MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanothermobacter thermautotrophicus str. Delta H chromosome

Total Repeats: 35216

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_000916	GAG	2	6	195206	195211	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678279
4002	NC_000916	G	6	6	195242	195247	0 %	0 %	100 %	0 %	15678279
4003	NC_000916	GGA	2	6	195278	195283	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678279
4004	NC_000916	GGA	2	6	195289	195294	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678279
4005	NC_000916	ATA	2	6	195299	195304	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15678279
4006	NC_000916	CTC	2	6	195314	195319	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678279
4007	NC_000916	GAG	2	6	195350	195355	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678279
4008	NC_000916	AT	3	6	195356	195361	50 %	50 %	0 %	0 %	15678279
4009	NC_000916	ATA	2	6	195405	195410	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15678279
4010	NC_000916	TTC	2	6	195431	195436	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15678279
4011	NC_000916	CTG	2	6	195471	195476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15678279
4012	NC_000916	AAG	2	6	195511	195516	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4013	NC_000916	GAAG	2	8	195550	195557	50 %	0 %	50 %	0 %	15678280
4014	NC_000916	CAT	2	6	195584	195589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678280
4015	NC_000916	TCC	2	6	195607	195612	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678280
4016	NC_000916	CTTCCT	2	12	195623	195634	0 %	50 %	0 %	50 %	15678280
4017	NC_000916	GGA	2	6	195709	195714	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678280
4018	NC_000916	ATTC	2	8	195755	195762	25 %	50 %	0 %	25 %	15678280
4019	NC_000916	AT	3	6	195786	195791	50 %	50 %	0 %	0 %	15678280
4020	NC_000916	TCTT	2	8	195892	195899	0 %	75 %	0 %	25 %	15678280
4021	NC_000916	GCT	2	6	195948	195953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15678280
4022	NC_000916	CTT	2	6	195983	195988	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15678280
4023	NC_000916	CTC	2	6	196083	196088	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678280
4024	NC_000916	TGG	3	9	196111	196119	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15678280
4025	NC_000916	ATGG	2	8	196257	196264	25 %	25 %	50 %	0 %	15678281
4026	NC_000916	GGA	2	6	196310	196315	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678281
4027	NC_000916	G	6	6	196469	196474	0 %	0 %	100 %	0 %	15678281
4028	NC_000916	GGGCT	3	15	196678	196692	0 %	20 %	60 %	20 %	15678281
4029	NC_000916	CGT	2	6	196694	196699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15678281
4030	NC_000916	CCT	2	6	196838	196843	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678281
4031	NC_000916	CAT	2	6	196931	196936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678281
4032	NC_000916	GAT	2	6	197024	197029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678281
4033	NC_000916	GGT	2	6	197060	197065	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15678281
4034	NC_000916	AT	3	6	197178	197183	50 %	50 %	0 %	0 %	15678281
4035	NC_000916	GAG	2	6	197217	197222	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678281
4036	NC_000916	CT	3	6	197226	197231	0 %	50 %	0 %	50 %	15678281
4037	NC_000916	AGG	2	6	197250	197255	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678281
4038	NC_000916	GCG	2	6	197283	197288	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15678281
4039	NC_000916	TCA	2	6	197302	197307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678281
4040	NC_000916	TGA	2	6	197315	197320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678281
4041	NC_000916	GTT	2	6	197325	197330	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15678281
4042	NC_000916	TGT	2	6	197354	197359	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15678281
4043	NC_000916	TCC	2	6	197469	197474	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678281
4044	NC_000916	T	6	6	197507	197512	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4045	NC_000916	CTG	2	6	197580	197585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4046	NC_000916	AACC	2	8	197604	197611	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4047	NC_000916	AT	3	6	197641	197646	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4048	NC_000916	TA	3	6	197648	197653	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4049	NC_000916	ATA	2	6	197669	197674	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4050	NC_000916	GGT	2	6	197688	197693	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15678282
4051	NC_000916	GAA	2	6	197724	197729	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15678282
4052	NC_000916	TAA	2	6	197730	197735	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15678282
4053	NC_000916	TGA	2	6	197761	197766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678282
4054	NC_000916	GAA	2	6	197807	197812	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15678282
4055	NC_000916	GGAA	2	8	197849	197856	50 %	0 %	50 %	0 %	15678282
4056	NC_000916	ATT	2	6	197918	197923	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4057	NC_000916	GCA	2	6	197941	197946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4058	NC_000916	TGA	2	6	197959	197964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4059	NC_000916	GAT	2	6	198009	198014	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4060	NC_000916	TA	3	6	198067	198072	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4061	NC_000916	ATT	2	6	198123	198128	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4062	NC_000916	GATG	2	8	198151	198158	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4063	NC_000916	AGG	2	6	198179	198184	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678283
4064	NC_000916	AGGTA	2	10	198279	198288	40 %	20 %	40 %	0 %	15678283
4065	NC_000916	CTC	2	6	198394	198399	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678283
4066	NC_000916	AGGAAA	2	12	198404	198415	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15678283
4067	NC_000916	CATA	2	8	198419	198426	50 %	25 %	0 %	25 %	15678283
4068	NC_000916	CAA	2	6	198434	198439	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15678283
4069	NC_000916	CAT	2	6	198482	198487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678283
4070	NC_000916	AGGC	2	8	198500	198507	25 %	0 %	50 %	25 %	15678283
4071	NC_000916	ATA	2	6	198532	198537	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15678283
4072	NC_000916	GAA	2	6	198547	198552	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15678283
4073	NC_000916	TTTCAA	2	12	198584	198595	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4074	NC_000916	TAA	2	6	198598	198603	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4075	NC_000916	CAG	2	6	198630	198635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15678284
4076	NC_000916	CTC	2	6	198776	198781	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678284
4077	NC_000916	GAA	2	6	198863	198868	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15678285
4078	NC_000916	TCT	2	6	198921	198926	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15678285
4079	NC_000916	GCA	3	9	198927	198935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15678285
4080	NC_000916	A	6	6	198992	198997	100 %	0 %	0 %	0 %	15678285
4081	NC_000916	A	6	6	199004	199009	100 %	0 %	0 %	0 %	15678286
4082	NC_000916	AGGA	2	8	199053	199060	50 %	0 %	50 %	0 %	15678286
4083	NC_000916	TGC	2	6	199109	199114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15678286
4084	NC_000916	CTT	2	6	199167	199172	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15678286
4085	NC_000916	TGG	2	6	199181	199186	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15678286
4086	NC_000916	CAAC	2	8	199268	199275	50 %	0 %	0 %	50 %	15678286
4087	NC_000916	ATA	2	6	199336	199341	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15678286
4088	NC_000916	TGA	2	6	199392	199397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678286
4089	NC_000916	AGATC	2	10	199471	199480	40 %	20 %	20 %	20 %	15678287
4090	NC_000916	CTT	2	6	199527	199532	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15678287
4091	NC_000916	GGT	2	6	199572	199577	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15678287
4092	NC_000916	A	6	6	199647	199652	100 %	0 %	0 %	0 %	15678287
4093	NC_000916	CTT	2	6	199682	199687	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15678287
4094	NC_000916	AGG	2	6	199801	199806	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678287
4095	NC_000916	GTG	2	6	199842	199847	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15678287
4096	NC_000916	ATGG	2	8	199873	199880	25 %	25 %	50 %	0 %	15678287
4097	NC_000916	CAG	2	6	199938	199943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15678287
4098	NC_000916	GAG	2	6	199986	199991	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678287
4099	NC_000916	AG	3	6	200003	200008	50 %	0 %	50 %	0 %	15678287
4100	NC_000916	ATA	2	6	200046	200051	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15678287
4101	NC_000916	CTC	2	6	200088	200093	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678287
4102	NC_000916	CAG	2	6	200115	200120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15678287
4103	NC_000916	AGC	2	6	200131	200136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15678287
4104	NC_000916	GAG	2	6	200145	200150	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678287
4105	NC_000916	AGG	2	6	200185	200190	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678287
4106	NC_000916	AT	3	6	200223	200228	50 %	50 %	0 %	0 %	15678287
4107	NC_000916	GAC	2	6	200247	200252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15678287
4108	NC_000916	ATG	2	6	200262	200267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678287
4109	NC_000916	CCA	2	6	200287	200292	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15678287
4110	NC_000916	CTC	2	6	200304	200309	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678287
4111	NC_000916	GAG	2	6	200325	200330	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678287
4112	NC_000916	GAA	2	6	200345	200350	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15678287
4113	NC_000916	GCA	2	6	200376	200381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15678287
4114	NC_000916	GAGG	2	8	200465	200472	25 %	0 %	75 %	0 %	15678287
4115	NC_000916	AGGC	2	8	200515	200522	25 %	0 %	50 %	25 %	15678287
4116	NC_000916	GGT	2	6	200561	200566	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15678287
4117	NC_000916	ATGT	2	8	200583	200590	25 %	50 %	25 %	0 %	15678287
4118	NC_000916	AGG	2	6	200625	200630	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678287
4119	NC_000916	GTG	2	6	200634	200639	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15678287
4120	NC_000916	AGG	2	6	200659	200664	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678287
4121	NC_000916	ATA	2	6	200682	200687	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15678287
4122	NC_000916	CAG	2	6	200713	200718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15678287
4123	NC_000916	GGA	2	6	200780	200785	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678287
4124	NC_000916	GAAGA	2	10	200814	200823	60 %	0 %	40 %	0 %	15678287
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4126	NC_000916	CAT	2	6	200843	200848	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678287
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4250	NC_000916	GAG	2	6	206910	206915	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678297
4251	NC_000916	CAGG	2	8	207000	207007	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4252	NC_000916	TA	3	6	207081	207086	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4253	NC_000916	ATAA	2	8	207096	207103	75 %	25 %	0 %	0 %	15678298
4254	NC_000916	TTA	2	6	207104	207109	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15678298
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4262	NC_000916	CCT	2	6	207732	207737	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678299
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4275	NC_000916	CAGT	2	8	208360	208367	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4276	NC_000916	A	6	6	208398	208403	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4277	NC_000916	TCG	2	6	208438	208443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4280	NC_000916	AAG	2	6	208553	208558	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15678300
4281	NC_000916	ATG	2	6	208620	208625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678300
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4289	NC_000916	TCC	2	6	209316	209321	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678301
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4324	NC_000916	A	7	7	211390	211396	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4325	NC_000916	TTCA	2	8	211423	211430	25 %	50 %	0 %	25 %	15678304
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4335	NC_000916	TAT	2	6	211850	211855	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4336	NC_000916	CAGC	2	8	211962	211969	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4337	NC_000916	GAT	2	6	211973	211978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4338	NC_000916	CAG	2	6	211981	211986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4343	NC_000916	TCACTG	2	12	212151	212162	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	15678305
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4363	NC_000916	TTC	2	6	213399	213404	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4364	NC_000916	GGA	2	6	213477	213482	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4366	NC_000916	GAA	2	6	213712	213717	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4373	NC_000916	CAG	2	6	214117	214122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15678307
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