MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanothermobacter thermautotrophicus str. Delta H chromosome

Total Repeats: 35216

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_000916	GCA	2	6	144126	144131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15678228
3002	NC_000916	TCCTT	2	10	144154	144163	0 %	60 %	0 %	40 %	15678228
3003	NC_000916	AGA	2	6	144187	144192	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15678228
3004	NC_000916	TTAA	2	8	144290	144297	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3005	NC_000916	GCT	2	6	144482	144487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15678229
3006	NC_000916	TGC	2	6	144555	144560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15678229
3007	NC_000916	TGG	2	6	144579	144584	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15678229
3008	NC_000916	GTT	2	6	144599	144604	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15678229
3009	NC_000916	GTA	2	6	144649	144654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678229
3010	NC_000916	GCAT	2	8	144673	144680	25 %	25 %	25 %	25 %	15678229
3011	NC_000916	CAGC	2	8	144711	144718	25 %	0 %	25 %	50 %	15678229
3012	NC_000916	ATG	2	6	144737	144742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678229
3013	NC_000916	ACT	2	6	144753	144758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3014	NC_000916	AT	3	6	144771	144776	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3015	NC_000916	TTA	2	6	144785	144790	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15678230
3016	NC_000916	GGT	2	6	144842	144847	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15678230
3017	NC_000916	GGT	2	6	144921	144926	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15678230
3018	NC_000916	ATG	2	6	145061	145066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3019	NC_000916	A	6	6	145076	145081	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3020	NC_000916	ATT	2	6	145101	145106	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15678231
3021	NC_000916	GAT	2	6	145109	145114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678231
3022	NC_000916	TCC	2	6	145218	145223	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678231
3023	NC_000916	CCT	2	6	145255	145260	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678231
3024	NC_000916	ACG	2	6	145349	145354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15678231
3025	NC_000916	GTA	2	6	145411	145416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678231
3026	NC_000916	GCA	2	6	145481	145486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15678231
3027	NC_000916	CAA	2	6	145497	145502	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15678231
3028	NC_000916	TC	3	6	145528	145533	0 %	50 %	0 %	50 %	15678231
3029	NC_000916	TGA	2	6	145672	145677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678231
3030	NC_000916	GAG	2	6	145690	145695	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678231
3031	NC_000916	TCC	3	9	145706	145714	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678231
3032	NC_000916	ATCT	2	8	145735	145742	25 %	50 %	0 %	25 %	15678231
3033	NC_000916	CTT	2	6	145753	145758	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15678231
3034	NC_000916	AGA	2	6	145833	145838	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15678231
3035	NC_000916	TC	3	6	145852	145857	0 %	50 %	0 %	50 %	15678231
3036	NC_000916	TCA	2	6	145886	145891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678231
3037	NC_000916	TCA	2	6	145922	145927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678231
3038	NC_000916	C	6	6	146016	146021	0 %	0 %	0 %	100 %	15678231
3039	NC_000916	ACC	2	6	146056	146061	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15678231
3040	NC_000916	ACCTTC	2	12	146075	146086	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	15678231
3041	NC_000916	CAA	2	6	146244	146249	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15678231
3042	NC_000916	ATC	2	6	146317	146322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678231
3043	NC_000916	T	6	6	146537	146542	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3044	NC_000916	GTG	2	6	146573	146578	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3045	NC_000916	TTTG	2	8	146585	146592	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3046	NC_000916	T	6	6	146598	146603	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3047	NC_000916	TGT	2	6	146616	146621	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3048	NC_000916	GTG	2	6	146626	146631	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3049	NC_000916	GCT	2	6	146657	146662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3050	NC_000916	TTC	2	6	146679	146684	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3051	NC_000916	ACC	2	6	146698	146703	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15678232
3052	NC_000916	AGG	2	6	146722	146727	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678232
3053	NC_000916	GTG	2	6	146744	146749	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15678232
3054	NC_000916	ATC	2	6	146764	146769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678232
3055	NC_000916	TCA	2	6	146770	146775	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678232
3056	NC_000916	CTC	2	6	146778	146783	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678232
3057	NC_000916	TTA	2	6	146798	146803	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15678232
3058	NC_000916	TCA	2	6	146812	146817	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678232
3059	NC_000916	GTT	2	6	146821	146826	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15678232
3060	NC_000916	CAA	2	6	146948	146953	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15678232
3061	NC_000916	GAG	2	6	147048	147053	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678232
3062	NC_000916	TCT	2	6	147114	147119	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15678232
3063	NC_000916	GCA	2	6	147199	147204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15678232
3064	NC_000916	GAG	2	6	147267	147272	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678232
3065	NC_000916	TCC	2	6	147303	147308	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678232
3066	NC_000916	ATC	2	6	147309	147314	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678232
3067	NC_000916	TGA	2	6	147329	147334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678232
3068	NC_000916	CCA	2	6	147386	147391	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15678232
3069	NC_000916	TA	3	6	147541	147546	50 %	50 %	0 %	0 %	15678232
3070	NC_000916	TTA	2	6	147551	147556	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15678232
3071	NC_000916	AGG	2	6	147562	147567	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678232
3072	NC_000916	AGC	2	6	147604	147609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15678232
3073	NC_000916	ATT	2	6	147643	147648	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15678232
3074	NC_000916	CT	3	6	147688	147693	0 %	50 %	0 %	50 %	15678232
3075	NC_000916	CCT	2	6	147717	147722	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3076	NC_000916	AC	3	6	147735	147740	50 %	0 %	0 %	50 %	15678233
3077	NC_000916	CTT	2	6	147778	147783	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15678233
3078	NC_000916	ATC	2	6	147816	147821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678233
3079	NC_000916	TAT	2	6	147834	147839	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15678233
3080	NC_000916	CCT	2	6	147845	147850	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678233
3081	NC_000916	CAG	2	6	147872	147877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15678233
3082	NC_000916	GAT	2	6	147912	147917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678233
3083	NC_000916	CCT	2	6	147980	147985	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678233
3084	NC_000916	TGG	2	6	148073	148078	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15678233
3085	NC_000916	C	6	6	148099	148104	0 %	0 %	0 %	100 %	15678233
3086	NC_000916	CGAATC	2	12	148166	148177	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	15678233
3087	NC_000916	CAC	2	6	148274	148279	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15678233
3088	NC_000916	GTT	2	6	148303	148308	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15678233
3089	NC_000916	TCC	2	6	148420	148425	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678233
3090	NC_000916	TTA	2	6	148442	148447	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15678233
3091	NC_000916	TTGCAA	2	12	148457	148468	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	15678233
3092	NC_000916	AT	3	6	148490	148495	50 %	50 %	0 %	0 %	15678233
3093	NC_000916	GAA	2	6	148542	148547	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15678233
3094	NC_000916	CGT	2	6	148616	148621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15678233
3095	NC_000916	CCG	2	6	148642	148647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15678233
3096	NC_000916	TAT	2	6	148677	148682	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15678233
3097	NC_000916	ATTA	2	8	148901	148908	50 %	50 %	0 %	0 %	15678234
3098	NC_000916	ATGA	2	8	149087	149094	50 %	25 %	25 %	0 %	15678234
3099	NC_000916	AAT	2	6	149104	149109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15678234
3100	NC_000916	A	6	6	149135	149140	100 %	0 %	0 %	0 %	15678235
3101	NC_000916	CTG	2	6	149202	149207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15678235
3102	NC_000916	GTT	2	6	149297	149302	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15678235
3103	NC_000916	GTT	2	6	149345	149350	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15678235
3104	NC_000916	AGG	2	6	149378	149383	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678235
3105	NC_000916	CAT	2	6	149386	149391	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678235
3106	NC_000916	GGA	2	6	149530	149535	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678236
3107	NC_000916	AAG	2	6	149645	149650	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15678236
3108	NC_000916	A	7	7	149729	149735	100 %	0 %	0 %	0 %	15678236
3109	NC_000916	TCC	2	6	149760	149765	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678236
3110	NC_000916	ATA	2	6	149795	149800	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15678236
3111	NC_000916	AC	3	6	149857	149862	50 %	0 %	0 %	50 %	15678236
3112	NC_000916	CT	3	6	149879	149884	0 %	50 %	0 %	50 %	15678236
3113	NC_000916	GAAGG	2	10	149935	149944	40 %	0 %	60 %	0 %	15678236
3114	NC_000916	CAT	2	6	149974	149979	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678236
3115	NC_000916	GAAGG	2	10	149983	149992	40 %	0 %	60 %	0 %	15678236
3116	NC_000916	AGC	2	6	150158	150163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15678236
3117	NC_000916	CTTT	2	8	150193	150200	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3118	NC_000916	CAA	2	6	150288	150293	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3119	NC_000916	TGA	2	6	150371	150376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678237
3120	NC_000916	CT	3	6	150379	150384	0 %	50 %	0 %	50 %	15678237
3121	NC_000916	GCT	2	6	150420	150425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15678237
3122	NC_000916	AGG	3	9	150463	150471	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678237
3123	NC_000916	ATA	2	6	150492	150497	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15678237
3124	NC_000916	GAG	2	6	150558	150563	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678237
3125	NC_000916	CCT	2	6	150617	150622	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678237
3126	NC_000916	CCA	2	6	150743	150748	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15678237
3127	NC_000916	CTT	2	6	150749	150754	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15678237
3128	NC_000916	GTC	2	6	150762	150767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15678237
3129	NC_000916	GAG	2	6	150813	150818	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678237
3130	NC_000916	AGG	2	6	150825	150830	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678237
3131	NC_000916	TGGT	2	8	150859	150866	0 %	50 %	50 %	0 %	15678237
3132	NC_000916	GAA	2	6	150965	150970	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15678237
3133	NC_000916	GAT	2	6	150993	150998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678237
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3135	NC_000916	AGG	2	6	151036	151041	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3136	NC_000916	TC	3	6	151074	151079	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3137	NC_000916	ATG	2	6	151097	151102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3138	NC_000916	CTA	2	6	151140	151145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678238
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3153	NC_000916	CA	4	8	152053	152060	50 %	0 %	0 %	50 %	15678238
3154	NC_000916	CAA	2	6	152078	152083	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15678238
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3157	NC_000916	TGA	2	6	152193	152198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678238
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3163	NC_000916	GGAT	2	8	152414	152421	25 %	25 %	50 %	0 %	15678238
3164	NC_000916	TAT	2	6	152463	152468	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15678238
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3232	NC_000916	CCCTT	2	10	155891	155900	0 %	40 %	0 %	60 %	15678241
3233	NC_000916	ACC	2	6	155917	155922	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15678241
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3235	NC_000916	CTCCAT	2	12	156018	156029	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	15678241
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3237	NC_000916	TC	3	6	156054	156059	0 %	50 %	0 %	50 %	15678241
3238	NC_000916	TCC	2	6	156133	156138	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678241
3239	NC_000916	T	6	6	156339	156344	0 %	100 %	0 %	0 %	15678241
3240	NC_000916	G	6	6	156380	156385	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3241	NC_000916	G	6	6	156502	156507	0 %	0 %	100 %	0 %	15678242
3242	NC_000916	GCC	2	6	156535	156540	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15678242
3243	NC_000916	CATC	2	8	156592	156599	25 %	25 %	0 %	50 %	15678242
3244	NC_000916	TCA	2	6	156621	156626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678242
3245	NC_000916	GGA	2	6	156844	156849	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678242
3246	NC_000916	TC	3	6	156851	156856	0 %	50 %	0 %	50 %	15678242
3247	NC_000916	TGG	2	6	157021	157026	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15678242
3248	NC_000916	TTAGT	2	10	157126	157135	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
3249	NC_000916	A	6	6	157174	157179	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3250	NC_000916	GAT	2	6	157213	157218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3376	NC_000916	GAGAA	2	10	162898	162907	60 %	0 %	40 %	0 %	15678248
3377	NC_000916	TCC	2	6	162913	162918	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678248
3378	NC_000916	GAG	2	6	162921	162926	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678248
3379	NC_000916	TGC	2	6	163051	163056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15678248
3380	NC_000916	TAT	2	6	163158	163163	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15678248
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3382	NC_000916	CAA	2	6	163253	163258	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15678248
3383	NC_000916	AGGT	2	8	163285	163292	25 %	25 %	50 %	0 %	15678248
3384	NC_000916	ATT	2	6	163433	163438	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3385	NC_000916	GGT	2	6	163463	163468	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3386	NC_000916	G	8	8	163478	163485	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3387	NC_000916	TCTT	2	8	163537	163544	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3388	NC_000916	AGA	2	6	163551	163556	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3389	NC_000916	ATG	2	6	163595	163600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3390	NC_000916	ATTA	2	8	163621	163628	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3391	NC_000916	A	8	8	163628	163635	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3392	NC_000916	TTC	2	6	163655	163660	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15678249
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3408	NC_000916	ATATTT	2	12	164487	164498	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3449	NC_000916	AAT	2	6	166597	166602	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3450	NC_000916	TAA	2	6	166614	166619	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3451	NC_000916	TGGC	2	8	166625	166632	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3452	NC_000916	CTG	2	6	166637	166642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3453	NC_000916	AACTGG	2	12	166646	166657	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
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3455	NC_000916	GAC	2	6	166717	166722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15678252
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3458	NC_000916	TGG	2	6	166871	166876	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15678252
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3461	NC_000916	TTA	2	6	167035	167040	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3462	NC_000916	ATAA	2	8	167175	167182	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3463	NC_000916	TTC	2	6	167201	167206	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3464	NC_000916	ATT	2	6	167209	167214	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3482	NC_000916	TC	3	6	168428	168433	0 %	50 %	0 %	50 %	15678253
3483	NC_000916	TCA	2	6	168445	168450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678253
3484	NC_000916	A	6	6	168450	168455	100 %	0 %	0 %	0 %	15678253
3485	NC_000916	AGG	2	6	168478	168483	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678253
3486	NC_000916	CCATGC	2	12	168536	168547	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	15678253
3487	NC_000916	AGG	3	9	168558	168566	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678253
3488	NC_000916	TGAT	2	8	168576	168583	25 %	50 %	25 %	0 %	15678253
3489	NC_000916	CTG	2	6	168598	168603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3490	NC_000916	TCA	2	6	168624	168629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3491	NC_000916	TGATT	2	10	168664	168673	20 %	60 %	20 %	0 %	15678254
3492	NC_000916	GATG	2	8	168725	168732	25 %	25 %	50 %	0 %	15678254
3493	NC_000916	ATA	2	6	168786	168791	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15678254
3494	NC_000916	TGG	2	6	168908	168913	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15678254
3495	NC_000916	AGGCA	2	10	168929	168938	40 %	0 %	40 %	20 %	15678254
3496	NC_000916	ATA	2	6	168954	168959	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15678254
3497	NC_000916	TCCT	2	8	168963	168970	0 %	50 %	0 %	50 %	15678254
3498	NC_000916	AGC	2	6	168991	168996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15678254
3499	NC_000916	TGC	2	6	169114	169119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15678254
3500	NC_000916	TCAG	2	8	169122	169129	25 %	25 %	25 %	25 %	15678254

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