MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanothermobacter thermautotrophicus str. Delta H chromosome

Total Repeats: 35216

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_000916	GAA	2	6	169140	169145	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15678254
3502	NC_000916	AGTT	2	8	169174	169181	25 %	50 %	25 %	0 %	15678254
3503	NC_000916	GAGG	2	8	169232	169239	25 %	0 %	75 %	0 %	15678254
3504	NC_000916	ATG	2	6	169278	169283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678254
3505	NC_000916	GT	3	6	169300	169305	0 %	50 %	50 %	0 %	15678254
3506	NC_000916	TTG	2	6	169393	169398	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15678254
3507	NC_000916	TGA	2	6	169411	169416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678254
3508	NC_000916	GTG	2	6	169434	169439	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15678254
3509	NC_000916	GCACT	2	10	169463	169472	20 %	20 %	20 %	40 %	15678254
3510	NC_000916	ATG	2	6	169537	169542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678254
3511	NC_000916	ATGG	2	8	169632	169639	25 %	25 %	50 %	0 %	15678254
3512	NC_000916	CTA	2	6	169640	169645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678254
3513	NC_000916	GAG	2	6	169712	169717	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678254
3514	NC_000916	CCT	2	6	169787	169792	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678254
3515	NC_000916	AGG	3	9	169965	169973	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678254
3516	NC_000916	AT	3	6	170073	170078	50 %	50 %	0 %	0 %	15678255
3517	NC_000916	TCCAC	2	10	170121	170130	20 %	20 %	0 %	60 %	15678255
3518	NC_000916	TGA	2	6	170179	170184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678255
3519	NC_000916	TCCC	2	8	170257	170264	0 %	25 %	0 %	75 %	15678255
3520	NC_000916	GCT	2	6	170327	170332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15678255
3521	NC_000916	CGC	2	6	170344	170349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15678255
3522	NC_000916	GATG	2	8	170434	170441	25 %	25 %	50 %	0 %	15678255
3523	NC_000916	TGC	2	6	170479	170484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15678255
3524	NC_000916	G	6	6	170545	170550	0 %	0 %	100 %	0 %	15678255
3525	NC_000916	GGC	2	6	170566	170571	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15678255
3526	NC_000916	TCC	2	6	170663	170668	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678256
3527	NC_000916	G	6	6	170670	170675	0 %	0 %	100 %	0 %	15678256
3528	NC_000916	GAG	2	6	170691	170696	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678256
3529	NC_000916	CCCA	2	8	170705	170712	25 %	0 %	0 %	75 %	15678256
3530	NC_000916	G	6	6	170724	170729	0 %	0 %	100 %	0 %	15678256
3531	NC_000916	ACT	2	6	170774	170779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678256
3532	NC_000916	CCCA	2	8	170813	170820	25 %	0 %	0 %	75 %	15678256
3533	NC_000916	CAT	2	6	170907	170912	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678256
3534	NC_000916	CCA	2	6	170966	170971	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15678256
3535	NC_000916	AGGG	2	8	171003	171010	25 %	0 %	75 %	0 %	15678256
3536	NC_000916	GGC	2	6	171081	171086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15678256
3537	NC_000916	GAG	2	6	171157	171162	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678256
3538	NC_000916	TGG	2	6	171212	171217	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15678256
3539	NC_000916	ATC	2	6	171301	171306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678256
3540	NC_000916	TGA	2	6	171315	171320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678256
3541	NC_000916	TAC	2	6	171364	171369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678256
3542	NC_000916	GGC	2	6	171412	171417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15678256
3543	NC_000916	GGCA	2	8	171435	171442	25 %	0 %	50 %	25 %	15678256
3544	NC_000916	AT	3	6	171461	171466	50 %	50 %	0 %	0 %	15678256
3545	NC_000916	CAGG	2	8	171487	171494	25 %	0 %	50 %	25 %	15678256
3546	NC_000916	GGA	2	6	171557	171562	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678256
3547	NC_000916	CCT	2	6	171615	171620	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678256
3548	NC_000916	CT	3	6	171619	171624	0 %	50 %	0 %	50 %	15678256
3549	NC_000916	GAG	2	6	171688	171693	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678256
3550	NC_000916	A	6	6	171715	171720	100 %	0 %	0 %	0 %	15678256
3551	NC_000916	G	6	6	171767	171772	0 %	0 %	100 %	0 %	15678256
3552	NC_000916	ACC	2	6	171780	171785	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15678256
3553	NC_000916	TGC	2	6	171799	171804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15678256
3554	NC_000916	GAG	2	6	171859	171864	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678256
3555	NC_000916	ATTA	2	8	171884	171891	50 %	50 %	0 %	0 %	15678256
3556	NC_000916	T	7	7	171893	171899	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3557	NC_000916	GAA	2	6	171938	171943	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15678257
3558	NC_000916	CAA	2	6	171961	171966	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15678257
3559	NC_000916	CTG	2	6	172002	172007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15678257
3560	NC_000916	CT	3	6	172071	172076	0 %	50 %	0 %	50 %	15678257
3561	NC_000916	AAT	2	6	172112	172117	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15678257
3562	NC_000916	CTC	2	6	172118	172123	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678257
3563	NC_000916	CAT	2	6	172162	172167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678257
3564	NC_000916	ATT	2	6	172170	172175	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15678257
3565	NC_000916	TC	3	6	172235	172240	0 %	50 %	0 %	50 %	15678257
3566	NC_000916	CT	3	6	172401	172406	0 %	50 %	0 %	50 %	15678257
3567	NC_000916	CCT	2	6	172408	172413	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678257
3568	NC_000916	GAT	2	6	172417	172422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678257
3569	NC_000916	ACT	2	6	172501	172506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3570	NC_000916	TAA	2	6	172517	172522	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3571	NC_000916	A	7	7	172578	172584	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3572	NC_000916	G	6	6	172587	172592	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3573	NC_000916	ACG	2	6	172661	172666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15678258
3574	NC_000916	CTG	2	6	172675	172680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15678258
3575	NC_000916	CTG	2	6	172684	172689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15678258
3576	NC_000916	TTG	2	6	172731	172736	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15678258
3577	NC_000916	CTG	3	9	172789	172797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15678258
3578	NC_000916	TCC	2	6	172799	172804	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678258
3579	NC_000916	TGTAT	2	10	172930	172939	20 %	60 %	20 %	0 %	15678258
3580	NC_000916	CAT	2	6	172995	173000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678258
3581	NC_000916	CTG	2	6	173012	173017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15678258
3582	NC_000916	GTGGG	2	10	173054	173063	0 %	20 %	80 %	0 %	15678258
3583	NC_000916	TGT	2	6	173067	173072	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15678258
3584	NC_000916	TCAT	2	8	173108	173115	25 %	50 %	0 %	25 %	15678258
3585	NC_000916	TTA	2	6	173118	173123	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15678258
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3587	NC_000916	TC	3	6	173196	173201	0 %	50 %	0 %	50 %	15678258
3588	NC_000916	ATT	2	6	173282	173287	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15678258
3589	NC_000916	CCTT	2	8	173315	173322	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3590	NC_000916	T	7	7	173329	173335	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3591	NC_000916	TG	3	6	173338	173343	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3592	NC_000916	TG	3	6	173351	173356	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3593	NC_000916	CAG	2	6	173358	173363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3594	NC_000916	A	6	6	173375	173380	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3595	NC_000916	TAT	2	6	173392	173397	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3596	NC_000916	AGA	2	6	173426	173431	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3597	NC_000916	TA	3	6	173436	173441	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3598	NC_000916	AT	3	6	173492	173497	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3599	NC_000916	TGC	2	6	173504	173509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3600	NC_000916	CT	3	6	173521	173526	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3601	NC_000916	AGG	2	6	173676	173681	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678259
3602	NC_000916	TGC	3	9	173707	173715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15678259
3603	NC_000916	A	6	6	173762	173767	100 %	0 %	0 %	0 %	15678259
3604	NC_000916	GGTG	2	8	173800	173807	0 %	25 %	75 %	0 %	15678259
3605	NC_000916	GAT	2	6	173858	173863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678259
3606	NC_000916	AGG	2	6	173945	173950	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678259
3607	NC_000916	G	6	6	173949	173954	0 %	0 %	100 %	0 %	15678259
3608	NC_000916	TCA	2	6	174087	174092	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678259
3609	NC_000916	CTGGTT	2	12	174134	174145	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	15678259
3610	NC_000916	TTG	2	6	174195	174200	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15678259
3611	NC_000916	AAT	2	6	174288	174293	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15678259
3612	NC_000916	ATTA	2	8	174309	174316	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3613	NC_000916	CAT	3	9	174455	174463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678260
3614	NC_000916	AAG	2	6	174522	174527	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15678260
3615	NC_000916	AGG	2	6	174631	174636	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678260
3616	NC_000916	AGCA	2	8	174680	174687	50 %	0 %	25 %	25 %	15678260
3617	NC_000916	CAGGGT	2	12	174707	174718	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	15678260
3618	NC_000916	CTC	2	6	174741	174746	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678260
3619	NC_000916	GGA	2	6	174749	174754	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678260
3620	NC_000916	ATG	2	6	174832	174837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678260
3621	NC_000916	AAGA	2	8	174863	174870	75 %	0 %	25 %	0 %	15678260
3622	NC_000916	GGA	2	6	174905	174910	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678260
3623	NC_000916	GGA	2	6	174956	174961	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678260
3624	NC_000916	ATA	2	6	174972	174977	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15678260
3625	NC_000916	CAG	2	6	175107	175112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15678260
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3752	NC_000916	TAA	2	6	181889	181894	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3753	NC_000916	TCT	2	6	181911	181916	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3998	NC_000916	TCA	2	6	195113	195118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678279
3999	NC_000916	GGC	2	6	195137	195142	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15678279
4000	NC_000916	AC	3	6	195198	195203	50 %	0 %	0 %	50 %	15678279

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