MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanothermobacter thermautotrophicus str. Delta H chromosome

Total Repeats: 35216

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
33001	NC_000916	CTTATC	2	12	1641321	1641332	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	15679782
33002	NC_000916	ATCC	2	8	1641351	1641358	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
33003	NC_000916	TTA	3	9	1641383	1641391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33004	NC_000916	ACAG	2	8	1641449	1641456	50 %	0 %	25 %	25 %	15679783
33005	NC_000916	TGAGGG	2	12	1641468	1641479	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	15679783
33006	NC_000916	GAT	2	6	1641497	1641502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15679783
33007	NC_000916	CAT	2	6	1641603	1641608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15679783
33008	NC_000916	GC	3	6	1641698	1641703	0 %	0 %	50 %	50 %	15679783
33009	NC_000916	ATA	2	6	1641717	1641722	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15679783
33010	NC_000916	GCAGT	2	10	1641742	1641751	20 %	20 %	40 %	20 %	15679783
33011	NC_000916	GCT	2	6	1641789	1641794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15679784
33012	NC_000916	ATG	2	6	1641875	1641880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15679784
33013	NC_000916	AC	3	6	1641922	1641927	50 %	0 %	0 %	50 %	15679784
33014	NC_000916	GAGG	2	8	1641952	1641959	25 %	0 %	75 %	0 %	15679784
33015	NC_000916	AGG	2	6	1641961	1641966	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679784
33016	NC_000916	GTT	2	6	1642066	1642071	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15679784
33017	NC_000916	CTC	2	6	1642081	1642086	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15679784
33018	NC_000916	AAG	2	6	1642176	1642181	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15679784
33019	NC_000916	TCA	2	6	1642234	1642239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15679784
33020	NC_000916	GGA	2	6	1642253	1642258	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679784
33021	NC_000916	CCT	2	6	1642306	1642311	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15679784
33022	NC_000916	ATAAGG	2	12	1642444	1642455	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	15679785
33023	NC_000916	GGT	2	6	1642641	1642646	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15679785
33024	NC_000916	GAA	2	6	1642662	1642667	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15679785
33025	NC_000916	TTC	2	6	1642858	1642863	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33026	NC_000916	TTC	2	6	1642914	1642919	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15679786
33027	NC_000916	CT	3	6	1642975	1642980	0 %	50 %	0 %	50 %	15679786
33028	NC_000916	AGA	2	6	1643069	1643074	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15679786
33029	NC_000916	AGGT	2	8	1643110	1643117	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
33030	NC_000916	TAT	2	6	1643410	1643415	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33031	NC_000916	A	6	6	1643548	1643553	100 %	0 %	0 %	0 %	15679788
33032	NC_000916	GAT	2	6	1643560	1643565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15679788
33033	NC_000916	ATA	2	6	1643624	1643629	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15679788
33034	NC_000916	G	6	6	1643631	1643636	0 %	0 %	100 %	0 %	15679788
33035	NC_000916	G	6	6	1643656	1643661	0 %	0 %	100 %	0 %	15679788
33036	NC_000916	A	6	6	1643674	1643679	100 %	0 %	0 %	0 %	15679788
33037	NC_000916	T	6	6	1643695	1643700	0 %	100 %	0 %	0 %	15679788
33038	NC_000916	T	7	7	1643721	1643727	0 %	100 %	0 %	0 %	15679788
33039	NC_000916	ATA	2	6	1643767	1643772	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15679788
33040	NC_000916	TG	3	6	1643782	1643787	0 %	50 %	50 %	0 %	15679788
33041	NC_000916	AC	3	6	1643794	1643799	50 %	0 %	0 %	50 %	15679788
33042	NC_000916	TA	3	6	1643823	1643828	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33043	NC_000916	GGTGA	2	10	1643837	1643846	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
33044	NC_000916	TAAT	2	8	1643870	1643877	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33045	NC_000916	TCAACC	2	12	1643996	1644007	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	15679789
33046	NC_000916	G	6	6	1644045	1644050	0 %	0 %	100 %	0 %	15679789
33047	NC_000916	TTCA	2	8	1644057	1644064	25 %	50 %	0 %	25 %	15679789
33048	NC_000916	CAT	2	6	1644069	1644074	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15679789
33049	NC_000916	CAT	2	6	1644108	1644113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15679789
33050	NC_000916	TGA	2	6	1644228	1644233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15679789
33051	NC_000916	GCT	2	6	1644263	1644268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15679789
33052	NC_000916	G	6	6	1644308	1644313	0 %	0 %	100 %	0 %	15679789
33053	NC_000916	TGA	2	6	1644333	1644338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15679789
33054	NC_000916	TGG	2	6	1644353	1644358	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15679789
33055	NC_000916	TCA	2	6	1644361	1644366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15679789
33056	NC_000916	CCT	2	6	1644369	1644374	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15679789
33057	NC_000916	GAA	2	6	1644424	1644429	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15679789
33058	NC_000916	TAA	2	6	1644509	1644514	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15679789
33059	NC_000916	ATG	2	6	1644515	1644520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15679789
33060	NC_000916	GTTGAT	2	12	1644532	1644543	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	15679789
33061	NC_000916	GTG	2	6	1644544	1644549	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15679789
33062	NC_000916	GAG	2	6	1644597	1644602	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679789
33063	NC_000916	ACCT	2	8	1644626	1644633	25 %	25 %	0 %	50 %	15679790
33064	NC_000916	TAT	2	6	1644646	1644651	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15679790
33065	NC_000916	TCC	2	6	1644833	1644838	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15679790
33066	NC_000916	CCTC	2	8	1644843	1644850	0 %	25 %	0 %	75 %	15679790
33067	NC_000916	ATC	2	6	1644877	1644882	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15679790
33068	NC_000916	TCAC	2	8	1644887	1644894	25 %	25 %	0 %	50 %	15679790
33069	NC_000916	GAG	2	6	1644901	1644906	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679790
33070	NC_000916	CTG	2	6	1644922	1644927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15679790
33071	NC_000916	CTGTC	2	10	1645017	1645026	0 %	40 %	20 %	40 %	15679790
33072	NC_000916	CTT	2	6	1645033	1645038	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15679790
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33091	NC_000916	TCC	2	6	1646049	1646054	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15679790
33092	NC_000916	CTC	2	6	1646084	1646089	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15679790
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33101	NC_000916	CT	3	6	1646516	1646521	0 %	50 %	0 %	50 %	15679790
33102	NC_000916	AACC	2	8	1646535	1646542	50 %	0 %	0 %	50 %	15679790
33103	NC_000916	CG	3	6	1646549	1646554	0 %	0 %	50 %	50 %	15679790
33104	NC_000916	GA	3	6	1646582	1646587	50 %	0 %	50 %	0 %	15679790
33105	NC_000916	TGC	2	6	1646615	1646620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15679790
33106	NC_000916	GA	3	6	1646639	1646644	50 %	0 %	50 %	0 %	15679790
33107	NC_000916	TTA	2	6	1646657	1646662	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15679790
33108	NC_000916	TCA	2	6	1646681	1646686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15679790
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33110	NC_000916	T	6	6	1646785	1646790	0 %	100 %	0 %	0 %	15679790
33111	NC_000916	CCTT	2	8	1646838	1646845	0 %	50 %	0 %	50 %	15679790
33112	NC_000916	GCG	2	6	1646870	1646875	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15679790
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33117	NC_000916	TCC	2	6	1647132	1647137	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15679790
33118	NC_000916	TCAC	2	8	1647146	1647153	25 %	25 %	0 %	50 %	15679790
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33359	NC_000916	CCT	2	6	1659214	1659219	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15679804
33360	NC_000916	TCAG	2	8	1659284	1659291	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
33361	NC_000916	TAACTG	2	12	1659293	1659304	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
33362	NC_000916	GTCT	2	8	1659387	1659394	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
33363	NC_000916	GA	3	6	1659395	1659400	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
33364	NC_000916	TG	3	6	1659439	1659444	0 %	50 %	50 %	0 %	15679805
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33372	NC_000916	GGA	2	6	1659771	1659776	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679805
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33469	NC_000916	CAC	2	6	1664035	1664040	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15679812
33470	NC_000916	CTCAT	2	10	1664047	1664056	20 %	40 %	0 %	40 %	15679812
33471	NC_000916	GGC	2	6	1664078	1664083	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15679812
33472	NC_000916	CAT	2	6	1664124	1664129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15679812
33473	NC_000916	GAG	2	6	1664163	1664168	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15679812
33474	NC_000916	TCT	2	6	1664179	1664184	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15679812
33475	NC_000916	T	7	7	1664217	1664223	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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