MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanothermobacter thermautotrophicus str. Delta H chromosome

Total Repeats: 35216

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
34501	NC_000916	AAC	2	6	1716395	1716400	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15679871
34502	NC_000916	ATC	2	6	1716411	1716416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15679871
34503	NC_000916	AGG	2	6	1716443	1716448	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679871
34504	NC_000916	TGA	2	6	1716557	1716562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15679872
34505	NC_000916	GGA	2	6	1716591	1716596	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679872
34506	NC_000916	ATGA	2	8	1716748	1716755	50 %	25 %	25 %	0 %	15679872
34507	NC_000916	TGA	2	6	1716765	1716770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15679872
34508	NC_000916	TTG	2	6	1716788	1716793	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15679872
34509	NC_000916	TGG	2	6	1716794	1716799	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15679872
34510	NC_000916	ATG	2	6	1716800	1716805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15679872
34511	NC_000916	TAA	2	6	1716878	1716883	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15679873
34512	NC_000916	GAT	2	6	1716895	1716900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15679873
34513	NC_000916	CAT	2	6	1716956	1716961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15679873
34514	NC_000916	CGA	2	6	1717010	1717015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15679873
34515	NC_000916	AGG	2	6	1717159	1717164	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679873
34516	NC_000916	CAA	2	6	1717172	1717177	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15679873
34517	NC_000916	TCC	2	6	1717209	1717214	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15679873
34518	NC_000916	ATG	2	6	1717286	1717291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15679873
34519	NC_000916	A	6	6	1717313	1717318	100 %	0 %	0 %	0 %	15679873
34520	NC_000916	TCT	2	6	1717319	1717324	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15679873
34521	NC_000916	TAT	2	6	1717362	1717367	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15679873
34522	NC_000916	TA	3	6	1717387	1717392	50 %	50 %	0 %	0 %	15679873
34523	NC_000916	G	9	9	1717418	1717426	0 %	0 %	100 %	0 %	15679873
34524	NC_000916	GCA	2	6	1717489	1717494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15679873
34525	NC_000916	ATT	2	6	1717633	1717638	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15679873
34526	NC_000916	A	6	6	1717695	1717700	100 %	0 %	0 %	0 %	15679873
34527	NC_000916	CTC	2	6	1717720	1717725	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15679873
34528	NC_000916	GCA	2	6	1717780	1717785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15679873
34529	NC_000916	GT	3	6	1717832	1717837	0 %	50 %	50 %	0 %	15679873
34530	NC_000916	ATTA	2	8	1717846	1717853	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34531	NC_000916	T	6	6	1717873	1717878	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34532	NC_000916	GTG	2	6	1718098	1718103	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
34533	NC_000916	AGC	2	6	1718171	1718176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34534	NC_000916	TCA	2	6	1718223	1718228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34535	NC_000916	CGG	2	6	1718236	1718241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
34536	NC_000916	ATTC	2	8	1718446	1718453	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
34537	NC_000916	T	6	6	1718456	1718461	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34538	NC_000916	CTTAC	2	10	1718501	1718510	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
34539	NC_000916	T	6	6	1718524	1718529	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34540	NC_000916	TTTG	2	8	1718534	1718541	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
34541	NC_000916	GGTG	2	8	1718547	1718554	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
34542	NC_000916	GTG	2	6	1718729	1718734	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
34543	NC_000916	CGAA	2	8	1718844	1718851	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
34544	NC_000916	TGC	2	6	1718948	1718953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34545	NC_000916	TTC	2	6	1718963	1718968	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34546	NC_000916	GTT	2	6	1719015	1719020	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34547	NC_000916	ATC	2	6	1719046	1719051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34548	NC_000916	GCA	2	6	1719118	1719123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34549	NC_000916	GCC	2	6	1719246	1719251	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
34550	NC_000916	ACC	2	6	1719442	1719447	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34551	NC_000916	GAAC	2	8	1719469	1719476	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
34552	NC_000916	CAC	2	6	1719663	1719668	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34553	NC_000916	CAG	2	6	1719726	1719731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34554	NC_000916	ATG	2	6	1719733	1719738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34555	NC_000916	TGA	2	6	1719746	1719751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34556	NC_000916	GAG	2	6	1719770	1719775	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
34557	NC_000916	GCC	2	6	1719783	1719788	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
34558	NC_000916	CGAG	2	8	1719828	1719835	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
34559	NC_000916	GGA	2	6	1719909	1719914	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
34560	NC_000916	GAC	2	6	1719922	1719927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34561	NC_000916	GTA	2	6	1720079	1720084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34562	NC_000916	CG	3	6	1720100	1720105	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
34563	NC_000916	CA	3	6	1720128	1720133	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
34564	NC_000916	TGT	2	6	1720182	1720187	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34565	NC_000916	GAG	2	6	1720207	1720212	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
34566	NC_000916	CCT	2	6	1720260	1720265	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34567	NC_000916	TG	3	6	1720287	1720292	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
34568	NC_000916	CTC	2	6	1720307	1720312	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34569	NC_000916	T	6	6	1720358	1720363	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34570	NC_000916	GCC	2	6	1720398	1720403	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
34571	NC_000916	GCC	2	6	1720459	1720464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
34572	NC_000916	TGG	2	6	1720483	1720488	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
34573	NC_000916	AG	3	6	1720564	1720569	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
34574	NC_000916	AAACC	2	10	1720579	1720588	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
34575	NC_000916	TTAT	2	8	1720594	1720601	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
34576	NC_000916	TGGCT	2	10	1720615	1720624	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
34577	NC_000916	TGA	2	6	1720633	1720638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34578	NC_000916	GAG	2	6	1720669	1720674	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
34579	NC_000916	GGGGGA	2	12	1720762	1720773	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
34580	NC_000916	CTGAA	2	10	1720779	1720788	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
34581	NC_000916	TAG	2	6	1720795	1720800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34582	NC_000916	GGA	2	6	1720803	1720808	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
34583	NC_000916	GGA	2	6	1720856	1720861	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
34584	NC_000916	CAT	2	6	1720873	1720878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34585	NC_000916	GTG	2	6	1720885	1720890	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
34586	NC_000916	GGTTG	2	10	1720934	1720943	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
34587	NC_000916	TCCTAA	2	12	1721069	1721080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34588	NC_000916	CGGCA	2	10	1721181	1721190	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
34589	NC_000916	GGAA	2	8	1721192	1721199	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
34590	NC_000916	GCTG	2	8	1721245	1721252	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
34591	NC_000916	GTGTC	2	10	1721257	1721266	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
34592	NC_000916	AAG	2	6	1721315	1721320	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34593	NC_000916	GCA	3	9	1721358	1721366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34594	NC_000916	CTGTG	2	10	1721368	1721377	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
34595	NC_000916	GTG	2	6	1721525	1721530	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
34596	NC_000916	TGG	2	6	1721600	1721605	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
34597	NC_000916	GA	3	6	1721724	1721729	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
34598	NC_000916	AAC	2	6	1721732	1721737	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34599	NC_000916	AGC	2	6	1721819	1721824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34600	NC_000916	CAC	2	6	1721915	1721920	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34601	NC_000916	TG	3	6	1721924	1721929	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
34602	NC_000916	GTA	3	9	1722010	1722018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34603	NC_000916	GCA	2	6	1722019	1722024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34604	NC_000916	GTGAG	2	10	1722027	1722036	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
34605	NC_000916	CCG	2	6	1722045	1722050	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
34606	NC_000916	TTG	2	6	1722302	1722307	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34607	NC_000916	GGT	2	6	1722308	1722313	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
34608	NC_000916	CTT	2	6	1722348	1722353	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34609	NC_000916	GCCA	2	8	1722478	1722485	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
34610	NC_000916	G	7	7	1722510	1722516	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
34611	NC_000916	TAA	2	6	1722527	1722532	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34612	NC_000916	CTAG	2	8	1722544	1722551	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
34613	NC_000916	GT	3	6	1722561	1722566	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
34614	NC_000916	CGG	2	6	1722635	1722640	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
34615	NC_000916	GCT	2	6	1722748	1722753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34616	NC_000916	CTG	2	6	1722818	1722823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34617	NC_000916	GTG	2	6	1722886	1722891	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
34618	NC_000916	ACC	2	6	1722908	1722913	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34619	NC_000916	G	7	7	1722947	1722953	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
34620	NC_000916	GGC	2	6	1722981	1722986	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
34621	NC_000916	GC	3	6	1723008	1723013	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
34622	NC_000916	CTA	2	6	1723085	1723090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34623	NC_000916	TCG	2	6	1723138	1723143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34624	NC_000916	GGT	2	6	1723187	1723192	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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34626	NC_000916	GTT	2	6	1723282	1723287	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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34988	NC_000916	TTG	2	6	1739869	1739874	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15679889
34989	NC_000916	T	7	7	1739887	1739893	0 %	100 %	0 %	0 %	15679889
34990	NC_000916	CTC	3	9	1739960	1739968	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15679889
34991	NC_000916	CCT	2	6	1739975	1739980	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15679889
34992	NC_000916	TCC	2	6	1739985	1739990	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15679889
34993	NC_000916	GAA	2	6	1740005	1740010	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15679889
34994	NC_000916	TCT	2	6	1740044	1740049	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15679889
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34996	NC_000916	ATG	2	6	1740105	1740110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15679889
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34998	NC_000916	GCA	2	6	1740159	1740164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15679889
34999	NC_000916	ATC	2	6	1740179	1740184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15679889
35000	NC_000916	TGC	2	6	1740196	1740201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15679889

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