2	8	217455	217462	25 %	25 %	50 %	0 %	15607327
5232	NC_000962	AGTTCG	2	12	217488	217499	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	15607327
5233	NC_000962	CGG	2	6	217515	217520	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15607327
5234	NC_000962	GCTG	2	8	217528	217535	0 %	25 %	50 %	25 %	15607327
5235	NC_000962	CGC	2	6	217636	217641	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15607327
5236	NC_000962	CAT	2	6	217726	217731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15607327
5237	NC_000962	TGG	2	6	218013	218018	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15607327
5238	NC_000962	GGC	2	6	218024	218029	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15607327
5239	NC_000962	CGGTTG	2	12	218126	218137	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	15607327
5240	NC_000962	CGG	2	6	218177	218182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15607327
5241	NC_000962	ACG	2	6	218220	218225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607327
5242	NC_000962	CGGTGG	2	12	218265	218276	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	15607327
5243	NC_000962	CGG	2	6	218283	218288	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15607327
5244	NC_000962	GGCC	2	8	218320	218327	0 %	0 %	50 %	50 %	15607327
5245	NC_000962	GGCC	2	8	218347	218354	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5246	NC_000962	TCG	2	6	218409	218414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	448824740
5247	NC_000962	ACAGCC	2	12	218480	218491	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	448824740
5248	NC_000962	GGT	2	6	218580	218585	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5249	NC_000962	AT	3	6	218617	218622	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5250	NC_000962	CTG	2	6	218669	218674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5251	NC_000962	GC	3	6	218675	218680	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5252	NC_000962	CGGT	2	8	218683	218690	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5253	NC_000962	CAACC	2	10	218720	218729	40 %	0 %	0 %	60 %	15607328
5254	NC_000962	CGA	2	6	218770	218775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607328
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5258	NC_000962	GC	3	6	218885	218890	0 %	0 %	50 %	50 %	15607328
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5260	NC_000962	GGT	2	6	218965	218970	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15607328
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5262	NC_000962	GGT	2	6	219049	219054	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15607328
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5272	NC_000962	TGC	2	6	219461	219466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5277	NC_000962	CTG	2	6	219597	219602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607329
5278	NC_000962	TCG	2	6	219634	219639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607329
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5281	NC_000962	GT	3	6	219769	219774	0 %	50 %	50 %	0 %	15607329
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5370	NC_000962	CGG	2	6	223172	223177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15607332
5371	NC_000962	CTG	2	6	223234	223239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607332
5372	NC_000962	TGC	2	6	223292	223297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607332
5373	NC_000962	CGG	2	6	223301	223306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15607332
5374	NC_000962	GCG	3	9	223316	223324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15607332
5375	NC_000962	CAT	2	6	223374	223379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15607332
5376	NC_000962	CTG	2	6	223390	223395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607332
5377	NC_000962	GCT	2	6	223401	223406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607332
5378	NC_000962	GAT	2	6	223425	223430	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15607332
5379	NC_000962	CGG	2	6	223442	223447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15607332
5380	NC_000962	GTT	2	6	223464	223469	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15607332
5381	NC_000962	CAG	2	6	223533	223538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5382	NC_000962	GAA	2	6	223579	223584	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15607333
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5384	NC_000962	CCG	2	6	223780	223785	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15607333
5385	NC_000962	GCC	2	6	223803	223808	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15607333
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5387	NC_000962	GCC	2	6	223827	223832	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15607333
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5400	NC_000962	CGT	2	6	224280	224285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607333
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5402	NC_000962	CCA	2	6	224328	224333	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15607333
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5406	NC_000962	GC	3	6	224486	224491	0 %	0 %	50 %	50 %	15607333
5407	NC_000962	GTC	2	6	224599	224604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607333
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5409	NC_000962	ACA	2	6	224627	224632	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15607333
5410	NC_000962	ACG	2	6	224636	224641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607333
5411	NC_000962	CG	3	6	224669	224674	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5412	NC_000962	AGC	2	6	224764	224769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607334
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5414	NC_000962	CAC	2	6	224787	224792	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15607334
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5417	NC_000962	GC	3	6	224928	224933	0 %	0 %	50 %	50 %	15607334
5418	NC_000962	CGG	2	6	224975	224980	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15607334
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5420	NC_000962	CGGG	2	8	225066	225073	0 %	0 %	75 %	25 %	15607334
5421	NC_000962	GCT	2	6	225074	225079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607334
5422	NC_000962	AGCC	2	8	225091	225098	25 %	0 %	25 %	50 %	15607334
5423	NC_000962	CTG	2	6	225122	225127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607334
5424	NC_000962	GC	3	6	225147	225152	0 %	0 %	50 %	50 %	15607334
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5427	NC_000962	TGG	2	6	225323	225328	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15607334
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5429	NC_000962	CG	3	6	225352	225357	0 %	0 %	50 %	50 %	15607334
5430	NC_000962	TTC	2	6	225409	225414	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15607334
5431	NC_000962	GAG	2	6	225420	225425	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15607334
5432	NC_000962	GCG	3	9	225445	225453	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15607334
5433	NC_000962	GCT	2	6	225473	225478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607334
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5448	NC_000962	TCG	2	6	226171	226176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607334
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5451	NC_000962	GAC	2	6	226227	226232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607334
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5459	NC_000962	CGG	2	6	226741	226746	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5460	NC_000962	ACC	2	6	226835	226840	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5461	NC_000962	TGG	2	6	226893	226898	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15607335
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5484	NC_000962	CGG	2	6	227657	227662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15607335
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5486	NC_000962	GCA	2	6	227680	227685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607335
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5488	NC_000962	GCCT	2	8	227715	227722	0 %	25 %	25 %	50 %	15607335
5489	NC_000962	CGGC	2	8	227736	227743	0 %	0 %	50 %	50 %	15607335
5490	NC_000962	CAG	2	6	227775	227780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607335
5491	NC_000962	GC	4	8	227781	227788	0 %	0 %	50 %	50 %	15607335
5492	NC_000962	GCCG	2	8	227821	227828	0 %	0 %	50 %	50 %	15607335
5493	NC_000962	CCGGG	2	10	227948	227957	0 %	0 %	60 %	40 %	15607335
5494	NC_000962	GGT	2	6	227969	227974	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15607335
5495	NC_000962	ACG	2	6	228028	228033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607335
5496	NC_000962	CA	3	6	228035	228040	50 %	0 %	0 %	50 %	15607335
5497	NC_000962	GGT	2	6	228057	228062	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15607335
5498	NC_000962	GCC	2	6	228169	228174	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15607335
5499	NC_000962	CGG	2	6	228202	228207	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15607335
5500	NC_000962	GCG	2	6	228213	228218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15607335

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